Биологический образец - Biological specimen

Биологические образцы от студии Exploration Architecture
Смотрите также: зоологический образец

А биологический образец (также называемый биопробы) это биологический лабораторный образец проводится биорепозиторий для исследования. Такой образец взяли бы отбор проб так, чтобы быть репрезентативным для любого другого образца, взятого из источника образца. Когда биологические образцы хранятся, в идеале они должны оставаться эквивалентными недавно собранным образцам для целей исследования.

Биологические образцы человека хранятся в биохранилище, называемом биобанк, а наука о сохранении биологических образцов наиболее активна в области биобанков.

Контроль качества

Изначально установление широких стандартов качества биологических образцов было недостаточно развитым аспектом роста биобанков.[1] В настоящее время обсуждается, какие стандарты должны быть в наличии и кто должен управлять этими стандартами. Поскольку многие организации устанавливают свои собственные стандарты и поскольку биобанки обязательно используются несколькими организациями и, как правило, стремятся к расширению, гармонизация стандартные рабочие процедуры для лабораторных практик имеют высокий приоритет.[1] Процедуры должны быть основаны на фактических данных и будут меняться со временем по мере появления новых исследований и технологий.[1]

Политики

Некоторый прогресс в создании директивных организаций включает Национальный институт рака создание в 2005 г. Управления биобанков и исследований биологических образцов (OBBR)[1] и ежегодные симпозиумы сети по исследованию биологических образцов.[2] В Международное общество биологических и экологических хранилищ, Международное агентство по изучению рака, Организация экономического сотрудничества и развития, и Австралазийская сеть биологических образцов также предложили политику и стандарты.[1] В 2008 AFNOR Французская организация по стандартизации опубликовала первый стандарт качества для биобанков.[1] Аспекты ISO 9000 были применены к биобанкам.[1]

Цели качества

Критерии качества образцов зависят от рассматриваемого исследования, и универсального стандартного типа образца не существует.[1] Целостность ДНК - важный фактор для исследований, включающих амплификацию всего генома.[3] Целостность РНК имеет решающее значение для некоторых исследований и может быть оценена гель-электрофорез.[4] Кроме того, биобанки, в которых хранятся образцы, не могут нести полную ответственность за их целостность, потому что до того, как они взяли образцы на хранение, кто-то должен их собрать и обработать, а такие эффекты, как деградация РНК, более вероятны из-за отсроченной обработки образцов, чем из-за ненадлежащего хранения.[5]

Образцы хранятся

В биорепозиториях хранятся разные образцы.[нужна цитата ] Разные экземпляры полезны для разных целей.[нужна цитата ]

Образцы биобанка
образециспользуеттехника извлеченияместо храненияхарактеристики
щека тканьДНК-профилированиебуккальный мазокучастники могут собраться сами; можно забрать по почте; настолько легко собрать, что информированное согласие может быть недостаточно рассмотрено
цельная кровьвенепункциятребует флеботомист собирать
Засохшее пятно кровидает высокое качество ДНК и РНКПалецлегко хранится годами при комнатной температуре
орган тканьдает высокое качество ДНК, РНК, Митохондриальная ДНК, и источник болезниБиопсиямного общего с кровью; также подходит для протеомный анализ; может быть трудно получить
Плазмаограниченное содержание ДНК и РНКФракционирование плазмы кровитребует флеботомист собирать
Мочамаркер для некоторых диагностических тестовМочеиспусканиенеинвазивный
Калмаркер для некоторых диагностических тестовОбразец стуланеинвазивный
КожаВ основном используется группами судебных экспертов, расследующих уголовные дела.по уголовным делам, собранным без согласия дарителя
ВолосыВ основном используется группами судебных экспертов, расследующих уголовные дела.Анализ волоспо уголовным делам, собранным без согласия дарителя

Методы хранения

Многие образцы в биобанках криоконсервированный.[нужна цитата ] Остальные экземпляры хранят другими способами.[6]

Техники, связанные с биобанками

Некоторые из лабораторных методов, связанных с хранением биологических образцов, включают: фенол-хлороформная экстракция, ПЦР, и RFLP.[нужна цитата ]

Рекомендации

  1. ^ а б c d е ж грамм час Хьюитт, Р. Э. (2011). «Биобанкинг: основа персонализированной медицины». Текущее мнение в области онкологии. 23 (1): 112–119. Дои:10.1097 / CCO.0b013e32834161b8. PMID  21076300.
  2. ^ Moore, H.M .; Compton, C.C .; Lim, M.D .; Vaught, J .; Кристиансен, К. Н .; Альпер, Дж. (2009). "Симпозиум сети по исследованию биопрепаратов 2009 г .: Развитие исследований рака с помощью науки о биологических образцах". Исследования рака. 69 (17): 6770–6772. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-09-1795. ЧВК  2782665. PMID  19706749.
  3. ^ Yuille, M .; Illig, T .; Hveem, K .; Schmitz, G .; Hansen, J .; Neumaier, M .; Tybring, G .; Wichmann, E .; Оллер, Б. (2010). «Лабораторное управление образцами в биобанках: отчет Европейской консенсусной группы экспертов». Биоконсервация и биобанкинг. 8 (1): 65–9. Дои:10.1089 / биография.2010.8102. PMID  24836342.
  4. ^ Guerin, J. S .; Мюррей, Д. У .; McGrath, M. M .; Yuille, M. A .; McPartlin, J.M .; Доран, П. П. (2010). «Руководство Ирландии по молекулярной медицине по стандартизированному биобанкингу». Биоконсервация и биобанкинг. 8 (1): 3–63. Дои:10.1089 / биография.2010.8101. PMID  24836341.
  5. ^ Barnes, M. G .; Grom, A. A .; Griffin, T. A .; Colbert, R.A .; Томпсон, С. Д. (2010). "Профили экспрессии генов мононуклеарных клеток периферической крови чувствительны к коротким задержкам обработки". Биоконсервация и биобанкинг. 8 (3): 153–162. Дои:10.1089 / биография.2010.0009. ЧВК  3129811. PMID  21743826.
  6. ^ Elliott, P .; Peakman, T. C .; Ук, Б. (2008). «Протокол обработки и хранения образцов биобанка Великобритании для сбора, обработки и архивирования крови и мочи человека». Международный журнал эпидемиологии. 37 (2): 234–244. Дои:10.1093 / ije / dym276. PMID  18381398.

внешняя ссылка