Малая ядрышковая РНК SNORD64 - Small nucleolar RNA SNORD64
| Малоядерная РНК SNORD64 | |
|---|---|
 Предсказанный вторичная структура и сохранение последовательности из SNORD64 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | SNORD64 |
| Альт. Символы | snoHBII-13 |
| Рфам | RF00570 |
| Прочие данные | |
| РНК тип | Ген; мяРНК; snoRNA; C / D-бокс |
| Домен (ы) | Эукариоты |
| ИДТИ | Термин GO должен начинаться с GO: Термин GO должен начинаться с GO: |
| ТАК | ТАК: 0000593 |
| PDB структуры | PDBe |
SNORD64 (также известен как HBII-13) это некодирующая РНК (нкРНК) молекула, которая участвует в биогенезе (модификации) других малые ядерные РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК находится в ядрышко эукариотической клетки, которая является основным участком биогенеза мяРНК. Он известен как малая ядрышковая РНК (snoRNA) и также часто упоминается как направляющая РНК.
SNORD64 принадлежит к C / D коробка класс snoRNA, которые содержат консервативные мотивы последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства боксов C / D действуют в направлении сайт-специфичных 2'-O-метилирование субстратных РНК.[1]
snoRNA HBII-13 экспрессируется в основном в тканях мозга, но также в легких, почках и мышцах;[2] однако HBII-13 не имеет идентифицированной целевой РНК.[3]Ген HBII-13 расположен в 460 т.п.н. интрон большого отечески выраженного блок транскрипции (SNURF-SNRNP -UBE3A AS) вместе с несколькими другими мяРНК HBII-436, HBII-437, HBII-438A / B и кластерами HBII-85, HBII-52.[4] Этот ген-хозяин представляет собой антисмысловой транскрипт материнского гена UBE3A.
Рекомендации
- ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (октябрь 2002 г.). «Очищенные бокс-C / D snoRNP способны воспроизводить сайт-специфичное 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro». Молекулярная и клеточная биология. 22 (19): 6663–8. Дои:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. ЧВК 134041. PMID 12215523.
- ^ Cavaillé J, Buiting K, Kiefmann M, Lalande M, Brannan CI, Horsthemke B, Bachellerie JP, Brosius J, Hüttenhofer A (декабрь 2000 г.). «Идентификация специфичных для мозга и импринтированных генов малых ядрышек РНК, демонстрирующих необычную геномную организацию». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 97 (26): 14311–6. Дои:10.1073 / pnas.250426397. ЧВК 18915. PMID 11106375.
- ^ Лестрейд Л., Вебер М.Дж. (январь 2006 г.). "snoRNA-LBME-db, всеобъемлющая база данных человеческих H / ACA и C / D box snoRNAs". Исследования нуклеиновых кислот. 34 (Проблема с базой данных): D158-62. CiteSeerX 10.1.1.105.7552. Дои:10.1093 / nar / gkj002. ЧВК 1347365. PMID 16381836.
- ^ Runte M, Hüttenhofer A, Gross S, Kiefmann M, Horsthemke B, Buiting K (ноябрь 2001 г.). «Транскрипт IC-SNURF-SNRPN служит хозяином для множества видов малых ядрышковых РНК и антисмысловой РНК для UBE3A». Молекулярная генетика человека. 10 (23): 2687–700. Дои:10.1093 / hmg / 10.23.2687. PMID 11726556.
внешняя ссылка
 | Этот молекулярный или же клеточная биология статья - это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |