AKAP9 - AKAP9

AKAP9
Идентификаторы
Псевдонимы	AKAP9, AKAP-9, AKAP350, AKAP450, CG-NAP, HYPERION, LQT11, MU-RMS-40.16A, PPP1R45, PRKA9, YOTIAO, белок-якорь А-киназы 9
Внешние идентификаторы	OMIM: 604001 ГомолоГен: 17517 Генные карты: AKAP9
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 7 (человек)[1] Группа 7q21.2 Начните 91,940,867 бп[1] Конец 92,110,673 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионного канала • активность регулятора калиевых каналов • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0032947 активность молекулярного адаптера • рецепторное связывание • связывание регуляторной субъединицы протеинкиназы А • Активность фактора обмена Ras-гуанил-нуклеотидов • Связывание ДНК • киназная активность Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • центросома • аппарат Гольджи • внутриклеточная мембраносвязанная органелла • комплекс потенциалзависимых калиевых каналов • сеть цис-Гольджи • центр организации микротрубочек • Стек Гольджи • цитоскелет • дендритная ветвь • синаптическая мембрана • тело нейрональной клетки • глутаматергический синапс • внешний компонент постсинаптической плотной мембраны Биологический процесс • положительная регуляция фосфорилирования пептидил-серина • Каскад MAPK • G2 / M переход митотического клеточного цикла • регуляция реполяризации мембраны • регулирование частоты сердечных сокращений сердечной проводимостью • клеточный ответ на цАМФ • преобразование сигнала • положительная регуляция активности трансмембранного переносчика ионов калия • зарождение микротрубочек • регуляция реполяризации клеточных мембран желудочков сердечной мышцы • химическая синаптическая передача • ответ на электрический раздражитель • отрицательная регуляция активности аденилатциклазы • стыковка цилиарного базального тела • регуляция потенциала действия клеток сердечной мышцы, участвующего в регуляции сокращения • поддержание местоположения центросомы • регуляция G2 / M перехода митотического клеточного цикла • регулирование организации Гольджи • положительное регулирование полимеризации микротрубочек • регуляция постсинаптической активности рецепторов нейромедиаторов • сердечная проводимость • фосфорилирование Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	10142	н / д
Ансамбль	ENSG00000127914	н / д
UniProt	Q99996 Q6PJH3	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_005751 NM_147166 NM_147171 NM_147185 NM_001379277	н / д
RefSeq (белок)	NP_005742 NP_671714 NP_001366206 NP_005742.4 NP_671714.1	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 7: 91.94 - 92.11 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Якорный белок А-киназы 9 это белок что у людей кодируется AKAP9 ген.^[3][4][5] AKAP9 также известен как белок, связанный с протеинкиназой N, локализованный в центросомах и Гольджи (CG-NAP), или AKAP350 или AKAP450. ^[6]

Функция

Якорные белки А-киназы (AKAP) представляют собой группу структурно разнообразных белков, которые имеют общую функцию связывания с регуляторной субъединицей протеинкиназа А (PKA) и удержание холофермента в отдельных местах внутри клетки. Этот ген кодирует члена семейства AKAP. Альтернативный сплайсинг этого гена приводит к появлению многих изоформ, которые локализуются в центросоме и аппарат Гольджи, и взаимодействуют с многочисленными сигнальными белками из нескольких преобразование сигнала пути. Эти сигнальные белки включают протеинкиназу A типа II, протеинкиназа серин / треонинкиназа N, протеинфосфатаза 1, протеинфосфатаза 2а, протеинкиназа C-эпсилон и фосфодиэстераза 4D3.^[5]

