Малая ядрышковая РНК sR8 - Small nucleolar RNA sR8

sR8
SR8.png
консенсусная последовательность sR8
Идентификаторы
СимволsR8
РфамRF01311
Прочие данные
РНК типsnoRNA; CD-бокс
Домен (ы)Sulfolobaceae, Thermococcaceae
PDB структурыPDBe

Малая ядрышковая РНК sR8 это некодирующая РНК принадлежащий к C / D коробка класс snoRNAs. sR8, наряду с другими мяРНК C / D-бокса, выполняет 2'-О-метилирование из рибоза на целевой нити рибосомная РНК.[1][2] Таргетинг достигается с помощью компонентов блока C и D, которые представляют собой короткие разделы консервативные последовательности, а также коробки C '/ D' (внутренние эквиваленты коробок C и D). Эти последовательности пара оснований с нуклеотиды в целевой рРНК, чтобы направить их метилирование.[3]

РНК sR8 действует вместе с белковыми компонентами в рибонуклеопротеин (РНП) комплекс. sR8 способен управлять метилированием мишеней, обнаруженных в структурированных стебель-петли, из чего следует, что компонент комплекса способен раскручивать такие конструкции.[3]

Как модельная система

sR8 считается `` моделью ''[3] C / D box sRNA и была использована в нескольких экспериментах по изучению природы C / D box snoRNA и рибонуклеопротеидных комплексов.[4][5] Это особенно полезно в исследованиях, потому что RNP может быть полностью построена in vitro.[3]

sR8 РНК из гипертермофил Methanocaldococcus jannaschii использовался, чтобы прояснить 3-х мерный структура C / D коробки RNP.[6] Неожиданно было обнаружено, что структура является димерной, в которой две молекулы РНК связываются с несколькими белками в одном комплексе.[6][7]

Рекомендации

  1. ^ Galardi, S .; Fatica, A .; Бачи, А .; Scaloni, A .; Presutti, C .; Боццони, И. (октябрь 2002 г.). «Очищенные бокс-C / D snoRNP способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro». Молекулярная и клеточная биология. 22 (19): 6663–6668. Дои:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. ЧВК  134041. PMID  12215523.
  2. ^ Поцелуй-Ласло, Z; Генри Y; Bachellerie JP; Caizergues-Ferrer M; Поцелуй Т (1996). «Сайт-специфическое метилирование рибозы прерибосомальной РНК: новая функция для малых ядрышковых РНК». Клетка. 85 (7): 1077–1088. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81308-2. PMID  8674114.
  3. ^ а б c d Appel CD, Maxwell ES (июнь 2007 г.). «Структурные особенности руководства: дуплекс РНК-мишени, необходимый для 2'-O-метилирования нуклеотидов C / D sRNA, контролируемого архейным боксом». РНК. 13 (6): 899–911. Дои:10.1261 / rna.517307. ЧВК  1869030. PMID  17438123.
  4. ^ Tran, E .; Чжан, X .; Lackey, L .; Максвелл, Э. С. (2005). «Для эффективного 2'-O-метилирования РНК-мишеней требуется консервативное расстояние между бокс-C / D и C '/ D' RNP комплекса архейного бокса C / D sRNP». РНК. 11 (3): 285–293. Дои:10.1261 / rna.7223405. ЧВК  1370718. PMID  15661846.
  5. ^ Рашид Р., Айтталеб М., Чен К., Шпигель К., Демелер Б., Ли Х. (октябрь 2003 г.). «Функциональные требования для симметричной сборки малых рибонуклеопротеиновых частиц C / D архейного бокса». J. Mol. Биол. 333 (2): 295–306. Дои:10.1016 / j.jmb.2003.08.012. PMID  14529617.
  6. ^ а б Блейхерт Ф., Ганьон К.Т., Браун Б.А. и др. (Сентябрь 2009 г.). «Димерная структура архейного бокса C / D малых рибонуклеопротеинов». Наука. 325 (5946): 1384–7. Дои:10.1126 / science.1176099. ЧВК  2975540. PMID  19745151.
  7. ^ «Исследование показывает неожиданную древнюю клеточную структуру». PhysOrg.com.

внешняя ссылка