Малая ядрышковая РНК TBR4 - Small nucleolar RNA TBR4
| snoTBR4 | |
|---|---|
 Предсказанный вторичная структура и сохранение последовательности малой ядрышковой РНК TBR4 | |
| Идентификаторы | |
| Рфам | RF02787 |
| Прочие данные | |
| Домен (ы) | Эукариоты |
| ИДТИ | Термин GO должен начинаться с GO:,Термин GO должен начинаться с GO: |
| ТАК | ТАК: 0000593 |
| PDB структуры | PDBe |
Малая ядрышковая РНК TBR4 это некодирующая РНК (нкРНК) молекула, идентифицированная в Trypanosoma brucei который функционирует в модификации других малые ядерные РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно находится в ядрышко эукариотической клетки, которая является основным участком биогенеза мяРНК. Он известен как малая ядрышковая РНК (snoRNA) и также часто упоминается как направляющая РНК.
snoRNA TBR4 принадлежит к C / D коробка класс snoRNA, которые содержат консервативные мотивы последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства боксов C / D направляют сайт-специфичные 2'-O-метилирование субстратных РНК.[1]
TBR4 был одной из семнадцати snoRNAs, идентифицированных в Trypanosoma brucei к иммунопреципитация с антителами против фибрилларина.[2] Вместе с TBR12, TBR6 и TBR2 это часть генного кластера мяРНК, которая повторяется тандемно. Эти 4 гена snoRNA транскрибируются как транскрипт полицистронной РНК.[3]
Другие мяРНК
Рекомендации
- ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (октябрь 2002 г.). «Очищенные бокс-C / D snoRNP способны воспроизводить сайт-специфичное 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro». Молекулярная и клеточная биология. 22 (19): 6663–8. Дои:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. ЧВК 134041. PMID 12215523.
- ^ а б Данбар Д.А., Вормсли С., Лоу TM, Басерга С.Дж. (май 2000 г.). «Фибрилларин-ассоциированные малые ядрышковые C / D-бокс-РНК в Trypanosoma brucei. Консервация последовательности и значение 2'-O-рибозного метилирования рРНК». Журнал биологической химии. 275 (19): 14767–76. Дои:10.1074 / jbc.m001180200. PMID 10747997.
- ^ Данбар Д.А., Чен А.А., Вормсли С., Басерга С.Дж. (август 2000 г.). «Гены малых ядрышковых РНК в Trypanosoma brucei организованы в кластеры и транскрибируются как полицистронная РНК». Исследования нуклеиновых кислот. 28 (15): 2855–61. Дои:10.1093 / nar / 28.15.2855. ЧВК 102681. PMID 10908346.