Модельные организмы

Акап9 нокаутный фенотип мыши

Характеристика	Фенотип
Гомозигота жизнеспособность	Аномальный
Рецессивный смертельное исследование	Нормальный
Плодородие	Нормальный
Масса тела	Аномальный[7]
Тревога	Нормальный
Неврологический осмотр	Нормальный
Сила захвата	Нормальный
Горячая тарелка	Нормальный
Дисморфология	Нормальный
Косвенная калориметрия	Аномальный[8]
Тест толерантности к глюкозе	Аномальный[9]
Слуховой ответ ствола мозга	Нормальный
DEXA	Аномальный[10]
Рентгенография	Аномальный[11]
Температура тела	Нормальный
Морфология глаза	Нормальный
Клиническая химия	Аномальный[12]
Гематология	Нормальный
Лимфоциты периферической крови	Аномальный
Микроядерный тест	Нормальный
Вес сердца	Нормальный
Гистопатология кожи	Нормальный
Гистопатология мозга	Нормальный
Гистопатология глаз	Нормальный
Сальмонелла инфекция	Нормальный[13]
Citrobacter инфекция	Нормальный[14][15]
Все тесты и анализы от[16]

Модельные организмы были использованы при изучении функции AKAP9. Условный нокаутирующая мышь линия, называемая Акап9^{tm1a (КОМП) Wtsi[17][18]} был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse программа - проект по мутагенезу с высокой пропускной способностью для создания и распространения моделей болезней на животных среди заинтересованных ученых.^[19][20][21]

Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения последствий удаления.^[16][22] Было проведено 26 испытаний мутант мышей и восемь значительных отклонений.^[16] Меньше, чем ожидалось гомозиготный мутант мыши выжили до отлучение от груди. Остальные тесты проводились как на гомозиготных, так и на гетерозиготный мутантные взрослые мыши. У животных обоего пола наблюдалось уменьшение жировых отложений и массы тела. кроветворный аномалии и нетипичная панель химии плазмы. Гомозиготы женского пола также демонстрировали аномальную морфологию зубов, в то время как гетерозиготные самцы животных демонстрировали аномальную морфологию зубов. тазовый пояс морфология костей.^[16]

Взаимодействия

AKAP9 был показан взаимодействовать с участием:

