Винсент Л. Пекораро - Vincent L. Pecoraro

Винсент Л. Пекораро

Винсент Л. Пекораро, профессор Мичиганского университета, исследователь в биоинорганическая химия и неорганическая химия. Он специалист по химии и биохимии марганец, ванадий, и металлическая корона химия. Он член Американская ассоциация развития науки

биография

Пекораро родился в Фрипорт, Нью-Йорк в августе 1956 г .; вскоре после этого его семья переехала в Калифорнию, где он провел большую часть своего детства.[1] По окончании средней школы продолжил образование в Калифорнийский университет в Лос-Анджелесе получил степень бакалавра наук. в области биохимии в 1977 году и защитил кандидатскую диссертацию. по химии на Калифорнийский университет в Беркли работая под Кен Рэймонд. После получения докторской степени он работал с У. Уоллес Клеланд на Университет Висконсин-Мэдисон для трехлетнего постдока. В 1984 году он был назначен доцентом кафедры университет Мичигана Кафедра химии.

Научные достижения

Металликроун

Металлакроуны и родственные органические краун-эфиры а) 12-краун-4 б) 12-MCFe (III) N-4 в) 15-краун-5 г) 15-MCCu (II) N-5

Металлокоронки представляют собой класс циклических соединений, которые содержат ионы металлов и неметаллы в повторяющихся звеньях. Винсент Л. Пекораро и Мён Су Ла сообщили о первом металлическая корона в 1989 году, и с тех пор эти соединения превратились в отдельную область исследований с многочисленными новыми приложениями.[2] Одним из наиболее интересных аспектов этих соединений является их разнообразие. Размер кольца можно изменить, установив новые лиганды или различные металлы в каркас, что приводит к изменению размера внутренней полости.[3] Таким образом, определенные ионы могут быть селективно захвачены в центре за счет настройки структуры металлической короны, а также путем изменения окружающей среды, такой как растворитель.[4] Благодаря этим уникальным свойствам и присущим зелень связанный с синтезом металлического крана (обычно с высоким выходом, одностадийным, безвредным растворителем), это все еще является активной темой исследований для группы Pecoraro и многих других ученых по всему миру.

Группа Pecoraro в настоящее время работает над использованием металлокоронок с селективным связыванием для различных биологических применений. Одно приложение использует металлические краски для медицинская визуализация. В настоящее время, гадолиний (Gd) используется в МРТ как контрастирующий агент в сочетании с хелатирующим лигандом. К сожалению, если Gd освобождается от своего хелатирующего агента, Gd довольно токсичен для человека.[5] Эти хелаты гадолиния представляют собой множество опасностей для здоровья и даже могут привести к смерти, хотя это редкое явление и обычно наблюдается только у пациентов с проблемами почек.[6] К счастью, этот же металл может быть избирательно и очень сильно захвачен металлическим мотивом короны.[7] В настоящее время группа работает над тем, чтобы подвергнуть эту систему воздействию различных условий, наблюдаемых в организме, таких как различные pH, а также различные соединения и металлы, которые также могут связываться с металлической короной, чтобы гарантировать, что токсичный Gd не будет вытеснен из металлической короны. .[1] Другие потенциальные применения металлокоронок в организме включают гидролиз фосфатных диэфиров, ключевой связующий компонент в РНК и ДНК.

Другая часть исследований группы Pecoraro в области металлических коронок сосредоточена на их применении в качестве одномолекулярный магнит. Металлакриптат можно рассматривать как металлическую корону в трех измерениях с оксид марганца в ловушке посередине.[8] Самое интересное в этом соединении то, что эта молекула действует как одномолекулярный магнит.[8] В настоящее время группа продолжает работать над полным пониманием этой системы с конечной целью - применить ее к запоминающим устройствам.

