Эпирегулин - Epiregulin

EREG
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1К36, 1К37, 5E8D
Идентификаторы
Псевдонимы	EREG, EPR, ER, Ep, эпирегулин
Внешние идентификаторы	OMIM: 602061 MGI: 107508 ГомолоГен: 1097 Генные карты: EREG
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 4 (человек)[1] Группа 4q13.3 Начинать 74,365,145 бп[1] Конец 74,388,749 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 | 5 E1 Начинать 91,074,622 бп[2] Конец 91,093,646 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • связывание рецептора эпидермального фактора роста • GO: 0001948 связывание с белками • активность фактора роста • активность протеинтирозинкиназы • активность фосфатидилинозитол-4,5-бисфосфат-3-киназы • Активность фактора обмена Ras-гуанил-нуклеотидов Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • мембрана • клеточная мембрана • неотъемлемый компонент плазматической мембраны • внеклеточная область • внутриклеточный • внеклеточный • мембрана везикул, покрытая клатрином Биологический процесс • сигнальный путь лютеинизирующего гормона • положительная регуляция активности рецепторов, активируемых эпидермальным фактором роста • дифференциация клеток • положительная регуляция процесса биосинтеза цитокинов • расширение кучевых облаков яичников • отрицательная регуляция дифференцировки гладкомышечных клеток • положительное регулирование выработки цитокинов • цитокин-опосредованный сигнальный путь • положительное регулирование пролиферации фибробластов • передача сигналов от клетки к клетке • морфогенез анатомической структуры • ответ на пептидный гормон • лечение раны • транскрипция мРНК • женское мейотическое ядерное деление • стадия первичного фолликула • дифференцировка кератиноцитов • Каскад MAPK • развитие многоклеточного организма • положительная регуляция репликации ДНК • пролиферация кератиноцитов • созревание ооцитов • ангиогенез • положительное регулирование пролиферации клеток • положительная регуляция врожденного иммунного ответа • отрицательная регуляция пролиферации эпителиальных клеток • морфогенез органов животных • положительная регуляция фосфорилирования • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • положительная регуляция митотического деления ядра • овуляция • положительная регуляция деления клеток • отрицательное регулирование пролиферации клеток • положительное регулирование пролиферации гладкомышечных клеток • положительная регуляция активности протеинкиназы • Путь передачи сигналов ERBB2 • регулирование подвижности клеток • сигнальный путь рецептора эпидермального фактора роста • фосфорилирование пептидил-тирозина • фосфатидилинозитол фосфорилирование • положительная регуляция передачи сигналов протеинкиназы B • преобразование сигнала • отрицательная регуляция сигнального пути рецептора эпидермального фактора роста • мембранная организация Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	2069	13874
Ансамбль	ENSG00000124882	ENSMUSG00000029377
UniProt	O14944	Q61521
RefSeq (мРНК)	NM_001432	NM_007950
RefSeq (белок)	NP_001423	NP_031976
Расположение (UCSC)	Chr 4: 74.37 - 74.39 Мб	Chr 5: 91.07 - 91.09 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Эпирегулин (EPR) - это белок что у людей кодируется EREG ген.^[5][6]

Структура

Эпирегулин состоит из 46 аминокислотных остатков. Его вторичная структура содержит примерно 30 процентов β-лист в пряди.^[7] Некоторые остатки образуют петли и повороты за счет водородная связь.^[7] Процент β-листа в эпирегулине зависит от домен и второстепенные структуры, которые они занимают. Полимерные молекулы эпирегулина имеют формульную массу 5280,1 г / моль с полипептидом (L), типом полимера.^[7]

Структурные мотивы в большинстве белков имеют типичные связи во всем β-мотиве. Это означает, что полипептидные цепи не образуют перекрестной связи или, поскольку этот тип связи не наблюдается. Эпирегулин - один из белков, который занимает типичное соединение во всех β-мотивах. Кроме того, поскольку структура эпирегулина образует цепь во всем β-мотиве, он также образует β-шпильку. структурный мотив. Β-шпилька - это когда две соседние антипараллельные β-нити соединены β-витком.

Функция

Эпирегулин входит в состав фактор роста эпидермиса семья. Эпирегулин может действовать как лиганд рецептор эпидермального фактора роста (EGFR), а также лиганд большинства членов ЕРББ (гомолог онкогена v-erb-b2) семейство рецепторы тирозинкиназы.^[6] Вторичная структура эпирегулина на С-конце отличается от других лигандов семейства эпидермальных факторов роста из-за отсутствия водородных связей. Структурные различия на С-конце могут объяснить пониженную аффинность связывания эпирегулина с рецепторами ERBB.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000124882 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029377 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Тойода Х., Комурасаки Т., Учида Д., Моримото С. (август 1997 г.). «Распределение мРНК эпирегулина человека, дифференциально экспрессируемого члена семейства эпидермальных факторов роста». Biochem. J. 326 (1): 69–75. Дои:10.1042 / bj3260069. ЧВК  1218638. PMID  9337852.
6. «Энтрез Джин: эпирегулин».
7. Сато К., Накамура Т., Мидзугути М., Миура К., Тада М., Айзава Т., Гоми Т., Миямото К., Кавано К. (октябрь 2003 г.). «Структура раствора эпирегулина и влияние его C-концевого домена на сродство связывания рецептора». FEBS Lett. 553 (3): 232–8. Дои:10.1016 / s0014-5793 (03) 01005-6. PMID  14572630. S2CID  24761378.

