BGI Group - BGI Group

BGI
Публичная компания
ПромышленностьСеквенирование генома
Биотехнологии
Основан9 сентября 1999 г. (Пекин)
ОсновательВан Цзянь
Юй Цзюнь
Ян Хуанмин
Лю Сици
Штаб-квартираШэньчжэнь, Гуандун, Китай
Количество локаций
Обслуживаемая площадь
Мировой
Ключевые люди
Ван Цзянь (Президент, председатель)
ТоварыПлатформа DNBseq ™ (платформа для секвенирования нового поколения), Тест NIFTY® (неинвазивный пренатальный тест)
БрендыDNBseq ™, NIFTY®
ДоходУвеличивать 251 миллион долларов (2016)[1]
Увеличивать 51,7 млн. Долл. США (2016)[1]
ВладелецВан Цзянь
Количество работников
~ 6000 (по всему миру)
ПодразделенияBGI Китай (материк)
BGI Азиатско-Тихоокеанский регион
BGI Americas
BGI Europe (Европа и Африка)
Дочерние компании
Интернет сайтwww.bgi.com/global/
www.genomics.cn

BGI, в настоящее время известный как BGI Group, ранее известный как Пекинский институт геномики, это китаец секвенирование генома компания со штаб-квартирой в Шэньчжэнь, Гуандун, Китай.[2][3]

Он был образован в 1999 году для участия в Проект генома человека как центр генетических исследований.[4] Он также секвенирует геномы других животных, растений и микроорганизмов.[5]

BGI Group объявила на конференции AGBT в феврале 2020 года, что сделает секвенирование генома дешевле, впервые преодолев 100-долларовый барьер.[6] Компания из Шэньчжэня заявляет, что низкая стоимость станет возможной благодаря «экстремальной» системе секвенирования ДНК, которую она планирует предложить, которая способна расшифровывать геномы 100 000 человек в год.

Компания превратилась из научно-исследовательского института, который расшифровал ДНК панд и рисовых растений, в компанию, занимающуюся клонированием животных, тестированием здоровья и контрактными исследованиями.

История

Ван Цзянь Юй Цзюнь, Ян Хуанмин и Лю Сици создали BGI в сентябре 1999 г.[5] в Пекине, Китай, в качестве неправительственного независимого исследовательского института с целью участия в Проект генома человека как представитель Китая.[7][8] После завершения проекта финансирование иссякло, после чего BGI переехала в Ханчжоу в обмен на финансирование от муниципального правительства Ханчжоу. В 2002 году BGI секвенировал рис геном, который был на обложке журнала Наука. В 2003 году BGI расшифровала ОРВИ геном вируса и создали набор для обнаружения вируса. В 2003 году BGI Hangzhou и Чжэцзянский университет основал новый научно-исследовательский институт Институт генома Джеймса Д. Уотсона, Чжэцзянский университет. Институт Уотсона должен был стать крупным центром исследований и образования в Восточной Азии по образцу Лаборатория Колд-Спринг-Харбор в США.

В 2007 году штаб-квартира BGI переехала в г. Шэньчжэнь как «первое управляемое гражданами некоммерческое исследовательское учреждение в Китае». Ю Цзюнь покинул BGI в это время, якобы продав свою долю другим трем учредителям за символическую сумму.[5] В 2008 году правительство Шэньчжэня официально признало BGI-Shenzhen некоммерческой организацией.[9] В 2008 году BGI опубликовал первый геном азиатского человека.[7][10]

В 2010 году BGI Shenzhen был сертифицирован как отвечающий требованиям стандарта ISO9001: 2008 для разработки и предоставления услуг высокопроизводительного секвенирования.[11] В том же году BGI купила 128 Иллюмина Машины для секвенирования генов HiSeq 2000,[4][7] который был поддержан 1,5 миллиарда долларов США в виде «фондов сотрудничества» в течение следующих 10 лет от Банк Развития Китая.[5][12][13] По сообщениям, к концу года их бюджет составлял 30 миллионов долларов.[14] В 2010 году была основана компания BGI Americas с главным офисом в г. Кембридж, Массачусетс, США и BGI Europe была основана в Копенгаген, Дания.[15][16] К 2018 г. к ним добавились офисы и лаборатории в г. Сиэтл и Сан - Хосе в США,[4] и Лондон в Великобритании, а также были основаны BGI Asia Pacific с офисами в Гонконг, Кобе (Япония), Бангкок (Таиланд), Лаос, Сингапур, Брисбен (Австралия) и многие другие.[17][18]

В 2011 году BGI сообщила, что в нем работает 4000 ученых и технических специалистов.[2] и имел доход в 192 миллиона долларов.[5] BGI провела секвенирование генома смертоносных 2011 Германия E. coli O104: вспышка H4 за три дня и выпустил по открытой лицензии.[19] С 2012 года он начал коммерциализацию своих услуг, имея инвестиции от Китайская компания по страхованию жизни, Citic's Goldstone Investment, Джек Ма Yunfeng Capital и SoftBank China Capital.[20] В том же году они запустили собственный научный журнал, GigaScience,[21] партнерство с BioMed Central публиковать научные статьи с большим объемом данных.[22] В 2013 году BGI сообщила, что поддерживает отношения с 17 из 20 ведущих мировых фармацевтических компаний.[5][23] и рекламировала, что предоставляет глобальным фармацевтическим компаниям услуги в области коммерческой науки, здравоохранения, сельского хозяйства и информатики.[24] В том году он купил Полная геномика из Маунтин-Вью, Калифорния, крупного поставщика технологий секвенирования ДНК, за 118 миллионов долларов США.[5][19] В том же году BGI был оценен примерно в 820 миллионов долларов.[5]

