EPHB3 - EPHB3

EPHB3
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3П1И, 3ZFY
Идентификаторы
Псевдонимы	EPHB3, ETK2, HEK2, TYRO6, рецептор EPH B3, EK2
Внешние идентификаторы	OMIM: 601839 MGI: 104770 ГомолоГен: 20938 Генные карты: EPHB3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 3 (человек)[1] Группа 3q27.1 Начните 184,561,785 бп[1] Конец 184,582,408 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 16 (мышь)[2] Группа 16 | 16 B1 Начните 21,204,755 бп[2] Конец 21,223,305 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание нуклеотидов • активность трансмембранного рецептора протеина тирозинкиназы • активность протеинкиназы • киназная активность • Связывание АТФ • трансферазная активность • активность рецептора эфрина • активность рецептора наведения аксонов • активность протеинтирозинкиназы • рецепторная тирозинкиназа • активность трансмембранного сигнального рецептора • активность трансмембранных рецепторов эфрина Сотовый компонент • внеклеточная область • дендрит • неотъемлемый компонент мембраны • проекция клетки • мембрана • цитозоль • клеточная мембрана • неотъемлемый компонент плазматической мембраны • цитоплазма • проекция нейрона • рецепторный комплекс Биологический процесс • фосфорилирование • фосфорилирование пептидилтирозина • развитие нервной системы • развитие многоклеточного организма • регуляция межклеточной адгезии • фосфорилирование белков • распространение клеток, зависящее от адгезии субстрата • сигнальный путь трансмембранного рецептора протеина тирозинкиназы • GO: 0043087, GO: 0032313, GO: 0032319, GO: 0032314, GO: 0043088 регуляция активности GTPase • аутофосфорилирование • ангиогенез • сигнальный путь рецептора эфрина • развитие мочеполовой системы • управление аксоном • аксональная фасцикуляция • миграция клеток • проекция центральной нервной системы нейрон аксоногенез • развитие мозолистого тела • ведение аксонов ганглиозных клеток сетчатки • развитие тимуса • морфогенез пищеварительного тракта • регуляция аксоногенеза • положительная регуляция сборки синапсов • развитие неба • развитие дендритного позвоночника • морфогенез дендритного позвоночника • отрицательная регуляция передачи сигнала • дифференциация клеток • отрицательная регуляция апоптотического процесса • положительная регуляция каскада ERK1 и ERK2 Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	2049	13845
Ансамбль	ENSG00000182580	ENSMUSG00000005958
UniProt	P54753	P54754
RefSeq (мРНК)	NM_004443	NM_010143
RefSeq (белок)	NP_004434	NP_034273
Расположение (UCSC)	Chr 3: 184,56 - 184,58 Мб	Chr 16: 21,2 - 21,22 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Рецептор эфрина типа B 3 это белок что у людей кодируется EPHB3 ген.^[5][6]

Функция

Рецепторы эфрина и их лиганды, эфрины, опосредуют многочисленные процессы развития, особенно в нервной системе. Основываясь на их структуре и взаимосвязи последовательностей, эфрины делятся на класс эфрина-A (EFNA), который прикреплен к мембране с помощью гликозилфосфатидилинозитовой связи, и класс эфрина-B (EFNB), которые являются трансмембранными белками. Семейство рецепторов Eph делится на 2 группы на основании сходства последовательностей их внеклеточных доменов и их сродства к связыванию лигандов эфрина-A и эфрина-B. Рецепторы эфрина составляют самую большую подгруппу семейства рецепторных тирозинкиназ (RTK). Белок, кодируемый этим геном, является рецептором для членов семейства эфрина-B.^[6]

Взаимодействия

EPHB3 был показан взаимодействовать с участием MLLT4^[7] и Активатор белка р21 RAS 1.^[8]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000182580 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000005958 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Бёме Б., Хольтрих Ю., Вольф Г., Люциус Х., Гжешик К. Х., Стребхардт К., Рюбсамен-Вайгманн Х. (октябрь 1993 г.). «ПЦР-опосредованное обнаружение новой рецепторной тирозинкиназы человека, НЕК 2». Онкоген. 8 (10): 2857–62. PMID  8397371.
6. «Ген Entrez: EPHB3 EPH рецептор B3».
7. Хок Б., Беме Б., Карн Т., Ямамото Т., Кайбути К., Холтрих Ю., Холланд С., Поусон Т., Рюбсамен-Вайгманн Н., Стребхардт К. (август 1998 г.). «Опосредованное PDZ-доменом взаимодействие Eph-родственной рецепторной тирозинкиназы EphB3 и ras-связывающего белка AF6 зависит от киназной активности рецептора». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 95 (17): 9779–84. Bibcode:1998PNAS ... 95.9779H. Дои:10.1073 / пнас.95.17.9779. ЧВК  21413. PMID  9707552.
8. Хок Б., Беме Б., Карн Т., Феллер С., Рюбсамен-Вайгманн Х., Стребхардт К. (июль 1998 г.). «Тирозин-614, главный сайт аутофосфорилирования рецепторной тирозинкиназы HEK2, функционирует как мульти-стыковочный сайт для взаимодействий, опосредованных SH2-доменом». Онкоген. 17 (2): 255–60. Дои:10.1038 / sj.onc.1201907. PMID  9674711.

дальнейшее чтение

• Фланаган Дж. Г., Вандерхэген П. (1998). «Эфрины и рецепторы Eph в нервном развитии» (PDF). Анну. Преподобный Neurosci. 21: 309–45. Дои:10.1146 / annurev.neuro.21.1.309. PMID  9530499. S2CID  1278600.
• Чжоу Р. (1998). «Рецепторы и лиганды семейства Eph». Pharmacol. Ther. 77 (3): 151–81. Дои:10.1016 / S0163-7258 (97) 00112-5. PMID  9576626.
• Держатель N, Klein R (1999). «Рецепторы Eph и эфрины: эффекторы морфогенеза». Развитие. 126 (10): 2033–44. PMID  10207129.
• Уилкинсон Д.Г. (2000). «Рецепторы Eph и эфрины: регуляторы наведения и сборки». Int. Преподобный Цитол. Международный обзор цитологии. 196: 177–244. Дои:10.1016 / S0074-7696 (00) 96005-4. ISBN  9780123646002. PMID  10730216.
• Сюй Кью, Меллитцер Г., Уилкинсон Д.Г. (2001). «Роль рецепторов Eph и эфринов в сегментарном формировании паттерна». Филос. Пер. R. Soc. Лондон. B Biol. Наука. 355 (1399): 993–1002. Дои:10.1098 / rstb.2000.0635. ЧВК  1692797. PMID  11128993.
• Уилкинсон Д.Г. (2001). «Множественные роли рецепторов EPH и эфринов в развитии нервной системы». Nat. Преподобный Neurosci. 2 (3): 155–64. Дои:10.1038/35058515. PMID  11256076. S2CID  205014301.
• Бёме Б., ВанденБос Т., Черретти Д.П., Парк Л.С., Хольтрих Ю., Рюбсамен-Вайгманн Х., Стребхардт К. (1996). «Межклеточная адгезия, опосредованная связыванием заякоренного в мембране лиганда LERK-2 с EPH-родственным рецептором эмбриональной киназы 2 человека, способствует активности тирозинкиназы». J. Biol. Chem. 271 (40): 24747–52. Дои:10.1074 / jbc.271.40.24747. PMID  8798744.
• Эфноменклатурный комитет (1997). «Единая номенклатура рецепторов семейства Eph и их лигандов, эфринов. Комитет по номенклатуре Eph». Ячейка. 90 (3): 403–4. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80500-0. PMID  9267020. S2CID  26773768.
• Бергеманн А.Д., Чжан Л., Чанг М.К., Брамбилла Р., Кляйн Р., Фланаган Дж. Г. (1998). «Эфрин-B3, лиганд рецептора EphB3, экспрессируемый по средней линии развивающейся нервной трубки». Онкоген. 16 (4): 471–80. Дои:10.1038 / sj.onc.1201557. PMID  9484836.
• Hock B, Böhme B, Karn T, Feller S, Rübsamen-Waigmann H, Strebhardt K (1998). «Тирозин-614, главный сайт аутофосфорилирования рецепторной тирозинкиназы HEK2, функционирует как мульти-стыковочный сайт для взаимодействий, опосредованных SH2-доменом». Онкоген. 17 (2): 255–60. Дои:10.1038 / sj.onc.1201907. PMID  9674711.
• Хок Б., Беме Б., Карн Т., Ямамото Т., Кайбути К., Холтрих Ю., Холланд С., Поусон Т., Рюбсамен-Вайгманн Н., Стребхардт К. (1998). «Опосредованное PDZ-доменом взаимодействие Eph-родственной рецепторной тирозинкиназы EphB3 и ras-связывающего белка AF6 зависит от киназной активности рецептора». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 95 (17): 9779–84. Bibcode:1998PNAS ... 95.9779H. Дои:10.1073 / пнас.95.17.9779. ЧВК  21413. PMID  9707552.
• Ciossek T, Monschau B, Kremoser C, Löschinger J, Lang S, Müller BK, Bonhoeffer F, Drescher U (1998). «Взаимодействия рецептора Eph с лигандом необходимы для управления аксонами ганглиозных клеток сетчатки in vitro». Евро. J. Neurosci. 10 (5): 1574–80. Дои:10.1046 / j.1460-9568.1998.00180.x. PMID  9751130. S2CID  20470923.
• Адамс Р. Х., Уилкинсон Г. А., Вайс С., Дайелла Ф., Гейл Н. В., Deutsch U, Рисау В., Кляйн Р. (1999). «Роль лигандов ephrinB и рецепторов EphB в развитии сердечно-сосудистой системы: демаркация артериальных / венозных доменов, морфогенез сосудов и прорастание ангиогенеза». Genes Dev. 13 (3): 295–306. Дои:10.1101 / gad.13.3.295. ЧВК  316426. PMID  9990854.

внешние ссылки

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: P54753 (Рецептор 3 эфрина типа B) на PDBe-KB.