EPH рецептор B1 - EPH receptor B1

EPHB1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2DJS, 2EAO, 3ZFX
Идентификаторы
Псевдонимы	EPHB1, Ephb1, 9330129L11, AW488255, C130099E04Rik, Cek6, ENSMUSG00000074119, Elk, Elkh, Hek6, Net, EPHT2, EPH рецептор B1, ELK, NET
Внешние идентификаторы	OMIM: 600600 MGI: 1096337 ГомолоГен: 20936 Генные карты: EPHB1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 3 (человек)[1] Группа 3q22.2 Начните 134,597,801 бп[1] Конец 135,260,467 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 9 (мышь)[2] Группа 9 | 9 F1 Начните 101,922,128 бп[2] Конец 102,354,693 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • трансферазная активность • связывание нуклеотидов • активность протеинкиназы • киназная активность • GO: 0001948 связывание с белками • активность трансмембранного рецептора протеина тирозинкиназы • активность протеинтирозинкиназы • Связывание АТФ • активность рецептора эфрина • активность рецептора наведения аксонов • активность трансмембранных рецепторов эфрина • GO: 0032403 связывание макромолекулярного комплекса Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • эндосома • проекция клетки • мембрана ранней эндосомы • мембрана • неотъемлемый компонент плазматической мембраны • внеклеточная область • дендрит • внеклеточная экзосома • эндоплазматический ретикулум • цитозоль • клеточная мембрана • аксон • цитоплазма • кончик филоподия • мембранный плот • проекция нейрона • рецепторный комплекс • глутаматергический синапс Биологический процесс • фосфорилирование • сигнальный путь трансмембранного рецептора протеина тирозинкиназы • развитие нервной системы • развитие дендритного позвоночника • адгезия клетки к субстрату • регулирование каскада JNK • фосфорилирование белков • клеточная адгезия • регуляция гибели нейронов • регуляция каскада ERK1 и ERK2 • аутофосфорилирование • фосфорилирование пептидилтирозина • формирование иммунологического синапса • управление аксоном • морфогенез зрительного нерва • проекция центральной нервной системы нейрон аксоногенез • ведение аксонов ганглиозных клеток сетчатки • сигнальный путь рецептора эфрина • морфогенез глаза камерного типа • положительная регуляция сборки синапсов • морфогенез дендритного позвоночника • ангиогенез • активация сателлитных клеток скелетных мышц • развитие черепных нервов • нейрогенез • установление полярности клеток • обнаружение температурного стимула, участвующего в сенсорном восприятии боли • хемотаксис клеток • пролиферация нервных клеток-предшественников • отрицательная регуляция пролиферации сателлитных клеток скелетных мышц • отрицательная регуляция дифференцировки сателлитных клеток • модуляция химической синаптической передачи Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	2047	270190
Ансамбль	ENSG00000154928	ENSMUSG00000032537
UniProt	P54762	Q8CBF3
RefSeq (мРНК)	NM_004441	NM_001168296 NM_173447
RefSeq (белок)	NP_004432	NP_001161768 NP_775623
Расположение (UCSC)	Chr 3: 134,6 - 135,26 Мб	Chr 9: 101.92 - 102.35 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Рецептор эфрина типа B 1 это белок что у людей кодируется EPHB1 ген.^[5][6]

Функция

Рецепторы эфрина и их лиганды, эфрины, опосредуют многочисленные процессы развития, особенно в нервной системе. Основываясь на их структуре и взаимосвязи последовательностей, эфрины делятся на класс эфрина-A (EFNA), который прикреплен к мембране с помощью гликозилфосфатидилинозитовой связи, и класс эфрина-B (EFNB), которые являются трансмембранными белками. Семейство рецепторов Eph делится на 2 группы на основании сходства последовательностей их внеклеточных доменов и их сродства к связыванию лигандов эфрина-A и эфрина-B. Рецепторы эфрина составляют самую большую подгруппу семейства рецепторных тирозинкиназ (RTK). Белок, кодируемый этим геном, является рецептором для членов семейства эфрина-B.^[6]

Взаимодействия

Было показано, что рецептор B1 EPH взаимодействовать с участием:

• ACP1^[7]
• GRB7^[8] и
• NCK1^[9]
• Эфрин-В2 ^[10]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000154928 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032537 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Тан XX, Бигель Дж. А., Найкум Л. М., Йошиока А., Бродер Г. М., Pleasure DE, Икегаки Н. (1995). «Клонирование кДНК, молекулярная характеристика и хромосомная локализация NET (EPHT2), гена протеин-тирозинкиназы рецептора человека, связанного с EPH, предпочтительно экспрессируемого в головном мозге». Геномика. 29 (2): 426–37. Дои:10.1006 / geno.1995.9985. PMID  8666391.
6. «Ген энтреза: EPHB1 EPH рецептор B1».
7. Штейн Э., Лейн А.А., Черретти Д.П., Шекльманн Х.О., Шрофф А.Д., Ван Эттен Р.Л., Даниэль Т.О. (март 1998 г.). «Рецепторы Eph различают олигомеры конкретных лигандов для определения альтернативных сигнальных комплексов, реакций присоединения и сборки». Genes Dev. 12 (5): 667–78. Дои:10.1101 / gad.12.5.667. ЧВК  316584. PMID  9499402.
8. Хан, округ Колумбия, Шэнь Т.Л., Мяо Х, Ван Б., Гуань Д.Л. (ноябрь 2002 г.). «EphB1 связывается с Grb7 и регулирует миграцию клеток». J. Biol. Chem. 277 (47): 45655–61. Дои:10.1074 / jbc.M203165200. PMID  12223469.
9. Stein E, Huynh-Do U, Lane AA, Cerretti DP, Daniel TO (январь 1998 г.). «Привлечение Nck к рецептору Eph, EphB1 / ELK, связывает активацию лиганда с киназой c-Jun». J. Biol. Chem. 273 (3): 1303–8. Дои:10.1074 / jbc.273.3.1303. PMID  9430661.
10. Williams, SE; Mann, F; Эрскин, Л. (2003). «Эфрин-B2 и EphB1 опосредуют расхождение аксонов сетчатки при перекресте зрительных нервов». Нейрон. 39 (6): 919–935. Дои:10.1016 / j.neuron.2003.08.017. PMID  12971893. S2CID  18565204.

дальнейшее чтение

• Фланаган Дж. Г., Вандерхэген П. (1998). «Эфрины и рецепторы Eph в нервном развитии». Анну. Преподобный Neurosci. 21: 309–45. Дои:10.1146 / annurev.neuro.21.1.309. PMID  9530499.
• Чжоу Р. (1998). «Рецепторы и лиганды семейства Eph». Pharmacol. Ther. 77 (3): 151–81. Дои:10.1016 / S0163-7258 (97) 00112-5. PMID  9576626.
• Абрахамсон Д.Р., Роберт Б., Хайинк Д.П., Сент-Джон П.Л., Дэниел Т.О. (1998). «Происхождение и формирование микрососудов в развивающейся почке». Kidney Int. Suppl. 67: S7-11. Дои:10.1046 / j.1523-1755.1998.06702.x. PMID  9736245.
• Держатель N, Klein R (1999). «Рецепторы Eph и эфрины: эффекторы морфогенеза». Развитие. 126 (10): 2033–44. PMID  10207129.
• Уилкинсон Д.Г. (2000). «Рецепторы Eph и эфрины: регуляторы наведения и сборки». Int. Преподобный Цитол. Международный обзор цитологии. 196: 177–244. Дои:10.1016 / S0074-7696 (00) 96005-4. ISBN  9780123646002. PMID  10730216.
• Сюй Кью, Меллитцер Г., Уилкинсон Д.Г. (2000). «Роль рецепторов Eph и эфринов в сегментарном формировании паттерна». Филос. Пер. R. Soc. Лондон. B Biol. Наука. 355 (1399): 993–1002. Дои:10.1098 / rstb.2000.0635. ЧВК  1692797. PMID  11128993.
• Уилкинсон Д.Г. (2001). «Множественные роли рецепторов EPH и эфринов в развитии нервной системы». Nat. Преподобный Neurosci. 2 (3): 155–64. Дои:10.1038/35058515. PMID  11256076. S2CID  205014301.
• Ларос Л., Гиш Дж, Шелсон С., Поусон Т. (1993). «Идентификация остатков в рецепторе бета-тромбоцитарного фактора роста, которые придают специфичность для связывания с фосфолипазой C-гамма 1». Онкоген. 8 (9): 2493–9. PMID  7689724.
• Дэвис С., Гейл Н.В., Олдрич Т.Х., Maisonpierre PC, Лхотак В., Поусон Т., Голдфарб М., Янкопулос Г.Д. (1994). «Лиганды для связанных с EPH рецепторных тирозинкиназ, которые требуют прикрепления к мембране или кластеризации для активности». Наука. 266 (5186): 816–9. Дои:10.1126 / science.7973638. PMID  7973638.
• Бекманн М.П., ​​Черретти Д.П., Баум П., Ванден Бос Т., Джеймс Л., Фарра Т., Козлоски С., Холлингсворт Т., Шиллинг Н., Марасковский Е. (1994). «Молекулярная характеристика семейства лигандов для рецепторов тирозинкиназы, связанных с eph». EMBO J. 13 (16): 3757–62. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1994.tb06685.x. ЧВК  395287. PMID  8070404.
• Черретти Д.П., Ванден Бос Т., Нельсон Н., Козлоски С.Дж., Редди П., Марасковский Е., Парк Л.С., Лайман С.Д., Коупленд Н.Г., Гилберт Д.Д. (1995). «Выделение LERK-5: лиганда рецепторных тирозинкиназ, связанных с eph». Мол. Иммунол. 32 (16): 1197–205. Дои:10.1016/0161-5890(95)00108-5. PMID  8559144.
• Гейл Н.В., Холланд С.Дж., Валенсуэла Д.М., Фленникен А., Пан Л., Райан Т.Е., Хенкемейер М., Стребхардт К., Хираи Н., Уилкинсон Д.Г., Поусон Т., Дэвис С., Янкопулос Г.Д. (1996). «Рецепторы и лиганды Eph включают два основных подкласса специфичности и реципрокно компартментализированы во время эмбриогенеза». Нейрон. 17 (1): 9–19. Дои:10.1016 / S0896-6273 (00) 80276-7. PMID  8755474. S2CID  1075856.
• Штейн Э, Черретти Д.П., Даниэль Т.О. (1996). «Активация лигандом тирозинкиназы рецептора ELK способствует ее ассоциации с Grb10 и Grb2 в эндотелиальных клетках сосудов». J. Biol. Chem. 271 (38): 23588–93. Дои:10.1074 / jbc.271.38.23588. PMID  8798570.
• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1996). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Козлоски CJ, VandenBos T, Park L, Cerretti DP, Carpenter MK (1997). «LERK-7: лиганд киназ, связанных с Eph, регулируется в мозге в процессе развития». Цитокин. 9 (8): 540–9. Дои:10.1006 / cyto.1997.0199. PMID  9245480.
• Эфноменклатурный комитет (1997). «Единая номенклатура рецепторов семейства Eph и их лигандов, эфринов. Комитет по номенклатуре Eph». Ячейка. 90 (3): 403–4. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80500-0. PMID  9267020. S2CID  26773768.
• Stein E, Huynh-Do U, Lane AA, Cerretti DP, Daniel TO (1998). «Привлечение Nck к рецептору Eph, EphB1 / ELK, связывает активацию лиганда с киназой c-Jun». J. Biol. Chem. 273 (3): 1303–8. Дои:10.1074 / jbc.273.3.1303. PMID  9430661.
• Штейн Э., Лейн А.А., Черретти Д.П., Шекльманн Х.О., Шрофф А.Д., Ван Эттен Р.Л., Даниэль Т.О. (1998). «Рецепторы Eph различают олигомеры конкретных лигандов для определения альтернативных сигнальных комплексов, реакций присоединения и сборки». Genes Dev. 12 (5): 667–78. Дои:10.1101 / gad.12.5.667. ЧВК  316584. PMID  9499402.