USP7 - USP7

USP7
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1NB8, 1NBF, 1ГГ6, 1YZE, 2F1W, 2F1X, 2F1Y, 2F1Z, 2FOJ, 2FOO, 2FOP, 2КВР, 2XXN, 2YLM, 3MQR, 3MQS, 4JJQ, 4KG9, 4M5W, 4M5X, 4PYZ, 4WPH, 4WPI, 4YOC, 5C56, 5C6D, 4YSI, 5FWI
Идентификаторы
Псевдонимы	USP7, HAUSP, TEF1, убиквитинспецифическая пептидаза 7 (ассоциированная с вирусом герпеса), убиквитинспецифическая пептидаза 7
Внешние идентификаторы	OMIM: 602519 MGI: 2182061 ГомолоГен: 2592 Генные карты: USP7
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 16 (человек)[1] Группа 16p13.2 Начните 8,892,097 бп[1] Конец 8,975,328 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 16 (мышь)[2] Группа 16 | 16 A1 Начните 8,689,595 бп[2] Конец 8,792,308 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность пептидазы цистеинового типа • связывание p53 • связывание фактора транскрипции • пептидазная активность • связывание с С-концом белка • GO: 0001948 связывание с белками • тиол-зависимая убиквитин-специфическая протеазная активность • активность эндопептидазы цистеинового типа • гидролазная активность • связывание убиквитин-протеин-лигазы • GO: 1904265 активность убиквитинилгидролазы • Lys48-специфическая активность деубиквитиназы Сотовый компонент • цитоплазма • Тело PML • ядерное тело • нуклеоплазма • ядро клетки • цитозоль • хромосома • макромолекулярный комплекс Биологический процесс • поддержание метилирования ДНК • убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс • стабилизация белка • протеолиз • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК • развитие многоклеточного организма • регуляция активности специфичного к последовательности ДНК связывающего фактора транскрипции • регуляция покрытия теломер • транскрипционно-связанная эксцизионная репарация нуклеотидов • GO: 0022415 вирусный процесс • отрицательная регуляция активности фактора транскрипции NF-kappaB • Ремонт ДНК • убиквитинирование белков • деубиквитинирование белков • деубиквитинирование моноубиквитинированного белка • гистон H2B консервативное деубиквитинирование С-конца лизина • регулирование стабильности белка • отрицательная регуляция протеасомного убиквитин-зависимого белкового катаболического процесса • деубиквитинирование белка K48 • положительная регуляция деметилирования ДНК • регулирование циркадного ритма • ритмический процесс Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	7874	252870
Ансамбль	ENSG00000187555	ENSMUSG00000022710
UniProt	Q93009	Q6A4J8
RefSeq (мРНК)	NM_003470 NM_001286457 NM_001286458 NM_001321858	NM_001003918
RefSeq (белок)	NP_001273386 NP_001273387 NP_001308787 NP_003461	NP_001003918
Расположение (UCSC)	Chr 16: 8.89 - 8.98 Мб	Chr 16: 8.69 - 8.79 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Убиквитин-специфическая процессирующая протеаза 7 (USP7), также известный как убиквитинкарбоксил-терминальная гидролаза 7 или убиквитин-специфическая протеаза, ассоциированная с герпесвирусом (HAUSP), является фермент что у людей кодируется USP7 ген.^[5][6][7][8]

Функция

Регулирование опухолевого супрессора p53

USP7 или HAUSP - это убиквитин конкретный протеаза или деубиквитилирующий фермент, который отщепляет убиквитин от его субстратов.^[9] Поскольку убиквитилирование (полиубиквитинирование ) чаще всего ассоциируется со стабильностью и деградацией клеточных белков, активность HAUSP обычно стабилизирует его субстратные белки.

HAUSP наиболее известен как прямой антагонист Mdm2, то Убиквитинлигаза E3 для белка-супрессора опухолей, p53.^[10] Обычно уровни p53 поддерживаются на низком уровне отчасти из-за Mdm2-опосредованного убиквитилирования и деградации p53. В ответ на онкогенные инсульты HAUSP может деубиквитинировать p53 и защищать p53 от Mdm2-опосредованной деградации, что указывает на то, что он может обладать функцией подавления опухоли для немедленной стабилизации p53 в ответ на стресс.