В 2015 году они подписали сотрудничество с Больница Чжуншань «Центр точной клинической медицины в Шанхае, открытый в мае 2015 года, с бюджетом 100 миллионов иен. Сообщается, что они участвуют в качестве института секвенирования в китайском исследовательском проекте медицинского обслуживания стоимостью 9,2 миллиарда долларов, который продлится 15 лет.[4][25] В мае 2017 года было объявлено о создании инновационного центра Западного побережья, расположенного в Сиэтле и Сан-Хосе, на первом месте, где планируется работать в области точной медицины и сотрудничать с Вашингтонский университет, то Институт изучения мозга Аллена, то Фонд Билла и Мелинды Гейтс, и Вашингтонский государственный университет, а на второй уже существующей лаборатории со 100 сотрудниками для разработки секвенирование следующего поколения технологии.[4] В мае 2018 года была достигнута договоренность с Больница Mount Sinai (Торонто), Канада, для первой установки платформ BGISEQ в Северной Америке.[26]

Дочерняя компания BGI Group, BGI Genomics, сделала первичное публичное размещение акций в июле 2017 г. Шэньчжэньская фондовая биржа, собрав 547 миллионов йен (80,7 миллиона долларов), при этом оценка компании в первый день составила более 1,15 миллиарда долларов.[1][27] В 2018 году 85,3% BGI принадлежало Ван Цзянь, а группе принадлежит 42,4% своего основного подразделения BGI Genomics. Заявленная рыночная стоимость BGI Genomics в июле 2018 года составила около 5 миллиардов долларов, как и другая дочерняя компания, MGI Tech, специализирующаяся на разработке и производстве технологий, IPO которой около 20% акций за 1 миллиард долларов запланировано на 2019 год в Гонконге. .[20]

Основные достижения

  • Сначала de novo последовательность и сборка млекопитающих[28] и человеческие геномы с коротким секвенированием (так называемое "секвенирование следующего поколения ")[29]
  • Секвенировал геном первого древнего человека из сохранившихся в вечной мерзлоте волос вымершего человека, которым примерно 4000 лет. Палео-эскимосский[30]
  • Секвенировал первый диплоидный геном азиатской особи,[31] в рамках проекта Ян Хуан
  • Инициировано построение карты последовательностей человеческого пангеном, по оценкам, содержит 19-40 миллионов баз не в человеческом эталонный геном[32][33]
  • Первый проект BGI внес 1% от Проект генома человека Эталонного генома и был единственным институтом в развивающемся мире, внесшим свой вклад[34]
  • Предоставил 10% информации о последовательности для Международный проект HapMap[34]
  • Проведено экспериментальное исследование для определения последовательности микробиом пищеварительной системы человека, примерно в 150 раз больше, чем геном человека[35][36]
  • Ключевой центр секвенирования в Проект 1000 геномов[34]
  • Первое китайское учреждение, упорядочившее Острое респираторное заболевание (SARS) вирус, всего через несколько часов после первого секвенирования вируса канадцами[37]
  • Ключевой игрок в выпуске данных из открытых источников и анализе E. coli O104, 2011 г .: вспышка H4[38]
  • Последовательность 40 домашних и диких тутовые шелкопряды, идентифицировав 354 гена, вероятно, важных для приручения.[39]
  • Последовал первый гигантская панда геном[28] равный по размеру геному человека, менее чем за 8 месяцев.[40] Секвенирование показало, что гигантская панда, Ailuropoda melanoleuca, имеет мутация сдвига рамки в гене, участвующем в распознавании пикантных вкусов, T1R1. Мутация может быть генетической причиной, по которой панда предпочитает бамбук мясу. Однако у панды также отсутствуют гены, необходимые для переваривания бамбука, поэтому ее микробиом может играть ключевую роль в метаболизме основного источника пищи.[28]
  • Ключевой участник китайско-британского проекта "Геном курицы"[34]
  • По состоянию на 2010 г., секвенированные геномы растений включают рис, огурец, соя, и Сорго. Секвенированные геномы животных включают тутовый шелкопряд, пчела, водяная блоха, ящерица, и гигантская панда. Также было секвенировано еще 40 видов животных и растений и более 1000 бактерий.[8][39][41]
  • Природа в 2010 году BGI Shenzhen занял 4-е место среди 10 лучших вузов Китая, а все остальные - университеты и Китайская Академия Наук. Рейтинг основан на статьях в Природа исследовательские журналы.[42] К 2016 году он возглавил список корпоративных организаций в Китае, а также был 13-м корпоративным учреждением в мире.[42][43][44] В 2017 году, среди самых продуктивных корпоративно-академических совместных проектов в период с 2012 по 2016 год, BGI и Копенгагенский университет партнерство заняло 4-е место.[45]
  • В период с 2001 по 2013 год BGI был представлен примерно в 250 статьях, опубликованных в первоклассных академических журналах.[46]
  • В 2014 году сообщалось, что BGI производит 500 клонированных свиней в год для тестирования новых лекарств.[47] и примерно 25% мировых геномных данных.[4]
  • В январе 2018 года генеральный директор BGI Genomics Инь Е заявил, что они секвенировали более 10000 образцов WGS, при этом еще 20000 секвенировали их платформой BGISEQ-500, около 70% животных и растений до настоящего времени были секвенированы компанией и их партнерами, поскольку хорошо проработала «более 10 миллионов клинических образцов, включая 2,8 миллиона неинвазивных пренатальных тестов, 2,6 миллиона тестов на вирус папилломы человека, 1,53 миллиона тестов на нарушение слуха, чуть более полумиллиона тестов для скрининга новорожденных и около 25 000 тестов на редкие заболевания».[48]

Текущие исследовательские проекты

Генетика человека

Проект генома человека

Основная статья: Проект генома человека

Международный проект был запущен в 1990 году и объявлен завершенным в 2003 году. Они присоединились к нему в 1999 году и обеспечили 1% рабочей нагрузки.[46]

Международный проект HapMap

Основная статья: Международный проект HapMap

Международный проект, запущенный в 2002 году и объявленный завершенным в 2009 году, обеспечил 10% рабочей нагрузки.[46]

