CHKB (ген) - CHKB (gene)

ЧКБ
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3FEG, 2IG7, 3LQ3
Идентификаторы
Псевдонимы	ЧКБ, CHETK, CHKL, CK, CKB, CKEKB, EK, EKB, MDCMC, холинкиназа бета
Внешние идентификаторы	OMIM: 612395 MGI: 1328313 ГомолоГен: 88718 Генные карты: ЧКБ
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 22 (человек)[1] Группа 22q13.33 Начинать 50,578,949 бп[1] Конец 50,601,455 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 15 (мышь)[2] Группа 15 | 15 E3 Начинать 89,426,360 бп[2] Конец 89,429,908 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • трансферазная активность • связывание нуклеотидов • Связывание АТФ • киназная активность • активность холинкиназы • активность этаноламин киназы Сотовый компонент • цитозоль Биологический процесс • процесс биосинтеза фосфатидилхолина • процесс биосинтеза фосфатидилэтаноламина • фосфорилирование • липидный обмен • процесс биосинтеза фосфолипидов • процесс биосинтеза глицерофосфолипидов • ЦДФ-холиновый путь Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	1120	12651
Ансамбль	ENSG00000100288	ENSMUSG00000022617
UniProt	Q9Y259	O55229
RefSeq (мРНК)	NM_152253 NM_005198	NM_007692
RefSeq (белок)	NP_005189	NP_031718
Расположение (UCSC)	Chr 22: 50,58 - 50,6 Мб	Chr 15: 89.43 - 89.43 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Бета холинкиназы (CK), также известный как Этаноламинкиназа (ЭК), Белок, подобный холинкиназе , холин / этаноламинкиназа бета (CKEKB), или же Холин / этаноламин киназа это белок закодировано ЧКБ ген.^[5][6] Этот ген находится на 22-й хромосоме человека. Кодируемый белок играет ключевую роль в фосфолипид биосинтез. Холинкиназа (CK) и этаноламинкиназа (EK) катализируют первую стадию фосфатидилэтаноламин биосинтез. Прочитанные стенограммы выражаются из этого локус которые включают экзоны от нижнего течения CPT1B локус.^[7][8][9]

Структура

В ЧКБ ген находится на q рука из хромосома 22 в положении 13.3 и охватывает 4041 пару оснований.^[7] В ЧКБ ген продуцирует белок массой 7 кДа, состоящий из 60 аминокислоты.^[10][11] Было установлено, что структура белка является гомодимер, и образует гетеродимер с ЧКА белок.^[9][8] Также было обнаружено, что он содержит несколько высококонсервативные домены, например Консенсусная последовательность фосфотрансферазы Бреннера необходимо в каталитическая функция.^[12]

Функция

В ЧКБ ген кодирует ключ белок в фосфолипид биосинтез Белки холинкиназы (CK) и этаноламинкиназы (EK), которые кодируются ЧКБ гена, катализируют фосфорилирование холин / этаноламин in vitro к фосфохолин /фосфоэтаноламин. В катализ контролируется АТФ в присутствии магний и ADP, и совершает холин к ферментативному пути биосинтеза фосфатидилхолин. Это первый шаг в биосинтезе фосфохолин /фосфоэтаноламин во всех клетках животных и осуществляется по пути Кеннеди. Высокоочищенный холинкиназы из источников млекопитающих и их рекомбинантный ген продукты были показаны этаноламинкиназа активности, что указывает на то, что обе активности находятся в одном и том же белке. Однако было показано, что белок имеет более высокую активность в отношении этаноламина и не может вносить значительный вклад в in vivo биосинтез фосфатидилхолина. Белок, подобный холинкиназе, кодируемый CHKB, принадлежит к группе семейство холин / этаноламин киназ; однако его точная функция неизвестна. По меньшей мере, два варианты расшифровки кодирование двух разных изоформы были обнаружены для этого гена, и один из стенограммы бицистронный.^{[7][8][9][13][14]}

Клиническое значение

Мутации в ЧКБ было обнаружено, что это приводит к митохондриальной недостаточности и связанным с ней нарушениям. Известно, что нокдаун гена приводит к снижению холинкиназа и фосфатидилхолин Мероприятия. Это нарушение активности может привести к изменению состава фосфолипидной композиции в митохондриальная мембрана приводящие к серьезным нарушениям функции и структура из митохондрии. Основные расстройства включают в себя мегакониальную врожденную мышечную дистрофию (MDCMC) и Нарколепсия.^[7][15]

Мегакониальная врожденная мышечная дистрофия (MDCMC)

