Малая ядрышковая РНК SNORD16 - Small nucleolar RNA SNORD16

Малая ядрышковая РНК SNORD16
RF00138.jpg
Идентификаторы
СимволSNORD16
Альт. СимволыU16
РфамRF00138
Прочие данные
РНК типГен; мяРНК; snoRNA; C / D-бокс
Домен (ы)Эукариоты
ИДТИТермин GO должен начинаться с GO: Термин GO должен начинаться с GO:
ТАКТАК: 0000593
PDB структурыPDBe

snoRNA U16 (также известен как SNORD16) это некодирующая РНК (нкРНК) молекула, которая функционирует в модификации других малые ядерные РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно находится в ядрышко эукариотической клетки, которая является основным участком биогенеза мяРНК. Он известен как малая ядрышковая РНК (snoRNA) и также часто упоминается как направляющая РНК.

snoRNA U16 принадлежит к C / D коробка класс snoRNA, которые содержат консервативные мотивы последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства боксов C / D действуют в направлении сайт-специфичных 2'-O-метилирование субстратных РНК.[1]

Предполагается, что U16 управляет метилированием 2'O-рибозы остатка 18S рибосомной РНК (рРНК) A484. [2] и закодирован в интрон гена для рибосомальные белки L1 у животных.[3] Эта snoRNA была независимо названа у мыши MBII-98.[4]

Рекомендации

  1. ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (октябрь 2002 г.). «Очищенные бокс-C / D snoRNP способны воспроизводить сайт-специфичное 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro». Молекулярная и клеточная биология. 22 (19): 6663–8. Дои:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. ЧВК  134041. PMID  12215523.
  2. ^ Kiss-László Z, Henry Y, Bachellerie JP, Caizergues-Ferrer M, Kiss T (июнь 1996 г.). «Сайт-специфическое метилирование рибозы прерибосомальной РНК: новая функция для малых ядрышковых РНК». Клетка. 85 (7): 1077–88. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81308-2. PMID  8674114.
  3. ^ Fragapane P, Prislei S, Michienzi A, Caffarelli E, Bozzoni I (июль 1993 г.). «Новая малая ядрышковая РНК (U16) кодируется внутри интрона рибосомного белка и возникает в результате процессинга пре-мРНК». Журнал EMBO. 12 (7): 2921–8. ЧВК  413545. PMID  8335006.
  4. ^ Hüttenhofer A, Kiefmann M, Meier-Ewert S, O'Brien J, Lehrach H, Bachellerie JP, Brosius J (июнь 2001 г.). «RNomics: экспериментальный подход, который идентифицирует 201 кандидата на новые, маленькие, не передающие РНК у мышей». Журнал EMBO. 20 (11): 2943–53. Дои:10.1093 / emboj / 20.11.2943. ЧВК  125495. PMID  11387227.

внешняя ссылка