ASPH - ASPH

Для объективов фотоаппаратов см. Асферический объектив § Объективы камеры.

ASPH
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 5APA
Идентификаторы
Псевдонимы	ASPH, AAH, BAH, CASQ2BP1, FDLAB, HAAH, JCTN, юнктин, аспартат-бета-гидроксилаза
Внешние идентификаторы	OMIM: 600582 MGI: 1914186 ГомолоГен: 20910 Генные карты: ASPH
Номер ЕС	1.14.11.16
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 8 (человек)[1] Группа 8q12.3 Начните 61,500,556 бп[1] Конец 61,714,640 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь)[2] Группа 4 | 4 A1 Начните 9,448,069 бп[2] Конец 9,669,344 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионного канала • активность диоксигеназы • структурная молекулярная активность • связывание ионов металлов • GO: 0001948 связывание с белками • пептид-аспартат бета-диоксигеназная активность • активность электронного переноса • оксидоредуктазная активность • структурная составляющая мышцы • связывание ионов кальция • активность 3-диоксигеназы пептидиласпарагиновой кислоты Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • комплекс кальциевых каналов • мембрана • клеточная мембрана • кортикальный эндоплазматический ретикулум • соединительная мембрана саркоплазматического ретикулума • саркоплазматический ретикулум • неотъемлемый компонент мембраны эндоплазматического ретикулума • мембрана саркоплазматического ретикулума • просвет саркоплазматического ретикулума • мембрана эндоплазматического ретикулума • эндоплазматический ретикулум • цитоплазма Биологический процесс • клеточный ответ на ион кальция • положительная регуляция внутриклеточного транспорта белков • регуляция активности рианодин-чувствительных каналов высвобождения кальция • регулирование активности инозитол-1,4,5-трифосфат-чувствительного канала высвобождения кальция • ответ на АТФ • регуляция сердечной проводимости • сокращение мышц • положительная регуляция транспорта ионов кальция в цитозоль • регулирование сокращения сердечной мышцы путем регулирования высвобождения секвестрированного иона кальция • модификация пептидиламинокислоты • обнаружение иона кальция • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • положительная регуляция активности рианодин-чувствительных каналов высвобождения кальция • трансмембранный перенос ионов • активация активности эндопептидазы цистеинового типа • трансмембранный транспорт ионов кальция • положительное регулирование протеолиза • регулирование межклеточной связи посредством электрической связи • регулирование высвобождения секвестрированного иона кальция в цитозоль саркоплазматическим ретикулумом • окислительно-восстановительный процесс • активация активности хранилищ кальциевых каналов • процесс спецификации шаблона • отрицательное регулирование пролиферации клеток • регулирование стабильности белка • морфогенез конечностей • гидроксилирование пептидиласпарагиновой кислоты • развитие неба • морфогенез лица • регулирование деполимеризации белков • электронная транспортная цепь Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	444	65973
Ансамбль	ENSG00000198363	ENSMUSG00000028207
UniProt	Q12797	Q8BSY0
RefSeq (мРНК)	NM_001164750 NM_001164751 NM_001164752 NM_001164753 NM_001164754 NM_001164755 NM_001164756 NM_004318 NM_020164 NM_032466 NM_032467 NM_032468	NM_001177849 NM_001177850 NM_001177851 NM_001177852 NM_001177853 NM_001177854 NM_001177855 NM_001177856 NM_001290367 NM_023066 NM_133723
RefSeq (белок)	NP_001158222 NP_001158223 NP_001158224 NP_001158225 NP_001158226 NP_001158227 NP_001158228 NP_004309 NP_064549 NP_115855 NP_115856 NP_115857	NP_001171320 NP_001171321 NP_001171322 NP_001171323 NP_001171324 NP_001171325 NP_001171326 NP_001171327 NP_001277296 NP_075553 NP_598484
Расположение (UCSC)	Chr 8: 61,5 - 61,71 Мб	Chr 4: 9.45 - 9.67 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Аспартил / аспарагинил бета-гидроксилаза (Ха-ха) является фермент что у людей кодируется ASPH ген.^[5][6][7] ASPH - это альфа-кетоглутарат-зависимая гидроксилаза, суперсемейство негемных железосодержащих белков.

Функция

Считается, что этот ген играет важную роль в кальций гомеостаз. Альтернативный сплайсинг этого гена приводит к пяти вариантам транскрипта, которые различаются по трансляции белка, кодированию каталитических доменов и тканевой экспрессии. Различия между этими транскриптами влияют на их функции, которые включают роль в процессе хранения и высвобождения кальция в эндоплазматическом и саркоплазматическом ретикулуме, а также гидроксилирование аспарагиновой кислоты и аспарагина в доменах различных белков, подобных эпидермальному фактору роста.^[7]

Клиническое значение

Еще в 1996 году чрезмерное выражение Ха-ха был признан индикатором рака у человека. Дальнейшие исследования выявили повышенную Ха-ха уровни (по-разному в пораженной ткани или сыворотка крови ) с гепатоцеллюлярным (печень ) карцинома^[8][9] аденокарцинома (панкреатический рак ),^[10] колоректальный рак,^[11] рак простаты.^[9] и рак легких.^[12] Исследование поджелудочной железы^[10] показал повышенный Ха-ха только в пораженной ткани, но не в соседней нормальной и воспаленной ткани.