дальнейшее чтение

• Ямамото Т., Акисуе Т., Маруи Т. и др. (2004). «Экспрессия бетацеллюлина, гепарин-связывающего эпидермального фактора роста и эпирегулина в злокачественной фиброзной гистиоцитоме человека». Противораковый Res. 24 (3b): 2007–10. PMID  15274392.
• Ли С., Такеучи Ф, Ван Дж. А. и др. (2008). «Мезенхимно-эпителиальные взаимодействия с участием эпирегулина в гамартомах комплекса туберозного склероза». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 105 (9): 3539–44. Дои:10.1073 / pnas.0712397105. ЧВК  2265180. PMID  18292222.
• Чо MC, Чой Х.С., Ли С. и др. (2008). «Экспрессия эпирегулина посредством пути передачи сигналов Ets-1 и ERK в клетках, трансформированных Ki-ras». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 377 (3): 832–7. Дои:10.1016 / j.bbrc.2008.10.053. PMID  18948081.
• Линдвалл С., Хоу М., Комурасаки Т. и др. (2003). «Молекулярная характеристика человеческих фибробластов, иммортализованных обратной транскриптазой человека, путем определения профиля экспрессии генов: активация гена эпирегулина». Рак Res. 63 (8): 1743–7. PMID  12702554.
• Морита С., Сираката Ю., Сираиси А. и др. (2007). «Пролиферация эпителиальных клеток роговицы человека эпирегулином и его перекрестная индукция другими членами семейства EGF». Мол. Vis. 13: 2119–28. PMID  18079685.
• Freimann S, Ben-Ami I, Dantes A, et al. (2004). «Экспрессия эпирегулина и амфирегулина EGF-подобного фактора регулируется гонадотропинами / цАМФ в фолликулярных клетках яичников человека». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 324 (2): 829–34. Дои:10.1016 / j.bbrc.2004.09.129. PMID  15474502.
• Бен-Ами I, Армон Л., Фрейманн С. и др. (2009). «EGF-подобные факторы роста как медиаторы ЛГ в желтом теле человека». Гм. Репрод. 24 (1): 176–84. Дои:10.1093 / humrep / den359. PMID  18835871.
• Шигейши Х., Хигашикава К., Хираока М. и др. (2008). «Экспрессия эпирегулина, нового лиганда эпидермального фактора роста, связанного с прогнозом плоскоклеточного рака полости рта человека». Онкол. Представитель. 19 (6): 1557–64. Дои:10.3892 / или 19.6.1557. PMID  18497965.
• Тейлор Д.С., Ченг X, Павловски Дж. Э. и др. (1999). «Эпирегулин представляет собой мощный митоген, происходящий из гладкомышечных клеток сосудов, индуцируемый ангиотензином II, эндотелином-1 и тромбином». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 96 (4): 1633–8. Дои:10.1073 / пнас.96.4.1633. ЧВК  15542. PMID  9990076.
• Чжан Дж., Иванага К., Чой К.С. и др. (2008). «Внутриопухолевый эпирегулин является маркером запущенного заболевания у пациентов с немелкоклеточным раком легкого и придает инвазивные свойства EGFR-мутантным клеткам». Cancer Prev Res (Phila). 1 (3): 201–7. Дои:10.1158 / 1940-6207.CAPR-08-0014. ЧВК  3375599. PMID  19138957.
• Дрейпер Б.К., Комурасаки Т., Дэвидсон М.К., Нэнни Л.Б. (2003). «Эпирегулин более эффективен, чем EGF или TGFalpha, в содействии закрытию ран in vitro из-за повышенной активации ERK / MAPK». J. Cell. Биохим. 89 (6): 1126–37. Дои:10.1002 / jcb.10584. PMID  12898511. S2CID  24643892.
• Révillion F, Lhotellier V, Hornez L, Bonneterre J, Peyrat JP (январь 2008 г.). «Лиганды ErbB / HER при раке груди человека и отношения с их рецепторами, биопатологические особенности и прогноз». Анна. Онкол. 19 (1): 73–80. Дои:10.1093 / annonc / mdm431. PMID  17962208.
• Бен-Ами I, Фрейманн С., Армон Л. и др. (2006). «PGE2 активизирует биосинтез EGF-подобного фактора роста в клетках гранулезы человека: новое понимание координации между PGE2 и LH при овуляции». Мол. Гм. Репрод. 12 (10): 593–9. Дои:10,1093 / моль · ч / гал068. PMID  16888076.
• Такахаши М., Хаяси К., Йошида К. и др. (2003). «Эпирегулин как основной аутокринный / паракринный фактор, высвобождаемый ERK- и p38MAPK-активированными гладкомышечными клетками сосудов». Тираж. 108 (20): 2524–9. Дои:10.1161 / 01.CIR.0000096482.02567.8C. PMID  14581411.
• Ласки-Су Дж., Нил Б.М., Франке Б. и др. (2008). «Полногеномное сканирование ассоциаций количественных признаков синдрома дефицита внимания и гиперактивности выявляет новые ассоциации и подтверждает ассоциации генов-кандидатов». Являюсь. J. Med. Genet. B Neuropsychiatr. Genet. 147B (8): 1345–54. Дои:10.1002 / ajmg.b.30867. PMID  18821565. S2CID  9493672.
• Гупта Г.П., Нгуен Д.X., Чианг А.С. и др. (2007). «Медиаторы ремоделирования сосудов участвуют в последовательных этапах метастазирования в легкие». Природа. 446 (7137): 765–70. Дои:10.1038 / природа05760. PMID  17429393. S2CID  4420038.
• Шираката Й., Комурасаки Т., Тойода Х. и др. (2000). «Эпирегулин, новый член семейства эпидермальных факторов роста, является аутокринным фактором роста в нормальных кератиноцитах человека». J. Biol. Chem. 275 (8): 5748–53. Дои:10.1074 / jbc.275.8.5748. PMID  10681561.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.