Афадин - Afadin

AFDN
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1T2M, 1XZ9, 2AIN, 2EXG, 5A6C
Идентификаторы
Псевдонимы	AFDN, AF6, MLL-AF6, MLLT4, миелоидный / лимфоидный лейкоз или лейкоз смешанного происхождения; транслоцированный, 4, афадин, фактор образования адгезивных соединений, l-афадин
Внешние идентификаторы	OMIM: 159559 MGI: 1314653 ГомолоГен: 21202 Генные карты: AFDN
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6q27 Начинать 167,826,922 бп[1] Конец 167,972,023 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 17 (мышь)[2] Группа 17 | 17 A1 Начинать 13,760,539 бп[2] Конец 13,906,150 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание с С-концом белка • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание Ras GTPase • связывание кадгерина • связывание молекул клеточной адгезии • связывание актиновой нити Сотовый компонент • стык • соединение клеток • клеточная мембрана • нуклеоплазма • цитозоль • межклеточное соединение • ядерное пятнышко • зона контакта ячейка • закупоривающий переход Биологический процесс • передача сигналов от клетки к клетке • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase • клеточная адгезия • установление эндотелиального кишечного барьера • преобразование сигнала • регулирование локализации белка • организация стыковки приверженцев • положительная регуляция экспрессии генов • положительная регуляция межклеточной адгезии • отрицательное регулирование миграции клеток • межклеточная адгезия, опосредованная кадгерином • установление локализации белка на плазматической мембране • сборка двухклеточного плотного спая • положительная регуляция межклеточной адгезии, опосредованная кадгерином Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	4301	17356
Ансамбль	ENSG00000130396	ENSMUSG00000068036
UniProt	P55196	Q9QZQ1
RefSeq (мРНК)	NM_001040000 NM_001040001 NM_001207008 NM_001291964 NM_005936 NM_001366319 NM_001366320 NM_001366321	NM_010806
RefSeq (белок)	NP_001035089 NP_001193937 NP_001278893 NP_001353248 NP_001353249 NP_001353250	NP_034936
Расположение (UCSC)	Chr 6: 167,83 - 167,97 Мб	Chr 17: 13.76 - 13.91 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Афадин это белок что у людей кодируется AFDN ген.^[5]

Функция

Афадин является мишенью Ras (см. HRAS; MIM 190020), которая регулирует межклеточные адгезии ниже по ходу активации Ras. Он слит с MLL (MIM 159555) при лейкозах, вызванных транслокациями t (6; 11) (Taya et al., 1998) [предоставлено OMIM]^[6]

Взаимодействия

Афадину показали взаимодействовать с:

