Конститутивный фотоморфогенный гомолог COP9 субъединица 5 - COP9 constitutive photomorphogenic homolog subunit 5 - Wikipedia

COPS5
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4D10, 4D18, 4F7O, 4WSN
Идентификаторы
Псевдонимы	COPS5, CSN5, JAB1, MOV-34, SGN5, COP9 субъединица 5 конститутивного фотоморфогенного гомолога, субъединица 5 сигнаносомы COP9
Внешние идентификаторы	OMIM: 604850 MGI: 1349415 ГомолоГен: 55992 Генные карты: COPS5
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 8 (человек)[1] Группа 8q13.1 Начинать 67,043,079 бп[1] Конец 67,083,783 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 1 (мышь)[2] Группа 1 A2 | 1 2,29 см Начинать 10,024,601 бп[2] Конец 10,038,168 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность фактора инициации трансляции • GO: 0001105 активность коактиватора транскрипции • связывание ионов металлов • пептидазная активность • GO: 0001948 связывание с белками • тиол-зависимая убиквитин-специфическая протеазная активность • гидролазная активность • металлопептидазная активность • NEDD8-специфическая протеазная активность • связывание ферментов • связывание фактора ингибирования миграции макрофагов • металлоэндопептидазная активность Сотовый компонент • цитоплазма • фактор инициации трансляции эукариот 3 • синаптический пузырек • синапс • нуклеоплазма • соединение клеток • перинуклеарная область цитоплазмы • Сигналосома COP9 • цитоплазматический пузырек • ядро клетки • хроматин • цитозоль Биологический процесс • биосинтез белка • эксцизионная репарация нуклеотидов, распознавание повреждений ДНК • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • протеолиз • регулирование клеточного цикла • деубиквитинирование белков • регулирование каскада JNK • экзосомальная секреция • транскрипционно-связанная эксцизионная репарация нуклеотидов • регуляция IRE1-опосредованного ответа развернутого белка • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • трансляционная инициация • белковое денддилирование • посттрансляционная модификация • отрицательная регуляция апоптотического процесса • положительная регуляция активности специфичного для последовательности ДНК связывающего фактора транскрипции Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	10987	26754
Ансамбль	ENSG00000121022	ENSMUSG00000025917
UniProt	Q92905	O35864
RefSeq (мРНК)	NM_006837	NM_001277101 NM_013715
RefSeq (белок)	NP_006828 NP_006828.2	NP_001264030 NP_038743
Расположение (UCSC)	Chr 8: 67.04 - 67.08 Мб	Chr 1: 10.02 - 10.04 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Субъединица 5 конститутивного фотоморфогенного гомолога COP9 (Arabidopsis), также известный как COPS5 или Csn5, является ген сохранено из люди к Saccharomyces cerevisiae.^[5]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является одной из восьми субъединиц Сигналосома COP9, высококонсервативный белковый комплекс, который функционирует как важный регулятор во множестве сигнальных путей. Сигналосома COP9 по структуре и функциям аналогична 19S-регуляторной частице 26S-протеасомы. Было показано, что сигналосома COP9 взаимодействует с убиквитинлигазами E3 SCF-типа и действует как позитивный регулятор убиквитинлигаз E3. Сообщается, что этот белок участвует в деградации ингибитора циклин-зависимой киназы CDKN1B / p27Kip1. Также известно, что он является коактиватором, повышающим специфичность факторов транскрипции JUN / AP1.^[5]

Взаимодействия

Было показано, что субъединица 5 конститутивного фотоморфогенного гомолога COP9 взаимодействовать с Фактор ингибирования миграции макрофагов,^[6][7] GFER,^[8] BCL3,^[9] Убиквитин карбоксиконцевая гидролаза L1,^[10] S100A7^[11] и C-июн.^[12]

Смотрите также

• COPS1
• COPS2
• COPS3
• COPS4
• COPS6
• COPS7A
• COPS7B
• COPS8

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000121022 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025917 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: субъединица 5 конститутивного фотоморфогенного гомолога COPS5 COP9 (Arabidopsis)».
6. Гош С., Литон Л.А., Фарр Л., Барфилд А., Муна С. (июль 2018 г.). «Взаимодействие между кодируемым паразитом JAB1 / CSN5 и белками фактора ингибирования миграции макрофагов ослабляет его провоспалительную функцию». Научные отчеты. 8 (1): 10241. Дои:10.1038 / s41598-018-28625-1. ЧВК  6035221. PMID  29980718.
7. Климанн Р., Хауссер А., Гейгер Г., Мишке Р., Бургер-Кентишер А., Флигер О. и др. (Ноябрь 2000 г.). «Внутриклеточное действие цитокина MIF для модуляции активности AP-1 и клеточного цикла через Jab1». Природа. 408 (6809): 211–6. Дои:10.1038/35041591. PMID  11089976. S2CID  205010648.
8. Лу Ц, Ли И, Чжао И, Син Г, Тан Ф, Ван Ц и др. (Январь 2002 г.). «Внутрикринный гепатопоэтин усиливает активность AP-1 через JAB1 независимо от пути MAPK». Журнал FASEB. 16 (1): 90–2. Дои:10.1096 / fj.01-0506fje. PMID  11709497. S2CID  7006611.
9. Деченд Р., Хирано Ф., Леманн К., Хейссмайер В., Анси С., Вульчин Ф. Г. и др. (Июнь 1999 г.). «Онкопротеин Bcl-3 действует как связующий фактор между NF-kappaB / Rel и ядерными ко-регуляторами». Онкоген. 18 (22): 3316–23. Дои:10.1038 / sj.onc.1202717. PMID  10362352.
10. Кабальеро О.Л., Ресто В., Паттураджан М., Меерзаман Д., Гуо М.З., Энглс Дж. И др. (Май 2002 г.). «Взаимодействие и совместная локализация PGP9.5 с JAB1 и p27 (Kip1)». Онкоген. 21 (19): 3003–10. Дои:10.1038 / sj.onc.1205390. PMID  12082530.
11. Эмберли Э.Д., Ню Ю., Лейгу Э., Томес Л., Гитц Р.Д., Мерфи Л.С., Уотсон PH (апрель 2003 г.). «Псориазин взаимодействует с Jab1 и влияет на прогрессирование рака груди». Исследования рака. 63 (8): 1954–61. PMID  12702588.
12. Claret FX, Hibi M, Dhut S, Toda T, Karin M (октябрь 1996 г.). «Новая группа консервативных коактиваторов, повышающих специфичность факторов транскрипции AP-1». Природа. 383 (6599): 453–7. Дои:10.1038 / 383453a0. PMID  8837781. S2CID  4353893.

