Малая ядрышковая РНК SNORD93 - Small nucleolar RNA SNORD93

Малоядерная РНК SNORD93
RF00606.jpg
Идентификаторы
СимволSNORD93
РфамRF00606
Прочие данные
РНК типГен; мяРНК; snoRNA; C / D-бокс
Домен (ы)Эукариоты
ИДТИТермин GO должен начинаться с GO: Термин GO должен начинаться с GO:
ТАКТАК: 0000593
PDB структурыPDBe

Малоядерная РНК SNORD93 (также известный как HBII-336) является некодирующая РНК (нкРНК) молекула, которая участвует в биогенезе (модификации) других малые ядерные РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК находится в ядрышко эукариотической клетки, которая является основным участком биогенеза мяРНК. Он известен как малая ядрышковая РНК (snoRNA) и также часто упоминается как направляющая РНК.

SNORD93 принадлежит к C / D коробка класс snoRNA, которые содержат мотивы бокса C (UGAUGA) и D (CUGA). Большинство членов семейства боксов C / D действуют в направлении сайт-специфичных 2'-O-метилирование субстратных РНК.[1] Эта snoRNA - человеческая ортолог мышиной snoRNA MBII-336.[2]Предполагается, что SNORD93 управляет метилированием 2'O-рибозы 18S. рибосомная РНК (рРНК) остаток A576.[3]Кроме того, SNORD93 может быть преобразован в более мелкий микроРНК-подобный фрагмент (называемый РНК, производной от snoRNA (sdRNA)), который способствует злокачественному фенотипу рака молочной железы.[4]Было показано, что обработанный фрагмент (sdRNA-93) нацелен на Pipox, белок, связанный с метаболизмом саркозина, экспрессия которого значительно коррелирует с различными молекулярными подтипами рака груди.

Рекомендации

  1. ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (октябрь 2002 г.). «Очищенные бокс-C / D snoRNP способны воспроизводить сайт-специфичное 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro». Молекулярная и клеточная биология. 22 (19): 6663–8. Дои:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. ЧВК  134041. PMID  12215523.
  2. ^ Hüttenhofer A, Kiefmann M, Meier-Ewert S, O'Brien J, Lehrach H, Bachellerie JP, Brosius J (июнь 2001 г.). «RNomics: экспериментальный подход, который идентифицирует 201 кандидата на новые, маленькие, не передающие РНК у мышей». Журнал EMBO. 20 (11): 2943–53. Дои:10.1093 / emboj / 20.11.2943. ЧВК  125495. PMID  11387227.
  3. ^ Лестрейд Л., Вебер М.Дж. (январь 2006 г.). "snoRNA-LBME-db, всеобъемлющая база данных человеческих H / ACA и C / D box snoRNAs". Исследования нуклеиновых кислот. 34 (Проблема с базой данных): D158-62. CiteSeerX  10.1.1.105.7552. Дои:10.1093 / nar / gkj002. ЧВК  1347365. PMID  16381836.
  4. ^ Паттерсон Д.Г., Робертс Д.Т., Кинг В.М., Хаусрова Д., Барнхилл Е.К., Круселло А., Польска С.Дж., Брантли Л.В., Кауфман Г.С., Нгуен М., Сантана М.В., Шиллер И.А., Спиччиани Д.С., Сапата А.К., Миллер М.М., Шерман Т.Д., Ма Р. , Чжао Х., Арора Р., Коли А.Б., Зейдан М.М., Тан М., Си Й., Борхерт Г.М. (2017). «Человеческая snoRNA-93 преобразуется в микроРНК-подобную РНК, которая способствует инвазии клеток рака груди». NPJ рака груди. 3: 25. Дои:10.1038 / s41523-017-0032-8. ЧВК  5503938. PMID  28702505.

внешняя ссылка