Проект Ян Хуан

Основанный в 2007 году и названный в честь двух императоров, которые, как считается, основали доминирующую этническую группу Китая,[49] BGI планировал в этом проекте секвенировать не менее 100 китайцев для создания карты китайских генетических полиморфизмов с высоким разрешением.[50][51] Первые данные о геноме были опубликованы в октябре 2007 года.[52] Анонимный китайский миллиардер пожертвовал на проект 10 миллионов юаней (около 1,4 миллиона долларов США), и в начале проекта его геном был секвенирован.[50][51]

Проект 1000 геномов

Основная статья: Проект 1000 геномов

Международный проект по созданию подробного каталога генетическая изменчивость человека запущен в 2008 году и объявлен завершенным в 2015 году.[46]

Международный проект генома рака

Основная статья: Международный консорциум генома рака

Международный проект, запущенный в 2008 году.[46]

Проект 1000 редких заболеваний

Международный проект, инициированный совместно с Детская больница Филадельфии в 2011.[46] С его помощью были обнаружены гены и мутации, связанные с редкими заболеваниями, о которых сообщалось в более чем 20 научных публикациях. Они также «участвовали в разработке клинического диагностического теста всего экзома, предлагаемого с 2012 года при патологии CHOP». Они снова начали сотрудничать в 2017 году, когда к Консорциуму детских опухолевых тканей головного мозга CHOP присоединились BGI Китайский национальный генетический банк.[53]

Проект когнитивной геномики

Проект под названием «Когнитивная геномика» был посвящен исследованию генетическая основа интеллекта было объявлено в августе 2012 года. Американский физик Стивен Хсу присоединился в качестве научного руководителя и был одним из руководителей проекта.[54] Это было сделано на 2200 образцах, в основном из США,[46] из них 1600 были физическими лицами, которые участвовали в Изучение математически недоразвитой молодежи и, как сообщается, IQ более 160, собранных американским психологом и генетиком Роберт Пломин.[54][55] Помимо публикации новой улучшенной версии популярного Полногеномная ассоциация Инструмент обучения PLINK,[56] проект так и не был завершен, и ведущие исследователи переехали в США, чтобы основать компанию Genomic Prediction, которая обеспечивает расширенное генетическое тестирование для ЭКО.[57]

Животные и растения

Проект генома 1000 растений

Основная статья: Проект "1000 геномов растений"

Названный Проект "1000 геномов растений" (1KP), это был международный проект, запущенный в 2008 году и объявленный завершенным в 2015 году. Окончательные результаты были опубликованы в Природа в 2019 году.[58] В 2010 году BGI объявила о выделении 100 миллионов долларов США на крупномасштабные проекты секвенирования растений и животных.[13][59] В 2018 году было объявлено, что 1КП На смену проекту пришел проект 10KP по секвенированию 10 000 видов растений до высокого (на хромосомном уровне) качества.[60]

Проект "Три экстремальных экологических генома животных"

В 2009 году BGI-Shenzhen объявила о запуске трех проектов генома, направленных на животных, живущих в экстремальные условия. Три выбранных генома - это геномы двух полярный животные: Полярный медведь и Императорский пингвин, и один Альтиплано животное: Тибетская антилопа.[61] В Тибетская антилопа геном был опубликован в 2013 г.,[62] в Полярный медведь в 2014,[63] и Император и Пингвин Адели геномов в 2014 году.[64]

Международный проект по геному больших кошек

В 2010 году BGI, Пекинский университет, Хэйлунцзян Маньчжурский тигровый лесной зоопарк, Институт зоологии Куньмина, Зоопарк Сан-Диего Калифорнийский институт природоохранных исследований и другие организации объявили, что они Амурский тигр, Южно-китайский тигр, бенгальский тигр, Азиатский лев, Африканский лев, дымчатый леопард, снежный барс, и другие представители семейства кошачьих. BGI также будет секвенировать геномы и эпигеномы лигер и тигон. Поскольку два реципрокных гибрида имеют разные фенотипы, несмотря на то, что они генетически идентичны, ожидалось, что эпигеном может выявить основу таких различий.[65] Цель проекта заключалась в том, чтобы значительно продвинуть исследования по охране природы, и он был благоприятно объявлен китайским годом Тигра.[66] Проекты лигера и тигона так и не были реализованы, но в 2013 г. были опубликованы результаты по геномам амурского тигра. белый бенгальский тигр, Африканский лев белый африканский лев и снежный барс.[67]

Симбионт Геном Проект

Совместно финансируемый проект, объявленный 19 марта 2010 года, BGI объявил, что будет сотрудничать с Сидни К. Пирсом из Университета Южной Флориды и Чарльзом Делвишем из Университета Мэриленда в Колледж-Парке для секвенирования геномов морского слизня. Elysia chlorotica, и его водорослевая пища Vaucheria litorea. Морской слизень использует гены водорослей для синтеза хлорофилл, первый обнаруженный межвидовой перенос генов. Секвенирование их геномов может выяснить механизм этого переноса.[68] Эта работа была в конечном итоге завершена, и была представлена ​​сборка генома общей длиной 557 мегабайт.[69]

Проект БиоГеном Земли

Основная статья: Проект БиоГеном Земли

Международный проект, инициированный Смитсоновский институт и другие партнеры в 2018 году для секвенирования ДНК 1,5 миллиона известных видов эукариот на планете.[53]

Микроорганизмы

Проект "Десять тысяч микробных геномов"

Проект был начат 1 августа 2009 года с целью секвенирования 10 000 микробов в течение 3 лет. Он включает в себя секвенирование промышленных, сельскохозяйственных, медицинских микроорганизмов и многие другие. Это делается в сотрудничестве со многими институтами, университетами и предприятиями, включая научно-исследовательский институт биотехнологии Китайской академии сельскохозяйственных наук и Тяньцзиньский институт промышленной биотехнологии. Китайская Академия Наук.[70]

