Сьюзан Голден - Susan Golden - Wikipedia
Сьюзан С. Голден | |
---|---|
Национальность | Американец |
Альма-матер | Б.А. в Биология из Университет Миссисипи для женщин (1978), Кандидат наук. в Генетика от Университет Миссури (1983) |
Научная карьера | |
Поля | Хронобиология, Биоинженерия |
Учреждения | Чикагский университет (1983), Техасский университет A&M (1986), UCSD Отделение биологических наук (2008) |
Сьюзан Голден (урожденная Стивенс) родилась в Пайн-Блафф, штат Арканзас, в 1957 году.[1] Она ходила в местную государственную среднюю школу, где участвовала в составлении оркестра и школьной газеты. Ее приняли в Университет Миссисипи для женщин В 1976 г. стал специализироваться по журналистике, но вскоре переключился на специализацию по биологии и химию.
Голден окончила MUW за два года, после чего ей предложили место в первой группе стажеров в Национальные институты здравоохранения США -финансируется докторская программа по генетике в Университет Миссури. Во время учебы в аспирантуре Голден познакомилась со своим мужем, Джеймсом Голденом, еще одним студентом программы NIH.[2] Они поженились в 1979 году. В Университете Миссури Голден исследовал белковый состав фотосинтетический центр в цианобактерии, работу она продолжила, когда переехала в Чикагский университет в 1983 году в качестве научного сотрудника с докторской степенью NIH.[1]
В 1986 году Голден принял должность преподавателя в Техас A&M для дальнейшего расследования светозависимых генная регуляция в бактериях. Именно в Texas A&M Голден впервые познакомился с Drs. Карл Х. Джонсон и Такао Кондо (два других исследователя, ответственные за открытие Кай комплекс) и впервые заинтересовался изучением циркадные ритмы.[2] Д-р Голден был назначен заслуженным профессором Техасского A&M в 2003 году, а затем перешел в UCSD в 2008 году, где она в настоящее время является заслуженным профессором и директором Центра циркадной биологии.[3]
Вклад в исследования
Ранняя работа
Доктор Голден начала свою аспирантуру в лаборатории доктора Луи А. Шермана, где она работала над разработкой генетических подходов к исследованию белкового состава фотосинтетических комплексов цианобактерий. Synechoccus elongatus. Голден был первым, кто продемонстрировал, что мутантный аллель ген psbA достаточно, чтобы дать гербицид устойчивость цианобактерий.[2] Другое исследование позже подтвердило, что этот ген кодирует белок, являющийся неотъемлемой частью фотосинтетического комплекса. Фотосистема II сложный.[4] Эти результаты также продемонстрировали, что генетические манипуляции с цианобактериями были несложными, открыв S. elongatus как модельный организм для будущих генетических экспериментов.[2] Во время ее постдокторского исследования в Чикагском университете в лаборатории Доктор Роберт Хазелкорн Доктор Голден продолжал работать над разработкой методов генетической манипуляции Synechoccus elongatus с целью выяснения механизмов регуляции генов фотосинтеза. В 1989 году команда доктора Голдена обнаружила, что конкретный аллель psbA, экспрессируемый цианобактериями, зависит от условий освещения, в которых выращивалась колония.[5] Это открытие привело ее к более общему исследованию того, как свет влияет на экспрессию фотосинтетических генов в организме,[6] и способствовал общему пониманию реакции бактерий на воздействие окружающей среды.[7] Это направление исследований потребовало разработки техники для визуализации изменений в экспрессии генов в живых организмах. Будучи профессором Техасского A&M, Голден попытался решить эту проблему, прикрепив люцифераза ген к промоутеры интересующих генов цианобактерий и просмотр колоний с прицел ночного видения.[2] Подход оказался успешным, позволив количественно оценить экспрессию генов цианобактерий. in vivo в течение длительного периода времени. Эта техника привлекла внимание хронобиолог Доктор Карл Х. Джонсон, с которым доктор Голден продолжил сотрудничать в открытии комплекса KaiABC.[2]
Открытие комплекса кай
Голден изучает эндогенный ритмы цианобактерии, группа прокариот показала, что циркадный часы. Она трансформировала Synechococcus elongatus, одну из наиболее изученных моделей, с помощью люцифераза репортерный ген и показал циркадный ритм в биолюминесценции. Это было использовано для открытия цианобактериальных часов, основанных на трех белках: KaiA, KaiB, и KaiC. В сотрудничестве с Карл Х. Джонсон и Такао Кондо, она продемонстрировала циркадные ритмы у S. elongatus PCC 7942,[8] единственный модельный организм для прокариотический циркадные часы.[3] Сьюзан Голден идентифицирует гены у S. elongatus геном которые способствуют циркадный ритм через обратная генетика, создавая мутация в гене и скрининг на мутант фенотипы. Транспозоны вставлены для рекомбинации в геном, производя нокаут гена.[3] В одном исследовании девятнадцать часовых мутаций были сопоставлены с тремя кай гены, и инактивация любого отдельного гена kai отменила циркадный ритм экспрессии KaiA и KaiB и снижение активности промотора kaiBC.[9]
Циркадная система белка кай
S. elongatus имеет циркадные часы с осциллятором, основанным только на трех белки, KaiA, KaiB и KaiC где ритм генерируется на основе KaiC фосфорилирование и дефосфорилирование in vitro. Фотосинтез используется для отправки световой информации, что приводит к выходам с синхронизацией, влияющим на транскрипция. Этот 24-часовой ритм можно воссоздать in vitro с добавлением АТФ.[10] Соотношение АТФ /ADP колеблется в течение дня и воспринимается KaiC, который фосфорилирует или дефосфорилирует на основе этого сигнала. Эта белковая система Kai является самой простой посттрансляционный осциллятор известен до сих пор.
