TXNDC5 - TXNDC5

TXNDC5
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2DIZ, 3UJ1, 3UVT, 3WGD, 3WGE, 3WGX
Идентификаторы
Псевдонимы	TXNDC5, ENDOPDI, ERP46, HCC-2, PDIA15, STRF8, UNQ364, HCC2, тиоредоксиновый домен, содержащий 5
Внешние идентификаторы	OMIM: 616412 MGI: 2145316 ГомолоГен: 11125 Генные карты: TXNDC5
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6п24.3 Начинать 7,881,517 бп[1] Конец 7,910,788 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 13 (мышь)[2] Группа 13 | 13 A3.3 Начинать 38,500,079 бп[2] Конец 38,528,824 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • изомеразная активность • активность протеин дисульфид изомеразы Сотовый компонент • просвет лизосомы • просвет эндоплазматического ретикулума • внеклеточная экзосома • эндоплазматический ретикулум • внеклеточная область • просвет азурофильных гранул Биологический процесс • клиренс апоптотических клеток • отрицательная регуляция апоптотического процесса • сворачивание белка • окислительно-восстановительный гомеостаз клеток • ответ на стресс эндоплазматического ретикулума • дегрануляция нейтрофилов Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	81567	105245
Ансамбль	ENSG00000239264	ENSMUSG00000038991
UniProt	Q8NBS9	Q91W90
RefSeq (мРНК)	NM_030810 NM_001145549 NM_022085	NM_001289598 NM_001289599 NM_145367
RefSeq (белок)	NP_001139021 NP_110437	NP_001276527 NP_001276528 NP_663342
Расположение (UCSC)	Chr 6: 7,88 - 7,91 Мб	Chr 13: 38,5 - 38,53 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок, содержащий тиоредоксиновый домен 5 это белок что у людей кодируется TXNDC5 ген.^[5]

Функция

Этот ген кодирует протеин дисульфид-изомераза.^[6] Его экспрессия вызвана гипоксией, и его роль может заключаться в защите гипоксический клетки из апоптоз. Этот ген может транскрибироваться с вышестоящим геном. MUTED.^[5]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000239264 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000038991 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. "Entrez Gene: домен тиоредоксина TXNDC5, содержащий 5".
6. Галлиган Дж. Дж., Петерсен Д. Р. (июль 2012 г.). «Семейство генов протеин дисульфид изомеразы человека». Геномика человека. 6 (6): 6. Дои:10.1186/1479-7364-6-6. ЧВК  3500226. PMID  23245351.

дальнейшее чтение

• Neve EP, Svensson K, Fuxe J, Pettersson RF (август 2003 г.). «VIPL, VIP36-подобный мембранный белок с предполагаемой функцией экспорта гликопротеинов из эндоплазматического ретикулума». Экспериментальные исследования клеток. 288 (1): 70–83. Дои:10.1016 / S0014-4827 (03) 00161-7. PMID  12878160.
• Knoblach B, Keller BO, Groenendyk J, Aldred S, Zheng J, Lemire BD, Li L, Michalak M (октябрь 2003 г.). «ERp19 и ERp46, новые члены семейства тиоредоксинов белков эндоплазматического ретикулума». Молекулярная и клеточная протеомика. 2 (10): 1104–19. Дои:10.1074 / mcp.M300053-MCP200. PMID  12930873.
• Салливан Д.К., Гуминеки Л., Мур Дж. В., Бойл Дж. Дж., Полсом Р., Кример Д., Баркер Дж., Бикнелл Р. (ноябрь 2003 г.). «EndoPDI, новый протеин-дисульфид-изомеразоподобный белок, который предпочтительно экспрессируется в эндотелиальных клетках, действует как фактор выживания при стрессе». Журнал биологической химии. 278 (47): 47079–88. Дои:10.1074 / jbc.M308124200. PMID  12963716.
• Брюнель А., Лабас В., Майлу А., Шарма С., Ройер Н., Вин Дж, Перне П., Вобурдоль М., Боден Б. (октябрь 2005 г.). «Протеомика эндотелиальных клеток пупочной вены человека применительно к апоптозу, вызванному этопозидом». Протеомика. 5 (15): 3876–84. Дои:10.1002 / pmic.200401239. PMID  16130169. S2CID  26007149.
• Nissom PM, Lo SL, Lo JC, Ong PF, Lim JW, Ou K, Liang RC, Seow TK, Chung MC (апрель 2006 г.). «Hcc-2, новый тиоредоксин ER млекопитающих, который дифференциально экспрессируется при гепатоцеллюлярной карциноме». Письма FEBS. 580 (9): 2216–26. Дои:10.1016 / j.febslet.2006.03.029. PMID  16574106. S2CID  1344909.
• Ван И, Ма И, Лю Б., Сюй Э, Хуанг Ц., Лай М. (октябрь 2007 г.). «Дифференциальная экспрессия мимекана и белка 5, содержащего тиоредоксиновый домен, при колоректальной аденоме и раке: протеомное исследование». Экспериментальная биология и медицина. 232 (9): 1152–9. Дои:10.3181 / 0701-RM-8. PMID  17895523. S2CID  42784486.