Эболавирус Тайского леса - Taï Forest ebolavirus

Эболавирус Тайского леса
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Область:Рибовирия
Королевство:Орторнавиры
Тип:Негарнавирикота
Учебный класс:Monjiviricetes
Заказ:Mononegavirales
Семья:Filoviridae
Род:Эболавирус
Разновидность:
Эболавирус Тайского леса
Синонимы

Вирус леса Тай (TAFV)

В разновидность Эболавирус Тайского леса (/тɑːˈя/)[1] это вирусологический таксон входит в род Эболавирус, семья Filoviridae, порядок Mononegavirales. Вид имеет один вирус член, вирус леса Тай (TAFV).[1] Представители этого вида называются эболавирусами Тайского леса.[1]

Эболавирус Тайского леса был замечен в одном случае заражения человека из-за контакта с шимпанзе из Тайский лес в Берег Слоновой Кости.[2]

Номенклатура

Название Эболавирус Тайского леса происходит от Национальный парк Таи (название национального парка в Берег Слоновой Кости, где впервые был обнаружен вирус Тайского леса) и таксономический суффикс эболавирус (что обозначает вид эболавируса).[1] Согласно правилам наименования таксонов, установленным Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV), название Эболавирус Тайского леса всегда быть заглавные, выделенный курсивом, никогда не сокращается, и перед ним должно стоять слово «виды». Имена его членов (эболавирусы Taï Forest) должны быть написаны с заглавной буквы, не выделяться курсивом и использоваться без статьи.[1]

Вид был интродуцирован в 1998 г. как Кот-д'Ивуар вирус Эбола.[3][4] В 2002 году название было изменено на Эболавирус Кот-д'Ивуара.[5][6] Название было предложено изменить на Эболавирус в лесу Тай в 2010,[1] и это предложение было немедленно принято ICTV.

Вирус рода Эболавирус является членом вида Эболавирус Тайского леса если:[1]

  • это эндемик в Кот-д'Ивуаре
  • у него есть геном с тремя перекрытиями генов (VP35/VP40, GP/VP30, VP24/L)
  • его геномная последовательность отличается от Вирус Эбола на ≥30%, но отличается от вируса Taï Forest на <30%.

Вирус леса Тай (/тɑːˈя/;[1] TAFV) является близким родственником гораздо более широко известного Вирус Эбола (EBOV). TAFV вызывает тяжелые болезнь в приматы, то Эбола геморрагическая лихорадка. TAFV - это Выбрать агента, Всемирная организация здоровья Возбудитель группы риска 4 (требующий Защита, эквивалентная 4-му уровню биобезопасности ), Национальные институты здоровья /Национальный институт аллергии и инфекционных заболеваний Приоритетный патоген категории А, Центры по контролю и профилактике заболеваний Агент биотерроризма категории А, и внесен в список в качестве биологического агента экспортного контроля Австралийская группа.

Использование термина

Вирус леса Тай (сокращенно TAFV) был впервые описан в 1995 г. как новый «штамм» Вирус Эбола.[7] Это единственный член разновидность Эболавирус Тайского леса, который входит в род Эболавирус, семья Filoviridae, порядок Mononegavirales.[1] Название «Вирус леса Тай» происходит от Национальный парк Таи (название национального парка в Берег Слоновой Кости, где он был впервые обнаружен) и таксономический суффикс вирус. Согласно правилам наименования таксонов, установленным Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV), имя Taï Forest virus всегда должно быть заглавные, но (в отличие от названий таксонов, например названий родов и видов) никогда не выделенный курсивом, и возможно сокращенный (официальная аббревиатура TAFV).[8]

Предыдущие обозначения

Вирус Тайского леса был впервые представлен как новый «штамм» вируса Эбола в 1995 году.[7] В 2000 году он получил обозначение Côte d'Ivoire Ebola virus,[9][10] а в 2002 году название было изменено на Côte d'Ivoire ebolavirus.[5][6] (оба раза опечатка "Кот"). Другие названия, циркулирующие в литературе, - это правильный вирус Эбола Кот-д'Ивуара и эболавирус Кот-д'Ивуара, а также жаргонные термины «вирус Эбола» из Кот-д'Ивуара и эболавирус из Кот-д'Ивуара. Предыдущие сокращения для вируса были EBOV-CI (для вируса Эбола Кот-д'Ивуар или вируса Эбола Кот-д'Ивуар), EBOV-IC (для вируса Эбола Кот-д'Ивуар), ICEBOV (для вируса Эбола из Кот-д'Ивуара или эболавируса из Кот-д'Ивуара) и совсем недавно CIEBOV (для Кот-д'Ивуара: вирус Эбола, вирус Эбола Кот-д'Ивуар, эболавирус Кот-д'Ивуара или эболавирус Кот-д'Ивуара). Окончательное название вирус получил в 2010 году, когда он был переименован в вирус леса Тай (TAFV).[1]