В фотосинтезе цианобактерии, свет запускает часы, а тьма сбрасывает их. Когда Голден мутировал ген cikA, часы не могли быть сброшены (что приводило к постоянному расстройство суточного биоритма в связи с дальним перелетом ), но часы продолжали работать. CikA содержал белковый домен, похожий на KaiA, что также оказалось важным при сбросе часов. CikA и KaiA связываются с хиноны, которые несут электроны в электронная транспортная цепь из фотосинтез. Хиноны окисляются в темноте и восстанавливаются на свету, а редокс состояние влияет на активность KaiA. Когда хиноны окисляются, KaiA отделяется от KaiC и связывается с ними, сбрасывая часы. Следовательно, хиноны необходимы для передачи световой информации в KaiC.[2]
Текущее исследование
Метаболическая инженерия
После переезда в UCSD в 2008 году исследования Сьюзан Голден совпали с исследованиями ее мужа Джеймса Голдена, чтобы исследовать биотопливо.[2] Она проводит исследование, посвященное использованию цианобактерии для промышленных целей. Цианобактерии привлекательные модельный организм из-за упрощенных геномов и их использования фотосинтез, и их можно было использовать для замены нефть топлива в будущем за счет производства биотопливо.[3] Цианобактерии также быстро растут и фиксируют атмосферный углерод, превращая углекислый газ в биомассу, которая затем может быть преобразована в биомасла и биотопливо. Им нужен только солнечный свет, вода и неорганические микроэлементы для роста, а также прямая фиксация углерода для биотоплива.[11]
В 2016 году Голден и его коллеги вручную создали модель метаболизма S. elongates, указав на важность линейного TCA (цикл трикарбоновых кислот) и открытие модели, лежащей в основе метаболического дизайна.[12]
Почести и награды[2]
- Премия Президента Национальному научному фонду молодому исследователю, 1989–1995 гг.
- Стипендия Американской академии микробиологии, 2000 г.
- Заслуженный профессор A&M Техаса, 2003 г.
- Член факультета 1000 биологии
- Член Национальной Академии Наук
- Профессор Медицинского института Говарда Хьюза
- Почетный профессор Калифорнийского университета в Сан-Диего и председатель совета директоров
- Лауреат премии Honma (2018)
Избранные публикации
- Кондо Т., Страйер К.А., Кулкарни Р.Д., Тейлор В., Ишиура М., Голден СС, Джонсон С.Х. (1993). «Циркадные ритмы у прокариот: люцифераза как репортер экспрессии циркадных генов у цианобактерий». Proc Natl Acad Sci USA. 90 (12): 5672–6. Дои:10.1073 / pnas.90.12.5672. ЧВК 46783. PMID 8516317.CS1 maint: несколько имен: список авторов (связь)
- Кондо Т., Циноремас Н.Ф., Голден СС, Джонсон С.Х., Куцуна С., Ишиура М. (1994). «Циркадные часы мутанты цианобактерий». Наука. 266 (5188): 1233–6. Дои:10.1126 / science.7973706. PMID 7973706.CS1 maint: несколько имен: список авторов (связь)
- Лю Ю., Голден СС, Кондо Т., Ишиура М., Джонсон С.Х. (1995). «Бактериальная люцифераза как репортер экспрессии циркадных генов у цианобактерий». J Бактериол. 177 (8): 2080–6. Дои:10.1128 / jb.177.8.2080-2086.1995. ЧВК 176852. PMID 7536731.CS1 maint: несколько имен: список авторов (связь)
- Золотой СС (1995). «Экспрессия светочувствительных генов в цианобактериях». J Бактериол. 177 (7): 1651–4. Дои:10.1128 / jb.177.7.1651-1654.1995. ЧВК 176789. PMID 7896684.
