TBL1X - TBL1X

TBL1X
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2XTC, 2XTD, 2XTE
Идентификаторы
Псевдонимы	TBL1X, EBI, SMAP55, TBL1, трансдуцин (бета) -подобный 1X-связанный, трансдуцин бета-подобный 1Х-связанный, трансдуцин бета-подобный 1-X-связанный, CHNG8
Внешние идентификаторы	OMIM: 300196 MGI: 1336172 ГомолоГен: 4128 Генные карты: TBL1X
Расположение гена (человек) Chr. Х-хромосома (человек)[1] Группа Xp22.31-p22.2 Начинать 9,463,295 бп[1] Конец 9,741,037 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Х-хромосома (мышь)[2] Группа X B | X 38,31 см Начинать 77,511,013 бп[2] Конец 77,662,983 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание бета-катенина • GO: 0001106 транскрипционная корепрессорная активность • специфическое связывание белкового домена • связывание гистонов • связывание фактора транскрипции • связывание с С-концом белка • GO: 0001948 связывание с белками • идентичное связывание с белками Сотовый компонент • гистондеацетилазный комплекс • транскрипционный репрессорный комплекс • нуклеоплазма • микротрубочка веретена • ядро клетки • митотическое веретено Биологический процесс • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • чувственное восприятие звука • транскрипция, ДНК-шаблон • протеолиз • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • деацетилирование гистонов • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • протеасомный убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс • регуляция липидного обмена • положительная регуляция канонического сигнального пути Wnt • стабилизация белка • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6907	21372
Ансамбль	ENSG00000101849	ENSMUSG00000025246
UniProt	O60907	Q9QXE7
RefSeq (мРНК)	NM_001139466 NM_001139467 NM_001139468 NM_005647	NM_020601
RefSeq (белок)	NP_001132938 NP_001132939 NP_001132940 NP_005638	NP_065626
Расположение (UCSC)	Chr X: 9.46 - 9.74 Мб	Chr X: 77.51 - 77.66 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Трансдуцин (бета) -подобный 1X-связанный, также известный как TBL1X, это белок который у человека кодируется TBL1X ген.^[5]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, имеет сходство последовательностей с членами WD40 повторить -содержащее семейство белков. Группа WD40 - это большое семейство белков, которые, по-видимому, выполняют регуляторную функцию. Считается, что повторы WD40 опосредуют белок-белковые взаимодействия, и члены этого семейства участвуют в преобразование сигнала, Обработка РНК, генная регуляция, везикулярный трафик, сборка цитоскелета и могут играть роль в контроле цитотипической дифференцировки. Этот кодируемый белок находится в виде субъединицы в корепрессор SMRT (медиатор подавления ретиноидов и рецепторов щитовидной железы) комплекс вместе с гистоновая деацетилаза 3 белка. Этот ген расположен рядом с геном глазного альбинизма, и считается, что он участвует в патогенезе глазной альбинизм с поздним началом нейросенсорная глухота фенотип. Этот ген очень похож на ген TBL1Y Y-хромосомы.^[5]

Взаимодействия

TBL1X показал взаимодействовать с:

• GPS2,^[6] и
• HDAC3,^[6][7]
• NCOA1,^[6][7][8][9] и
• NCOA2.^{[7][8][9][10]}

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000101849 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025246 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: TBL1X трансдуцин (бета) -подобный 1X-связанный».
6. Чжан Дж., Калкум М., Чайт Б.Т., Рёдер Р.Г. (март 2002 г.). «Корепрессорный комплекс ядерного рецептора N-CoR-HDAC3 ингибирует путь JNK через интегральную субъединицу GPS2». Мол. Клетка. 9 (3): 611–23. Дои:10.1016 / с1097-2765 (02) 00468-9. PMID  11931768.
7. Guenther MG, Lane WS, Fischle W., Verdin E, Lazar MA, Shiekhattar R (май 2000 г.). «Основной корепрессорный комплекс SMRT, содержащий HDAC3 и TBL1, белок с повторами WD40, связанный с глухотой». Genes Dev. 14 (9): 1048–57. Дои:10.1101 / gad.14.9.1048 (неактивно 10.09.2020). ЧВК  316569. PMID  10809664.
8. Юн Х.Г., Чан Д.В., Хуан Ц.К., Ли Дж., Фонделл Дж.Д., Цинь Дж., Вонг Дж. (Март 2003 г.). «Очистка и функциональная характеристика комплекса N-CoR человека: роли HDAC3, TBL1 и TBLR1». EMBO J. 22 (6): 1336–46. Дои:10.1093 / emboj / cdg120. ЧВК  151047. PMID  12628926.
9. Ли Дж., Ван Дж., Ван Дж., Наваз З., Лю Дж. М., Цинь Дж., Вонг Дж. (Август 2000 г.). «Оба корепрессорных белка SMRT и N-CoR существуют в больших белковых комплексах, содержащих HDAC3». EMBO J. 19 (16): 4342–50. Дои:10.1093 / emboj / 19.16.4342. ЧВК  302030. PMID  10944117.
10. Гюнтер М.Г., Ю.Дж., Као Г.Д., Йен Т.Дж., Лазар М.А. (декабрь 2002 г.). «Сборка репрессионного комплекса SMRT-гистондеацетилаза 3 требует кольцевого комплекса TCP-1». Genes Dev. 16 (24): 3130–5. Дои:10.1101 / gad.1037502. ЧВК  187500. PMID  12502735.