Мутации в ASPH причина Синдром Трабулси.^[13]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000198363 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028207 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Кориот Ф., Гифферс С., Фрей Дж. (Декабрь 1994 г.). «Клонирование и характеристика человеческого гена, кодирующего аспартил бета-гидроксилазу». Ген. 150 (2): 395–9. Дои:10.1016 / 0378-1119 (94) 90460-Х. PMID  7821814.
6. Lim KY, Hong CS, Kim DH (сентябрь 2000 г.). «Клонирование кДНК и характеристика человеческого сердечного юнктина». Ген. 255 (1): 35–42. Дои:10.1016 / S0378-1119 (00) 00299-7. PMID  10974562.
7. «Ген Entrez: аспартат-гидроксилаза ASPH».
8. Инс Н., де ла Монте С.М., Жезлы Дж. Р. (март 2000 г.). «Сверхэкспрессия человеческой аспартил (аспарагинил) бета-гидроксилазы связана со злокачественной трансформацией». Исследования рака. 60 (5): 1261–6. PMID  10728685.
9. Сюэ Т., Сюэ XP, Хуан QS, Вэй Л., Сунь К., Сюэ Т. (август 2009 г.). «Моноклональные антитела против аспартил (аспарагинил) бета-гидроксилазы человека, полученные путем иммунизации ДНК». Гибридома. 28 (4): 251–7. Дои:10.1089 / hyb.2009.0017. PMID  19663697.
10. Palumbo KS, Wands JR, Safran H, King T, Carlson RI, de la Monte SM (июль 2002 г.). «Человеческие моноклональные антитела к аспартил (аспарагинил) бета-гидроксилазе: потенциальные биомаркеры карциномы поджелудочной железы». Поджелудочная железа. 25 (1): 39–44. Дои:10.1097/00006676-200207000-00010. PMID  12131769. S2CID  2098747.
11. «CC Detect - Доступен сывороточный диагностический тест на рак толстой кишки».
12. Хэмптон Т. (ноябрь 2007 г.). «Новые методы скрининга показывают потенциал для раннего выявления рака легких». JAMA. 298 (17): 1997. Дои:10.1001 / jama.298.17.1997. PMID  17986689.
13. Пател Н., Хан А.О., Мансур А., Мохамед Дж.Й., Аль-Ассири А., Хаддад Р. и др. (Май 2014 г.). «Мутации в ASPH вызывают лицевой дисморфизм, дислокацию хрусталика, аномалии переднего сегмента и спонтанную фильтрацию пузырьков, или синдром Трабулси». Американский журнал генетики человека. 94 (5): 755–9. Дои:10.1016 / j.ajhg.2014.04.002. ЧВК  4067561. PMID  24768550.

внешние ссылки

• Человек ASPH расположение генома и ASPH страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.
• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: Q12797 (Аспартил / аспарагинил бета-гидроксилаза) на PDBe-KB.