Технология биоинформатики

В 2010 году институтский суперкомпьютер с 500 узлами обрабатывал 10 терабайт необработанных данных секвенирования каждые 24 часа с имеющихся 30 или около того анализаторов генома от Illumina. Годовой бюджет компьютерного центра составлял 9 миллионов долларов США.[14] В том же году вычислительные биологи BGI разработали первый успешный алгоритм, основанный на теория графов, для выравнивания миллиардов цепочек из 25-75 пар оснований, созданных секвенсорами следующего поколения, в частности Иллюмина Анализатор генома во время секвенирования de novo. Алгоритм под названием SOAPdenovo может собрать геном за два дня и был использован для сборки массива геномов растений и животных.[33]

SOAPdenovo является частью "Пакет для короткого анализа олигонуклеотидов " (МЫЛО), набор инструментов, разработанный BGI для сборки de novo геномов человеческого размера, выравнивания, обнаружения SNP, повторного секвенирования, нахождения индексов и анализа структурных вариаций. SOAPdenovo, созданный для коротких считываний секвенсоров Illumina, использовался для сборки нескольких геномов человека.[29][30][31] (идентификация вставки размером восемь килобаз, не обнаруженной путем сопоставления с эталонным геномом человека[71]) и животных, таких как гигантская панда.[28]

Вплоть до 2015 года BGI выпускала BGISEQ-100 на основе Thermo Fisher Scientific с Ион Торрент устройство, и BGISEQ-1000, основанное на аналогичной технологии от Полная геномика, для обоих из которых было одобрено CFDA для пренатального теста NIFTY (неинвазивный тест на трисомию плода).[72][73] В октябре 2015 года BGI запустила BGISEQ-500,[74] более крупная настольная система секвенирования, которая через год получила одобрение CFDA как медицинское устройство. Сообщается, что компания получила более 500 заказов на систему и провела более 112 000 тестов до конца 2016 года.[73] Китайский национальный генетический банк, открытый BGI и правительством Китая в сентябре 2016 года,[75] имеет 150 инструментов системы.[73] BGISEQ-500 был разработан как платформа для секвенирования, способная конкурировать с Иллюмина платформы с его качеством и сниженной ценой.[72] В ноябре 2016 года BGI выпустила BGISEQ-50, миниатюрную версию настольного секвенсора.[76] В 2017 году BGI начала предлагать WGS по цене 600 долларов.[4] В октябре 2017 года MGI Tech, дочерняя компания BGI, выпустила два новых секвенсора MGISEQ-2000 и MGISEQ-200 (позже переименованных в DNBSEQ-G400 и DNBSEQ-G50),[77] а через год DNBSEQ-T7.[78]

Критика и споры

Обвинения в генетическом надзоре в Синьцзяне

В 2019 году сообщалось, что дочерняя компания BGI, Forensic Genomics International, создала WeChat -активированная база данных генетических профилей людей по всей стране.[79][80][81][82][83] В июле 2020 года сообщалось, что BGI вернула Программа защиты зарплаты заем после проверки в СМИ.[84] В том же месяце Министерство торговли США с Бюро промышленности и безопасности разместила две дочерние компании BGI на своей Список сущностей за помощь в предполагаемых нарушениях прав человека благодаря генетическому анализу в Синьцзян.[85][86] BGI ответили на листинг, заявив, что они «не потворствуют и никогда не будут участвовать в каких-либо нарушениях прав человека», и заявив, что они были озадачены этим решением, поскольку «упомянутая дочерняя компания была создана в ноябре 2016 года и не вела фактическую деятельность»[87]

Обвинения в неисправном комплекте для тестирования COVID-19

25 августа 2020 г. Рейтер сообщил, что около 3700 человек в Швеции ошибочно сообщили, что у них есть коронавирус из-за неисправности набора для тестирования COVID-19 от BGI Genomics.[88] Несмотря на то, что это 5-й тест ВОЗ Список аварийного использования,[89] и получение наивысших оценок в тестах на чувствительность в голландском исследовании, которое проводило независимую проверку коммерчески доступных тестов.[90] BGI Genomics защищала продукт, обвиняя различия в порогах, используемых лабораториями при очень низких уровнях вируса.[91]

