Митохондриальный код асцидии - Ascidian mitochondrial code
Митохондриальный код асцидии (таблица перевода 13) это генетический код найдено в митохондриях Асцидия.
Код
AA = FFLLSSSSYY ** CCWWLLLLPPPPHHQQRRRRIIMMTTTTNNKKSSGGVVVVVAAAADDEEGGGGНачинается = --- М ------------------------------ ММ -------------- -М ------------Base1 = TTTTTTTTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGGGGGGGGGGGGBase2 = TTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGBase3 = TCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAG
Базы: аденин (А), цитозин (С), гуанин (G) и тимин (T) или урацил (U).
Аминокислоты: Аланин (Ала, А), Аргинин (Arg, R), Аспарагин (Asn, N), Аспарагиновая кислота (Asp, D), Цистеин (Cys, C), Глютаминовая кислота (Glu, E), Глутамин (Gln, Q), Глицин (Gly, G), Гистидин (Его, H), Изолейцин (Иль, я), Лейцин (Leu, L), Лизин (Лис, К), Метионин (Met, M), Фенилаланин (Phe, F), Пролин (Pro, P), Серин (Сер, S), Треонин (Thr, T), Триптофан (Трп, Вт), Тирозин (Tyr, Y), Валин (Вал, В)
Отличия от стандартного кода
| Кодоны ДНК | Кодоны РНК | Этот код (13) | Стандартный код (1) | |
|---|---|---|---|---|
| AGA | AGA | Gly (Г) | Arg (Р) | |
| AGG | AGG | Gly (Г) | Arg (Р) | |
| ATA | AUA | Встретил (М) | Иль (Я) | |
| TGA | UGA | Trp (Вт) | СТОП = Тер (*) |
Систематический диапазон и комментарии
Имеются свидетельства филогенетически разнообразной выборки оболочки (Урохордовые ), что коды AGA и AGG для глицин. У других организмов код AGA / AGG либо аргинин или серин и у позвоночных митохондрии они кодируют СТОП. Доказательства глициновой трансляции AGA / AGG были впервые обнаружены в 1993 г. Пюра столонифера[1] и Halocynthia roretzi.[2] Затем это было подтверждено секвенированием тРНК.[3] и секвенирование целых митохондриальных геномов.[4][5]
Альтернативные кодоны инициации
- АТА, ГТГ и ТТГ[5]
- ATT является стартовым кодоном гена CytB в Halocynthia roretzi.[6]
Смотрите также
использованная литература
Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.[7]
- ^ Дюррейм Г.А., Корфилд В.А., Харли Э.Х., Рикеттс М.Н. (1993). «Нуклеотидная последовательность цитохромоксидазы (субъединица III) из митохондрии оболочки Пюра столонифера: свидетельство того, что AGR кодирует глицин ". Исследования нуклеиновых кислот. 21 (15): 3587–8. Дои:10.1093 / nar / 21.15.3587. ЧВК 331473. PMID 8393993.
- ^ Йокобори С., Уэда Т., Ватанабе К. (январь 1993 г.). «Кодоны AGA и AGG читаются как глицин в митохондриях асцидии». Журнал молекулярной эволюции. 36 (1): 1–8. Дои:10.1007 / bf02407301. PMID 8381878. S2CID 12603691.
- ^ Кондов А., Сузуки Т., Йокобори С., Уэда Т., Ватанабе К. (июнь 1999 г.). «Дополнительная tRNAGly (U * CU), обнаруженная в митохондриях асцидии, ответственная за декодирование неуниверсальных кодонов AGA / AGG как глицин». Исследования нуклеиновых кислот. 27 (12): 2554–9. Дои:10.1093 / nar / 27.12.2554. ЧВК 148460. PMID 10352185.
- ^ Йокобори С., Уэда Т., Фельдмайер-Фукс Г., Пэабо С., Уэшима Р., Кондов А., Нисикава К., Ватанабе К. (декабрь 1999 г.). "Полная последовательность ДНК митохондриального генома асцидии Halocynthia roretzi (Chordata, Urochordata) ". Генетика. 153 (4): 1851–62. ЧВК 1460873. PMID 10581290.
- ^ а б Йокобори С., Ватанабэ Ю., Осима Т. (ноябрь 2003 г.). «Митохондриальный геном Ciona Savignyi (Urochordata, Ascidiacea, Enterogona): сравнение расположения генов и генов тРНК с Halocynthia roretzi митохондриальный геном ". Журнал молекулярной эволюции. 57 (5): 574–87. Дои:10.1007 / s00239-003-2511-9. PMID 14738316. S2CID 19474615.
- ^ Гисси C, Песоле G (2003). «Картирование транскриптов и аннотация генома асцидийской мтДНК с использованием данных EST». Геномные исследования. 13 (9): 2203–12. Дои:10.1101 / гр.1227803. ЧВК 403730. PMID 12915488.
- ^ Эльзановский А, Остелл Дж, Лейпе Д., Сусов В. "Генетические коды". Браузер таксономии. Национальный центр биотехнологической информации (NCBI), Национальная медицинская библиотека США. Получено 5 июн 2016.
 | Эта генетика статья - это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |