WWC2 - WWC2

WWC2
Идентификаторы
Псевдонимы	WWC2, BOMB, WW и домен C2, содержащий 2
Внешние идентификаторы	MGI: 1261872 ГомолоГен: 32618 Генные карты: WWC2
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 4 (человек)
Конец	183,320,777 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 8 (мышь)
Конец	47,990,924 бп
Генная онтология
Молекулярная функция	• GO: 0032947 активность молекулярного адаптера; • связывание киназы;
Сотовый компонент	• цитозоль;
Биологический процесс	• отрицательная регуляция роста органов; • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • отрицательная регуляция передачи сигналов бегемота;
	Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
	80014
	52357
	ENSG00000151718
	ENSMUSG00000031563
	Q6AWC2
	Q6NXJ0
	NM_024949
	NM_133791
	NP_079225
	NP_598552
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

WW и домен C2, содержащий 2 (WWC2) - это белок, который у человека кодируется WWC2 ген (4q35.1). Хотя функция WWC2 остается неизвестной, было предсказано, что WWC2 может играть роль в развитии рака.

Ген

Locus

Человеческий ген WWC2 находится на хромосома 4 на полосе 4q35.1. Ген находится на плюсовой цепи хромосомы и имеет длину 8 822 пары оснований. Ген содержит 23 экзона. Локус WWC2 довольно сложен и, по-видимому, продуцирует несколько белков без перекрытия последовательностей.^[5]

Псевдонимы

Обычный псевдоним гена - BH3-Only Member B (BOMB).^[6]

Гомология

Паралоги

У людей обнаружены два паралога WWC2: WWC1 и WWC3. WWC1 расположен на хромосома 5 и является вероятным регулятором Сигнальный путь бегемота который играет роль в подавлении опухоли, ограничивая пролиферацию и способствуя апоптозу.^[7] WWC3 находится на хромосома X и о его функциях известно не так много.

Последовательность	Род / вид	Номер доступа	Seq. длина	Seq. личность
WWC2	Homo sapiens	NP_079225	1192 аа	100%
КИБРА (WWC1)	Homo sapiens	AA015881	1113 лет назад	49.7%
WWC3	Homo sapiens	NP_056506	1092 аа	41.2%

Ортологи

WWC2 хорошо сохраняется в Млекопитающие, Авес, Рептилии, и Амфибия, а также редкие латимерия, который более тесно связан с двоякодышащими рыбами, рептилиями и млекопитающими, чем с лучевыми плавниками. WWC2 сохраняется в некоторых Актиноптеригии, Брюхоногие, и Двустворчатые моллюски. Однако WWC2 плохо сохраняется в Насекомое.

Род / Вид	Распространенное имя	Дата расхождения	Номер доступа	Seq. личность
Homo sapiens	Человек	Нет данных	NP_079225	100%
Пан троглодиты	Шимпанзе	6,1 млн лет	XP_003310624	99%
Heterocephalus glaber	Голый землекоп	91 MYA	EHB18748	88%
Mus musculus	Мышь	91 MYA	NP_598552	86%
Orcinus orca	Косатка	97,4 млн лет	XP_004281794	90%
Bos mutus	Як	97,4 млн лет	XP_005903227	84%
Аллигатор миссисипиенсис	Аллигатор	324,5 млн лет	XP_006269678	79.2%
Пелодискус китайский	Китайская черепаха с мягким панцирем	324,5 млн лет	XP_006130219	79%
Анас платиринхос	Кряква	324,5 млн лет	EOA93642	78%
Falco peregrinus	Сапсан	324,5 млн лет	XP_005230882	77%
Ficedula albicollis	Ошейниковая мухоловка	324,5 млн лет	XP_005045160	76%
Xenopus (Silurana) tropicalis	Западная когтистая лягушка	361,2 млн. Лет	NP_001004872	71%
Офиофаг ханна	Королевская кобра	362,2 млн лет	ETE71408	71%
Latimeria chalumnae	Целакант	430 млн лет	XP_005989542	72%
Такифугу рубрипс	Рыба фугу	454,6 млн лет	XP_003973883	55%
Данио Рерио	Данио	454,6 млн лет	XP_689275	53%
Xiphophorus maculatus	Южный плоскодонный	454,6 млн лет	XP_005800442	51%
Аплизия калифорнийская	Калифорнийский морской заяц (слизняк)	782,7 млн. Лет	XP_005096216	51%
Crassostrea gigas	Тихоокеанская устрица	910 MYA	EKC42771	39%
Anopheles darlingi	Комар	910 MYA	ETN67979	34%
Drosophila melanogaster	Плодовая муха	910 MYA	AAF55090.2	28.9%