Критерии включения вирусов

Вирус вида Эболавирус Тайского леса является вирусом Taï Forest (TAFV), если он обладает свойствами эболавирусов Taï Forest и если его геном отличается от прототипа вируса Taï Forest, варианта вируса Taï Forest Côte d'Ivoire (TAFV / CI) на ≤10% в нуклеотид уровень.[1]

Болезнь

TAFV - один из четырех эболавирусов, вызывающих Болезнь, вызванная вирусом Эбола (БВВЭ) у человека (в литературе также часто упоминается как геморрагическая лихорадка Эбола, КВЧ). БВВЭ, вызванный инфекцией TAFV, нельзя отличить от БВВЭ, вызванной другими эболавирусами, только на основании клинических наблюдений, поэтому клинические проявления и патология инфекций, вызванных всеми эболавирусами, представлены вместе на отдельной странице (см. Болезнь, вызванная вирусом Эбола ). TAFV впервые и до сих пор единственное известное появление появилось в 1994 году во время вирусной геморрагической лихорадки. эпизоотический среди западных шимпанзе (Pan troglodytes verus) в Национальный парк Тай, Берег Слоновой Кости. По мере того, как было обнаружено все больше мертвых западных шимпанзе, многие дали положительный результат на инфекцию эболавирусом, отличным от уже известных. Один из ученых, проводивших вскрытие трупов инфицированных западных шимпанзе, заразился TAFV. У нее появились симптомы, похожие на симптомы лихорадка денге примерно через неделю после вскрытия, и был доставлен в Швейцарию для лечения. Она была выписана из больницы через две недели и полностью выздоровела через шесть недель после заражения.[нужна цитата ]

Болезнь, вызванная вирусом Эбола (БВВЭ) вспышки инфекции, вызванной вирусом Таи-Форест (TAFV)
ГодГеографическое положениеСлучаи / смерти людей (летальность)
1994Национальный парк Тай, Берег Слоновой Кости1/0 (0%)

Экология

Экология TAFV в настоящее время неясна, и ни один резервуар-хозяин еще не идентифицирован. Таким образом, остается неясным, как TAFV был введен в популяцию западных шимпанзе. Летучие мыши подозреваются в том, что они являются носителями вируса, потому что инфекционные Марбургский вирус (MARV), отдаленно родственный филовирус, был выделен от летучих мышей,[11] и потому что следы (но не инфекционные частицы) более близких Вирус Эбола (EBOV) также были обнаружены у летучих мышей.[12]

Молекулярная биология

TAFV в основном не охарактеризован на молекулярном уровне. Однако его геномная последовательность, а вместе с ней и геномный организация и сохранение индивидуального открытые рамки для чтения, аналогичен таковому у других четырех известных эболавирусов. Поэтому в настоящее время предполагается, что знания, полученные для EBOV, могут быть экстраполированный в TAFV и все TAFV белки ведут себя аналогично EBOV.[нужна цитата ]