• Ген BCR,^[7]
• EPHB3,^[8]
• Рецептор F11,^[9]
• HRAS^[10][11] и
• LMO2,^[12]
• PVRL1,^[13]
• PVRL3,^[14][15]
• Профилин 1,^[10]
• RAP1A,^[10]
• RAP1GAP,^[16]
• СОРБС1,^[17]
• SSX2IP,^[18]
• Протеин плотного соединения 1,^[11] и
• USP9X.^[19][20]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000130396 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000068036 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Prasad R, Gu Y, Alder H, Nakamura T., Canaani O, Saito H, Huebner K, Gale RP, Nowell PC, Kuriyama K (декабрь 1993 г.). «Клонирование партнера по слиянию ALL-1, гена AF-6, вовлеченного в острый миелоидный лейкоз с транслокацией t (6; 11) хромосомы». Исследования рака. 53 (23): 5624–8. PMID  8242616.
6. «Ген Entrez: миелоидный / лимфоидный MLLT4 или лейкоз смешанного происхождения (гомолог триторакса, Drosophila); перемещен в, 4».
7. Радзивилл Г., Эрдманн Р.А., Маргелиш Ю., Меллинг К. (июль 2003 г.). «Киназа Bcr подавляет передачу сигналов Ras путем фосфорилирования AF-6 и связывания с его доменом PDZ». Молекулярная и клеточная биология. 23 (13): 4663–72. Дои:10.1128 / mcb.23.13.4663-4672.2003. ЧВК  164848. PMID  12808105.
8. Хок Б., Беме Б., Карн Т., Ямамото Т., Кайбути К., Холтрих Ю., Холланд С., Поусон Т., Рюбсамен-Вайгманн Н., Стребхардт К. (август 1998 г.). «Опосредованное PDZ-доменом взаимодействие Eph-родственной рецепторной тирозинкиназы EphB3 и ras-связывающего белка AF6 зависит от киназной активности рецептора». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 95 (17): 9779–84. Bibcode:1998PNAS ... 95.9779H. Дои:10.1073 / пнас.95.17.9779. ЧВК  21413. PMID  9707552.
9. Эбнет К., Шульц К.Ю., Мейер Цу Брикведде МК, Пендл Г.Г., Вествебер Д. (сентябрь 2000 г.). «Соединительная молекула адгезии взаимодействует с белками, содержащими PDZ-домен AF-6 и ZO-1». Журнал биологической химии. 275 (36): 27979–88. Дои:10.1074 / jbc.M002363200. PMID  10856295.
10. Бёттнер Б., Говек Э., Кросс Дж., Ван Элст Л. (август 2000 г.). «Соединительный мультидоменный белок AF-6 является партнером по связыванию Rap1A GTPase и ассоциируется с профилином, регулирующим актин цитоскелета». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 97 (16): 9064–9. Bibcode:2000PNAS ... 97.9064B. Дои:10.1073 / пнас.97.16.9064. ЧВК  16822. PMID  10922060.
11. Ямамото Т., Харада Н., Кавано Ю., Тая С., Кайбути К. (май 1999 г.). «Взаимодействие in vivo AF-6 с активированным Ras и ZO-1». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 259 (1): 103–7. Дои:10.1006 / bbrc.1999.0731. PMID  10334923.
12. Бегай-Мюллер В., Ансьо С., Лойц А. (июнь 2002 г.). «Белок Lmo2 домена LIM связывается с AF6, партнером по транслокации онкогена MLL». Письма FEBS. 521 (1–3): 36–8. Дои:10.1016 / s0014-5793 (02) 02814-4. PMID  12067721. S2CID  29461336.
13. Такахаши К., Наканиши Х., Мияхара М., Мандаи К., Сато К., Сато А., Нисиока Х., Аоки Дж., Номото А., Мидзогути А., Такай Й. (май 1999 г.). «Нектин / PRR: иммуноглобулиноподобная молекула клеточной адгезии, рекрутируемая в адгезивные соединения на основе кадгерина посредством взаимодействия с афадином, белком, содержащим домен PDZ». Журнал клеточной биологии. 145 (3): 539–49. Дои:10.1083 / jcb.145.3.539. ЧВК  2185068. PMID  10225955.
14. Сато-Хорикава К., Наканиси Х., Такахаши К., Мияхара М., Нисимура М., Татибана К., Мидзогути А., Такай И. (апрель 2000 г.). «Нектин-3, новый член иммуноглобулиноподобных молекул клеточной адгезии, проявляющий гомофильную и гетерофильную адгезию между клетками». Журнал биологической химии. 275 (14): 10291–9. Дои:10.1074 / jbc.275.14.10291. PMID  10744716.
15. Реймонд Н., Борг Дж. П., Лекок Е., Аделаида Дж., Кампаделли-Фьюме Дж., Дюбрей П., Лопес М. (сентябрь 2000 г.). «Человеческий нектин3 / PRR3: новый член семейства PVR / PRR / нектинов, который взаимодействует с афадином». Ген. 255 (2): 347–55. Дои:10.1016 / s0378-1119 (00) 00316-4. PMID  11024295.
16. Су Л., Хаттори М., Морияма М., Мурата Н., Харазаки М., Кайбути К., Минато Н. (апрель 2003 г.). «AF-6 контролирует опосредованную интегрином клеточную адгезию, регулируя активацию Rap1 за счет специфического привлечения Rap1GTP и SPA-1». Журнал биологической химии. 278 (17): 15232–8. Дои:10.1074 / jbc.M211888200. PMID  12590145.
17. Мандаи К., Наканиси Х., Сато А., Такахаши К., Сато К., Нисиока Х., Мидзогути А., Такай Й. (март 1999 г.). «Понсин / SH3P12: l-афадин- и винкулин-связывающий белок, локализованный на стыках адгезивов клетка-клетка и клетка-матрица». Журнал клеточной биологии. 144 (5): 1001–17. Дои:10.1083 / jcb.144.5.1001. ЧВК  2148189. PMID  10085297.
18. Асада М., Ирие К., Моримото К., Ямада А., Икеда В., Такеучи М., Такай И. (февраль 2003 г.). «ADIP, новый афадин- и альфа-актинин-связывающий белок, локализованный на стыках межклеточных сращений». Журнал биологической химии. 278 (6): 4103–11. Дои:10.1074 / jbc.M209832200. PMID  12446711.
19. Тая С., Ямамото Т., Канаи-Адзума М., Вуд С.А., Кайбути К. (декабрь 1999 г.). «Деубиквитинирующий фермент Fam взаимодействует с бета-катенином и стабилизирует его». Гены в клетки. 4 (12): 757–67. Дои:10.1046 / j.1365-2443.1999.00297.x. PMID  10620020. S2CID  85747886.
20. Тая С., Ямамото Т., Кано К., Кавано И., Ивамацу А., Цучия Т., Танака К., Канаи-Адзума М., Вуд С.А., Маттик Дж. С., Кайбути К. (август 1998 г.). «Мишень Ras AF-6 является субстратом фам-деубиквитинирующего фермента». Журнал клеточной биологии. 142 (4): 1053–62. Дои:10.1083 / jcb.142.4.1053. ЧВК  2132865. PMID  9722616.