Иски о нарушении патентных прав

В 2019 году конкурент Illumina, Inc. подал несколько нарушение патента иски против BGI.[92][93]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c «BGI Genomics привлекает 81 млн долларов в ходе IPO». Новости генной инженерии и биотехнологии. 17 июля 2017 г.. Получено 2 декабря 2018.
  2. ^ а б Одинокий Фрэнк, Качественная ДНК, 24 апреля 2011 г., The Daily Beast
  3. ^ "Вступление". BGI Group.
  4. ^ а б c d е ж грамм Меган Молтени (18 мая 2017 г.). "Китайский геномный гигант нацелился на совершенный секвенсор". Проводной. Получено 2 декабря 2018.
  5. ^ а б c d е ж грамм час Шу-Чинг Жан Чен (2 сентября 2013 г.). «Геномные мечты сбываются в Китае». Forbes Asia. Получено 27 октября 2014.
  6. ^ https://www.technologyreview.com/s/615289/china-bgi-100-dollar-genome/
  7. ^ а б c Кевин Дэвис (27 сентября 2011 г.) Основа BGI: Хуаньминь Ян Bio-IT World, последнее обращение 14 января 2014 г.
  8. ^ а б ДНК дракона, 17 июня 2010 г., The Economist
  9. ^ О BGI, BGI
  10. ^ Е, Цзя (2008) Интервью с лидером в области геномики - Пекинский институт геномики Asia Biotech, последнее посещение - 14 января 2013 г.
  11. ^ «Новое поколение службы высокопроизводительного секвенирования BGI получило сертификат ISO9001». 23 марта 2010 г.. Получено 14 января 2014.
  12. ^ «BGI получит 1,5 миллиарда долларов в виде« совместных фондов »в течение 10 лет от Китайского банка развития | Последовательность | Секвенирование | GenomeWeb». Получено 29 марта 2010.
  13. ^ а б Fox, J .; Клинг, Дж. (2010). «Китайский институт делает смелую постановку последовательности». Природа Биотехнологии. 28 (3): 189–191. Дои:10.1038 / nbt0310-189c. ЧВК  7097335. PMID  20212469. S2CID  205266392.
  14. ^ а б Пецко, Г. А. (2010). «Восхождение на восток». Геномная биология. 11 (1): 102. Дои:10.1186 / gb-2010-11-1-102. ЧВК  2847708. PMID  20156314. S2CID  7008023.
  15. ^ "BGI Americas". BGI. Получено 3 декабря 2018.
  16. ^ "BGI Europe & Africa". BGI. Получено 3 декабря 2018.
  17. ^ "BGI Asia Pacific". BGI. Получено 3 декабря 2018.
  18. ^ «Офисы и лаборатории». BGI. Получено 3 декабря 2018.
  19. ^ а б Спектр, Майкл (6 января 2014 г.) Генная фабрика The New Yorker, последнее посещение - 28 октября 2014 г.
  20. ^ а б Ван Луяо; Хан Вэй (19 июля 2018 г.). «Genome Giant ищет 1 миллиард долларов на оборудование для потенциального IPO». Caixin. Получено 3 декабря 2018.
  21. ^ «Большой и связанный в научном издательстве запуск журнала по большим данным GigaScience». EurekAlert!. Получено 2019-06-17.
  22. ^ Поллак, Эндрю (30.11.2011). «Секвенирование ДНК поймано в потоке данных». Нью-Йорк Таймс. ISSN  0362-4331. Получено 2019-06-17.
  23. ^ Фармацевтические и биотехнологические услуги Введение, BGI
  24. ^ BGI - Промышленность, BGI
  25. ^ Дэвид Сираноски (6 января 2016 г.). «Китай широко использует точную медицину». Природа. Получено 2 декабря 2018.
  26. ^ Ребекка Роббинс; Кейт Шеридан (26 октября 2018). «Китайская компания представляет новый мощный секвенсор. Но сможет ли он конкурировать в США?». Стат. Получено 3 декабря 2018.
  27. ^ «Китайская геномная компания BGI дебютирует на фондовом рынке». China Daily. 14 июля 2017 г.. Получено 2 декабря 2018.
  28. ^ а б c d Li, R .; Fan, W .; Tian, ​​G .; Zhu, H .; Он, Л .; Cai, J .; Huang, Q .; Cai, Q .; Li, B .; Bai, Y .; Zhang, Z .; Zhang, Y .; Wang, W .; Li, J .; Wei, F .; Li, H .; Jian, M .; Li, J .; Zhang, Z .; Nielsen, R .; Li, D .; Gu, W .; Ян, З .; Xuan, Z .; Райдер, О. А .; Leung, F. C. C .; Zhou, Y .; Cao, J .; Солнце, X .; и другие. (2009). «Последовательность и сборка de novo генома гигантской панды». Природа. 463 (7279): 311–317. Bibcode:2010Натура.463..311L. Дои:10.1038 / природа08696. ЧВК  3951497. PMID  20010809. S2CID  4317858.
  29. ^ а б Li, R .; Zhu, H .; Ruan, J .; Qian, W .; Fang, X .; Ши, З .; Li, Y .; Li, S .; Shan, G .; Kristiansen, K .; Li, S .; Ян, H .; Wang, J .; Ван, Дж. (2009). «Сборка de novo геномов человека с массовым параллельным секвенированием короткого чтения». Геномные исследования. 20 (2): 265–272. Дои:10.1101 / гр.097261.109. ЧВК  2813482. PMID  20019144.
  30. ^ а б Rasmussen, M .; Li, Y .; Lindgreen, S .; Pedersen, J. S .; Альбрехтсен, А .; Мольтке, I .; Мецпалу, М .; Мецпалу, Э .; Кивисилд, Т .; Gupta, R .; Берталан, М .; Nielsen, K .; Gilbert, M. T. P .; Wang, Y .; Рагхаван, М .; Кампос, П. Ф .; Kamp, H.M .; Wilson, A. S .; Gledhill, A .; Tridico, S .; Bunce, M .; Lorenzen, E.D .; Binladen, J .; Guo, X .; Zhao, J .; Чжан, X .; Zhang, H .; Ли, З .; Chen, M .; Орландо, Л. (2010). «Древняя последовательность генома человека вымершего палео-эскимоса». Природа. 463 (7282): 757–762. Bibcode:2010Натура.463..757R. Дои:10.1038 / природа08835. ЧВК  3951495. PMID  20148029. S2CID  4423505.