Исследование отделения лантанидов[9]

Марганец

Структура каталазы

Группа Пекораро также исследует роль марганец в биологических системах с особым интересом к марганцу (Mn) на основе ферменты. Эти ферменты выполняют множество важных функций в организме, в том числе действуют как антиоксидант (супероксиддисмутаза )[10] и защита клетки от окисления (каталаза ).[11] Группа также изучает кислород выделяющий комплекс, который катализирует окисление воды. Это соединение играет ключевую роль в растении фотосинтез преобразования CO2 и воды в сахар.[12]

Группа Pecoraro подходит к этим соединениям на основе марганца, сначала создавая модельные системы и изучая их. Группе удалось синтезировать комплекс диманганца, в котором атомы Mn имели такое же разделение, как и в кислород выделяющий комплекс (OEC), также имея аналогичное лигандное окружение. Также было показано, что это соединение имеет каталитическую активность, аналогичную активности каталаза.[13] Информация, полученная из этой системы, привела к новым предложениям относительно того, как происходит OEC. Один механизм включает последовательное окисление OEC отбор водорода.[14] Группа проверила жизнеспособность этого механизма с помощью термодинамический расчеты и исследования их фиктивной системы, чтобы обнаружить, что это действительно возможный механизм.[14] Этот димерный Также было обнаружено, что система существует с множеством различных степеней окисления марганца. Было показано, что эти состояния окисления также существуют в каталазе. Наблюдая за привязкой гидроксид к одному из марганца создается несимметричный димер.[15]

Ванадий

Его группа интересуется ванадий для биоинорганических приложений. Ванадий естественным образом содержится в ферменты у некоторых морских животных. Один из этих типов ферментов, нитрогеназы, несут ответственность за преобразование азот газ для аммиак и затем могут быть доступны растениям, что имеет решающее значение для их развития.[16] Другой тип, галопероксидазы, берет бром из морской воды вместе с пероксид водорода и превращает их в броморганический соединения.[17] Эти уникальные комплексы ванадия, а также другие встречаются у некоторых земных существ, таких как грибы. Кроме того, эти соединения могут быть очень полезны для людей, поскольку, как было установлено, они помогают людям с сахарный диабет за счет улучшения контроля глюкозы.[18]Группа Pecoraro взяла эти интересные применения ванадия и начала исследования, чтобы лучше понять их. В частности, галопероксидазы были в центре внимания исследований. Во-первых, группа синтезировала комплексы ванадия, чтобы имитировать галопероксидазы ванадия, чтобы понять механизм. Мало того, что их система эффективно катализировать реакции, но они также смогли собрать ценные кинетический данные и придумать предлагаемый каталитический цикл как показано ниже.[19] Информация показала, что для катализа необходима кислота / основание. Имея эту информацию в руках, предпринимаются попытки понять, как эти комплексы активируются естественным путем, позволяя галогениду окисление.[20] Кроме того, они работают над пониманием структуры неактивных форм этих галопероксидаз на основе ванадия.[1] Эта информация предоставит важную информацию о том, как эти галопероксидазы ванадия обнаруживаются и действуют в этих биологических системах, что, в свою очередь, приблизит группу на один шаг к возможности применять соединения ванадия для лечения диабета.

Предлагаемый каталитический цикл для получения галогенидов на основе ванадия

Металлопептиды

Наблюдаемая геометрия связывания в пептидах

Группа также проводит исследования роли тяжелые металлы в организме и как уменьшить их токсическое действие. Тяжелые металлы, такие как вести и Меркурий токсичны для человеческого организма и могут привести к опасным для жизни заболеваниям, таким как Болезнь Минамата.[21] К сожалению, человеческий организм снова практически беззащитен перед этими металлами. Проблема с ртутью и свинцом заключается в том, что они вытесняют цинк в ферментах, что приводит к остановке реакционной способности. Они также сильно координируют сера часто приводит к неправильная укладка белков, содержащих цистеины. Мышьяк также является другим металлом, вызывающим озабоченность, поскольку он заменяет азот в ДНК вызывая отклонение от его желаемой и необходимой роли. Все эти металлы, а также многие другие имеют серьезные последствия для здоровья. Хотя у людей нет способа справиться с этими тяжелыми металлами, было обнаружено, что бактерии разработали способы удаления этих металлов для предотвращения токсических побочных эффектов. Эта информация - то, что мотивирует группу Pecoraro.