Протеин

Первичная последовательность

Ген кодирует белок, также называемый WWC2, который состоит из 1192 аминокислот. Молекулярная масса белка составляет 133,9 килодальтон.^[8] Белок богат серином и не содержит зарядовых кластеров, гидрофобных сегментов или трансмембранных доменов. Изоэлектрическая точка 5.23800^[9]

Домены и мотивы

WWC2 является членом семейства белков WWC.^[10] который состоит из WW домен и C2 домен.WWC2 содержит два домена WW и один домен C2. WWC2 также содержит два домена с неизвестной функцией, DUF342 и DUF444. А лейциновая молния находится в позиции 854.

Пост-трансляционные модификации

Белок WWC2, по прогнозам, будет очень фосфорилированный.^[11] Есть 89 прогнозируемых участков серин фосфорилирование, 17 предсказанных сайтов треонин фосфорилирование и 11 предполагаемых сайтов тирозин фосфорилирование. Эти числа были относительно постоянными для ортологичных белков.

Также предполагается, что p38 митоген-активированные протеинкиназы и киназа гликогенсинтазы 3 связать в позиции T3, и казеинкиназа 2 связывается в положениях S13 и T50.^[12]

Выражение

Выражение

WWC2 экспрессируется на низком уровне и является тканевой, специфичной для матки, щитовидной железы, легких и печени. Выражение WWC2 оказывается повышенным в бластоциста и стадии развития плода.

Варианты стенограммы

Для WWC2 существует множество вариантов транскрипции. Те, которые изменяют высококонсервативный аминокислотный остаток или окружают высококонсервативный аминокислотный остаток, перечислены ниже:

SNP	Аллель	Остаток белка	Аминокислотное положение
rs200024780	От А до G	Тир (T) в Cys (C)	470
rs191286964	С к Т	Arg (R) в Cys (C)	1082
rs139606516	G в T	Arg (R) в Leu (L)	1082
rs149738870	От А до G	Asn (N) в Ser (S)	1084

Взаимодействующие белки

Факторы транскрипции

Факторы транскрипции с наивысшими значениями матрицы, которые связываются с последовательностями внутри промотора (ID GXP_1499160), показаны ниже:

СТАТ (преобразователь сигнала и активатор транскрипции)
Мышцы Коробка ТАТА
NOLF (нейрон-специфический обонятельный фактор)
XCPE (основной промоторный элемент 1 гена X)
CTCF (CCCTC-связывающий фактор)
HDBP (болезнь Хантингтона регуляторная область гена)
OCT1 (октамер-связывающий белок)
E2FF (E2F -мой с активатор регулятора клеточного цикла)
ZF57 (белок 57 цинкового пальца домена KRAB)
ZF07 (фактор транскрипции цинкового пальца C2H2 7)
EGRF (белок, индуцированный фактором роста нервов / EGR)
CDEF (элемент, зависимый от клеточного цикла - сайт связывания CDF-1)
AP2F (белок-активатор 2)

Белки

Потенциально взаимодействующие белки включают: YWHAZ, YWHAQ, RUVBL1, и REPS1.

Клиническое значение и текущая биоинформация

Хотя точная функция WWC2 остается неизвестной, несколько мутаций и вариантов WWC2 были исследованы при болезни. Роман миссенс-мутация в WWC2 был проанализирован в Синдром беспокойных ног, но не был идентифицирован как ген-кандидат.^[13] В одном исследовании изучалась роль дрозофилы КИБРА (WWC1) в сигнальном каскаде Expanded-Hippo-Warts, который участвует в подавление опухоли. В исследовании говорится, что аберрация числа копий, транслокация и точечные мутации WWC2, а также других генов должны быть дополнительно изучены при раке человека.^[14] Псевдоним WWC2, BOMB, был исследован в рамках гранта, предполагающего, что BOMB вместе с двумя другими генами (АПОЛ6 и APOL1 ) способствовал гибели клеток в p53 -ноль Клетки HCT116.