  31. ^ а б Wang, J .; Wang, W .; Li, R .; Li, Y .; Tian, ​​G .; Goodman, L .; Fan, W .; Zhang, J .; Li, J .; Zhang, J .; Guo, Y .; Feng, B .; Li, H .; Lu, Y .; Fang, X .; Liang, H .; Ду, З .; Li, D .; Zhao, Y .; Hu, Y .; Ян, З .; Zheng, H .; Hellmann, I .; Inouye, M .; Pool, J .; Yi, X .; Zhao, J .; Duan, J .; Zhou, Y .; Цинь, Дж. (2008). «Диплоидная последовательность генома азиатского человека». Природа. 456 (7218): 60–65. Bibcode:2008 Натур 456 ... 60 Вт. Дои:10.1038 / природа07484. ЧВК  2716080. PMID  18987735. S2CID  4397887.
  32. ^ Li, R .; Li, Y .; Zheng, H .; Luo, R .; Zhu, H .; Li, Q .; Qian, W .; Ren, Y .; Tian, ​​G .; Li, J .; Чжоу, G .; Чжу, X .; Wu, H .; Qin, J .; Джин, X .; Li, D .; Cao, H .; Ху, X .; Blanche, H. L. N .; Cann, H .; Чжан, X .; Li, S .; Bolund, L .; Kristiansen, K .; Ян, H .; Wang, J .; Ван, Дж. (2009). «Построение карты последовательностей пангенома человека». Природа Биотехнологии. 28 (1): 57–63. Дои:10.1038 / nbt.1596. PMID  19997067. S2CID  205274447.
  33. ^ а б «Чтобы начать создание« пангенома человека », BGI De Novo собирает два генома на основе данных Illumina | Последовательность | Секвенирование | GenomeWeb». Получено 29 марта 2010.
  34. ^ а б c d Аарон Саенс (11 ноября 2010 г.). "BGI - Китайский центр геномики приложил руку ко всему". Singularity Hub. Университет сингулярности. Получено 2 декабря 2018.
  35. ^ Qin, J .; Li, R .; Raes, J .; Arumugam, M .; Burgdorf, K. S .; Manichanh, C .; Nielsen, T .; Pons, N .; Levenez, F .; Yamada, T .; Mende, D. R .; Li, J .; Xu, J .; Li, S .; Li, D .; Cao, J .; Ван, Б .; Liang, H .; Zheng, H .; Xie, Y .; Tap, J .; Lepage, P .; Берталан, М .; Batto, J.M .; Hansen, T .; Le Paslier, D .; Linneberg, A .; Nielsen, H. B. R .; Pelletier, E .; Рено, П. (2010). «Каталог микробных генов кишечника человека, созданный с помощью метагеномного секвенирования». Природа. 464 (7285): 59–65. Bibcode:2010Натура 464 ... 59.. Дои:10.1038 / природа08821. ЧВК  3779803. PMID  20203603. S2CID  4426541.
  36. ^ "Международная группа по каталогам микробных генов в кишечнике человека | Ежедневные новости GenomeWeb | Секвенирование | GenomeWeb". В архиве из оригинала 7 марта 2010 г.. Получено 29 марта 2010.
  37. ^ Энзеринк, М. (2003). «ТОРС В КИТАЕ: упущенный шанс Китая». Наука. 301 (5631): 294–296. Дои:10.1126 / science.301.5631.294. PMID  12869735. S2CID  166598822.
  38. ^ Немецкие команды, BGI и Life Technologies выявили смертельный европейский штамм кишечной палочки, 23 марта 2012 г. | Биотехнологический мир
  39. ^ а б Xia, Q .; Guo, Y .; Zhang, Z .; Li, D .; Xuan, Z .; Ли, З .; Dai, F .; Li, Y .; Cheng, D .; Li, R .; Cheng, T .; Jiang, T .; Becquet, C .; Сюй, X .; Liu, C .; Zha, X .; Fan, W .; Lin, Y .; Shen, Y .; Jiang, L .; Jensen, J .; Hellmann, I .; Tang, S .; Zhao, P .; Xu, H .; Yu, C .; Zhang, G .; Li, J .; Cao, J .; Лю С. (2009). «Полное ресеквенирование 40 геномов выявляет случаи одомашнивания и гены у шелкопряда (Bombyx)». Наука. 326 (5951): 433–436. Bibcode:2009Научный ... 326..433X. Дои:10.1126 / science.1176620. ЧВК  3951477. PMID  19713493.
  40. ^ Сираноски, Д. (2010). «Китайская бионаука: фабрика последовательностей». Природа. 464 (7285): 22–24. Дои:10.1038 / 464022a. ЧВК  7095434. PMID  20203579. S2CID  205053566.
  41. ^ Huang, S .; Li, R .; Zhang, Z .; Li, L .; Гу, X .; Fan, W .; Лукас, В .; Ван, X .; Се, В .; Ni, P .; Ren, Y .; Zhu, H .; Li, J .; Связь.; Jin, W .; Fei, Z .; Li, G .; Staub, J .; Килиан, А .; Van Der Vossen, E. A. G .; Wu, Y .; Guo, J .; He, J .; Цзя, З .; Ren, Y .; Tian, ​​G .; Lu, Y .; Ruan, J .; Qian, W .; Ван, М. (2009). «Геном огурца Cucumis sativus L». Природа Генетика. 41 (12): 1275–1281. Дои:10,1038 / нг.475. PMID  19881527. S2CID  10711523.
  42. ^ а б "Почести и награды". BGI. Получено 3 декабря 2018.
  43. ^ «Таблицы на 2016 год: Организации - корпоративные (Китай)». Природа. Получено 3 декабря 2018.
  44. ^ «Таблицы на 2016 год: Организации - корпоративные (глобальные)». Природа. Получено 3 декабря 2018.
  45. ^ «Сотрудничество растет, поскольку компании передают исследования в академические круги». Природа. 6 декабря 2017 г.. Получено 3 декабря 2018.
  46. ^ а б c d е ж грамм Чжаочэнь Ван; и другие. (2014). «Следуя шагам гиганта - вопросы управления и биоэтические размышления в Китае». BMC Med Ethics. 15: 79. Дои:10.1186/1472-6939-15-79. ЧВК  4226894. PMID  25361573. S2CID  15568900.
  47. ^ Шукман, Давид (14 января 2014 г.) Клонирование в Китае в "промышленных масштабах" BBC News Science and Environment, последнее обращение 14 января 2014 г.