Первоначальные исследования были сосредоточены на понимании связывания этих тяжелых металлов с пептиды. Мышьяк (В качестве), Меркурий (Hg) и кадмий (Cd) все были использованы в системах с различными пептидами. Было обнаружено, что мышьяк связывается с пептидами в основном через тригонально-пирамидальную или тетраэдрическую форму, что является кинетически и термодинамически благоприятным образом.[22] С другой стороны, было обнаружено, что ртуть связывается с двумя атомами серы в отдельных пептидах через линейную форму, таким образом вызывая образование двухцепочечной спиральная катушка.[23] Было также показано, что при определенных условиях, называемых ступенчатой ​​агрегацией-депротонированием, ртуть может быть использована для связывания трех серы, в результате чего получается трехниточная спиральная спираль с Hg в середине.[24] Кадмий был последним тяжелым металлом, изученным в этих системах. Было обнаружено, что Cd также связывается с тремя отдельными серами, хотя он не похож на систему Hg в том смысле, что он не образует линейной формы связывания внутри двухцепочечной спиральной спирали.[25] Полученная информация дает ценную информацию о том, как эти тяжелые металлы влияют на белки и их укладку. Это первый шаг к пониманию и потенциальному решению проблемы связывания тяжелых металлов в организме.

Пептиды, созданные De Novo

По крайней мере, треть всех белков содержат хотя бы один металл. Несколько примеров этих белков можно увидеть выше (каталаза и выделяющий кислород комплекс). При рассмотрении различных ролей, которые эти металлопротеины играть, начиная от гидролитический После разрыва связи с фотосинтетическими ролями растений удивительно, насколько мало на самом деле известно о роли металла. Для решения этой проблемы группа Pecoraro предприняла de novo или "с нуля" белковый дизайн. Эта методология позволяет получить уникальную аминокислотную последовательность, сайт связывания металла и, наконец, укладку белка. Группа Пекораро проявляет особый интерес к размещению сайта связывания, поскольку они считают, что изменение окружающей среды металла в конечном итоге вызовет драматический эффект во всех процессах, связанных с металлом, таких как каталитическая активность, скорость и сила связывания.[26]

Его группа создала первый биметаллический искусственный протеин. Этот белок содержит как Меркурий, для стабильности, и цинк, для каталитической активности, и было доказано, что он выполняет различные гидролитические реакции природных белков.[27] Там, где большинство синтетических соединений не работают аналогично натуральным белкам, особенно карбоангидраза, этот искусственный металлопротеин продемонстрировал эффективность, аналогичную карбоангидраза, один из самых быстрых и высококаталитических белков в мире.[27]

Почести

  • Сотрудник Фонда Горация Х. Рэкхема (1985)
  • Сотрудник Фонда Эли Лилли (1985)
  • Ученый биомедицинских исследований Г.Д. Серла (1986-1989)
  • Сотрудник Альфреда П. Слоана (1989–1990)
  • Премия LS&A за выдающиеся достижения в области обучения студентов (1991)
  • Награда ACS Akron Section за выдающиеся достижения в области химии (1995)
  • Преподаватель Frontier, Техасский университет A&M (1996 год)
  • Преподаватель Мэри Кэпп, Университет Содружества Вирджинии (1997 год)
  • Керхер, лектор, Оклахомский университет (1999)
  • Лектор PittCon, Университет Дюкен (2004 г.)
  • Премия Александра фон Гумбольдта для старших ученых США (1998–99)
  • Председатель конференции «Металлы в биологии» Гордона (2000 г.)
  • Научный сотрудник Американской ассоциации развития науки (2000 г.)
  • Премия факультета наук имени Маргарет и Германа Сокол (2004-5)
  • La Chaire Internationale des Recherche Blaise Pascal (2010-2012)
  • Национальный лектор Тайваня (2010)
  • Сотрудник ACS (2010)
  • Премия Ванадиса (2010)