Другая важная роль функции HAUSP связана с онкогенной стабилизацией p53. Онкогены, такие как Мой с и E1A, как полагают, активируют p53 через зависимый от рамки считывания p19 (p19ARF, также называемый ARF) путь, хотя некоторые данные свидетельствуют о том, что ARF не является существенным в этом процессе. Возможно, HAUSP обеспечивает альтернативный путь защиты клетки от онкогенных поражений.

Роль в регуляции транскрипции

USP7 может деубиквитинировать гистон H2B и эта активность связана с молчанием генов у дрозофилы.^[11] USP7 связывается с метаболическим ферментом, GMP-синтетазой (GMPS), и эта ассоциация стимулирует активность деубиквитиназы USP7 в отношении H2B.^[11] Комплекс USP7-GMPS рекрутируется в область polycomb (Pc) у Drosophila и способствует эпигенетическому подавлению молчания гомеотический гены.^[12]

Ассоциация с герпесвирусами

USP7 был первоначально идентифицирован как белок, связанный с ICP0 белок Вирус простого герпеса (HSV ), отсюда и название Герпесвирус Ассоциированный USP (HAUSP). ICP0 представляет собой E3-убиквитинлигазу, которая участвует в убиквитинировании и последующей деградации самого себя и некоторых клеточных белков. Было показано, что USP7 регулирует аутоубиквитинирование и деградацию ICP0.

Совсем недавно взаимодействие между USP7 и белком EBNA1 Вирус Эпштейна-Барра (EBV) (другой герпесвирус ) также был обнаружен.^[13] Это взаимодействие особенно интересно с учетом онкогенный потенциал (способность вызывать рак) ВЭБ, который связан с несколькими видами рака у человека. EBNA1 может конкурировать с p53 за связывание USP7. Стабилизация с помощью USP7 важна для функции р53, подавляющей опухоль. В клетках EBNA1 может изолировать USP7 от p53 и, таким образом, ослаблять стабилизацию p53, делая клетки предрасположенными к превращению в раковые. Нарушение функции p53 путем секвестрирования USP7 - это один из способов, которым EBNA1 может способствовать онкогенный потенциал ВЭБ. Кроме того, было показано, что человеческий USP7 образует комплекс с GMPS, и этот комплекс рекрутируется в последовательности генома EBV.^[14] Было показано, что USP7 важен для гистон H2B деубиквитинирование в клетках человека и деубиквитинирование гистон H2B включены в геном EBV. Таким образом, USP7 также может быть важным для регуляции экспрессии вирусных генов.

Тот факт, что вирусные белки эволюционировали таким образом, чтобы нацеливаться на USP7, подчеркивает важность USP7 в подавлении опухолей и других клеточных процессах.

Связующие партнеры

Ниже приведен список некоторых известных партнеров USP7 / HAUSP по связыванию клеток:

• p53
• Mdm2^[15]
• Mdm4 / MdmX
• FOXO4
• Daxx
• PTEN
• 7 марта
• UVSSA^[16]

Взаимодействия

USP7 был показан взаимодействовать с участием Атаксин 1,^[17] CLSPN^[18] и P53.^[10] Протеомный скрининг, проведенный для идентификации взаимодействующих партнеров 75 деубиквитинирующих ферментов человека (DUB), выявил несколько новых партнеров по связыванию USP7.^[19]

Клиническое значение

Мутации с потерей функции USP7 связаны с расстройством нервного развития, симптомы которого включают задержку развития / умственную отсталость, расстройство аутистического спектра, повышенная распространенность эпилепсия, аномальные МРТ головного мозга и нарушения речи / моторики, причем некоторые пациенты полностью невербальны,^[20][21]

USP7 можно использовать как сенолитический агент из-за убиквитинирование и последующие протеасома деградация mdm2, тем самым увеличивая p53 Мероприятия.^[15]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000187555 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000022710 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Пуэнте XS, Санчес Л.М., Общий CM, Лопес-Отин C (июль 2003 г.). «Протеазы человека и мыши: сравнительный геномный подход». Обзоры природы. Генетика. 4 (7): 544–58. Дои:10.1038 / nrg1111. PMID  12838346. S2CID  2856065.
6. Робинсон П.А., Ломонте П., Маркхэм А.Ф., Эверетт Р.Д. (март 1999 г.). «Присвоение 1 гена HAUSP-ассоциированной с вирусом герпеса убиквитин-специфической протеазы HAUSP полосе хромосомы человека 16p13.3 путем гибридизации in situ». Цитогенетика и клеточная генетика. 83 (1–2): 100. Дои:10.1159/000015142. PMID  9925944. S2CID  34084848.
7. «Ген Entrez: убиквитинспецифическая пептидаза 7 USP7 (ассоциированная с вирусом герпеса)».
8. Эверетт Р.Д., Мередит М., Орр А., Кросс А., Катория М., Паркинсон Дж. (Апрель 1997 г.). «Новая убиквитинспецифическая протеаза динамически связана с ядерным доменом PML и связывается с регуляторным белком вируса герпеса». Журнал EMBO. 16 (7): 1519–30. Дои:10.1093 / emboj / 16.7.1519. ЧВК  1169756. PMID  9130697.
9. Holowaty MN, Sheng Y, Nguyen T., Arrowsmith C, Frappier L (ноябрь 2003 г.). «Домены взаимодействия белков убиквитин-специфической протеазы, USP7 / HAUSP». Журнал биологической химии. 278 (48): 47753–61. Дои:10.1074 / jbc.M307200200. PMID  14506283.
10. Ли М., Чен Д., Шайло А., Ло Дж., Николаев А.Ю., Цинь Дж., Гу В. (апрель 2002 г.). «Деубиквитинирование p53 с помощью HAUSP является важным путем стабилизации p53». Природа. 416 (6881): 648–53. Дои:10.1038 / природа737. PMID  11923872. S2CID  4389394.
11. ван дер Кнаап Дж. А., Кумар Б. Р., Мошкин Ю. М., Лангенберг К., Крайгсвельд Дж., Хек А. Дж., Карч Ф., Верриджзер С. П. (март 2005 г.). «GMP-синтетаза стимулирует деубиквитилирование гистона H2B эпигенетическим сайленсером USP7». Молекулярная клетка. 17 (5): 695–707. Дои:10.1016 / j.molcel.2005.02.013. PMID  15749019.
12. ван дер Кнаап Я.А., Кожевникова Е., Лангенберг К., Мошкин Ю.М., Веррийзер С.П. (февраль 2010 г.). «Биосинтетический фермент GMP-синтетаза взаимодействует с убиквитин-специфической протеазой 7 в регуляции транскрипции генов-мишеней экдистероидов». Молекулярная и клеточная биология. 30 (3): 736–44. Дои:10.1128 / MCB.01121-09. ЧВК  2812229. PMID  19995917.
