EPH рецептор B2 - EPH receptor B2

EPHB2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1B4F, 1F0M, 2QBX, 3ZFM
Идентификаторы
Псевдонимы	EPHB2, Ephb2, Cek5, Drt, ETECK, Erk, Hek5, Nuk, Prkm5, Qek5, Sek3, Tyro5, CAPB, EK5, EPHT3, PCBC, рецептор EPH B2, DRT, ERK, BDPLT22
Внешние идентификаторы	OMIM: 600997 MGI: 99611 ГомолоГен: 37925 Генные карты: EPHB2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1п36.12 Начинать 22,710,839 бп[1] Конец 22,921,500 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь)[2] Группа 4 D3 | 4 69,0 см Начинать 136,647,539 бп[2] Конец 136,835,988 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • трансферазная активность • связывание нуклеотидов • активность протеинкиназы • активность трансмембранных рецепторов эфрина • киназная активность • GO: 0001948 связывание с белками • идентичное связывание с белками • активность трансмембранного рецептора протеина тирозинкиназы • активность протеинтирозинкиназы • рецепторное связывание • Связывание АТФ • активность рецептора наведения аксонов • активность рецептора эфрина • связывание бета-амилоида • сигнальная активность рецептора • GO: 0032403 связывание макромолекулярного комплекса Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • цитозоль • проекция клетки • мембрана • неотъемлемый компонент плазматической мембраны • внеклеточная область • аксон • тело нейрональной клетки • дендрит • ядро клетки • клеточная мембрана • проекция нейрона • рецепторный комплекс • постсинапс • глутаматергический синапс • неотъемлемый компонент постсинаптической мембраны • неотъемлемый компонент пресинаптической мембраны Биологический процесс • положительная регуляция сборки синапсов • развитие неба • фосфорилирование • сигнальный путь трансмембранного рецептора протеина тирозинкиназы • морфогенез зрительного нерва • сигнальный путь рецептора эфрина • учусь • управление аксоном комиссурального нейрона • развитие нервной системы • развитие многоклеточного организма • регуляция аксоногенеза • развитие дендритного позвоночника • морфогенез дендритного позвоночника • отрицательная регуляция аксоногенеза • фосфорилирование белков • положительная регуляция долговременной синаптической пластичности нейронов • регулирование уровня жидкости в организме • морфогенез внутреннего уха • ангиогенез • клеточный морфогенез • морфогенез органов животных • регуляция нейрональной синаптической пластичности • развитие мочеполовой системы • фосфорилирование пептидилтирозина • развитие мозолистого тела • проекция центральной нервной системы нейрон аксоногенез • аксональная фасцикуляция • морфогенез глаза камерного типа • ведение аксонов ганглиозных клеток сетчатки • управление аксоном • транс-синаптическая передача сигналов посредством транс-синаптического комплекса, модулирующая синаптическую передачу • отрицательная регуляция фосфорилирования белков • обучение или память • положительная регуляция экспрессии генов • положительная регуляция синаптической пластичности • отрицательная регуляция передачи сигнала белка Ras • инактивация активности MAPKK • регулирование сборки синапсов • отрицательная регуляция каскада ERK1 и ERK2 • сборка постсинаптической мембраны • ретракция проекции нейрона • положительная регуляция долговременной синаптической потенциации • положительное регулирование локализации белка в плазматической мембране • отрицательная регуляция активности рецептора глутамата NMDA • положительная регуляция активности рецептора глутамата NMDA Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	2048	13844
Ансамбль	ENSG00000133216	ENSMUSG00000028664
UniProt	P29323	P54763
RefSeq (мРНК)	NM_001309192 NM_001309193 NM_004442 NM_017449	NM_001290753 NM_010142
RefSeq (белок)	NP_001296121 NP_001296122 NP_004433 NP_059145	NP_001277682 NP_034272
Расположение (UCSC)	Chr 1: 22.71 - 22.92 Мб	Chr 4: 136,65 - 136,84 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Рецептор эфрина типа B 2 это белок что у людей кодируется EPHB2 ген.^[5]

