Малая ядрышковая РНК SNORD34 - Small nucleolar RNA SNORD34

Малая ядрышковая РНК SNORD34
RF00147.jpg
Идентификаторы
СимволSNORD34
Альт. СимволыU34
РфамRF00147
Прочие данные
РНК типГен; мяРНК; snoRNA; CD-бокс
Домен (ы)Эукариоты
ИДТИТермин GO должен начинаться с GO: Термин GO должен начинаться с GO:
ТАКТАК: 0000593
PDB структурыPDBe

snoRNA U34 (также известен как SNORD34) это некодирующая РНК (нкРНК) молекула, которая функционирует в модификации других малые ядерные РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно находится в ядрышко эукариотической клетки, которая является основным участком биогенеза мяРНК. Он известен как малая ядрышковая РНК (snoRNA) и также часто упоминается как направляющая РНК.

snoRNA U34 принадлежит к C / D коробка класс snoRNA, которые содержат консервативные мотивы последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства боксов C / D действуют в направлении сайт-специфичных 2'-O-метилирование субстратных РНК.[1]

snoRNA U34 первоначально была охарактеризована компьютерным скринингом и в геноме человека кодируется в интроне 5 гена рибосомальный белок L13a.[2] Предполагается, что U34 управляет сайт-специфическим 2'-O-метилированием 25S рРНК. Необычно для snoRNA, хотя для выбора целевого нуклеотида требуется антисмысловой элемент и консервативный бокс D или D 'snoRNA, в случае snoRNP U34 предполагается, что активность метилтрансферазы находится в одном из белковых компонентов.[1] U34 snoRNA имеет гомологи у мышей Arabidopsis (обозначено как snoR4) и в нескольких копиях у риса (альтернативно названо snoZ181).[3]

Рекомендации

  1. ^ а б Galardi, S .; Fatica, A .; Бачи, А .; Scaloni, A .; Presutti, C .; Боццони, И. (октябрь 2002 г.). «Очищенные бокс-C / D snoRNP способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro». Молекулярная и клеточная биология. 22 (19): 6663–6668. Дои:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. ЧВК  134041. PMID  12215523.
  2. ^ Николосо М., Ку Л.Х., Мишо Б., Bachellerie JP (1996). «Кодируемые интроном антисмысловые малые ядрышковые РНК: характеристика девяти новых видов указывает на их прямую роль в качестве проводников для 2'-O-рибозы метилирования рРНК». J. Mol. Биол. 260 (2): 178–95. Дои:10.1006 / jmbi.1996.0391. PMID  8764399.
  3. ^ Чен К.Л., Лян Д., Чжоу Х., Чжо М., Чен Ю.К., Цюй Л.Х. (2003). «Высокое разнообразие snoRNA в растениях: идентификация и сравнительное исследование 120 генов snoRNA Oryza sativa». Нуклеиновые кислоты Res. 31 (10): 2601–13. Дои:10.1093 / нар / gkg373. ЧВК  156054. PMID  12736310.

внешняя ссылка