• CALM2,^[23]
• CALM1,^[23]
• FNBP1,^[24]
• KvLQT1^[25]
• PRKAR2A,^[26][27]
• ПКН1,^[26] и
• TRIP10.^[24]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000127914 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. Лин Дж. В., Вышински М., Мадхаван Р., Силок Р., Ким Дж. Ю, Шэн М. (апрель 1998 г.). «Yotiao, новый белок нервно-мышечного соединения и мозга, который взаимодействует со специфическими вариантами сплайсинга субъединицы рецептора NMDA NR1». J Neurosci. 18 (6): 2017–27. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.18-06-02017.1998. ЧВК  6792910. PMID  9482789.
4. Westphal RS, Tavalin SJ, Lin JW, Alto NM, Fraser ID, Langeberg LK, Sheng M, Scott JD (июль 1999 г.). «Регулирование рецепторов NMDA с помощью связанного сигнального комплекса фосфатаза-киназа». Наука. 285 (5424): 93–6. Дои:10.1126 / наука.285.5424.93. PMID  10390370.
5. «Ген Entrez: якорный белок киназы AKAP9 A (PRKA) (yotiao) 9».
6. Онг СТ, Чаласани М.Л., Фазиль М.Х., Прасаннан П., Кижакейл А., Райт Г.Д., Келлехер Д., Верма Н.К. (март 2018 г.). "Центросомный и локализованный по Гольджи протеинкиназный N-ассоциированный белок служит стыковочной платформой для передачи сигналов протеинкиназы А и зарождения микротрубочек в мигрирующих Т-клетках". Фронт. Иммунол. 9 (397): 397. Дои:10.3389 / fimmu.2018.00397. ЧВК  5837996. PMID  29545805.
7. «Данные о массе тела для Akap9». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
8. «Данные косвенной калориметрии для Акап9». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
9. «Данные теста на толерантность к глюкозе для Акап9». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
10. "Данные DEXA для Akap9". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
11. «Данные рентгенографии для Акап9». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
12. «Данные клинической химии для Акап9». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
13. "Сальмонелла данные о заражении для Akap9 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
14. "Citrobacter данные о заражении для Akap9 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
15. Портал ресурсов мыши, Институт Wellcome Trust Sanger.
16. Гердин А.К. (2010). "Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью". Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
17. «Международный консорциум нокаут-мышей».
18. "Информатика генома мыши".
19. Скарнес В.С., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт АФ, Брэдли А (2011). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–342. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК  3572410. PMID  21677750.
20. Долгин Э (2011). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
21. Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (2007). «Мышь на все случаи жизни». Ячейка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
22. ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геном Биол. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК  3218837. PMID  21722353.
23. Такахаши М., Ямагива А., Нисимура Т., Мукаи Х., Оно Й. (сентябрь 2002 г.). «Центросомные белки CG-NAP и кендрин обеспечивают сайты зарождения микротрубочек, закрепляя кольцевой комплекс гамма-тубулин». Мол. Биол. Ячейка. 13 (9): 3235–45. Дои:10.1091 / mbc.E02-02-0112. ЧВК  124155. PMID  12221128.
24. Ларокка М.С., Шанкс Р.А., Тиан Л., Нельсон Д.Л., Стюарт Д.М., Голденринг-младший (июнь 2004 г.). «Взаимодействие AKAP350 с cdc42 взаимодействующим белком 4 в аппарате Гольджи». Мол. Биол. Ячейка. 15 (6): 2771–81. Дои:10.1091 / mbc.E03-10-0757. ЧВК  420101. PMID  15047863.
25. Marx SO, Kurokawa J, Reiken S, Motoike H, D'Armiento J, Marks AR, Kass RS (январь 2002 г.). «Потребность в макромолекулярном сигнальном комплексе для модуляции бета-адренорецептора калиевого канала KCNQ1-KCNE1». Наука. 295 (5554): 496–9. Дои:10.1126 / science.1066843. PMID  11799244. S2CID  6153394.
26. Такахаши М., Шибата Х, Шимакава М., Миямото М., Мукаи Х., Оно Й (июнь 1999 г.). «Характеристика нового гигантского каркасного белка, CG-NAP, который закрепляет множественные сигнальные ферменты на центросоме и аппарате Гольджи». J. Biol. Chem. 274 (24): 17267–74. Дои:10.1074 / jbc.274.24.17267. PMID  10358086.
27. Альто Н.М., Содерлинг С.Х., Хоши Н., Лангеберг Л.К., Фейос Р., Дженнингс П.А., Скотт Д.Д. (апрель 2003 г.). «Биоинформатический дизайн А-киназы, фиксирующей протеин-in silico: мощный и селективный пептидный антагонист протеинкиназы А типа II, фиксирующий». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 100 (8): 4445–50. Дои:10.1073 / пнас.0330734100. ЧВК  153575. PMID  12672969.