Рекомендации

  1. ^ а б c Пекораро, Винсент. "Веб-страница Pecoraro Group". Pecoraro Group. Получено 28 ноября 2013.
  2. ^ Ла, Мён Су; Пекораро, Винсент Л. (август 1989 г.). «Выделение и характеристика {MnII [MnIII (салицилгидроксимат)] 4 (ацетат) 2 (ДМФ) 6} .cntdot.2DMF: неорганический аналог M2 + (12-краун-4)». Журнал Американского химического общества. 111 (18): 7258–7259. Дои:10.1021 / ja00200a054.
  3. ^ Mezei, Gellert; Залески, Кертис М .; Пекораро, Винсент Л. (ноябрь 2007 г.). «Структурно-функциональная эволюция металлических коронок». Химические обзоры. 107 (11): 4933–5003. Дои:10.1021 / cr078200h. PMID  17999555.
  4. ^ Stemmler, Ann J .; Кампф, Джефф У .; Пекораро, Винсент Л. (декабрь 1996 г.). «Планарный [15] Metallacrown-5, который избирательно связывает ураниловый катион». Angewandte Chemie International Edition на английском языке. 35 (2324): 2841–2843. Дои:10.1002 / anie.199628411.
  5. ^ Пенфилд, Джеффри Джи; Рейли, Роберт Ф (декабрь 2007 г.). «Что нефрологам нужно знать о гадолинии». Природа Клиническая Практика Нефрология. 3 (12): 654–668. Дои:10.1038 / ncpneph0660. PMID  18033225.
  6. ^ Гробнер, Т. (19 декабря 2005 г.). «Гадолиний - специфический спусковой крючок для развития нефрогенной фиброзирующей дермопатии и нефрогенного системного фиброза?». Нефрологическая диализная трансплантация. 21 (4): 1104–1108. Дои:10.1093 / ndt / gfk062. PMID  16431890.
  7. ^ Coucouvanis, Dimitri, ed. (2002). Неорганические синтезы. Нью-Йорк: Джон Вили и сыновья. ISBN  978-0-471-46075-6.
  8. ^ а б Дендрину-Самара, Екатерина; Алексиу, Мария; Залески, Кертис М .; Кампф, Джефф У .; Кирк, Мартин Л .; Kessissoglou, Dimitris P .; Пекораро, Винсент Л. (18 августа 2003 г.). «Синтез и магнитные свойства металлакрипта, который ведет себя как одномолекулярный магнит». Angewandte Chemie. 115 (32): 3893–3896. Дои:10.1002 / ange.200351246.
  9. ^ Тегони, Маттео; Фурлотти, Микеле; Тропиано, Мануэль; Лим, Чунг Сун; Пекораро, Винсент Л. (7 июня 2010 г.). «Термодинамика замены основного металла и самосборки Ca 15-Metallacrown-5». Неорганическая химия. 49 (11): 5190–5201. Дои:10.1021 / ic100315u. PMID  20429607.
  10. ^ Пекораро, Винсент Л., изд. (1992). Редокс-ферменты марганца. Нью-Йорк, Нью-Йорк: ВЧ. ISBN  978-0471187431.
  11. ^ Chelikani, P .; Fita, I .; Лёвен, П. К. (1 января 2004 г.). «Разнообразие структур и свойств каталаз». Клеточные и молекулярные науки о жизни. 61 (2): 192–208. Дои:10.1007 / s00018-003-3206-5. PMID  14745498.
  12. ^ Орт, Дональд Р., изд. (1996). Кислородный фотосинтез: световые реакции. Дордрехт [u.a.]: Kluwer Acad. Publ. ISBN  978-0-7923-3683-9.
  13. ^ Болдуин, Майкл Дж .; Закон, Нил А.; Stemmler, Timothy L .; Кампф, Джефф У .; Пеннер-Хан, Джеймс Э.; Пекораро, Винсент Л. (октябрь 1999 г.). «Реакционная способность [{Mn (salpn)} (μ-O, μ-OCH)] и [{Mn (salpn)} (μ-O, μ-OH)]: эффекты лабильности протонов и водородной связи». Неорганическая химия. 38 (21): 4801–4809. Дои:10.1021 / ic990346e.
  14. ^ а б Болдуин, Майкл Дж .; Пекораро, Винсент Л. (январь 1996 г.). "Энергетика протонно-связанного переноса электронов в системах с высоким валентным Mn (μ-O): модели окисления воды кислородно-выделяющим комплексом фотосистемы II". Журнал Американского химического общества. 118 (45): 11325–11326. Дои:10.1021 / ja9626906.
  15. ^ Кодл, М. Тайлер; Пекораро, Винсент Л. (апрель 1997 г.). «Термодинамическая жизнеспособность переноса атома водорода из воды в координированный кислород-выделяющий комплекс фотосистемы II». Журнал Американского химического общества. 119 (14): 3415–3416. Дои:10.1021 / ja9641158.