Рекомендации

  1. ^ а б c d е ж грамм час я j k Kuhn, Jens H .; Беккер, Стефан; Эбихара, Хидеки; Geisbert, Thomas W .; Джонсон, Карл М .; Каваока, Ёсихиро; Липкин, В. Ян; Негредо, Ана I; и другие. (2010). «Предложение по пересмотренной таксономии семейства Filoviridae: классификация, названия таксонов и вирусов, а также аббревиатуры вирусов». Архив вирусологии. 155 (12): 2083–103. Дои:10.1007 / s00705-010-0814-х. ЧВК  3074192. PMID  21046175.
  2. ^ Байз, Сильвен; Паннетье, Дельфина; Остерайх, Лиза; Ригер, Тони; Койвогуи, Ламин; Магассуба, Н'Фали; Соропогуи, Барре; Соу, Мамаду Салиу; Кейта, Сакоба; Де Клерк, Хильде; Тиффани, Аманда; Домингес, Джемма; Луа, Матьё; Траоре, Алексис; Колие, Мусса; Малано, Эммануэль Роланд; Хелезе, Эммануэль; Боквин, Энн; Мели, Стефан; Рауль, Эрве; Каро, Валери; Кадар, Даниэль; Габриэль, Мартин; Палманн, Мейке; Таппе, Деннис; Шмидт-Чанасит, Йонас; Импоума, Бенидо; Диалло, Абдул Карим; Форменти, Пьер; и другие. (2014). «Возникновение Заирской болезни, вызванной вирусом Эбола, в Гвинее». Медицинский журнал Новой Англии. 371 (15): 1418–25. Дои:10.1056 / NEJMoa1404505. PMID  24738640.
  3. ^ Нетесов, С. В .; Feldmann, H .; Jahrling, P. B .; Klenk, H.D .; Санчес, А. (2000). «Семейство Filoviridae». In van Regenmortel, M.HV .; Fauquet, C.M .; Бишоп, Д. Х. Л .; Карстенс, Э. Б .; Эстес, М. К .; Lemon, S.M .; Maniloff, J .; Mayo, M. A .; McGeoch, D. J .; Pringle, C.R .; Викнер, Р. Б. (ред.). Таксономия вирусов - седьмой отчет Международного комитета по таксономии вирусов. Сан-Диего, США: Academic Press. С. 539–48. ISBN  978-0-12-370200-5.
  4. ^ Прингл, К. Р. (1998). «Таксономия вирусов - Сан-Диего 1998». Архив вирусологии. 143 (7): 1449–59. Дои:10.1007 / s007050050389. PMID  9742051. S2CID  13229117.
  5. ^ а б Feldmann, H .; Geisbert, T. W .; Jahrling, P. B .; Klenk, H.-D .; Нетесов, С. В .; Peters, C.J .; Sanchez, A .; Swanepoel, R .; Волчков, В. Е. (2005). «Семейство Filoviridae». In Fauquet, C.M .; Mayo, M. A .; Maniloff, J .; Desselberger, U .; Болл, Л. А. (ред.). Таксономия вирусов - восьмой отчет Международного комитета по таксономии вирусов. Сан-Диего, США: Elsevier / Academic Press. С. 645–653. ISBN  978-0-12-370200-5.
  6. ^ а б Мэйо, М.А. (2002). «ICTV на парижском ICV: результаты пленарного заседания и биномиального голосования». Архив вирусологии. 147 (11): 2254–60. Дои:10.1007 / s007050200052. S2CID  43887711.
  7. ^ а б le Guenno, B .; Форменти, П .; Wyers, M .; Gounon, P .; Уокер, Ф .; Бош, К. (1995). «Выделение и частичная характеристика нового штамма вируса Эбола». Ланцет. 345 (8960): 1271–4. Дои:10.1016 / S0140-6736 (95) 90925-7. PMID  7746057. S2CID  38897209.
  8. ^ ICTV: Как написать название вируса, на ICTV онлайн (2019)
  9. ^ Нетесов, С. В .; Feldmann, H .; Jahrling, P. B .; Klenk, H.D .; Санчес, А. (2000). «Семейство Filoviridae». In van Regenmortel, M.HV .; Fauquet, C.M .; Бишоп, Д. Х. Л .; Карстенс, Э.Б .; Эстес, М. К .; Lemon, S.M .; Maniloff, J .; Mayo, M. A .; McGeoch, D. J .; Pringle, C.R .; Викнер, Р. Б. (ред.). Таксономия вирусов - седьмой отчет Международного комитета по таксономии вирусов. Сан-Диего, США: Academic Press. С. 539–48. ISBN  978-0-12-370200-5 {{противоречивые цитаты}}
  10. ^ Прингл, К. Р. (1998). «Таксономия вирусов - Сан-Диего 1998». Архив вирусологии. 143 (7): 1449–59. Дои:10.1007 / s007050050389. PMID  9742051. S2CID  13229117.
  11. ^ Towner, J. S .; Amman, B.R .; Сили, Т. К .; Кэрролл, С. А. Р .; Comer, J. A .; Kemp, A .; Swanepoel, R .; Paddock, C.D .; Балинанди, С .; Христова, М.Л .; Форменти, П. Б .; Albarino, C.G .; Миллер, Д. М .; Рид, З. Д .; Kayiwa, J. T .; Mills, J. N .; Кэннон, Д. Л .; Грир, П. У .; Byaruhanga, E .; Farnon, E.C .; Atimnedi, P .; Okware, S .; Катонголе-Мбидде, Э .; Даунинг, Р.; Tappero, J. W .; Zaki, S. R .; Ksiazek, T. G .; Никол, С. Т .; Роллин, П. Э. (2009). Фушье, Рон А. М. (ред.). «Выделение генетически разнообразных вирусов Марбург из египетских летучих мышей». Патогены PLOS. 5 (7): e1000536. Дои:10.1371 / journal.ppat.1000536. ЧВК  2713404. PMID  19649327.
  12. ^ Leroy, E.M .; Kumulungui, B .; Pourrut, X .; Rouquet, P .; Хассанин, А .; Yaba, P .; Délicat, A .; Paweska, J. T .; Gonzalez, J. P .; Свейнпол, Р. (2005). «Летучие мыши как резервуары вируса Эбола». Природа. 438 (7068): 575–576. Bibcode:2005Натура 438..575л. Дои:10.1038 / 438575a. PMID  16319873. S2CID  4403209.

внешняя ссылка