TBC домен - TBC domain

В TBC (Tre-2 / Bub2 / Cdc16) определяется как домен некоторых белки или как белковый мотив и широко признанный консервированный, который включает около 200 аминокислоты в целом эукариоты.

Обзор

Первоначально TBC был идентифицирован как консервативный домен среди онкогенного продукта tre-2 и дрожжевого клетка регуляторы цикла. Было показано, что люди имеют почти 42 различных белка TBC, которые отличаются друг от друга дополнительными мотивами и доменами (ГРАММ, ПРОБЕГ, PTB …) И добавить функциональное разнообразие в семейство. Самыми известными белками этой группы являются TBC1D1 и TBC1D4 которые напрямую связаны с функциональными болезни. Более того, у большинства из них действительно близкие отношения с другими белковые домены. Например, было продемонстрировано, что некоторые из них действуют как GAP (белок, активирующий GTPase) для маленьких GTPases: Активность Rab частично модулируется белками, активирующими GTPase (GAP), и многие из этих RabGAP имеют общую архитектуру Tre2 / Bub2 / Cdc16 (TBC) -доменов. Однако нужно много исследование об этих типах белков, и в этой статье объясняется то, что известно на данный момент.

  • Esquema rab.jpg

Рисунок 1. Рабский цикл в мембранном трафике: Цикл между GTP-связанный неактивный государство и GTP-привязанный активное состояние управляется белком Rab и регулируется активирующим ферментом GEF[1] и инактивирующий фермент ЗАЗОР который в данном случае может быть белком TBC. В дальнейшем активированная форма Rab, связанная с GTP, включается в конкретный органелла или же везикул и способствует его транспортировке, взаимодействуя с конкретным эффектор молекула. Белки, активирующие ГТФазу (GAP), ограничивают продолжительность активного состояния и ускоряют медленную внутреннюю скорость ГТФ гидролиз.

Функции

TBC в основном функционирует как конкретный Rab GAP (белки, активирующие GTPases) за счет использования в качестве инструментов для отключения определенных мембранная торговля События. Пробелы служить для увеличения GTPase активности за счет внесения остатков в активный сайт и содействия конверсии из GTP к ВВП форма. Такая активность TBC белки не всегда требует близкого физического взаимодействие хотя некоторые белки TBC показали явную активность GAP в отношении их связывания Рабс.[2] Семьи Рабов вносят свой вклад в определение органеллы и контроль специфичности и скорости транспорта отдельными путями. Следовательно, TBC Rab-GAPS необходимы регуляторы внутриклеточных и мембрана транспортирует а также центральные участники сигнала трансдукция. Тем не менее, не все TBC могут играть главную роль в качестве Rab-GAP и, наоборот, не все Rab-GAP содержат TBC. Кроме того, тот факт, что это семейство плохо изучено, еще больше усложняет его.

Эволюция и исследования

Филогенетический анализ предоставил представление о эволюция семьи TBC. ScrollSaw была реализована как недавняя стратегия преодоления плохого разрешения между TBC гены обнаруживается в стандартных филогенетических стратегиях во время первоначальных реконструкций.[3] Примечательно, что домен TBC почти всегда меньше, чем Раб когорта у любого человека геном, предполагая коэволюцию Rab / TBC. Был обнаружен 21 предполагаемый подкласс TBC, который идентифицирован как семь надежных и два умеренно поддерживаемые клады.

Более того, также было систематический анализ для того, чтобы идентифицировать целевые Rab белков TBC. Сначала это было основано на физическом взаимодействии между доменом TBC и его субстратом Rab. Например, Барр и его коллеги обнаружили конкретное взаимодействие между RUTBC3 / RabGAP-5 и Rab5A который активирует активность GTPase изоформы Rab5. Аналогичным образом, другие исследования показали, что, помимо других важных аспектов, одного взаимодействия TBC-Rab недостаточно для определения цель белков ТВС. Однако был и второй подход к определению цели. Рабс TBC, исследуя их in vitro ЗАЗОР Мероприятия. Тем не менее, существуют аналогичные расхождения между выводами разных исследователей, которые можно найти в литературе и которые могут быть объяснены различиями между методами исследования. in vitro. Кроме того, исследования показали, что белки ТВС связаны с некоторыми человеческими болезни. Например, нарушение функции TBC1D1 и TBC1D4 напрямую влияет инсулин действия и глюкоза поглощение. Причинение лишний вес или худоба из-за того, что эти два члена семьи TBC регулируют инсулино-стимулированный GLUT4 перевод в плазматическая мембрана в млекопитающие. Кроме того, было показано, что многие из них связаны с рак, но точный механизм, которым они связаны с этим заболеванием, остается в значительной степени неизвестным. Поэтому по этой биологической теме еще предстоит провести много исследований.

Рекомендации

  1. ^ Rowlands AG, Panniers R, Henshaw EC (1988). «Каталитический механизм действия фактора обмена гуаниновых нуклеотидов и конкурентное ингибирование фосфорилированным эукариотическим фактором инициации 2». Журнал биологической химии. 263 (12): 5526–33. PMID  3356695.
  2. ^ Bos JL, Rehmann H, Wittinghofer A (2007). «GEFs и GAPs: критические элементы в контроле малых G белков». Клетка. 129 (5): 865–77. Дои:10.1016 / j.cell.2007.05.018. PMID  17540168. S2CID  15798389.
  3. ^ Габерне-Кастелло C, О'Рейли AJ, Dacks JB, Field MC (2013). «Эволюция Tre-2 / Bub2 / Cdc16 (TBC) Rab GTPase-активирующих белков». Молекулярная биология клетки. 24 (10): 1574–83. Дои:10.1091 / mbc.E12-07-0557. ЧВК  3655817. PMID  23485563.

внешняя ссылка