  48. ^ «Последние новости: BGI представляет два важных глобальных плана на конференции JP Morgan Healthcare». genomics.cn. BGI. 11 января 2018 г.. Получено 2 декабря 2018.
  49. ^ "Китайские ученые расшифровывают геном первого добровольца". Жэньминь жибао в Интернете. 7 января 2008 г.. Получено 29 октября 2014.
  50. ^ а б Цю, Джейн; Хайден, Чек (2008). «Геномика в размерах». Природа. 451 (7176): 234. Bibcode:2008Натура.451..234Q. Дои:10.1038 / 451234a. PMID  18202611. S2CID  5088288.
  51. ^ а б "BGI предлагает услугу секвенирования нового поколения, запускает проект по секвенированию 100 геномов | Последовательность | Секвенирование | GenomeWeb". Genomeweb LLC. 8 января 2008 г.. Получено 29 октября 2014.
  52. ^ (20 ноября 2008 г.) Туанхуанг - первый азиатский диплоидный геном В архиве 2010-01-30 на Wayback Machine Веб-страница BGI Shenzen, последнее посещение - 29 октября 2014 г.
  53. ^ а б «BGI объявляет о новом партнерстве и вехе в честь 8-й годовщины в США». BGI. 4 мая 2018. Получено 3 декабря 2018.
  54. ^ а б Эд Йонг (14 мая 2013 г.). «Китайский проект исследует генетику гения». Природа. 497 (7449): 297–299. Bibcode:2013Натура.497..297л. Дои:10.1038 / 497297a. PMID  23676731.
  55. ^ Джейсон Дорриер (19 марта 2013 г.). "Китайский BGI отследит 2200 гениев в поисках" умных "генов". Singularity Hub. Университет сингулярности. Получено 3 декабря 2018.
  56. ^ Чанг, Кристофер С .; Чоу, Карсон С .; Телье, Лоран САМ; Ваттикути, Шашаанк; Перселл, Шон М .; Ли, Джеймс Дж. (01.12.2015). "PLINK второго поколения: ответ на вызов более крупных и богатых наборов данных". GigaScience. 4 (1): 7. Дои:10.1186 / s13742-015-0047-8. ЧВК  4342193. PMID  25722852.
  57. ^ «Геномное предсказание». genomicprediction.com. Получено 2020-10-25.
  58. ^ Либенс-Мак, Джеймс Х .; Баркер, Майкл С .; Карпентер, Эрик Дж .; Дейхолос, Майкл К .; Gitzendanner, Matthew A .; Грэм, Шон У .; Гроссе, Иво; Ли, Чжэн; Мелконян, Майкл; Мирараб, Сиаваш; Порш, Мартин (октябрь 2019 г.). «Тысяча транскриптомов растений и филогеномика зеленых растений». Природа. 574 (7780): 679–685. Дои:10.1038 / s41586-019-1693-2. ISSN  1476-4687. ЧВК  6872490. PMID  31645766.
  59. ^ «BGI ищет предложения по секвенированию 1000 геномов растений и животных; обещает 100 миллионов долларов на усилия». GenomeWeb. 12 января 2010 г.. Получено 3 декабря 2018.
  60. ^ Ченг, Шифэн; Мелконян, Майкл; Смит, Стивен А; Брокингтон, Сэмюэл; Арчибальд, Джон М; Дело, Пьер-Марк; Ли, Фэй-Вэй; Мелконян, Барбара; Мавродиев, Евгений В; Солнце, Венцзин; Фу, Юань (20.02.2018). «10KP: план секвенирования филодиверсионного генома». GigaScience. 7 (3): 1–9. Дои:10.1093 / gigascience / giy013. ISSN  2047-217X. ЧВК  5869286. PMID  29618049.
  61. ^ «Запуск геномных проектов для трех животных, обитающих в экстремальных условиях». 26 апреля 2009 г.. Получено 22 мая 2015.
  62. ^ Ге, Ри-Ли; Цай, Цингл; Шен, Юн-И; Сан, А .; Ма, Лан; Чжан, Юн; Йи, Синь; Чен, Ян; Ян, Линфэн; Хуанг, Инь; Он, Ронгджун (14.05.2013). «Проект последовательности генома тибетской антилопы». Nature Communications. 4 (1): 1858. Дои:10.1038 / ncomms2860. ISSN  2041-1723. ЧВК  3674232. PMID  23673643.
  63. ^ Лю, судоходство; Lorenzen, Eline D .; Фумагалли, Маттео; Ли, Бо; Харрис, Келли; Сюн, Цзыцзюнь; Чжоу, Лонг; Корнелиуссен, Торфинн Санд; Сомель, Мехмет; Бэббит, Кортни; Рэй, Грег (2014-05-08). «Популяционная геномика выявляет недавнее видообразование и быструю эволюционную адаптацию белых медведей». Клетка. 157 (4): 785–794. Дои:10.1016 / j.cell.2014.03.054. ISSN  0092-8674. ЧВК  4089990. PMID  24813606.
  64. ^ Ли, Цай; Чжан, Юн; Ли, Цзяньвэнь; Конг, Лешэн; Ху, Хаофу; Пан, Хайлин; Сюй, Луохао; Дэн, юань; Ли, Ци Ё; Цзинь, Лицзюнь; Ю, Хао (декабрь 2014 г.). «Два генома антарктических пингвинов позволяют лучше понять их эволюционную историю и молекулярные изменения, связанные с окружающей средой Антарктики». GigaScience. 3 (1): 27. Дои:10.1186 / 2047-217x-3-27. ISSN  2047-217X. ЧВК  4322438. PMID  25671092.
  65. ^ "BGI для секвенирования видов тигров, львов и леопардов в этом году | Последовательность | Секвенирование | GenomeWeb". В архиве из оригинала 28 февраля 2010 г.. Получено 29 марта 2010.
  66. ^ «БГИ». Архивировано из оригинал 17 февраля 2010 г.. Получено 29 марта 2010.
  67. ^ Чо, Ю. С .; Hu, L .; Hou, H .; Lee, H .; Xu, J .; Kwon, S .; Ой, S .; Kim, H.M .; Jho, S .; Kim, S .; Шин, Ю. А .; Kim, B.C .; Kim, H .; Kim, C.U .; Luo, S.J .; Johnson, W. E .; Koepfli, K. P .; Schmidt-Küntzel, A .; Тернер, Дж. А .; Маркер, л .; Harper, C .; Miller, S.M .; Jacobs, W .; Bertola, L.D .; Kim, T. H .; Lee, S .; Чжоу, Q .; Jung, H.J .; Сюй, X .; и другие. (2013). «Геном тигра и сравнительный анализ с геномами льва и снежного барса». Nature Communications. 4: 2433. Bibcode:2013 НатКо ... 4.24 33C. Дои:10.1038 / ncomms3433. HDL:2263/32583. ЧВК  3778509. PMID  24045858.
