Малая ядрышковая РНК SNORD95 - Small nucleolar RNA SNORD95

Малая ядрышковая РНК SNORD95
RF00189.jpg
Идентификаторы
СимволSNORD95
Альт. СимволыU95
РфамRF00189
Прочие данные
РНК типГен; мяРНК; snoRNA; C / D-бокс
Домен (ы)Эукариоты
ИДТИТермин GO должен начинаться с GO: Термин GO должен начинаться с GO:
ТАКТАК: 0000593
PDB структурыPDBe

snoRNA U95 (также известен как SNORD95 или же Z38) это некодирующая РНК (нкРНК) молекула, которая функционирует в модификации других малые ядерные РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно находится в ядрышко эукариотической клетки, которая является основным участком биогенеза мяРНК. Он известен как малая ядрышковая РНК (snoRNA) и также часто упоминается как направляющая РНК.

snoRNA U95 принадлежит к C / D коробка класс snoRNA, которые содержат консервативные мотивы последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства боксов C / D действуют в направлении сайт-специфичных 2'-O-метилирование субстратных РНК.[1]

U95 был идентифицирован путем компьютерного скрининга интронов рибосомальный белок гены для консервативных мотивов последовательности C / D-бокса и экспрессия, экспериментально подтвержденная северный блоттинг.[2]Предполагается, что U95 управляет метилированием 2'O-рибозы 28S остатков рибосомной РНК (рРНК) A2802 и C2811.[2][3]

Рекомендации

  1. ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (октябрь 2002 г.). «Очищенные бокс-C / D snoRNP способны воспроизводить сайт-специфичное 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro». Молекулярная и клеточная биология. 22 (19): 6663–8. Дои:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. ЧВК  134041. PMID  12215523.
  2. ^ а б Виталий П., Ройо Х., Зейтц Х., Bachellerie JP, Hüttenhofer A, Cavaillé J (ноябрь 2003 г.). «Идентификация 13 новых управляющих РНК человека». Исследования нуклеиновых кислот. 31 (22): 6543–51. Дои:10.1093 / нар / gkg849. ЧВК  275545. PMID  14602913.
  3. ^ Лестрейд Л., Вебер М.Дж. (январь 2006 г.). "snoRNA-LBME-db, всеобъемлющая база данных человеческих H / ACA и C / D box snoRNAs". Исследования нуклеиновых кислот. 34 (Проблема с базой данных): D158-62. CiteSeerX  10.1.1.105.7552. Дои:10.1093 / nar / gkj002. ЧВК  1347365. PMID  16381836.

внешняя ссылка