TFE3 - TFE3

TFE3
Идентификаторы
Псевдонимы	TFE3, RCCP2, RCCX1, TFEA, bHLHe33, связывание фактора транскрипции с энхансером 3 IGHM
Внешние идентификаторы	OMIM: 314310 MGI: 98511 ГомолоГен: 4755 Генные карты: TFE3
Расположение гена (человек) Chr. Х-хромосома (человек)[1] Группа Xp11.23 Начните 49,028,726 бп[1] Конец 49,043,410 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Х-хромосома (мышь)[2] Группа X A1.1 | X 3.5 см Начните 7,762,560 бп[2] Конец 7,775,202 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • активность димеризации белков • Связывание ДНК • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II Сотовый компонент • нуклеоплазма • ядро клетки • цитозоль Биологический процесс • положительная регуляция клеточной адгезии • транскрипция, ДНК-шаблон • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • адаптивный иммунный ответ • регуляция дифференцировки остеокластов • иммунная система • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • гуморальный иммунный ответ • отрицательная регуляция термогенеза, вызванного холодом Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	7030	209446
Ансамбль	ENSG00000068323	ENSMUSG00000000134
UniProt	P19532	Q64092
RefSeq (мРНК)	NM_001282142 NM_006521	NM_001105196 NM_001105197 NM_001271489 NM_001271490 NM_001271491 NM_172472
RefSeq (белок)	NP_001269071 NP_006512	NP_001098666 NP_001098667 NP_001258418 NP_001258419 NP_001258420 NP_766060
Расположение (UCSC)	Chr X: 49.03 - 49.04 Мб	Chr X: 7.76 - 7.78 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор транскрипции E3 это белок что у людей кодируется TFE3 ген.^[5][6][7]

Функция

TFE3, член семейства спираль-петля-спираль факторы транскрипции, связывается с мотивом mu-E3 иммуноглобулин энхансер тяжелой цепи и экспрессируется во многих типах клеток (Henthorn et al., 1991) [поставляется OMIM]^[7]

Взаимодействия

TFE3 показал взаимодействовать с участием:

• E2F3,^[8]
• Фактор транскрипции, связанный с микрофтальмией,^[9][10] и
• Матери против декапентаплегического гомолога 3^[11][12]

Транслокации

Часть карцином почек (ПКР), встречающихся у молодых пациентов, связана с транслокациями с участием гена TFE3 в хромосоме Xp11.2. PRCC

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000068323 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000000134 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Пак Дж. М., Стюарт С. К., Хенторн П. С. (май 1991 г.). «Высокочастотный RFLP в локусе TFE3 человека на Х-хромосоме». Нуклеиновые кислоты Res. 19 (3): 684. Дои:10.1093 / nar / 19.3.684-а. ЧВК  333678. PMID  1672758.
6. Henthorn PS, Stewart CC, Kadesch T., Puck JM (февраль 1992 г.). «Ген, кодирующий человеческий TFE3, фактор транскрипции, который связывает энхансер тяжелой цепи иммуноглобулина, отображается на Xp11.22». Геномика. 11 (2): 374–8. Дои:10.1016/0888-7543(91)90145-5. PMID  1685140.
7. «Ген Entrez: связывание фактора транскрипции TFE3 с энхансером 3 IGHM».
8. Giangrande PH, Hallstrom TC, Tunyaplin C, Calame K, Nevins JR (июнь 2003 г.). «Идентификация фактора E-box TFE3 как функционального партнера для фактора транскрипции E2F3». Мол. Cell. Биол. 23 (11): 3707–20. Дои:10.1128 / mcb.23.11.3707-3720.2003. ЧВК  155231. PMID  12748276.
9. Штайнгримссон Э., Тессаролло Л., Патак Б., Хоу Л., Арнхейтер Х., Коупленд Н.Г., Дженкинс Н.А. (апрель 2002 г.). «Mitf и Tfe3, два члена семейства Mitf-Tfe факторов транскрипции bHLH-Zip, играют важную, но функционально избыточную роль в развитии остеокластов». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (7): 4477–82. Дои:10.1073 / pnas.072071099. ЧВК  123673. PMID  11930005.
10. Mansky KC, Sulzbacher S, Purdom G, Nelsen L, Hume DA, Rehli M, Ostrowski MC (февраль 2002 г.). «Фактор транскрипции микрофтальмии и связанные с ним факторы« спираль-петля-спираль-застежка-молния »TFE-3 и TFE-C взаимодействуют, чтобы активировать устойчивый к тартрату промотор кислой фосфатазы». J. Leukoc. Биол. 71 (2): 304–10. PMID  11818452.
11. Гринберг А.В., Керппола Т. (март 2003 г.). «И Max, и TFE3 взаимодействуют с белками Smad для связывания промотора ингибитора-1 активатора плазминогена, но они имеют противоположные эффекты на транскрипционную активность». J. Biol. Chem. 278 (13): 11227–36. Дои:10.1074 / jbc.M211734200. PMID  12551947.
12. Хуа Х, Миллер З.А., Ву Джи, Ши Й., Лодиш Х.Ф. (ноябрь 1999 г.). «Специфичность трансформирующего фактора роста бета-индуцированной транскрипции гена ингибитора-1 активатора плазминогена: взаимодействия промоторной ДНК, фактора транскрипции muE3 и белков Smad». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 96 (23): 13130–5. Дои:10.1073 / пнас.96.23.13130. ЧВК  23912. PMID  10557285.