дальнейшее чтение

• Takai Y, Nakanishi H (январь 2003 г.). «Нектин и афадин: новые организаторы межклеточных контактов». Журнал клеточной науки. 116 (Pt 1): 17–27. CiteSeerX  10.1.1.321.6596. Дои:10.1242 / jcs.00167. PMID  12456712. S2CID  6465469.
• Саха В., Лиллингтон Д.М., Шеллинг А.Н., Чаплин Т., Яспо М.Л., Ганесан Т.С., Янг Б.Д. (ноябрь 1995 г.). «Ген AF6 на полосе хромосомы 6q27 отображается дистальнее минимальной области делеции при эпителиальном раке яичников». Гены, хромосомы и рак. 14 (3): 220–2. Дои:10.1002 / gcc.2870140311. PMID  8589040. S2CID  23752846.
• Боналду М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Геномные исследования. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Мандаи К., Наканиси Х., Сато А., Обайши Х., Вада М., Нисиока Х., Ито М., Мизогути А., Аоки Т., Фудзимото Т., Мацуда Й., Цукита С., Такай Й. (октябрь 1997 г.). «Афадин: новый белок, связывающий актиновые филаменты, с одним доменом PDZ, локализованным на стыке клеточных адгезивов на основе кадгерина». Журнал клеточной биологии. 139 (2): 517–28. Дои:10.1083 / jcb.139.2.517. ЧВК  2139800. PMID  9334353.
• Джох Т., Ямамото К., Кагами И., Какуда Х., Сато Т., Ямамото Т., Такахаши Т., Уэда Р., Кайбути К., Сето М. (октябрь 1997 г.). «Химерные продукты MLL с Ras-связывающим цитоплазматическим белком AF6, участвующим в лейкемии t (6; 11) (q27; q23), локализуются в ядре». Онкоген. 15 (14): 1681–7. Дои:10.1038 / sj.onc.1201332. PMID  9349501.
• Сайто С., Мацусима М., Сирахама С., Минагути Т., Канамори Ю., Минами М., Накамура И. (апрель 1998 г.). «Полные полиморфизмы ДНК структуры генома и альтернативный сплайсинг человеческого гена AF-6». ДНК исследования. 5 (2): 115–20. Дои:10.1093 / dnares / 5.2.115. PMID  9679199.
• Хок Б., Беме Б., Карн Т., Ямамото Т., Кайбути К., Холтрих Ю., Холланд С., Поусон Т., Рюбсамен-Вайгманн Н., Стребхардт К. (август 1998 г.). «Опосредованное PDZ-доменом взаимодействие Eph-родственной рецепторной тирозинкиназы EphB3 и ras-связывающего белка AF6 зависит от киназной активности рецептора». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 95 (17): 9779–84. Bibcode:1998PNAS ... 95.9779H. Дои:10.1073 / пнас.95.17.9779. ЧВК  21413. PMID  9707552.
• Тая С., Ямамото Т., Кано К., Кавано И., Ивамацу А., Цучия Т., Танака К., Канаи-Адзума М., Вуд С.А., Маттик Дж. С., Кайбути К. (август 1998 г.). «Мишень Ras AF-6 является субстратом фам-деубиквитинирующего фермента». Журнал клеточной биологии. 142 (4): 1053–62. Дои:10.1083 / jcb.142.4.1053. ЧВК  2132865. PMID  9722616.
• Мандаи К., Наканиси Х., Сато А., Такахаши К., Сато К., Нисиока Х., Мидзогути А., Такай Й. (март 1999 г.). «Понсин / SH3P12: l-афадин- и винкулин-связывающий белок, локализованный на стыках адгезивов клетка-клетка и клетка-матрица». Журнал клеточной биологии. 144 (5): 1001–17. Дои:10.1083 / jcb.144.5.1001. ЧВК  2148189. PMID  10085297.
• Линнеманн Т., Гейер М., Джайтнер Б.К., Блок С, Калбицер Х.Р., Виттингхофер А., Херрманн С. (май 1999 г.). «Термодинамическая и кинетическая характеристика взаимодействия между связывающим доменом Ras AF6 и членами подсемейства Ras». Журнал биологической химии. 274 (19): 13556–62. Дои:10.1074 / jbc.274.19.13556. PMID  10224125.