- Лю Ю., Циноремас Н.Ф., Джонсон С.Х., Лебедева Н.В., Голден СС, Ишиура М., Кондо Т. (1995). «Циркадная оркестровка экспрессии генов у цианобактерий». Genes Dev. 9 (12): 1469–78. Дои:10.1101 / gad.9.12.1469. PMID 7601351.CS1 maint: несколько имен: список авторов (связь)
- Циноремас Н.Ф., Ишиура М., Кондо Т., Андерссон К.Р., Танака К., Такахаши Н., Джонсон С.Х., Голден СС (1996). «Сигма-фактор, который изменяет циркадную экспрессию подмножества генов цианобактерий». EMBO J. 15 (10): 2488–95. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00606.x. ЧВК 450181. PMID 8665856.CS1 maint: несколько имен: список авторов (связь)
- Джонсон СН, Голден СС, Ишиура М, Кондо Т (1996). «Циркадные часы прокариот». Мол Микробиол. 21 (1): 5–11. Дои:10.1046 / j.1365-2958.1996.00613.x. PMID 8843429.CS1 maint: несколько имен: список авторов (связь)
- Кондо Т., Мори Т., Лебедева Н.В., Аоки С., Ишиура М., Golden SS (1997). «Циркадные ритмы у быстро делящихся цианобактерий». Наука. 275 (5297): 224–7. Дои:10.1126 / science.275.5297.224. PMID 8985018.CS1 maint: несколько имен: список авторов (связь)
- Голден СС, Ишиура М, Джонсон СН, Кондо Т (1997). «Цианобактериальные циркадные ритмы». Анну Рев Завод Физиол Растение Мол Биол. 48: 327–354. Дои:10.1146 / annurev.arplant.48.1.327. PMID 15012266.CS1 maint: несколько имен: список авторов (связь)
- Оуян Y, Андерссон CR, Кондо Т, Голден СС, Джонсон CH (1998). «Резонирующие циркадные часы улучшают физическую форму цианобактерий». Proc Natl Acad Sci USA. 95 (15): 8660–4. Дои:10.1073 / пнас.95.15.8660. ЧВК 21132. PMID 9671734.CS1 maint: несколько имен: список авторов (связь)
- Ишиура М., Куцуна С., Аоки С., Ивасаки Х., Андерссон С.Р., Танабе А., Голден СС, Джонсон С.Х., Кондо Т. (1998). «Экспрессия кластера генов kaiABC как циркадный процесс обратной связи у цианобактерий». Наука. 281 (5382): 1519–23. Дои:10.1126 / science.281.5382.1519. PMID 9727980.CS1 maint: несколько имен: список авторов (связь)
- Джонсон СН, Голден СС, Кондо Т (1998). «Адаптивное значение циркадных программ у цианобактерий». Тенденции Microbiol. 6 (10): 407–10. Дои:10.1016 / s0966-842x (98) 01356-0. PMID 9807785.CS1 maint: несколько имен: список авторов (связь)
- Голден СС, Джонсон СН, Кондо Т (1998). «Циркадная система цианобактерий: на расстоянии часов». Curr Opin Microbiol. 1 (6): 669–73. Дои:10.1016 / с 1369-5274 (98) 80113-6. PMID 10066545.CS1 maint: несколько имен: список авторов (связь)
- Катаяма М., Циноремас Н.Ф., Кондо Т., Golden SS (1999). «cpmA, ген, участвующий в сигнальном пути циркадной системы цианобактерий». J Бактериол. 181 (11): 3516–24. Дои:10.1128 / JB.181.11.3516-3524.1999. ЧВК 93820. PMID 10348865.CS1 maint: несколько имен: список авторов (связь)
- Джонсон CH, Golden SS (1999). «Циркадные программы у цианобактерий: адаптивность и механизм». Анну Рев Микробиол. 53: 389–409. Дои:10.1146 / annurev.micro.53.1.389. PMID 10547696.