дальнейшее чтение

• Бекманн Х., Кадеш Т (1991). «Лейциновая молния TFE3 диктует специфичность димеризации спираль-петля-спираль». Genes Dev. 5 (6): 1057–66. Дои:10.1101 / gad.5.6.1057. PMID  2044953.
• Бекманн Х., Су Л.К., Кадеш Т (1990). «TFE3: белок спираль-петля-спираль, который активирует транскрипцию через мотив muE3 усилителя иммуноглобулина». Genes Dev. 4 (2): 167–79. Дои:10.1101 / gad.4.2.167. PMID  2338243.
• Zhao GQ, Zhao Q, Zhou X, Mattei MG, de Crombrugghe B (1993). «TFEC, основной белок спираль-петля-спираль, образует гетеродимеры с TFE3 и ингибирует TFE3-зависимую активацию транскрипции». Мол. Cell. Биол. 13 (8): 4505–12. Дои:10.1128 / mcb.13.8.4505. ЧВК  360062. PMID  8336698.
• Сидхар С.К., Кларк Дж., Гилл С., Хамуди Р., Экипаж А.Дж., Гвиллиам Р., Росс М., Лайнхан В.М., Бердсолл С., Шипли Дж., Купер С.С. (1997). «Транслокация t (X; 1) (p11.2; q21.2) в папиллярной почечно-клеточной карциноме сливает новый ген PRCC с геном фактора транскрипции TFE3». Гм. Мол. Genet. 5 (9): 1333–8. Дои:10.1093 / hmg / 5.9.1333. PMID  8872474.
• Weterman MA, Wilbrink M, Geurts van Kessel A (1997). «Слияние гена фактора транскрипции TFE3 с новым геном PRCC в t (X; 1) (p11; q21) -позитивных папиллярно-клеточных карциномах почки». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 93 (26): 15294–8. Дои:10.1073 / пнас.93.26.15294. ЧВК  26398. PMID  8986805.
• Кларк Дж, Лу Й.Дж., Сидхар С.К., Паркер С., Гилл С., Смедли Д., Хамуди Р., Лайнхан В.М., Шипли Дж., Купер С.С. (1997). «Слияние генов факторов сплайсинга PSF и NonO (p54nrb) с геном TFE3 при папиллярной почечно-клеточной карциноме». Онкоген. 15 (18): 2233–9. Дои:10.1038 / sj.onc.1201394. PMID  9393982.
• Хуа Х, Лю Х, Ансари Д.О., Лодиш Х.Ф. (1998). «Синергетическое взаимодействие TFE3 и белков smad в индуцированной TGF-бета транскрипции гена ингибитора-1 активатора плазминогена». Genes Dev. 12 (19): 3084–95. Дои:10.1101 / gad.12.19.3084. ЧВК  317197. PMID  9765209.
• Steingrímsson E, Tessarollo L, Reid SW, Jenkins NA, Copeland NG (1999). «Фактор транскрипции bHLH-Zip Tfeb необходим для васкуляризации плаценты». Развитие. 125 (23): 4607–16. PMID  9806910.
• Хуа Х, Миллер З.А., Ву Г., Ши Й., Лодиш Х.Ф. (1999). «Специфичность трансформирующего фактора роста бета-индуцированной транскрипции гена ингибитора-1 активатора плазминогена: взаимодействия промоторной ДНК, фактора транскрипции muE3 и белков Smad». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 96 (23): 13130–5. Дои:10.1073 / пнас.96.23.13130. ЧВК  23912. PMID  10557285.