• Такахаши К., Наканиши Х., Мияхара М., Мандаи К., Сато К., Сато А., Нисиока Х., Аоки Дж., Номото А., Мидзогути А., Такай Й. (май 1999 г.). «Нектин / PRR: иммуноглобулиноподобная молекула клеточной адгезии, рекрутируемая в адгезивные соединения на основе кадгерина посредством взаимодействия с афадином, белком, содержащим домен PDZ». Журнал клеточной биологии. 145 (3): 539–49. Дои:10.1083 / jcb.145.3.539. ЧВК  2185068. PMID  10225955.
• Ямамото Т., Харада Н., Кавано Ю., Тая С., Кайбути К. (май 1999 г.). «Взаимодействие in vivo AF-6 с активированным Ras и ZO-1». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 259 (1): 103–7. Дои:10.1006 / bbrc.1999.0731. PMID  10334923.
• Минагути Т., Мацусима М., Сайто С., Канамори Ю., Сирахама С., Окамото С., Минами М., Такетани И., Накамура И. (апрель 1999 г.). «Полная последовательность ДНК и характеристика области, богатой VNTR 330 т.п.н. на хромосоме 6q27, которая обычно удаляется при раке яичников». ДНК исследования. 6 (2): 131–6. Дои:10.1093 / dnares / 6.2.131. PMID  10382971.
• Куиллиам Л.А., Кастро А.Ф., Роджерс-Грэм К.С., Мартин С.Б., Der CJ, Би С. (август 1999 г.). «M-Ras / R-Ras3, трансформирующий белок ras, регулируемый Sos1, GRF1 и p120 Ras GTPase-активирующим белком, взаимодействует с предполагаемым эффектором Ras AF6». Журнал биологической химии. 274 (34): 23850–7. Дои:10.1074 / jbc.274.34.23850. PMID  10446149.
• Кавабе Х., Хата Й, Такеучи М, Иде Н., Мидзогути А, Такай Й (октябрь 1999 г.). «nArgBP2, новый нервный член семейства понсин / ArgBP2 / винексин, который взаимодействует с синапс-ассоциированным белком 90 / постсинаптической плотностью-95-ассоциированным белком (SAPAP)». Журнал биологической химии. 274 (43): 30914–8. Дои:10.1074 / jbc.274.43.30914. PMID  10521485.
• Шао Х., Кадоно-Окуда К., Финлин Б.С., Андрес Д.А. (ноябрь 1999 г.). «Биохимическая характеристика Ras-связанных GTPases Rit и Rin». Архивы биохимии и биофизики. 371 (2): 207–19. Дои:10.1006 / abbi.1999.1448. PMID  10545207.
• Асакура Т., Наканиси Х., Сакисака Т., Такахаши К., Мандаи К., Нисимура М., Сасаки Т., Такай И. (октябрь 1999 г.). «Подобное и различное поведение между системами нектин-афадин-понсин и кадгерин-катенин во время формирования и нарушения выравнивания поляризованных соединений в эпителиальных клетках». Гены в клетки. 4 (10): 573–81. Дои:10.1046 / j.1365-2443.1999.00283.x. PMID  10583506. S2CID  24023429.
• Мияхара М., Наканиши Х., Такахаши К., Сато-Хорикава К., Татибана К., Такай Й. (январь 2000 г.). «Взаимодействие нектина с афадином необходимо для его кластеризации на сайтах межклеточного контакта, но не для его цис-димеризации или транс-взаимодействия». Журнал биологической химии. 275 (1): 613–8. Дои:10.1074 / jbc.275.1.613. PMID  10617658.
• Бушар М.Дж., Донг И., Макдермотт Б.М., Лам Д.Х., Браун К.Р., Шелански М., Бельве А.Р., Раканиелло В.Р. (апрель 2000 г.). «Дефекты ядерной и цитоскелетной морфологии и митохондриальной локализации в сперматозоидах мышей, лишенных нектина-2, компонента межклеточных сращений». Молекулярная и клеточная биология. 20 (8): 2865–73. Дои:10.1128 / MCB.20.8.2865-2873.2000. ЧВК  85510. PMID  10733589.