  68. ^ «БГИ». Архивировано из оригинал 21 августа 2010 г.. Получено 29 марта 2010.
  69. ^ Черновой вариант сборки генома морского слизня Elysia chlorotica, работающего на солнечной энергии. Научные данные 6, 190022 (2019). DOI: 10.1038 / sdata.2019.22 в научных отчетах в 2019 году
  70. ^ "План генома 10000 микробов Начинается в Шэньчжэне ». Китайская академия наук. 5 августа 2009 г. Архивировано с оригинал 25 сентября 2010 г.. Получено 2 декабря 2018.
  71. ^ "BGI использует новый алгоритм кратковременного считывания для сборки генома панды в качестве доказательства концепции человеческого генома | Биоинформ | Информатика | GenomeWeb". Получено 28 марта 2010.
  72. ^ а б «BGI переоборудовала технологию Complete Genomics для своего нового высокопроизводительного настольного секвенсора». Bio-ITWorld. Кембриджский институт Healthtech. 28 октября 2015 г.. Получено 2 декабря 2018.
  73. ^ а б c «BGI запускает новый настольный секвенсор в Китае, регистрирует более крупную версию в CFDA». 360Dx. GenomeWeb. 11 ноября 2016 г.. Получено 2 декабря 2018.
  74. ^ Юлия Каров (26 октября 2015). «BGI запускает настольный секвенсор в Китае; планирует зарегистрировать платформу в CFDA». GenomeWeb. Получено 2 декабря 2018.
  75. ^ Моника Хегер (21 сентября 2016 г.). «Китайский национальный генетический банк открывается за счет инвестиций от BGI, правительства». GenomeWeb. Получено 2 декабря 2018.
  76. ^ Моника Хегер (26 октября 2018 г.). «BGI запускает новый секвенсор, поскольку клиенты сообщают данные с более ранних инструментов». GenomeWeb. Получено 2 декабря 2018.
  77. ^ «MGI Tech от BGI запускает две новые платформы NGS». PR Newswire. 31 октября 2017 г.. Получено 3 декабря 2018.
  78. ^ «MGI представляет революционный секвенсор со сверхвысокой пропускной способностью, MGISEQ-T7». PR Newswire. 27 октября 2018 г.. Получено 3 декабря 2018.
  79. ^ Моро, Ив (2019-12-03). "Прекратить геномное наблюдение". Природа. 576 (7785): 36–38. Bibcode:2019Натура 576 ... 36 млн. Дои:10.1038 / d41586-019-03687-х. PMID  31796907. S2CID  208621060.
  80. ^ «BGI официально входит в зону высоких технологий Урумчи». www.uhdz.gov.cn (на китайском языке). 2016-07-27. В архиве из оригинала на 2019-12-07. Получено 2019-12-07.
  81. ^ Сираноски, Дэвид (25 мая 2017 г.). «Китай расширяет сбор данных о ДНК в проблемном западном регионе». Природа. 545 (7655): 395–396. Bibcode:2017Натура.545..395C. Дои:10.1038 / 545395a. ISSN  0028-0836. PMID  28541335.
  82. ^ Ви, Суи-Ли; Мозур, Пол (2019-12-03). «Китай использует ДНК для картирования лиц с помощью Запада». Нью-Йорк Таймс. ISSN  0362-4331. Получено 2020-02-15.
  83. ^ Аллен-Эбрагимиан, Бетани; Дорфман, Зак (3 июня 2020 г.). «Китайский производитель тестов на коронавирус согласился создать генобанк Синьцзяна». Axios. В архиве с оригинала 3 июня 2020 г.. Получено 3 июня, 2020.
  84. ^ Аллен-Эбрагимиан, Бетани (20 июля 2020 г.). «Дочерняя компания китайского биотехнологического гиганта в США возвращает кредит ГЧП после истории Axios». Axios. Получено 20 июля, 2020.
  85. ^ Басу, Захари (20 июля 2020 г.). «США занесли в черный список китайские компании, связанные с проектом генного банка Синьцзян». Axios. Получено 20 июля, 2020.
  86. ^ «Министерство торговли добавляет одиннадцать китайских организаций, причастных к нарушениям прав человека в Синьцзяне, в список организаций». Министерство торговли США. 2020-07-20. Получено 2020-07-20.
  87. ^ Мир, Республика. «Китайская генетическая компания BGI отрицает нарушения прав человека уйгуров». Республика мир. Получено 2020-11-01.
  88. ^ Джонсон, Саймон. «Тысячи шведов получили ложноположительный результат на COVID-19 из-за неисправности тестового набора». Рейтер. В архиве с оригинала 27 августа 2020 г.. Получено 27 августа 2020.
  89. ^ Всемирная организация здравоохранения. «Перечень использования ВОЗ в чрезвычайных ситуациях для диагностики in vitro (IVD) при обнаружении SARS-CoV-2» (PDF).
  90. ^ «Китайский тестовый набор на Covid-19 превосходит альтернативы в голландском исследовании». Южно-Китайская утренняя почта. 2020-05-20. Получено 2020-11-01.
  91. ^ Персонал, Reuters (26 августа 2020 г.). «Китайская компания BGI защищает набор для тестирования COVID-19 после критики со стороны Швеции». Рейтер. Получено 2020-11-01.
  92. ^ Нидхэм, Кирсти (14 мая 2020 г.). «Китайский BGI закрепился в Австралии благодаря массовым тестам на коронавирус». Рейтер. Получено 3 июня, 2020.
  93. ^ «Illumina близка к победе в тендере на блокирование продаж продуктов ДНК BGI». Закон360. 11 мая 2020. Получено 3 июня, 2020.

внешняя ссылка