ТМЛХЭ - TMLHE

ТМЛХЭ
Идентификаторы
Псевдонимы	ТМЛХЭ, AUTSX6, BBOX2, TMLD, TMLH, TMLHED, XAP130, D430017M14Rik, триметиллизингидроксилаза, эпсилон
Внешние идентификаторы	OMIM: 300777 MGI: 2180203 ГомолоГен: 21853 Генные карты: ТМЛХЭ
Расположение гена (человек) Chr. Х-хромосома (человек)[1] Группа Xq28 Начинать 155,489,011 бп[1] Конец 155,669,944 бп[1]
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов железа • оксидоредуктазная активность • оксидоредуктазная активность, действующая на отдельных доноров с включением молекулярного кислорода, включение двух атомов кислорода • связывание ионов металлов • активность диоксигеназы • активность триметиллизиндиоксигеназы • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • митохондриальный матрикс • митохондрия Биологический процесс • отрицательная регуляция активности оксидоредуктазы • процесс биосинтеза карнитина • окислительно-восстановительный процесс Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	55217	192289
Ансамбль	ENSG00000185973	ENSMUSG00000079834
UniProt	Q9NVH6	Q91ZE0
RefSeq (мРНК)	NM_001184797 NM_018196	NM_138758
RefSeq (белок)	NP_001171726 NP_060666	NP_620097
Расположение (UCSC)	Chr X: 155,49 - 155,67 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Триметиллизиндиоксигеназа, митохондриальная является фермент что у людей кодируется ТМЛХЭ ген в хромосома X.^[4][5][6] Мутации в ТМЛХЭ ген, приводящий к биосинтез карнитина нарушения были связаны с симптомами аутизма.^[7]

Структура

В TMHLE ген расположен на крайнем конце области Xq28 с высокой геномной нестабильностью,^[8] и кодирует протеинтриметиллизиндиоксигеназу, а, Fe2 + и 2-оксоглитарат-зависимую негемогидролазу железа и двухвалентного железа, локализованную в митохондриальный матрикс.^[9]

Функция

Фермент триметиллизиндиоксигеназа катализирует первую стадию карнитин путь биосинтеза,^[9] который является частью биосинтеза амина. Карнитин представляет собой молекулу, которая играет важную роль в транспортировке активированных жирные кислоты через внутренняя митохондриальная мембрана где они метаболизируются. Закодированный белок преобразует триметиллизин в гидрокситриметиллизин с реакцией (EC 1.14.11.8):

N₆, N₆, N (6) -триметил-L-лизин + 2-оксоглутарат + O₂ = 3-гидрокси-N₆, N₆, N (6) -триметил-L-лизин + сукцинат + CO₂.

и требует утюг и я-аскорбат в качестве кофакторы.

Клиническое значение

Мутации в THLHE генные причины Дефицит эпсилон-триметиллизингидроксилазы (TMLHED),^[10][11] ан врожденная ошибка обмена веществ в биосинтез карнитина, что может увеличить риски развития расстройства нервного развития, аутизм -связанное поведение, и Расстройства аутистического спектра.^[12][7]