• Weterman MJ, van Groningen JJ, Jansen A, van Kessel AG (2000). «Ядерная локализация и трансактивирующая способность белков TFE3 и PRCC (слитых), связанных с папиллярно-клеточной карциномой почки». Онкоген. 19 (1): 69–74. Дои:10.1038 / sj.onc.1203255. PMID  10644981.
• Хуа Х, Миллер З.А., Беншабан Х, Врана Дж.Л., Лодиш Х.Ф. (2000). «Синергизм между факторами транскрипции TFE3 и Smad3 в трансформации транскрипции гена Smad7, индуцированной фактором роста бета». J. Biol. Chem. 275 (43): 33205–8. Дои:10.1074 / jbc.C000568200. PMID  10973944.
• Ladanyi M, Lui MY, Antonescu CR, Krause-Boehm A, Meindl A, Argani P, Healey JH, Ueda T., Yoshikawa H, Meloni-Ehrig A, Sorensen PH, Mertens F, Mandahl N, van den Berghe H, Sciot R , Даль Цин П., Бридж Дж. (2001). «Der (17) t (X; 17) (p11; q25) саркомы мягкой альвеолярной части человека сливает ген фактора транскрипции TFE3 с ASPL, новым геном в 17q25». Онкоген. 20 (1): 48–57. Дои:10.1038 / sj.onc.1204074. PMID  11244503.
• Weterman MA, van Groningen JJ, den Hartog A, Geurts van Kessel A (2001). «Трансформационная способность слитых генов PRCCTFE3 и TFE3PRCC, ассоциированных с папиллярной почечной карциномой». Онкоген. 20 (12): 1414–24. Дои:10.1038 / sj.onc.1204213. PMID  11313885.
• Heimann P, El Housni H, Ogur G, Weterman MA, Petty EM, Vassart G (2001). «Слияние нового гена RCC17 с геном TFE3 в папиллярно-клеточной карциноме, несущей t (X; 17) (p11.2; q25.3)». Рак Res. 61 (10): 4130–5. PMID  11358836.
• Чунг М.С., Ким Х.К., Кавамото С. (2001). «TFEC может функционировать как активатор транскрипции гена тяжелой цепи A немышечного миозина II в трансфицированных клетках». Биохимия. 40 (30): 8887–97. Дои:10.1021 / bi002847d. PMID  11467950.
• Dintilhac A, Bernués J (2002). «HMGB1 взаимодействует со многими очевидно неродственными белками, распознавая короткие аминокислотные последовательности». J. Biol. Chem. 277 (9): 7021–8. Дои:10.1074 / jbc.M108417200. PMID  11748221.
• Кавата Ю., Сузуки Х., Хигаки Ю., Денисенко О., Шуллери Д., Абрасс С., Бомштык К. (2002). "bcn-1 Элемент-зависимая активация гена гамма-цепи 1 ламинина за счет кооперативного действия фактора транскрипции E3 (TFE3) и белков Smad". J. Biol. Chem. 277 (13): 11375–84. Дои:10.1074 / jbc.M111284200. PMID  11801598.
• Steingrimsson E, Tessarollo L, Pathak B, Hou L, Arnheiter H, Copeland NG, Jenkins NA (2002). «Mitf и Tfe3, два члена семейства Mitf-Tfe факторов транскрипции bHLH-Zip, играют важную, но функционально избыточную роль в развитии остеокластов». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (7): 4477–82. Дои:10.1073 / pnas.072071099. ЧВК  123673. PMID  11930005.