WDR3 - WDR3

Для немецкой радиостанции см. Westdeutscher Rundfunk.

WDR3
Идентификаторы
Псевдонимы	WDR3, DIP2, UTP12, домен повтора WD 3
Внешние идентификаторы	OMIM: 604737 MGI: 2443143 ГомолоГен: 4937 Генные карты: WDR3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1п12 Начинать 117,929,720 бп[1] Конец 117,966,543 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 | 3 F2.2 Начинать 100,138,180 бп[2] Конец 100,162,407 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание snoRNA • Связывание РНК Сотовый компонент • Pwp2p-содержащий субкомплекс прерибосомы 90S • процессом малых субъединиц • не мембрана • ядрышко • нуклеоплазма • ядро клетки Биологический процесс • обработка рРНК • созревание SSU-рРНК Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	10885	269470
Ансамбль	ENSG00000065183	ENSMUSG00000033285
UniProt	Q9UNX4	Q8BHB4
RefSeq (мРНК)	NM_006784	NM_175552 NM_001355657
RefSeq (белок)	NP_006775	NP_780761 NP_001342586
Расположение (UCSC)	Chr 1: 117.93 - 117.97 Мб	Chr 3: 100.14 - 100.16 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок 3, содержащий повторы WD это белок что у людей кодируется WDR3 ген.^[5][6]

Этот ген кодирует ядерный белок, содержащий 10 повторов WD. Повторы WD представляют собой домены из 30-40 аминокислот, содержащие несколько консервативных остатков, которые обычно включают trp-asp на С-конце. Белки, принадлежащие к семейству повторов WD, участвуют во множестве клеточных процессов, включая развитие клеточного цикла, передачу сигнала, апоптоз и регуляцию генов.^[6]

Модельные организмы

Wdr3 нокаутный фенотип мыши

Характеристика	Фенотип
Гомозигота жизнеспособность	Аномальный
Рецессивный смертельное исследование	Аномальный
Плодородие	Нормальный
Масса тела	Нормальный
Беспокойство	Нормальный
Неврологический осмотр	Нормальный
Сила захвата	Нормальный
Горячая тарелка	Нормальный
Дисморфология	Нормальный
Косвенная калориметрия	Нормальный
Тест толерантности к глюкозе	Нормальный
Слуховой ответ ствола мозга	Нормальный
DEXA	Нормальный
Рентгенография	Нормальный
Температура тела	Нормальный
Морфология глаза	Нормальный
Клиническая химия	Нормальный
Гематология	Нормальный
Лимфоциты периферической крови	Нормальный
Микроядерный тест	Нормальный
Вес сердца	Нормальный
Гистопатология мозга	Нормальный
Сальмонелла инфекционное заболевание	Нормальный[7]
Citrobacter инфекционное заболевание	Нормальный[8]
Все тесты и анализы от[9][10]

Модельные организмы были использованы при изучении функции WDR3. Условный нокаутирующая мышь линия, называемая Wdr3^{tm1a (КОМП) Wtsi[11][12]} был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse программа - проект по мутагенезу с высокой пропускной способностью для создания и распространения моделей болезней на животных среди заинтересованных ученых.^[13][14][15]

Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения последствий удаления.^[9][16] Было проведено 24 испытания на мутант мышей и двух значительных отклонений не наблюдалось.^[9] Нет гомозиготный мутант эмбрионы были идентифицированы во время беременности, и поэтому ни один из них не выжил до отлучение от груди. Остальные испытания проводились на гетерозиготный мутантные взрослые мыши; у этих животных не наблюдалось никаких дополнительных значительных отклонений от нормы.^[9]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000065183 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033285 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Клаудио Дж. О., Лью С. К., Ма Дж., Хенг Х. Х., Стюарт А. К., Хоули Р. Г. (август 1999 г.). «Клонирование и анализ экспрессии нового гена повтора WD, WDR3, сопоставление с 1p12-p13». Геномика. 59 (1): 85–9. Дои:10.1006 / geno.1999.5858. PMID  10395803.
6. «Ген Entrez: домен 3 повтора WD WDR3».
7. "Сальмонелла данные о заражении Wdr3 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
8. "Citrobacter данные о заражении Wdr3 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
9. Гердин А.К. (2010). "Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью". Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x.
10. Портал ресурсов мыши, Институт Wellcome Trust Sanger.
11. «Международный консорциум нокаут-мышей».
12. "Информатика генома мыши".
13. Skarnes, W. C .; Rosen, B .; West, A. P .; Koutsourakis, M .; Бушелл, Вт .; Iyer, V .; Mujica, A.O .; Thomas, M .; Harrow, J .; Cox, T .; Джексон, Д .; Severin, J .; Biggs, P .; Fu, J .; Нефедов, М .; Де Йонг, П. Дж .; Стюарт, А. Ф .; Брэдли, А. (2011). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–342. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК  3572410. PMID  21677750.
14. Долгин Э (2011). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
15. Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (2007). «Мышь на все случаи жизни». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247.
16. ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геном Биол. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК  3218837. PMID  21722353.

дальнейшее чтение

• Nousiainen M, Silljé HH, Sauer G, et al. (2006). «Фосфопротеомный анализ митотического веретена человека». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 103 (14): 5391–6. Дои:10.1073 / pnas.0507066103. ЧВК  1459365. PMID  16565220.
• Андерсен Дж. С., Лам Ю. В., Леунг А. К. и др. (2005). «Динамика нуклеолярного протеома». Природа. 433 (7021): 77–83. Дои:10.1038 / природа03207. PMID  15635413.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Scherl A, Couté Y, Déon C и др. (2003). «Функциональный протеомный анализ ядрышка человека». Мол. Биол. Клетка. 13 (11): 4100–9. Дои:10.1091 / mbc.E02-05-0271. ЧВК  133617. PMID  12429849.
• Андерсен Дж. С., Лион CE, Фокс А. Х. и др. (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека». Curr. Биол. 12 (1): 1–11. Дои:10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9. PMID  11790298.
• Клаудио Дж.О., Лью С.К., Демпси А.А. и др. (1999). «Идентификация меченых последовательностью транскриптов, дифференциально экспрессируемых в гемопоэтической иерархии человека». Геномика. 50 (1): 44–52. Дои:10.1006 / geno.1998.5308. PMID  9628821.