TP53RK - TP53RK

TP53RK
Идентификаторы
ПсевдонимыTP53RK, BUD32, C20orf64, Nori-2, Nori-2p, PRPK, dJ101A2, регулирующая киназа TP53, GAMOS4, TPRKB
Внешние идентификаторыOMIM: 608679 MGI: 1914050 ГомолоГен: 6042 Генные карты: TP53RK
Номер ЕС3.6.-.-
Расположение гена (человек)
Хромосома 20 (человек)
Chr.Хромосома 20 (человек)[1]
Хромосома 20 (человек)
Геномное расположение TP53RK
Геномное расположение TP53RK
Группа20q13.12Начинать46,684,365 бп[1]
Конец46,689,444 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_033550

NM_023815

RefSeq (белок)

NP_291028

NP_076304.2

Расположение (UCSC)Chr 20: 46.68 - 46.69 МбChr 2: 166,79 - 166,8 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

TP53-регулирующая киназа, также известный как ПРПК является фермент что у людей кодируется TP53RK ген.[5][6][7] Этот белок представляет собой серин / треониновую протеинкиназу, которая фосфорилирует p53 на Ser15.

ПРПК является частью KEOPS / EKC комплекс, который участвует в контроле транскрипции,[8] регуляция теломер [9] и модификация тРНК.[10]

Модельные организмы

Модельные организмы были использованы при изучении функции TP53RK. Условный нокаутирующая мышь линия называется Трп53ркtm1a (EUCOMM) Wtsi был создан на Wellcome Trust Sanger Institute.[11] Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг[12] для определения последствий удаления.[13][14][15][16] Проведены дополнительные проверки: - Углубленное иммунологическое фенотипирование[17]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000172315 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000042854 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Абэ Ю., Мацумото С., Вей С., Незу К., Миёши А., Кито К., Уэда Н., Шигемото К., Хицумото Ю., Никава Дж., Эномото Ю. (ноябрь 2001 г.). «Клонирование и характеристика р53-родственной протеинкиназы, экспрессируемой в активированных интерлейкином-2 цитотоксических Т-клетках, линиях эпителиальных опухолевых клеток и семенниках». Журнал биологической химии. 276 (47): 44003–11. Дои:10.1074 / jbc.M105669200. PMID  11546806.
  6. ^ Факчин С., Лопрейато Р., Руццен М., Марин О., Сартори Дж., Гётц К., Монтенарх М., Кариньяни Г., Пинна Л.А. (август 2003 г.). «Функциональная гомология между дрожжевым piD261 / Bud32 и человеческим PRPK: как фосфорилированный p53, так и PRPK частично компенсируют дефицит piD261 / Bud32». Письма FEBS. 549 (1–3): 63–6. Дои:10.1016 / S0014-5793 (03) 00770-1. PMID  12914926. S2CID  24581860.
  7. ^ "Энтрез Ген: TP53RK TP53 регулирующая киназа".
  8. ^ Киселева-Романова Е., Лопрейато Р., Боден-Байе А., Руссель Дж. К., Илан Л., Хофманн К., Намане А., Манн С., Либри Д. (август 2006 г.). «Дрожжевой гомолог антигена рака яичка определяет новый транскрипционный комплекс». Журнал EMBO. 25 (15): 3576–85. Дои:10.1038 / sj.emboj.7601235. ЧВК  1538566. PMID  16874308.
  9. ^ Дауни М., Хоулсворт Р., Марингель Л., Ролли А., Брем М., Галисия С., Гиллард С., Партингтон М., Зубко М.К., Кроган Н.Дж., Эмили А., Гринблатт Д.Ф., Харрингтон Л., Лидалл Д., Дюроше Д. (март 2006 г.). «Скрининг всего генома идентифицирует эволюционно консервативный комплекс KEOPS как регулятор теломер». Клетка. 124 (6): 1155–68. Дои:10.1016 / j.cell.2005.12.044. PMID  16564010. S2CID  13928061.
  10. ^ Сринивасан М., Мехта П., Ю Й, Пругар Е., Кунин Е. В., Карзай А. В., Стернланц Р. (март 2011 г.). «Высококонсервативный комплекс KEOPS / EKC необходим для универсальной модификации тРНК, t6A». Журнал EMBO. 30 (5): 873–81. Дои:10.1038 / emboj.2010.343. ЧВК  3049205. PMID  21183954.
  11. ^ Гердин А.К. (2010). «Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью». Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
  12. ^ а б «Международный консорциум по фенотипированию мышей».
  13. ^ Скарнес В.К., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт AF, Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–42. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК  3572410. PMID  21677750.
  14. ^ Долгин Э (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  15. ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
  16. ^ Уайт Дж. К., Гердин А. К., Карп Н. А., Райдер Э., Бульян М., Басселл Дж. Н., Солсбери Дж., Клэр С., Ингем Нью-Джерси, Подрини С., Хоутон Р., Эстабель Дж., Боттомли Дж. Р., Мелвин Д. Дж., Сантер Д., Адамс, Северная Каролина, Таннахилл Д. , Logan DW, Macarthur DG, Flint J, Mahajan VB, Tsang SH, Smyth I, Watt FM, Skarnes WC, Dougan G, Adams DJ, Ramirez-Solis R, Bradley A, Steel KP (июль 2013 г.). «Полногеномное поколение и систематическое фенотипирование мышей с нокаутом открывает новые роли для многих генов». Клетка. 154 (2): 452–64. Дои:10.1016 / j.cell.2013.06.022. ЧВК  3717207. PMID  23870131.
  17. ^ а б «Консорциум иммунофенотипирования инфекций и иммунитета (3i)».

дальнейшее чтение