- Андерссон ЧР, Циноремас Н.Ф., Шелтон Дж., Лебедева Н.В., Ярроу Дж., Мин Х., Голден СС (2000). «Применение биолюминесценции для изучения циркадных ритмов цианобактерий». Методы Энзимол. Методы в энзимологии. 305: 527–42. Дои:10.1016 / s0076-6879 (00) 05511-7. ISBN 9780121822064. PMID 10812624.CS1 maint: несколько имен: список авторов (связь)
- Уильямс С.Б., Ваконакис I, Golden SS, LiWang AC (2002). «Структура и функция циркадного часового белка KaiA Synechococcus elongatus: потенциальный механизм ввода часов». Proc Natl Acad Sci USA. 99 (24): 15357–62. Дои:10.1073 / pnas.232517099. ЧВК 137721. PMID 12438647.CS1 maint: несколько имен: список авторов (связь)
- Дитти JL, Уильямс SB, Golden SS (2003). «Циркадный временной механизм цианобактерий». Анну Рев Жене. 37: 513–43. Дои:10.1146 / annurev.genet.37.110801.142716. PMID 14616072.CS1 maint: несколько имен: список авторов (связь)
- Золотой СС (2003). «Хронометраж в бактериях: циркадные часы цианобактерий». Curr Opin Microbiol. 6 (6): 535–40. Дои:10.1016 / j.mib.2003.10.012. PMID 14662347.
- Золотой СС (2004). «Переключение механизмов циркадных часов цианобактерий». Proc Natl Acad Sci USA. 101 (38): 13697–8. Дои:10.1073 / pnas.0405623101. ЧВК 518819. PMID 15367731.
- Макки С.Р., Золотой СС (2007). «Заводим циркадные часы цианобактерий». Тенденции Microbiol. 15 (9): 381–8. Дои:10.1016 / j.tim.2007.08.005. PMID 17804240.
- Ким Йи, Донг Джи, Каррутерс CW младший, Голден СС, ЛиВанг А (2008). «Переключатель день / ночь в KaiC, центральном компоненте осциллятора циркадных часов цианобактерий». Proc Natl Acad Sci USA. 105 (35): 12825–30. Дои:10.1073 / pnas.0800526105. ЧВК 2529086. PMID 18728181.CS1 maint: несколько имен: список авторов (связь)
- Донг Джи, Золотой СС (2008). «Как цианобактерия определяет время». Curr Opin Microbiol. 11 (6): 541–6. Дои:10.1016 / j.mib.2008.10.003. ЧВК 2692899. PMID 18983934.
- Чен Й, Ким Йи, Макки С.Р., Холтман К.К., Ливанг А., Golden SS (2009). «Новый аллель kaiA сокращает циркадный период и усиливает взаимодействие компонентов осциллятора в цианобактерии Synechococcus elongatus PCC 7942». J Бактериол. 191 (13): 4392–400. Дои:10.1128 / JB.00334-09. ЧВК 2698500. PMID 19395479.CS1 maint: несколько имен: список авторов (связь)
- Донг Джи, Ян Кью, Ван Кью, Ким Йи, Вуд Т.Л., Остерён К.В., Ван Ауденаарден А., Golden SS (2010). «Повышенная активность АТФазы KaiC обеспечивает циркадный контроль деления клеток у Synechococcus elongatus». Клетка. 140 (4): 529–39. Дои:10.1016 / j.cell.2009.12.042. ЧВК 3031423. PMID 20178745.CS1 maint: несколько имен: список авторов (связь)
- Донг Джи, Ким Йи, Golden SS (2010). «Простота и сложность механизма циркадных часов цианобактерий». Curr Opin Genet Dev. 20 (6): 619–25. Дои:10.1016 / j.gde.2010.09.002. ЧВК 2982900. PMID 20934870.CS1 maint: несколько имен: список авторов (связь)
- Коэн С.Е., Golden SS (2015). «Циркадные ритмы цианобактерий». Микробиол Мол Биол Рев. 79 (4): 373–85. Дои:10.1128 / MMBR.00036-15. ЧВК 4557074. PMID 26335718.