дальнейшее чтение

• Bassi MT, Ramesar RS, Caciotti B, Winship IM, De Grandi A, Riboni M, Townes PL, Beighton P, Ballabio A, Borsani G (1999). «Х-связанная поздняя сенсоневральная глухота, вызванная делецией с участием OA1 и нового гена, содержащего повторы WD-40». Являюсь. J. Hum. Genet. 64 (6): 1604–16. Дои:10.1086/302408. ЧВК  1377903. PMID  10330347.
• Guenther MG, Lane WS, Fischle W., Verdin E, Lazar MA, Shiekhattar R (2000). «Основной корепрессорный комплекс SMRT, содержащий HDAC3 и TBL1, белок с повторами WD40, связанный с глухотой». Genes Dev. 14 (9): 1048–57. Дои:10.1101 / gad.14.9.1048 (неактивно 10.09.2020). ЧВК  316569. PMID  10809664.
• Ли Дж., Ван Дж., Ван Дж., Наваз З., Лю Дж. М., Цинь Дж, Вонг Дж. (2000). «Оба корепрессорных белка SMRT и N-CoR существуют в больших белковых комплексах, содержащих HDAC3». EMBO J. 19 (16): 4342–50. Дои:10.1093 / emboj / 19.16.4342. ЧВК  302030. PMID  10944117.
• Мацузава С.И., Рид Дж.С. (2001). «Siah-1, SIP и Ebi совместно работают над новым путем деградации бета-катенина, связанной с ответами p53». Мол. Клетка. 7 (5): 915–26. Дои:10.1016 / S1097-2765 (01) 00242-8. PMID  11389839.
• Чжан Дж., Калкум М., Чайт Б.Т., Рёдер Р.Г. (2002). «Корепрессорный комплекс ядерного рецептора N-CoR-HDAC3 ингибирует путь JNK через интегральную субъединицу GPS2». Мол. Клетка. 9 (3): 611–23. Дои:10.1016 / S1097-2765 (02) 00468-9. PMID  11931768.
• Юн Х.Г., Чан Д.В., Хуан Ц.К., Ли Дж., Фонделл Дж. Д., Цинь Дж., Вонг Дж. (2003). «Очистка и функциональная характеристика комплекса N-CoR человека: роли HDAC3, TBL1 и TBLR1». EMBO J. 22 (6): 1336–46. Дои:10.1093 / emboj / cdg120. ЧВК  151047. PMID  12628926.
• Юн Х.Г., Чан Д.В., Рейнольдс А.Б., Цинь Дж., Вонг Дж. (2003). «N-CoR опосредует репрессию, зависящую от метилирования ДНК, через метил-CpG-связывающий белок Kaiso». Мол. Клетка. 12 (3): 723–34. Дои:10.1016 / j.molcel.2003.08.008. PMID  14527417.
• Перисси В., Аггарвал А., Гласс С. К., Роуз Д. В., Розенфельд М. Г. (2004). «Обменный комплекс корепрессор / коактиватор, необходимый для активации транскрипции ядерными рецепторами и другими регулируемыми факторами транскрипции». Клетка. 116 (4): 511–26. Дои:10.1016 / S0092-8674 (04) 00133-3. PMID  14980219. S2CID  18807923.
• Юн Х.Г., Чой Й, Коул ПА, Вонг Дж. (2005). «Чтение и функция гистонового кода, участвующего в нацеливании на корепрессорные комплексы для репрессии». Мол. Клетка. Биол. 25 (1): 324–35. Дои:10.1128 / MCB.25.1.324-335.2005. ЧВК  538779. PMID  15601853.
• Герлитц Г., Дархин Э., Джорджио Г., Франко Б., Райнер О. (2005). «Новые функциональные особенности домена Lis-H: роль в димеризации белка, период полужизни и клеточная локализация». Клеточный цикл. 4 (11): 1632–40. Дои:10.4161 / cc.4.11.2151. PMID  16258276.