13. Holowaty MN, Frappier L (ноябрь 2004 г.). «HAUSP / USP7 как мишень вируса Эпштейна-Барра». Сделки биохимического общества. 32 (Пт 5): 731–2. Дои:10.1042 / BST0320731. PMID  15494000.
14. Саркари Ф., Санчес-Алькарас Т., Ван С., Холовати М.Н., Шенг Й., Фраппье Л. (октябрь 2009 г.). Спек Ш. (ред.). «EBNA1-опосредованное привлечение деубиквитилирующего комплекса гистона H2B к латентному ориджину репликации ДНК вируса Эпштейна-Барра». Патогены PLOS. 5 (10): e1000624. Дои:10.1371 / journal.ppat.1000624. ЧВК  2757719. PMID  19834552.
15. Хэ Й, Ли В, Ур Д, Чжан Х, Чжан Х, Ортиз Ю.Т., Будамагунта В, Кампизи Дж, Чжэн Дж, Чжоу Д. (2020). «Ингибирование активности USP7 выборочно устраняет стареющие клетки частично за счет восстановления активности p53». Ячейка старения. 19 (3): e13117. Дои:10.1111 / acel.13117. ЧВК  7059172. PMID  32064756.
16. Швертман П., Лагару А., Деккерс Д.Х., Рамс А., ван дер Хук А.С., Лаффебер С., Хоймейкерс Дж. Х., Деммерс Дж. А., Фустери М., Вермёлен В., Мартейн Дж. А. (май 2012 г.). «Белок УФ-чувствительного синдрома UVSSA привлекает USP7 для регулирования восстановления, связанного с транскрипцией». Природа Генетика. 44 (5): 598–602. Дои:10,1038 / нг. 2230. PMID  22466611. S2CID  5486230.
17. Хун С., Ким С.Дж., Ка С., Чой И., Кан С. (июнь 2002 г.). «USP7, убиквитин-специфическая протеаза, взаимодействует с атаксином-1, продуктом гена SCA1». Молекулярная и клеточная нейронауки. 20 (2): 298–306. Дои:10.1006 / mcne.2002.1103. PMID  12093161. S2CID  41295664.
18. Фауструп Х, Беккер-Йенсен С., Бартек Дж., Лукас Дж., Майланд Н. (январь 2009 г.). «USP7 противодействует SCFbetaTrCP-, но не APCCdh1-опосредованному протеолизу Claspin». Журнал клеточной биологии. 184 (1): 13–9. Дои:10.1083 / jcb.200807137. ЧВК  2615094. PMID  19124652.
19. Sowa ME, Беннетт EJ, Gygi SP, Harper JW (июль 2009 г.). «Определение ландшафта взаимодействия человеческого деубиквитинирующего фермента». Ячейка. 138 (2): 389–403. Дои:10.1016 / j.cell.2009.04.042. ЧВК  2716422. PMID  19615732.
20. Хао Й., Фонтан, доктор медицины, Фон Тасер К., Ся Ф, Би В., Канг Ш., Патель А, Розенфельд Дж. А., Ле Кайнек С., Исидор Б., Кранц И. Д., Нун ЮВ, Пфотенхауэр Дж. П., Морган ТМ, Моран Р., Педерсен Р. К., Saenz MS, Schaaf CP, Potts PR (сентябрь 2015 г.). «USP7 действует как молекулярный реостат, способствуя зависящей от WASH рециркуляции эндосомных белков и мутирует при расстройстве нервного развития человека». Мол. Ячейка. 59 (6): 956–69. Дои:10.1016 / j.molcel.2015.07.033. ЧВК  4575888. PMID  26365382.
21. «Заболевания, связанные с USP7». Национальная организация по редким заболеваниям (NORD).