- Рубин Б.Е., Ветмор К.М., Прайс М.Н., Даймонд С., Шульцабергер Р.К., Лоу Л.К., Куртин Г., Аркин А.П., Дойчбауэр А., Golden SS (2015). «Основной набор генов фотосинтетического организма». Proc Natl Acad Sci USA. 112 (48): E6634–43. Дои:10.1073 / pnas.1519220112. ЧВК 4672817. PMID 26508635.CS1 maint: несколько имен: список авторов (связь)
- Ценг Р., Гуларте Н.Ф., Чаван А., Луу Дж., Коэн С.Е., Чанг Ю.Г., Хейслер Дж., Ли С., Майкл А.К., Трипати С., Голден СС, ЛиВанг А., Партч К.Л. (2017). «Структурные основы перехода дня и ночи в бактериальных циркадных часах». Наука. 355 (6330): 1174–1180. Дои:10.1126 / science.aag2516. ЧВК 5441561. PMID 28302851.CS1 maint: несколько имен: список авторов (связь)
Рекомендации
- ^ а б "SQ Online / В центре внимания: доктор Сьюзан Голден". sqonline.ucsd.edu. Получено 2017-04-12.
- ^ а б c d е ж грамм час я Гупта, Суджата (28 мая 2013 г.). "Профиль Сьюзен С. Голден". Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 110 (22): 8758–8760. Дои:10.1073 / pnas.1305064110. ISSN 0027-8424. ЧВК 3670312. PMID 23620521.
- ^ а б c d "Сьюзен С. Голден". biology.ucsd.edu. Получено 2017-04-12.
- ^ Гуссиас, Харилаос; Буссак, Ален; Резерфорд, Уильям (2002-10-29). «Фотосистема II и фотосинтетическое окисление воды: обзор». Философские труды Королевского общества B: биологические науки. 357 (1426): 1369–1420. Дои:10.1098 / rstb.2002.1134. ISSN 0962-8436. ЧВК 1693055. PMID 12437876.
- ^ Schaefer, M. R .; Голден, С. С. (1989-05-05). «Доступность света влияет на соотношение двух форм D1 в тилакоидах цианобактерий». Журнал биологической химии. 264 (13): 7412–7417. ISSN 0021-9258. PMID 2496127.
- ^ http://www.nasonline.org, Национальная академия наук -. "Сьюзан Голден". www.nasonline.org. Получено 2017-04-12.
- ^ Тандо де Марсак, Николь; Хумар, Жан (1993-01-01). «Адаптация цианобактерий к раздражителям окружающей среды: новые шаги к молекулярным механизмам». Письма о микробиологии FEMS. 104 (1–2): 119–189. Дои:10.1111 / j.1574-6968.1993.tb05866.x. ISSN 0168-6445.
- ^ Коэн, Сьюзен (1 декабря 2015 г.). «Циркадные ритмы цианобактерий». Обзоры микробиологии и молекулярной биологии. 79 (4): 373–385. Дои:10.1128 / MMBR.00036-15. ЧВК 4557074. PMID 26335718.
- ^ Ишиура, Масахиро; Куцуна, Шинсуке; Аоки, Сэцуюки; Ивасаки, Хидео; Андерссон, Кэрол Р .; Танабэ, Акио; Golden, Susan S .; Джонсон, Карл Х .; Кондо, Такао (1998-09-04). «Экспрессия генного кластера kaiABC как циркадный процесс обратной связи в цианобактериях». Наука. 281 (5382): 1519–1523. Дои:10.1126 / science.281.5382.1519. ISSN 0036-8075. PMID 9727980.
- ^ Донг, Гоган (10 ноября 2008 г.). "Как цианобактерии определяют время". Текущее мнение в микробиологии. 11 (6): 541–546. Дои:10.1016 / j.mib.2008.10.003. ЧВК 2692899. PMID 18983934.
- ^ Сарсекеева, Фариза (22 февраля 2015 г.). «Цианотопливо: биотопливо из цианобактерий. Реальность и перспективы». Фотосинтез Исследования. 125 (1): 325–340. Дои:10.1007 / s11120-015-0103-3. PMID 25702086.
- ^ Броддрик, Джаред Т .; Рубин, Бенджамин Е .; Велки, Дэвид Дж .; Ду, Ниу; Мих, Натан; Даймонд, Спенсер; Ли, Дженни Дж .; Golden, Susan S .; Палссон, Бернхард О. (20 декабря 2016 г.). «Уникальные признаки метаболизма цианобактерий, выявленные с помощью улучшенного метаболического моделирования в масштабе генома и анализа основных генов». Труды Национальной академии наук. 113 (51): E8344 – E8353. Дои:10.1073 / pnas.1613446113. ISSN 0027-8424. ЧВК 5187688. PMID 27911809.