Взаимодействия

Было показано, что THLHE имеет 14 двоичных белок-белковые взаимодействия включая 12 сопряженных взаимодействий. THLHE, похоже, взаимодействует с SUGCT.^[13]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000185973 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Rogner UC, Heiss NS, Kioschis P, Wiemann S, Korn B, Poustka A (октябрь 1996 г.). «Транскрипционный анализ области-кандидата для пигментного недержания мочи (IP2) в Xq28». Геномные исследования. 6 (10): 922–34. Дои:10.1101 / гр. 6.10.922. PMID  8908511.
5. Vaz FM, Ofman R, Westinga K, Back JW, Wanders RJ (сентябрь 2001 г.). «Молекулярная и биохимическая характеристика эпсилон-N-триметиллизингидроксилазы крысы, первого фермента биосинтеза карнитина». Журнал биологической химии. 276 (36): 33512–7. Дои:10.1074 / jbc.M105929200. PMID  11431483.
6. «Энтрез Ген: триметиллизингидроксилаза TMLHE, эпсилон».
7. Ziats MN, Comeaux MS, Yang Y, Scaglia F, Elsea SH, Sun Q, Beaudet AL, Schaaf CP (сентябрь 2015 г.). «Улучшение регрессивных симптомов аутизма у ребенка с дефицитом TMLHE после приема карнитина». Американский журнал медицинской генетики. Часть А. 167A (9): 2162–7. Дои:10.1002 / ajmg.a.37144. PMID  25943046.
8. Монфрегола Дж., Наполитано Дж., Конте I, Севенини А., Мильяччио С., Д'Урсо М., Урсини М. В. (2007). «Функциональная характеристика гена TMLH: анализ промотора, гибридизация in situ, идентификация и картирование альтернативных вариантов сплайсинга». Ген. 395 (1–2): 86–97. Дои:10.1016 / j.gene.2007.02.012. PMID  17408883.
9. Монфрегола Дж., Севенини А., Терраччиано А., Ван Флис Н., Арбуччи С., Вандерс Р. Дж., Д'Урсо М., Ваз FM, Урсини М. В. (2005). «Функциональный анализ вариантов TMLH и определение доменов, необходимых для каталитической активности и митохондриального нацеливания». J. Cell. Физиол. 204 (3): 839–47. Дои:10.1002 / jcp.20332. PMID  15754339.
10. Celestino-Soper PB, Shaw CA, Sanders SJ, Li J, Murtha MT, Ercan-Sencicek AG, Davis L, Thomson S, Gambin T, Chinault AC, Ou Z, German JR, Milosavljevic A, Sutcliffe JS, Cook EH, Stankiewicz P, State MW, Боде А.Л. (2011). «Использование массива CGH для обнаружения вариантов числа экзонных копий по всему геному в семьях с аутизмом обнаруживает новую делецию в TMLHE». Гм. Мол. Genet. 20 (22): 4360–70. Дои:10.1093 / hmg / ddr363. ЧВК  3196886. PMID  21865298.
11. Nava C, Lamari F, Héron D, Mignot C, Rastetter A, Keren B, Cohen D, Faudet A, Bouteiller D, Gilleron M, Jacquette A, Whalen S, Afenjar A, Périsse D, Laurent C, Dupuits C, Gautier C , Жерар М., Хьюге Г., Кайе С., Лехеп Б., Лебойер М., Гиллберг С., Делорм Р., Буржерон Т., Брис А., Депьен С. (2012). «Анализ экзома хромосомы X у пациентов с расстройствами аутистического спектра выявил новые гены-кандидаты, включая TMLHE». Перевод Психиатрия. 2: e179. Дои:10.1038 / tp.2012.102. ЧВК  3565810. PMID  23092983.
12. http://www.omim.org/entry/300872
13. "14 бинарных взаимодействий найдено для поискового запроса TMLHE". База данных по молекулярным взаимодействиям IntAct. EMBL-EBI. Получено 2018-08-25.

дальнейшее чтение

• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Геномные исследования. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (сентябрь 2000 г.). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO отчеты. 1 (3): 287–92. Дои:10.1093 / embo-reports / kvd058. ЧВК  1083732. PMID  11256614.
• Wiemann S, Arlt D, Huber W., Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (октябрь 2004 г.). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Геномные исследования. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Монфрегола Дж., Севенини А., Терраччиано А., ван Влис Н., Арбуччи С., Вандерс Р. Дж., Д'Урсо М., Ваз FM, Урсини М. В. (сентябрь 2005 г.). «Функциональный анализ вариантов TMLH и определение доменов, необходимых для каталитической активности и митохондриального нацеливания». Журнал клеточной физиологии. 204 (3): 839–47. Дои:10.1002 / jcp.20332. PMID  15754339.
• Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И., дель Валь С., Арльт Д., Хане Ф., Бехтель С., Симпсон Дж., Хофманн О., Хиде В., Глаттинг К. Х., Хубер В., Пепперкок Р., Поустка А., Виманн С. (январь 2006 г.). «База данных LIFEdb в 2006 году». Исследования нуклеиновых кислот. 34 (Проблема с базой данных): D415-8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.
• Monfregola J, Napolitano G, Conte I, Cevenini A, Migliaccio C, D'Urso M, Ursini MV (июнь 2007 г.). «Функциональная характеристика гена TMLH: анализ промотора, гибридизация in situ, идентификация и картирование альтернативных вариантов сплайсинга». Ген. 395 (1–2): 86–97. Дои:10.1016 / j.gene.2007.02.012. PMID  17408883.