Функция

Рецепторы эфрина и их лиганды, эфрины, опосредуют многочисленные процессы развития, особенно в нервная система. Основываясь на их структуре и взаимосвязи последовательностей, эфрины делятся на класс эфрина-A (EFNA), которые прикреплены к мембране с помощью гликозилфосфатидилинозитоловой связи, и класс эфрина-B (EFNB), которые являются трансмембранные белки. Семейство рецепторов Eph делится на 2 группы на основании сходства последовательностей их внеклеточных доменов и их сродства к связыванию лигандов эфрина-A и эфрина-B. Рецепторы эфрина составляют самую большую подгруппу рецепторная тирозинкиназа (РТК) семья. Белок, кодируемый этим геном, является рецептором для членов семейства эфрина-B.^[6]

Исследования на животных

EphB2 является частью Сигнализация NMDA пути и восстановление экспрессии спасают когнитивные функции в модель животных из Болезнь Альцгеймера.^[7]

А рецессивный Ген EphB2 отвечает за мутацию хохлатого пера у голуби.^[8]

Взаимодействия

Рецептор B2 EPH, как было показано, взаимодействовать с:

• Abl ген^[9]
• Активатор белка р21 RAS 1^[10]
• Src^[11][12]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000133216 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028664 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Чан Дж., Ватт В.М. (август 1991 г.). «eek и erk, новые представители подкласса eph рецепторных протеин-тирозинкиназ». Онкоген. 6 (6): 1057–61. PMID  1648701.
6. «Ген Entrez: EPHB2 EPH рецептор B2».
7. Cissé M, Halabisky B, Harris J, Devidze N, Dubal DB, Sun B, Orr A, Lotz G, Kim DH, Hamto P, Ho K, Yu GQ, Mucke L (январь 2011 г.). «Обращение вспять истощения EphB2 спасает когнитивные функции в модели Альцгеймера». Природа. 469 (7328): 47–52. Дои:10.1038 / природа09635. ЧВК  3030448. PMID  21113149. Сложить резюме – NHS Choices.
8. Shapiro MD, Kronenberg Z, Li C, Domyan ET, Pan H, Campbell M, Tan H, Huff CD, Hu H, Vickrey AI, Nielsen SC, Stringham SA, Hu H, Willerslev E, Gilbert MT, Yandell M, Zhang G , Ван Дж (январь 2013 г.). «Геномное разнообразие и эволюция гребня у сизого голубя». Наука. 339 (6123): 1063–7. Дои:10.1126 / science.1230422. ЧВК  3778192. PMID  23371554. Сложить резюме – Нью-Йорк Таймс.
9. Ю. Х. Х., Зиш А. Х., Доделет В. К., Паскуале Э. Б. (июль 2001 г.). «Множественные сигнальные взаимодействия киназ Abl и Arg с рецептором EphB2». Онкоген. 20 (30): 3995–4006. Дои:10.1038 / sj.onc.1204524. PMID  11494128.
10. Holland SJ, Gale NW, Gish GD, Roth RA, Songyang Z, Cantley LC, Henkemeyer M, Yancopoulos GD, Pawson T. (июль 1997 г.). «Остатки юкстамембранного тирозина связывают рецептор семейства Eph EphB2 / Nuk со специфическими белками домена SH2 в нейрональных клетках». EMBO J. 16 (13): 3877–88. Дои:10.1093 / emboj / 16.13.3877. ЧВК  1170012. PMID  9233798.
11. Зиш А.Х., Кало М.С., Чонг Л.Д., Паскуале Э.Б. (май 1998 г.). «Для образования комплекса между EphB2 и Src требуется фосфорилирование тирозина 611 в прилегающей к мембране области EphB2». Онкоген. 16 (20): 2657–70. Дои:10.1038 / sj.onc.1201823. PMID  9632142.
12. Zisch AH, Pazzagli C, Freeman AL, Schneller M, Hadman M, Smith JW, Ruoslahti E, Pasquale EB (январь 2000 г.). «Замена двух консервативных тирозинов рецептора EphB2 на глутаминовую кислоту предотвращает связывание доменов SH2 без отмены киназной активности и биологических ответов». Онкоген. 19 (2): 177–87. Дои:10.1038 / sj.onc.1203304. PMID  10644995.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.