ZHX3 - ZHX3

ZHX3
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2DA5, 2DN0
Идентификаторы
Псевдонимы	ZHX3, TIX1, цинковые пальцы и гомеобоксы 3
Внешние идентификаторы	OMIM: 609598 MGI: 2444772 ГомолоГен: 9000 Генные карты: ZHX3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 20 (человек)[1] Группа 20q12 Начинать 41,178,448 бп[1] Конец 41,317,672 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 | 2 H2 Начинать 160,748,708 бп[2] Конец 160,872,998 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • Связывание ДНК • GO: 0001948 связывание с белками • активность гомодимеризации белков • GO: 0001106 транскрипционная корепрессорная активность • связывание ионов металлов • активность гетеродимеризации белков • связывание нуклеиновой кислоты • Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II Сотовый компонент • ядро клетки • нуклеоплазма Биологический процесс • дифференциация клеток • положительная регуляция дифференцировки остеобластов • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция, ДНК-шаблон Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	23051	320799
Ансамбль	ENSG00000174306	ENSMUSG00000035877
UniProt	Q9H4I2	Q8C0Q2
RefSeq (мРНК)	NM_015035	NM_177263
RefSeq (белок)	NP_055850	NP_796237
Расположение (UCSC)	Chr 20: 41.18 - 41.32 Мб	Chr 2: 160,75 - 160,87 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Цинковые пальцы и протеин гомеобоксов 3 это белок что у людей кодируется ZHX3 ген.^[5][6]

Этот ген кодирует член семейства генов цинковых пальцев и гомеобоксов (ZHX). Закодированный Протеин содержит два цинковых пальца типа C2H2 и пять Homeodomains и образует Димер с собой или с Цинковые пальцы и член семьи гомеобоксов 1. В Ядро димеризованный белок взаимодействует с субъединицей А повсеместно распространенного фактора транскрипции ядерного фактора-Y и может функционировать как репрессор транскрипции.^[6]FX

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000174306 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000035877 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Исикава К., Нагасе Т., Накадзима Д., Секи Н., Охира М., Миядзима Н., Танака А., Котани Н., Номура Н., Охара О. (февраль 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. VIII. 78 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 4 (5): 307–13. Дои:10.1093 / днарес / 4.5.307. PMID  9455477.
6. «Entrez Gene: цинковые пальцы и гомеобоксы ZHX3 3».

дальнейшее чтение

• Накадзима Д., Окадзаки Н., Ямакава Н. и др. (2003). «Конструирование готовых к экспрессии клонов кДНК для генов KIAA: ручное культивирование 330 клонов кДНК KIAA». ДНК Res. 9 (3): 99–106. Дои:10.1093 / днарес / 9.3.99. PMID  12168954.
• Лю Дж., Клемент Л.С., Канвар Ю.С. и др. (2007). «Белки ZHX регулируют экспрессию гена подоцитов во время развития нефротического синдрома». J. Biol. Chem. 281 (51): 39681–92. Дои:10.1074 / jbc.M606664200. PMID  17056598.
• Лим Дж., Хао Т., Шоу С. и др. (2006). «Сеть межбелкового взаимодействия для унаследованных атаксий человека и нарушений дегенерации клеток Пуркинье». Клетка. 125 (4): 801–14. Дои:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID  16713569. S2CID  13709685.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Bibcode:2004ПНАС..10112130Б. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Кавата Х., Ямада К., Шоу З. и др. (2004). «Семейство цинковых пальцев и гомеобоксов (ZHX) мыши; ZHX2 образует гетеродимер с ZHX3». Ген. 323: 133–40. Дои:10.1016 / j.gene.2003.09.013. PMID  14659886.
• Ямада К., Кавата Х., Шоу З. и др. (2003). «Анализ белков, взаимодействующих с цинковыми пальцами и гомеобоксов (ZHX) -1: молекулярное клонирование и характеристика члена семейства ZHX, ZHX3». Biochem. J. 373 (Pt 1): 167–78. Дои:10.1042 / BJ20021866. ЧВК  1223464. PMID  12659632.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Цзя Л., Янг М.Ф., Пауэлл Дж и др. (2002). «Профиль экспрессии генов стромальных клеток костного мозга человека: высокопроизводительный анализ секвенирования экспрессируемых последовательностей». Геномика. 79 (1): 7–17. Дои:10.1006 / geno.2001.6683. PMID  11827452.
• Делукас П., Мэтьюз Л.Х., Ашерст Дж. И др. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ хромосомы 20 человека». Природа. 414 (6866): 865–71. Bibcode:2001Натура.414..865D. Дои:10.1038 / 414865a. PMID  11780052.
• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.