  16. ^ Робсон, Роберт Л .; Иди, Роберт Р .; Ричардсон, Тоби Х .; Миллер, Ричард В .; Хокинс, Мари; Постгейт, Джон Р. (24 июля 1986 г.). «Альтернативной нитрогеназой Azotobacter chroococcum является фермент ванадий». Природа. 322 (6077): 388–390. Bibcode:1986Натура.322..388R. Дои:10.1038 / 322388a0.
  17. ^ Батлер, Элисон; Картер-Франклин, Джейм Н. (2004). «Роль ванадийбромопероксидазы в биосинтезе галогенированных морских природных продуктов». Отчеты о натуральных продуктах. 21 (1): 180–8. Дои:10.1039 / b302337k. PMID  15039842.
  18. ^ Halberstam, M .; Cohen, N .; Шлимович, П .; Россетти, Л .; Шамун, Х. (1 мая 1996 г.). «Пероральный ванадилсульфат улучшает чувствительность к инсулину при NIDDM, но не у пациентов с ожирением, не страдающих диабетом». Сахарный диабет. 45 (5): 659–666. Дои:10.2337 / диабет.45.5.659. PMID  8621019.
  19. ^ Colpas, Gerard J .; Hamstra, Brent J .; Кампф, Джефф У .; Пекораро, Винсент Л. (январь 1996 г.). «Функциональные модели для галопероксидазы ванадия: реакционная способность и механизм окисления галогенидов». Журнал Американского химического общества. 118 (14): 3469–3478. Дои:10.1021 / ja953791r.
  20. ^ Schneider, Curtis J .; Пеннер-Хан, Джеймс Э.; Пекораро, Винсент Л. (март 2008 г.). «Выяснение места протонирования комплексов пероксида ванадия и значение для биомиметического катализа». Журнал Американского химического общества. 130 (9): 2712–2713. Дои:10.1021 / ja077404c. PMID  18266364.
  21. ^ Адефрис, Адаль. «Токсичность хэви-метала». Medscape. Получено 28 ноября 2013.
  22. ^ Фаррер, Брайан Т .; McClure, Craig P .; Пеннер-Хан, Джеймс Э.; Пекораро, Винсент Л. (ноябрь 2000 г.). «Взаимодействия мышьяка (III) -цистеина стабилизируют трехспиральные связки в водном растворе». Неорганическая химия. 39 (24): 5422–5423. Дои:10.1021 / ic0010149.
  23. ^ Фаррер, Брайан Т .; Harris, Nzingha P .; Balchus, Kristen E .; Пекораро, Винсент Л. (декабрь 2001 г.). "Термодинамическая модель стабилизации тригональной тиолатной ртути (II) в разработанных трехцепочечных спиральных катушках". Биохимия. 40 (48): 14696–14705. Дои:10.1021 / bi015649a.
  24. ^ Фаррер, Б. Т .; Пекораро, В. Л. (27 января 2003 г.). «Связывание Hg (II) со слабо связанной спиральной спиралью зарождает закодированную складку металлопротеина: кинетический анализ». Труды Национальной академии наук. 100 (7): 3760–3765. Дои:10.1073 / pnas.0336055100. ЧВК  152995. PMID  12552128.
  25. ^ Мацапетакис, Манолис; Фаррер, Брайан Т .; Вэн, Цу-Чиен; Хеммингсен, Ларс; Пеннер-Хан, Джеймс Э.; Пекораро, Винсент Л. (июль 2002 г.). «Сравнение связывания кадмия (II), ртути (II) и мышьяка (III) с пептидами, разработанными de Novo TRI L12C и TRI L16C». Журнал Американского химического общества. 124 (27): 8042–8054. Дои:10.1021 / ja017520u.
  26. ^ Застров, Мелисса Л. (2013). «Влияние местоположения активного центра на каталитическую активность в металлоферментах цинка, разработанных de Novo». Журнал Американского химического общества. 135 (15): 5895–5903. Дои:10.1021 / ja401537t. ЧВК  3667658. PMID  23516959.
  27. ^ а б Zastrow, Melissa L .; Павлин, Анна Ф. А .; Стаки, Жанна А .; Пекораро, Винсент Л. (27 ноября 2011 г.). «Гидролитический катализ и структурная стабилизация в разработанном металлопротеине». Химия природы. 4 (2): 118–123. Дои:10.1038 / NCHEM.1201. ЧВК  3270697. PMID  22270627.