ЧКБ мутации в основном связаны с мегакониальной врожденной мышечной дистрофией (MDCMC). Мегакониальная врожденная мышечная дистрофия (MDCMC) - это аутосомный рецессивный врожденный мышечная дистрофия был характеризован биопсия мышц результаты отображаются в увеличенном виде митохондрии которые обычны на периферии волокон, но редко встречаются вокруг центра.^[16]

Общие клинические проявления MDCMC включают:^[15][17]

• раннее начало гипотония
• атрофия мышц
• слегка приподнятый сыворотка креатинкиназа (CK) уровни
• суровый Интеллектуальная недееспособность без структурных аномалий головного мозга
• Признак Гауэра
• умственная отсталость
• фатальный кардиомиопатия

Такие симптомы, как нейрогенный атрофия, увеличенный митохондрии на периферии волокон, и комплекс I дефицит был показан у испанского пациента с гомозиготный мутация из c.810T> A.^[15] Другой пациент с гомозиготной мутацией (p.E292X) в ЧКБ ген проявлял ритмичные подергивания руками, которые характеризовались как мышечные спазмы.^[14] Наконец, у пациента с гомозиготным c.810T> A были обнаружены признаки Признак Гауэра, гипотония, и проксимальный мышечная слабость.^[18]

Нарколепсия

Нарколепсия это неврологический инвалид расстройство сна, характеризующийся чрезмерным дневным сонливость, фрагментация сна, симптомы аномального быстрое движение глаз (REM) сон, катаплексия, гипнагогические галлюцинации, и сонный паралич. Катаплексия - это внезапная потеря мышечный тонус вызвано эмоциями, что является наиболее ценным клиническим признаком, используемым для диагностики нарколепсии. Нарколепсия человека - это в первую очередь спорадически возникающее заболевание, но наблюдалась семейная кластеризация.^[19]

Взаимодействия

CHKB показал, что Белковые взаимодействия со следующим.^[20][8]

• ALB
• Альбумин сыворотки человека

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000100288 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000022617 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ямазаки Н., Яманака Ю., Хашимото Ю., Шинохара Ю., Шима А., Терада Х (июнь 1997 г.). «Структурные особенности гена, кодирующего карнитин пальмитоилтрансферазу I мышечного типа человека». FEBS Lett. 409 (3): 401–6. Дои:10.1016 / S0014-5793 (97) 00561-9. PMID  9224698.
6. Аояма К., Ляо Х., Ишидатэ К. (май 2004 г.). «Структура и функция изоформ холинкиназы в клетках млекопитающих». Прог. Липидный Res. 43 (3): 266–81. Дои:10.1016 / j.plipres.2003.12.001. PMID  15003397.
7. «Ген Entrez: бета холинкиназы CHKB». Эта статья включает текст из этого источника, который находится в всеобщее достояние.
8. «CHKB - холин / этаноламинкиназа - Homo sapiens (человек) - ген и белок CHKB». Получено 2018-08-23. Эта статья включает текст доступно под CC BY 4.0 лицензия.
9. «UniProt: универсальная база знаний о белках». Исследования нуклеиновых кислот. 45 (D1): D158 – D169. Январь 2017 г. Дои:10.1093 / нар / gkw1099. ЧВК  5210571. PMID  27899622.
10. Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Дуан Х., Улен М., Йетс Дж. Р., Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии кардиального протеома и медицины посредством специализированной базы знаний». Циркуляционные исследования. 113 (9): 1043–53. Дои:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. ЧВК  4076475. PMID  23965338.
11. «Белок CHKB-CPT1B». Атлас кардиоорганических белков (COPaKB). Архивировано из оригинал на 2018-08-24. Получено 2018-08-23.
12. Аояма К., Ямадзаки Н., Терада Х, Ишидате К. (2000). «Структура и характеристика генов изоферментов холин / этаноламин киназы мышей альфа и бета». J. Lipid Res. 41 (3): 452–64. PMID  10706593.
13. Ишидатэ К. (1997). «Холин / этаноламинкиназа из тканей млекопитающих». Биохим. Биофиз. Acta. 1348 (1–2): 70–8. Дои:10.1016 / с0005-2760 (97) 00118-5. PMID  9370318.
14. Gutiérrez Ríos, P; Kalra, AA; Wilson, JD; Танджи, К; Акман, Х.о .; Площадь Гомес, E; Schon, EA; ДиМауро, С. (май 2012 г.). «Врожденная мегакониальная миопатия, вызванная новым дефектом гена холинкиназы бета». Архив неврологии. 69 (5): 657–61. Дои:10.1001 / archneurol.2011.2333. PMID  22782513.
15. Кастро-Гаго, М; Дакруз-Альварес, Д; Пинтос-Мартинес, Э; Бейрас-Иглесиас, А; Арены, Дж; Martín, МА; Мартинес-Азорин, Ф (январь 2016 г.). «Врожденная нейрогенная мышечная атрофия при мегакониальной миопатии из-за мутации в гене CHKB». Мозг и развитие. 38 (1): 167–72. Дои:10.1016 / j.braindev.2015.05.008. PMID  26006750.
16. Mitsuhashi, S; Окума, А; Талим, Б; Карахаши, М; Комура, Т; Аояма, C; Курихара, М; Quinlivan, R; Сьюри, C; Mitsuhashi, H; Гото, К; Коксал, Б; Кале, G; Икеда, К; Taguchi, R; Ногучи, S; Hayashi, YK; Нонака, I; Шер, РБ; Сугимото, H; Накагава, Y; Кокс, Джорджия; Топалоглу, H; Нишино, I (10 июня 2011 г.). «Врожденная мышечная дистрофия со структурными аномалиями митохондрий, вызванная нарушением биосинтеза фосфатидилхолина de novo». Американский журнал генетики человека. 88 (6): 845–851. Дои:10.1016 / j.ajhg.2011.05.010. ЧВК  3113344. PMID  21665002.
17. «Информационный центр по генетическим и редким заболеваниям (GARD) - врожденная мышечная дистрофия, мегакониальный тип - программа NCATS». Rarediseases.info.nih.gov.
18. Нишино, I; Кобаяши, О; Гото, Y; Курихара, М; Кумагай, К; Fujita, T; Хашимото, К; Horai, S; Нонака, I (январь 1998 г.). «Новая врожденная мышечная дистрофия с нарушениями структуры митохондрий». Мышцы и нервы. 21 (1): 40–7. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-4598 (199801) 21: 1 <40 :: AID-MUS6> 3.0.CO; 2-G. PMID  9427222.
19. «Нарколепсия 7». www.uniprot.org.
20. Mick DU, Dennerlein S, Wiese H, Reinhold R, Pacheu-Grau D, Lorenzi I, Sasarman F, Weraarpachai W., Shoubridge EA, Warscheid B, Rehling P (декабрь 2012 г.). «MITRAC связывает транслокацию митохондриальных белков со сборкой дыхательной цепи и регуляцией трансляции». Клетка. 151 (7): 1528–41. Дои:10.1016 / j.cell.2012.11.053. PMID  23260140.

