Малая ядрышковая РНК SNORD103 - Small nucleolar RNA SNORD103

Малая ядрышковая РНК SNORD103 / SNORD85
RF00188.jpg
Идентификаторы
СимволSNORD103
Альт. СимволыU103
РфамRF00188
Прочие данные
РНК типГен; мяРНК; snoRNA; CD-бокс
Домен (ы)Эукариоты
ИДТИТермин GO должен начинаться с GO: Термин GO должен начинаться с GO:
ТАКТАК: 0000593
PDB структурыPDBe

snoRNA U103 (также известен как SNORD103) это некодирующая РНК (нкРНК) молекула, которая функционирует в модификации других малые ядерные РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно находится в ядрышко эукариотической клетки, которая является основным участком биогенеза мяРНК. Он известен как малая ядрышковая РНК (snoRNA) и также часто упоминается как направляющая РНК.

snoRNA U103 принадлежит к C / D коробка класс snoRNA, которые содержат консервативные мотивы последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства боксов C / D действуют в направлении сайт-специфичных 2'-O-метилирование субстратных РНК.[1]

U103 был идентифицирован путем компьютерного скрининга интронов рибосомальный белок гены для консервативных мотивов последовательности C / D-бокса и экспрессия, экспериментально подтвержденная северный блоттинг.[2]

Предполагается, что U103 руководит метилированием 2'O-рибозы 18S. рибосомная РНК (рРНК) остаток G601.[2][3] Как в геноме человека, так и в геноме мыши есть две копии гена U103 (называемые U103A или SNORD103A и U103B или SNORD103B), расположенные внутри интроны 17 и 21 гена PUM1.[2]

Рекомендации

  1. ^ Galardi, S .; Fatica, A .; Бачи, А .; Scaloni, A .; Presutti, C .; Боццони, И. (октябрь 2002 г.). «Очищенные бокс-C / D snoRNP способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro». Молекулярная и клеточная биология. 22 (19): 6663–6668. Дои:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. ЧВК  134041. PMID  12215523.
  2. ^ а б c Виталий П., Ройо Х., Зейтц Х., Bachellerie JP, Hüttenhofer A, Cavaillé J (2003). «Идентификация 13 новых управляющих РНК человека». Нуклеиновые кислоты Res. 31 (22): 6543–51. Дои:10.1093 / нар / gkg849. ЧВК  275545. PMID  14602913.
  3. ^ Лестрейд, Лоран; Вебер, Мишель Дж. (2006). "snoRNA-LBME-db, всеобъемлющая база данных человеческих H / ACA и C / D box snoRNAs". Исследования нуклеиновых кислот. 34 (Приложение 1: Проблема с базой данных): D158 – D162. CiteSeerX  10.1.1.105.7552. Дои:10.1093 / nar / gkj002. ЧВК  1347365. PMID  16381836.

внешняя ссылка