дальнейшее чтение

• Хирота К., Семенза Г.Л. (декабрь 2005 г.). «Регулирование индуцируемого гипоксией фактора 1 пролил- и аспарагинилгидроксилазами». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 338 (1): 610–6. Дои:10.1016 / j.bbrc.2005.08.193. PMID  16154531.
• Lavaissiere L, Jia S, Nishiyama M, de la Monte S, Stern AM, Wands JR, Friedman PA (сентябрь 1996 г.). «Сверхэкспрессия аспартил (аспарагинил) бета-гидроксилазы человека при гепатоцеллюлярной карциноме и холангиокарциноме». Журнал клинических исследований. 98 (6): 1313–23. Дои:10.1172 / JCI118918. ЧВК  507557. PMID  8823296.
• Чжан Л., Келли Дж., Шмайссер Дж., Кобаяши Ю.М., Джонс Л.Р. (сентябрь 1997 г.). «Комплексообразование между юнктином, триадином, кальсеквестрином и рецептором рианодина. Белки мембраны саркоплазматического ретикулума сердечного соединения». Журнал биологической химии. 272 (37): 23389–97. Дои:10.1074 / jbc.272.37.23389. PMID  9287354.
• Ветцель GT, Динг С., Чен Ф (март 2000 г.). «Молекулярное клонирование юнктина из сердца человека и развивающегося кролика». Молекулярная генетика и метаболизм. 69 (3): 252–8. Дои:10.1006 / мг.2000.2966. PMID  10767180.
• Динчук Дж. Э., Хендерсон Н. Л., Берн Т. К., Хубер Р., Хо С. П., Линк Дж. И др. (Декабрь 2000 г.). «Аспартил бета-гидроксилаза (Asph) и эволюционно консервативная изоформа Asph, у которой отсутствует каталитический домен, разделяют экзоны с юнктином». Журнал биологической химии. 275 (50): 39543–54. Дои:10.1074 / jbc.M006753200. PMID  10956665.
• Treves S, Feriotto G, Moccagatta L, Gambari R, Zorzato F (декабрь 2000 г.). «Молекулярное клонирование, экспрессия, функциональная характеристика, хромосомная локализация и генная структура юнктата, нового интегрального кальций-связывающего белка мембраны сарко (эндо) плазматического ретикулума». Журнал биологической химии. 275 (50): 39555–68. Дои:10.1074 / jbc.M005473200. PMID  11007777.
• Кирххефер У., Нойман Дж., Баба Х.А., Бегроу Ф., Кобаяши Ю.М., Рейнке У. и др. (Февраль 2001 г.). «Гипертрофия сердца и нарушение расслабления у трансгенных мышей, сверхэкспрессирующих триадин 1». Журнал биологической химии. 276 (6): 4142–9. Дои:10.1074 / jbc.M006443200. PMID  11069905.
• Сепе П.С., Лахус С.А., Джемелли Б., Чанг Х., Маеда Т., Жезлы Дж. Р., де ла Монте С.М. (июль 2002 г.). «Роль гена аспартил-аспарагинил-бета-гидроксилазы в подвижности клеток нейробластомы». Лабораторные исследования; Журнал технических методов и патологии. 82 (7): 881–91. Дои:10.1097 / 01.lab.0000020406.91689.7f. PMID  12118090.
• Хо С.П., Скалли М.С., Краутхаузер С.М., Векслер Э.Дж., Стоу М.Д., Динчук Дж.Э. и др. (Август 2002 г.). «Антисмысловые олигонуклеотиды селективно регулируют аспартил-бета-гидроксилазу и ее усеченную изоформу белка in vitro, но плохо распределяются в опухолях A549 in vivo». Журнал фармакологии и экспериментальной терапии. 302 (2): 795–803. Дои:10.1124 / jpet.302.2.795. PMID  12130746.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, Derge JG, Klausner RD, Collins FS, et al. (Декабрь 2002 г.). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Маэда Т., Сепе П., Лахус С., Тамаки С., Эндоджи М., Жезлы Дж. Р., де ла Монте С. М. (май 2003 г.). «Антисмысловые олигодезоксинуклеотиды, направленные против аспартил (аспарагинил) бета-гидроксилазы, подавляют миграцию клеток холангиокарциномы». Журнал гепатологии. 38 (5): 615–22. Дои:10.1016 / S0168-8278 (03) 00052-7. PMID  12713872.
• Тревес С., Францини-Армстронг С., Моккагатта Л., Арно С., Грассо С., Шрам А. и др. (Август 2004 г.). «Юнктат является ключевым элементом в проникновении кальция, вызванном активацией рецепторов InsP3 и / или истощением запасов кальция». Журнал клеточной биологии. 166 (4): 537–48. Дои:10.1083 / jcb.200404079. ЧВК  1868564. PMID  15302852.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж. И др. (Август 2004 г.). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 101 (33): 12130–5. Bibcode:2004ПНАС..10112130Б. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Сиань Чж, Чжан Ш., Конг В.М., Ян Х.С., Ван К., Ву МС (февраль 2006 г.). «Экспрессия аспартил бета-гидроксилазы и ее клинико-патологическое значение при гепатоцеллюлярной карциноме». Современная патология. 19 (2): 280–6. Дои:10.1038 / modpathol.3800530. PMID  16341145.
• де ла Монте С.М., Тамаки С., Кантарини М.С., Инс Н., Видманн М., Картер Дж. Дж. и др. (Май 2006 г.). «Аспартил- (аспарагинил) -бета-гидроксилаза регулирует инвазивность гепатоцеллюлярной карциномы». Журнал гепатологии. 44 (5): 971–83. Дои:10.1016 / j.jhep.2006.01.038. PMID  16564107.
• Feldmann G, Nattermann J, Nischalke HD, Gorschlüter M, Kuntzen T., Ahlenstiel G, et al. (Июнь 2006 г.). «Обнаружение человеческой аспартил (аспарагинил) бета-гидроксилазы и гомеобокса B7 мРНК в образцах кистевой цитологии от пациентов с раком желчных протоков». Эндоскопия. 38 (6): 604–9. Дои:10.1055 / с-2006-925065. PMID  16673309.
• Гундоган Ф., Элвуд Дж., Греко Д., Рубин Л.П., Пинар Х., Карлсон Р.И. и др. (Январь 2007 г.). «Роль аспартил- (аспарагинил) бета-гидроксилазы в плацентарной имплантации: значение для ранней потери беременности». Патология человека. 38 (1): 50–9. Дои:10.1016 / j.humpath.2006.06.005. PMID  16949909.