дальнейшее чтение

• Д'Андреа А., Пеллман Д. (1999). «Деубиквитинирующие ферменты: новый класс биологических регуляторов». Критические обзоры по биохимии и молекулярной биологии. 33 (5): 337–52. Дои:10.1080/10409239891204251. PMID  9827704.
• Holowaty MN, Frappier L (ноябрь 2004 г.). «HAUSP / USP7 как мишень вируса Эпштейна-Барра». Сделки биохимического общества. 32 (Пт 5): 731–2. Дои:10.1042 / BST0320731. PMID  15494000.
• Эверетт Р.Д., Мередит М., Орр А., Кросс А., Катория М., Паркинсон Дж. (Февраль 1997 г.). «Новая убиквитин-специфическая протеаза динамически связана с ядерным доменом PML и связывается с регуляторным белком вируса герпеса». Журнал EMBO. 16 (3): 566–77. Дои:10.1093 / emboj / 16.3.566. ЧВК  1169660. PMID  9034339.
• Эверетт Р.Д., Мередит М., Орр А., Кросс А., Катория М., Паркинсон Дж. (Апрель 1997 г.). «Новая убиквитинспецифическая протеаза динамически связана с ядерным доменом PML и связывается с регуляторным белком вируса герпеса». Журнал EMBO. 16 (7): 1519–30. Дои:10.1093 / emboj / 16.7.1519. ЧВК  1169756. PMID  9130697.
• Сапата Дж. М., Павловски К., Хаас Э., Уэр К. Ф., Годзик А., Рид Дж. К. (июнь 2001 г.). «Разнообразное семейство белков, содержащих домены факторов, связанных с рецептором фактора некроза опухоли». Журнал биологической химии. 276 (26): 24242–52. Дои:10.1074 / jbc.M100354200. PMID  11279055.
• Ли М., Чен Д., Шайло А., Ло Дж., Николаев А.Ю., Цинь Дж., Гу В. (апрель 2002 г.). «Деубиквитинирование p53 с помощью HAUSP является важным путем стабилизации p53». Природа. 416 (6881): 648–53. Дои:10.1038 / природа737. PMID  11923872. S2CID  4389394.
• Хонг С., Ким С.Дж., Ка С., Чой И., Кан С. (июнь 2002 г.). «USP7, убиквитин-специфическая протеаза, взаимодействует с атаксином-1, продуктом гена SCA1». Молекулярная и клеточная нейронауки. 20 (2): 298–306. Дои:10.1006 / mcne.2002.1103. PMID  12093161. S2CID  41295664.
• Ху М., Ли П, Ли М, Ли В., Яо Т., Ву Дж. У., Гу В., Коэн Р. Э., Ши Й. (декабрь 2002 г.). «Кристаллическая структура деубиквитинирующего фермента UBP-семейства изолированно и в комплексе с убиквитиновым альдегидом». Ячейка. 111 (7): 1041–54. Дои:10.1016 / S0092-8674 (02) 01199-6. PMID  12507430. S2CID  8363066.
• Holowaty MN, Sheng Y, Nguyen T., Arrowsmith C, Frappier L (ноябрь 2003 г.). «Домены взаимодействия белков убиквитин-специфической протеазы, USP7 / HAUSP». Журнал биологической химии. 278 (48): 47753–61. Дои:10.1074 / jbc.M307200200. PMID  14506283.
• Браженович М., Джоберти Г., Кюстер Б., Бауместер Т., Дрюес Г. (март 2004 г.). «Всесторонний протеомный анализ человеческих белковых комплексов Par показывает взаимосвязанную белковую сеть». Журнал биологической химии. 279 (13): 12804–11. Дои:10.1074 / jbc.M312171200. PMID  14676191.
• Ли М., Брукс С.Л., Кон Н., Гу В. (март 2004 г.). «Динамическая роль HAUSP в пути p53-Mdm2». Молекулярная клетка. 13 (6): 879–86. Дои:10.1016 / S1097-2765 (04) 00157-1. PMID  15053880.
• Камминз Дж. М., Раго С., Кохли М., Кинзлер К. В., Ленгауэр С., Фогельштейн Б. (апрель 2004 г.). «Подавление опухоли: нарушение гена HAUSP стабилизирует p53». Природа. 428 (6982): 1 п после 486. Дои:10.1038 / природа02501. PMID  15058298. S2CID  4357501.
• Каннинг М., Бутелл С., Паркинсон Дж., Эверетт Р.Д. (сентябрь 2004 г.). «Убиквитинлигаза RING finger защищена от автокатализируемого убиквитинирования и деградации за счет связывания с убиквитин-специфической протеазой USP7». Журнал биологической химии. 279 (37): 38160–8. Дои:10.1074 / jbc.M402885200. PMID  15247261.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М.А., Кантли Л.С., Гиги С.П. (август 2004 г.). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Саридакис В., Шенг Й., Саркари Ф., Холовати М.Н., Шир К., Нгуен Т., Чжан Р.Г., Ляо Дж., Ли В., Эдвардс А.М., Эроусмит С.Х., Фраппье Л. (апрель 2005 г.). «Структура p53-связывающего домена HAUSP / USP7, связанного с ядерным антигеном 1 Эпштейна-Барра, имеет значение для EBV-опосредованной иммортализации». Молекулярная клетка. 18 (1): 25–36. Дои:10.1016 / j.molcel.2005.02.029. PMID  15808506.

внешние ссылки

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: Q93009 (Убиквитинкарбоксил-концевая гидролаза 7) на PDBe-KB.