дальнейшее чтение

• Нагасе Т., Исикава К., Суяма М., Кикуно Р., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О. (1999). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XI. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 5 (5): 277–86. Дои:10.1093 / днарес / 5.5.277. PMID  9872452.
• Шмидт PH, Дрансфилд Д.Т., Клаудио Дж.О., Хоули Р.Г., Троттер К.В., Милграм С.Л., Голденринг-младший (1999). «AKAP350, многократно сплайсированный белок, заякоренный протеинкиназой А, связанный с центросомами». J. Biol. Chem. 274 (5): 3055–66. Дои:10.1074 / jbc.274.5.3055. PMID  9915845.
• Витчак О., Сколхегг Б.С., Кериер Г., Борненс М., Таскен К., Янсен Т., Орставик С. (1999). «Клонирование и характеристика кДНК, кодирующей заякоренный белок А-киназы, расположенный в центросоме, AKAP450». EMBO J. 18 (7): 1858–68. Дои:10.1093 / emboj / 18.7.1858. ЧВК  1171271. PMID  10202149.
• Такахаши М., Шибата Х, Шимакава М., Миямото М., Мукаи Х, Оно Й (1999). «Характеристика нового гигантского каркасного белка, CG-NAP, который закрепляет множественные сигнальные ферменты на центросоме и аппарате Гольджи». J. Biol. Chem. 274 (24): 17267–74. Дои:10.1074 / jbc.274.24.17267. PMID  10358086.
• Хуси Х., Уорд М.А., Чоудхари Д.С., Блэксток В.П., Грант С.Г. (2000). «Протеомный анализ сигнальных комплексов рецептор NMDA-белок адгезии». Nat. Неврологи. 3 (7): 661–9. Дои:10.1038/76615. HDL:1842/742. PMID  10862698. S2CID  14392630.
• Такахаши М., Мукаи Х, Оиси К., Исагава Т., Оно Й (2000). «Ассоциация незрелой гипофосфорилированной протеинкиназы цепсилона с якорным белком CG-NAP». J. Biol. Chem. 275 (44): 34592–6. Дои:10.1074 / jbc.M005285200. PMID  10945988.
• Маркс С.О., Курокава Дж., Рейкен С., Мотоике Х., Д'Армиенто Дж., Маркс А.Р., Касс Р.С. (2002). «Потребность в макромолекулярном сигнальном комплексе для модуляции бета-адренорецептора калиевого канала KCNQ1-KCNE1». Наука. 295 (5554): 496–9. Дои:10.1126 / science.1066843. PMID  11799244. S2CID  6153394.
• Стедман Б.Т., Шмидт PH, Шанкс Р.А., Лапьер Л.А., Голденринг-младший (2002). «Трансформирующий кислый белок 4, содержащий спиральную спираль, взаимодействует с центросомным AKAP350 и аппаратом митотического веретена». J. Biol. Chem. 277 (33): 30165–76. Дои:10.1074 / jbc.M201914200. PMID  12015314.
• Брей Дж. Д., Ченнатукужи В. М., Хехт Н. Б. (2002). «Идентификация и характеристика кДНК, кодирующих четыре новых белка, которые взаимодействуют с транслином, связанным с фактором X». Геномика. 79 (6): 799–808. Дои:10.1006 / geno.2002.6779. PMID  12036294.
• Шанкс Р.А., Ларокка М.С., Берриман М., Эдвардс Дж. К., Урушидани Т., Наварра Дж., Голденринг Дж. Р. (2002). «AKAP350 в аппарате Гольджи. II. Ассоциация AKAP350 с новым членом семейства хлоридных внутриклеточных каналов (CLIC)». J. Biol. Chem. 277 (43): 40973–80. Дои:10.1074 / jbc.M112277200. PMID  12163479.
• Такахаши М., Ямагива А., Нисимура Т., Мукаи Х., Оно Й (2003). «Центросомные белки CG-NAP и кендрин обеспечивают сайты зарождения микротрубочек, закрепляя кольцевой комплекс γ-тубулина». Мол. Биол. Ячейка. 13 (9): 3235–45. Дои:10.1091 / mbc.E02-02-0112. ЧВК  124155. PMID  12221128.
• Силлиборн Дж. Э., Милн Д. М., Такахаши М., Оно Й., Мик Д. В. (2002). «Центросомное закрепление протеинкиназы CK1delta, опосредованное прикреплением к большому, скаффолдинговому белку спиральной спирали CG-NAP / AKAP450». J. Mol. Биол. 322 (4): 785–97. Дои:10.1016 / S0022-2836 (02) 00857-4. PMID  12270714.
• Ту Х, Тан Т.С., Ван З., Безпрозванный я (2004). «Ассоциация инозитол-1,4,5-трифосфатного рецептора типа 1 с AKAP9 (Yotiao) и протеинкиназой A». J. Biol. Chem. 279 (18): 19375–82. Дои:10.1074 / jbc.M313476200. PMID  14982933.

внешние ссылки

• AKAP9 расположение человеческого гена в Браузер генома UCSC.
• AKAP9 детали человеческого гена в Браузер генома UCSC.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.