Малая ядрышковая РНК SNORD66 - Small nucleolar RNA SNORD66
| Малая ядрышковая РНК SNORD66 | |
|---|---|
 Предсказанный вторичная структура и сохранение последовательности из SNORD66 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | SNORD66 |
| Альт. Символы | snoHBII-142 |
| Рфам | RF00572 |
| Прочие данные | |
| РНК тип | Ген; мяРНК; snoRNA; C / D-бокс |
| Домен (ы) | Эукариоты |
| ИДТИ | Термин GO должен начинаться с GO: Термин GO должен начинаться с GO: |
| ТАК | ТАК: 0000593 |
| PDB структуры | PDBe |
SNORD66 (также известный как HBII-142) является некодирующая РНК (нкРНК) молекула, которая функционирует в модификации других малые ядерные РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно находится в ядрышко эукариотической клетки, которая является основным участком биогенеза мяРНК. Он известен как малая ядрышковая РНК (snoRNA) и также часто упоминается как направляющая РНК.
HBII-142 относится к C / D коробка класс snoRNA, которые содержат консервативные мотивы последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства боксов C / D действуют в направлении сайт-специфичных 2'-O-метилирование субстратных РНК.[1]
HBII-142 является человеческим ортологом мяРНК мыши MBII-142.[2] и предсказано, что он управляет метилированием 2'O-рибозы 18S рибосомная РНК (рРНК) по остатку C1272.[3]
Эксперимент, в котором изучались 22 вида немелкоклеточных рак легких ткани обнаружили, что SNORD33, SNORD66 и SNORD76 были чрезмерно экспрессированы по сравнению с подобранными доброкачественными легочными тканями.[4]
Рекомендации
- ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (октябрь 2002 г.). «Очищенные бокс-C / D snoRNP способны воспроизводить сайт-специфичное 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro». Молекулярная и клеточная биология. 22 (19): 6663–8. Дои:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. ЧВК 134041. PMID 12215523.
- ^ Hüttenhofer A, Kiefmann M, Meier-Ewert S, O'Brien J, Lehrach H, Bachellerie JP, Brosius J (июнь 2001 г.). «RNomics: экспериментальный подход, который идентифицирует 201 кандидата на новые, маленькие, не передающие РНК у мышей». Журнал EMBO. 20 (11): 2943–53. Дои:10.1093 / emboj / 20.11.2943. ЧВК 125495. PMID 11387227.
- ^ Лестрейд Л., Вебер М.Дж. (январь 2006 г.). "snoRNA-LBME-db, всеобъемлющая база данных человеческих H / ACA и C / D box snoRNAs". Исследования нуклеиновых кислот. 34 (Проблема с базой данных): D158-62. CiteSeerX 10.1.1.105.7552. Дои:10.1093 / nar / gkj002. ЧВК 1347365. PMID 16381836.
- ^ Ляо Дж, Ю Л, Мэй И, Гуарнера М., Шен Дж, Ли Р, Лю З, Цзян Ф (июль 2010 г.). «Сигнатуры малой ядрышковой РНК как биомаркеры немелкоклеточного рака легкого». Молекулярный рак. 9: 198. Дои:10.1186/1476-4598-9-198. ЧВК 2919450. PMID 20663213.
внешняя ссылка
 | Этот молекулярный или же клеточная биология статья - это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |