TXNDC12 - TXNDC12 - Wikipedia

TXNDC12
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1SEN, 2К8В
Идентификаторы
Псевдонимы	TXNDC12, AG1, AGR1, ERP16, ERP18, ERP19, PDIA16, TLP19, hAG-1, hTLP19, тиоредоксиновый домен, содержащий 12
Внешние идентификаторы	OMIM: 609448 MGI: 1913323 ГомолоГен: 41074 Генные карты: TXNDC12
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1п32.3 Начинать 52,020,131 бп[1] Конец 52,055,191 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь)[2] Группа 4 | 4 C7 Начинать 108,834,601 бп[2] Конец 108,862,127 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • оксидоредуктазная активность • активность протеин-дисульфидредуктазы (глутатиона) • активность пептидисульфид оксидоредуктазы • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • просвет эндоплазматического ретикулума • эндоплазматический ретикулум Биологический процесс • отрицательная регуляция внутреннего апоптотического сигнального пути, вызванного стрессом эндоплазматического ретикулума • окислительно-восстановительный процесс • окислительно-восстановительный гомеостаз клеток • дифференциация клеток • отрицательная регуляция гибели клеток Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	51060	66073
Ансамбль	ENSG00000117862	ENSMUSG00000028567
UniProt	O95881	Q9CQU0
RefSeq (мРНК)	NM_015913	NM_025334
RefSeq (белок)	NP_056997	NP_079610
Расположение (UCSC)	Chr 1: 52.02 - 52.06 Мб	Chr 4: 108,83 - 108,86 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок, содержащий тиоредоксиновый домен 12 это белок что у людей кодируется TXNDC12 ген.^[5][6][7]

TXNDC12 принадлежит тиоредоксин надсемейство (см. TXN; MIM 187700). Члены этого надсемейство обладают тиоредоксиновой складкой с консенсусной последовательностью активного сайта (CxxC ) и иметь роли в редокс регулирование, защита от окислительный стресс, рефолдинг дисульфид -содержащие белки и регуляция факторов транскрипции^[8] (Лю и др., 2003 г.) [предоставлено OMIM]^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000117862 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028567 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Д.Ю., Лю В., Гиббс Р.А. (июнь 1996 г.). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный биохим. 236 (1): 107–13. Дои:10.1006 / abio.1996.0138. PMID  8619474.
6. Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. К., Музни Д. М., Дин Й., Лю В., Рикафренте Д. Ю., Вентланд М. А., Леннон Г., Гиббс Р. А. (июнь 1997 г.). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК». Genome Res. 7 (4): 353–8. Дои:10.1101 / гр. 7.4.353. ЧВК  139146. PMID  9110174.
7. «Ген Entrez: домен тиоредоксина TXNDC12, содержащий 12 (эндоплазматический ретикулум)».
8. Галлиган Дж. Дж., Петерсен Д. Р. (июль 2012 г.). «Семейство генов протеин дисульфид изомеразы человека». Геномика человека. 6 (6): 6. Дои:10.1186/1479-7364-6-6. ЧВК  3500226. PMID  23245351.

дальнейшее чтение

• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Аланен Х.И., Уильямсон Р.А., Ховард М.Дж. и др. (2003). «Функциональная характеристика ERp18, нового члена суперсемейства тиоредоксинов, локализованного в эндоплазматическом ретикулуме». J. Biol. Chem. 278 (31): 28912–20. Дои:10.1074 / jbc.M304598200. PMID  12761212.
• Кларк Х.Ф., Герни А.Л., Абая Э. и др. (2003). «Инициатива по открытию секретных белков (SPDI), широкомасштабная попытка идентифицировать новые секретируемые и трансмембранные белки человека: оценка биоинформатики». Genome Res. 13 (10): 2265–70. Дои:10.1101 / гр.1293003. ЧВК  403697. PMID  12975309.
• Лю Ф., Ронг Ю.П., Цзэн Л.С. и др. (2004). «Выделение и характеристика нового человеческого тиоредоксин-подобного гена hTLP19, кодирующего секреторный белок». Ген. 315: 71–8. Дои:10.1016 / S0378-1119 (03) 00732-7. PMID  14557066.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Чжан З., Хензель В.Дж. (2005). «Прогнозирование сигнального пептида на основе анализа экспериментально подтвержденных сайтов расщепления». Белковая наука. 13 (10): 2819–24. Дои:10.1110 / пс. 04682504. ЧВК  2286551. PMID  15340161.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Оцуки Т., Ота Т., Нисикава Т. и др. (2007). «Сигнальная последовательность и ловушка ключевого слова in silico для отбора полноразмерных человеческих кДНК, кодирующих секрецию или мембранные белки из библиотек олигокапированных кДНК». ДНК Res. 12 (2): 117–26. Дои:10.1093 / dnares / 12.2.117. PMID  16303743.
• Грегори С.Г., Барлоу К.Ф., Маклей К.Э. и др. (2006). «Последовательность ДНК и биологическая аннотация хромосомы 1 человека». Природа. 441 (7091): 315–21. Дои:10.1038 / природа04727. PMID  16710414.