Фактор роста гепатомы - Hepatoma-derived growth factor

HDGF
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1RI0, 2NLU
Идентификаторы
Псевдонимы	HDGF, HMG1L2, фактор роста гепатомы, гепарин-связывающий фактор роста
Внешние идентификаторы	OMIM: 600339 MGI: 1194494 ГомолоГен: 3306 Генные карты: HDGF
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q23.1 Начните 156,742,109 бп[1] Конец 156,766,925 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 F1 | 3 38,78 см Начните 87,906,321 бп[2] Конец 87,916,132 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание нуклеотидов • Связывание ДНК • связывание корепрессора транскрипции • GO: 0001106 транскрипционная корепрессорная активность • активность фактора роста • связывание гепарина • Связывание РНК Сотовый компонент • цитоплазма • транскрипционный репрессорный комплекс • ядро клетки • нуклеоплазма • внеклеточный • внеклеточный матрикс • внеклеточная область • коллагенсодержащий внеклеточный матрикс Биологический процесс • IRE1-опосредованный ответ развернутого белка • клеточная пролиферация • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция, ДНК-шаблон • преобразование сигнала • клеточный процесс • регуляция рецепторной активности • клеточный ответ на интерлейкин-7 Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	3068	15191
Ансамбль	ENSG00000143321	ENSMUSG00000004897
UniProt	P51858	P51859
RefSeq (мРНК)	NM_001126050 NM_001126051 NM_004494 NM_001319186 NM_001319187 NM_001319188	NM_008231 NM_001331051 NM_001331052
RefSeq (белок)	NP_001119522 NP_001119523 NP_001306115 NP_001306116 NP_001306117 NP_004485	NP_001317980 NP_001317981 NP_032257
Расположение (UCSC)	Chr 1: 156.74 - 156.77 Мб	Chr 3: 87.91 - 87.92 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор роста гепатомы (HDGF) также известен как белок группы высокой подвижности 1-подобный 2 (HMG-1L2) - это белок что у людей кодируется HDGF ген.^[5][6]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000143321 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000004897 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ваншура С., Шенмакерс Э. Ф., Гюисманс С., Бартницке С., Ван де Вен В. Дж., Буллердик Дж. (Май 1997 г.). «Картирование гена, кодирующего фактор роста, полученный из гепатомы человека (HDGF) с гомологией с белком группы высокой подвижности (HMG) -1, с Xq25». Геномика. 32 (2): 298–300. Дои:10.1006 / geno.1996.0122. PMID  8833162.
6. «Ген Entrez: фактор роста, полученный из гепатомы HDGF (подобный белку 1 группы с высокой подвижностью)».

дальнейшее чтение

• Эверетт А.Д., Бушвеллер Дж. (2003). «Фактор роста, полученный из гепатомы, является митогеном, нацеленным на ядро». Текущие цели в отношении лекарств. 4 (5): 367–71. Дои:10.2174/1389450033490975. PMID  12816346.
• Накамура Х., Изумото Й., Камбе Х. и др. (1994). «Молекулярное клонирование комплементарной ДНК для нового фактора роста, происходящего от гепатомы человека. Его гомология с протеином группы 1 с высокой подвижностью». J. Biol. Chem. 269 (40): 25143–9. PMID  7929202.
• Кишима Ю., Ямамото Н., Изумото Ю. и др. (2002). «Фактор роста, полученный из гепатомы, стимулирует рост клеток после перемещения в ядро ​​с помощью сигналов ядерной локализации». J. Biol. Chem. 277 (12): 10315–22. Дои:10.1074 / jbc.M111122200. PMID  11751870.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Мори М., Моришита Х, Накамура Х и др. (2004). «Фактор роста, происходящий из гепатомы, участвует в ремоделировании легких, стимулируя рост эпителия». Am. J. Respir. Cell Mol. Биол. 30 (4): 459–69. Дои:10.1165 / rcmb.2003-0013OC. PMID  12972397.
• Йошида К., Накамура Х., Окуда Й. и др. (2004). «Экспрессия фактора роста гепатомы в гепатоканцерогенезе». J. Gastroenterol. Гепатол. 18 (11): 1293–301. Дои:10.1046 / j.1440-1746.2003.03191.x. PMID  14535987.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Шу Х, Чен С., Би Кью и др. (2004). «Идентификация фосфопротеинов и их сайтов фосфорилирования в клеточной линии лимфомы WEHI-231 B». Мол. Cell. Протеомика. 3 (3): 279–86. Дои:10.1074 / mcp.D300003-MCP200. PMID  14729942.
• Эверетт А.Д., Наррон СП, Ступс Т. и др. (2004). «Фактор роста, происходящий от гепатомы, представляет собой ангиогенный фактор, экспрессируемый эндотелиальными клетками легких». Am. J. Physiol. Lung Cell Mol. Физиол. 286 (6): L1194–201. Дои:10.1152 / ajplung.00427.2003. PMID  14751852.
• Сью SC, Chen JY, Huang TH (2004). «Последовательно-специфические резонансные отнесения 1H, 13C и 15N к hath-домену фактора роста, происходящего от гепатомы человека». J. Biomol. ЯМР. 29 (1): 95–6. Дои:10.1023 / B: JNMR.0000019467.57276.05. PMID  15017145.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Баллиф Б.А., Виллен Дж., Босолей С.А. и др. (2005). «Фосфопротеомный анализ развивающегося мозга мыши». Мол. Cell. Протеомика. 3 (11): 1093–101. Дои:10.1074 / mcp.M400085-MCP200. PMID  15345747.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Шен XY, Закал N, Сингх G, Радуга AJ (2005). «Изменения экспрессии митохондриальных и регулирующих апоптоз генов в устойчивых к фотодинамической терапии вариантах клеток карциномы толстой кишки HT29». Photochem. Фотобиол. 81 (2): 306–13. Дои:10.1562 / 2004-07-22-RA-242. PMID  15560738.
• Барриос-Родилес М., Браун К.Р., Оздамар Б. и др. (2005). «Высокопроизводительное отображение динамической сигнальной сети в клетках млекопитающих». Наука. 307 (5715): 1621–5. Дои:10.1126 / science.1105776. PMID  15761153.
• Ивасаки Т., Накагава К., Накамура Х. и др. (2005). «Фактор роста гепатомы как прогностический маркер при полностью удаленном немелкоклеточном раке легкого». Онкол. Представитель. 13 (6): 1075–80. Дои:10.3892 / или 13.6.1075. PMID  15870924.
• Грегори С.Г., Барлоу К.Ф., Маклей К.Э. и др. (2006). «Последовательность ДНК и биологическая аннотация хромосомы 1 человека». Природа. 441 (7091): 315–21. Дои:10.1038 / природа04727. PMID  16710414.
• Беранова-Джорджанни С., Чжао Ю., Дезидерио Д.М., Джорджианни Ф. (2006). «Фосфопротеомический анализ гипофиза человека». Гипофиз. 9 (2): 109–20. Дои:10.1007 / s11102-006-8916-x. PMID  16807684.
• Клермон Ф., Гонсалес Н.С., Коммуни Д., Франкен С., Дюмон Дж. Э., Робай Б. (2008). «HDGF дефосфорилируется на ранних стадиях апоптоза эндотелиальных клеток каспазозависимым образом». J Cell Biochem. 104 (4): 1161–1171. Дои:10.1002 / jcb.21788. PMID  18465786.

внешние ссылки

• PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для фактора роста, происходящего от гепатомы человека