внешняя ссылка

• Человек ЧКБ расположение генома и ЧКБ страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.
• Человек CKB расположение генома и CKB страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Аояма С., Ляо Х, Ишидатэ К. (2004). «Структура и функция изоформ холинкиназы в клетках млекопитающих». Прог. Липидный Res. 43 (3): 266–81. Дои:10.1016 / j.plipres.2003.12.001. PMID  15003397.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Коллинз Дж. Э., Райт К. Л., Эдвардс К. А. и др. (2005). «Основанный на аннотации генома подход к клонированию ORFeome человека». Геном Биол. 5 (10): R84. Дои:10.1186 / gb-2004-5-10-r84. ЧВК  545604. PMID  15461802.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Хиросава М., Нагасе Т., Мурахаши Ю. и др. (2001). «Идентификация новых транскрибируемых последовательностей на хромосоме 22 человека путем картирования меток экспрессии». ДНК Res. 8 (1): 1–9. Дои:10.1093 / dnares / 8.1.1. PMID  11258795.
• Ямадзаки Н., Шинохара Ю., Каджимото К. и др. (2000). «Новое выражение двусмысленных сообщений, содержащих как области холин / этаноламин киназы, так и карнитин пальмитоилтрансферазу I мышечного типа». J. Biol. Chem. 275 (41): 31739–46. Дои:10.1074 / jbc.M006322200. PMID  10918069.
• Лофтус Б.Дж., Ким Ю.Дж., Снеддон В.П. и др. (1999). «Дупликации генома и другие особенности в 12 Mb последовательности ДНК из хромосомы 16p и 16q человека». Геномика. 60 (3): 295–308. Дои:10.1006 / geno.1999.5927. PMID  10493829.
• Аояма К., Накашима К., Мацуи М., Ишидатэ К. (1998). «Комплементарная последовательность ДНК для холин / этаноламинкиназы крысы 42 кДа». Биохим. Биофиз. Acta. 1390 (1): 1–7. Дои:10.1016 / с0005-2760 (97) 00177-х. PMID  9487136.
• Ямазаки Н., Яманака Ю., Хашимото Ю. и др. (1997). «Структурные особенности гена, кодирующего карнитин пальмитоилтрансферазу I мышечного типа человека». FEBS Lett. 409 (3): 401–6. Дои:10.1016 / S0014-5793 (97) 00561-9. PMID  9224698.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.