внешняя ссылка

• Человек COPS5 расположение генома и COPS5 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Вольф Д.А., Чжоу С., Ви С. (декабрь 2003 г.). «Сигналосома COP9: платформа для сборки и обслуживания лигаз убиквитина cullin?». Природа клеточной биологии. 5 (12): 1029–33. Дои:10.1038 / ncb1203-1029. PMID  14647295. S2CID  37458780.
• Claret FX, Hibi M, Dhut S, Toda T, Karin M (октябрь 1996 г.). «Новая группа консервативных коактиваторов, повышающих специфичность факторов транскрипции AP-1». Природа. 383 (6599): 453–7. Дои:10.1038 / 383453a0. PMID  8837781. S2CID  4353893.
• Asano K, Vornlocher HP, Richter-Cook NJ, Merrick WC, Hinnebusch AG, Hershey JW (октябрь 1997 г.). «Структура кДНК, кодирующих субъединицы фактора 3 инициации эукариот человека. Возможные роли в связывании РНК и сборке макромолекул». Журнал биологической химии. 272 (43): 27042–52. Дои:10.1074 / jbc.272.43.27042. PMID  9341143.
• Сигер М., Крафт Р., Феррелл К., Беч-Отсшир Д., Дамди Р., Шаде Р. и др. (Апрель 1998 г.). «Новый белковый комплекс, участвующий в передаче сигнала, обладающий сходством с 26S протеасомными субъединицами». Журнал FASEB. 12 (6): 469–78. Дои:10.1096 / fasebj.12.6.469. PMID  9535219. S2CID  25424324.
• Вэй Н, Цуге Т., Серино Дж., Дохмае Н., Такио К., Мацуи М., Дэн XW (1998). «Комплекс COP9 сохраняется у растений и млекопитающих и связан с регуляторным комплексом протеасомы 26S». Текущая биология. 8 (16): 919–22. Дои:10.1016 / S0960-9822 (07) 00372-7. PMID  9707402. S2CID  13873982.
• Томода К., Кубота Ю., Като Дж. (Март 1999 г.). «Разложение ингибитора циклин-зависимой киназы p27Kip1 инициируется Jab1». Природа. 398 (6723): 160–5. Дои:10.1038/18230. PMID  10086358. S2CID  204991745.
• Деченд Р., Хирано Ф., Леманн К., Хейссмайер В., Анси С., Вульчин Ф. Г. и др. (Июнь 1999 г.). «Онкопротеин Bcl-3 действует как связующий фактор между NF-kappaB / Rel и ядерными ко-регуляторами». Онкоген. 18 (22): 3316–23. Дои:10.1038 / sj.onc.1202717. PMID  10362352.
• Chauchereau A, Georgiakaki M, Perrin-Wolff M, Milgrom E, Loosfelt H (март 2000 г.). «JAB1 взаимодействует как с рецептором прогестерона, так и с SRC-1». Журнал биологической химии. 275 (12): 8540–8. Дои:10.1074 / jbc.275.12.8540. PMID  10722692.
• Bianchi E, Denti S, Granata A, Bossi G, Geginat J, Villa A и др. (Апрель 2000 г.). «Интегрин LFA-1 взаимодействует с коактиватором транскрипции JAB1, чтобы модулировать активность AP-1». Природа. 404 (6778): 617–21. Дои:10.1038/35007098. PMID  10766246. S2CID  4384395.
• Климанн Р., Хауссер А., Гейгер Г., Мишке Р., Бургер-Кентишер А., Флигер О. и др. (Ноябрь 2000 г.). «Внутриклеточное действие цитокина MIF для модуляции активности AP-1 и клеточного цикла через Jab1». Природа. 408 (6809): 211–6. Дои:10.1038/35041591. PMID  11089976. S2CID  205010648.
• Бех-Отшир Д., Крафт Р., Хуанг Х, Хенкляйн П., Капелари Б., Поллманн С., Дубиль В. (апрель 2001 г.). «Фосфорилирование, специфичное для сигнаносомы COP9, направлено на деградацию p53 под действием убиквитиновой системы». Журнал EMBO. 20 (7): 1630–9. Дои:10.1093 / emboj / 20.7.1630. ЧВК  145508. PMID  11285227.
• Ляпина С., Коуп Г., Шевченко А., Серино Г., Цуге Т., Чжоу С. и др. (Май 2001 г.). «Содействие расщеплению конъюгата NEDD-CUL1 сигнаносомой COP9». Наука. 292 (5520): 1382–5. Дои:10.1126 / science.1059780. PMID  11337588. S2CID  14224920.
• Томода К., Кубота Ю., Арата Ю., Мори С., Маэда М., Танака Т. и др. (Январь 2002 г.). «Цитоплазматическое перемещение и последующая деградация p27Kip1, опосредованная Jab1 / CSN5 и сигнальным комплексом COP9». Журнал биологической химии. 277 (3): 2302–10. Дои:10.1074 / jbc.M104431200. PMID  11704659.
• Bae MK, Ahn MY, Jeong JW, Bae MH, Lee YM, Bae SK и др. (Январь 2002 г.). «Jab1 напрямую взаимодействует с HIF-1альфа и регулирует его стабильность». Журнал биологической химии. 277 (1): 9–12. Дои:10.1074 / jbc.C100442200. PMID  11707426.
• Лу Ц, Ли И, Чжао И, Син Г, Тан Ф, Ван Ц и др. (Январь 2002 г.). «Внутрикринный гепатопоэтин усиливает активность AP-1 через JAB1 независимо от пути MAPK». Журнал FASEB. 16 (1): 90–2. Дои:10.1096 / fj.01-0506fje. PMID  11709497. S2CID  7006611.
• Dai YS, Cserjesi P (апрель 2002 г.). «Основной фактор спираль-петля-спираль, HAND2, функционирует как активатор транскрипции, связываясь с E-боксами в качестве гетеродимера». Журнал биологической химии. 277 (15): 12604–12. Дои:10.1074 / jbc.M200283200. PMID  11812799.
• Ван М., Цао Х, Ву И, Бай С., Ву Л., Ши Х и др. (Февраль 2002 г.). «Jab1 противодействует передаче сигналов TGF-бета, вызывая деградацию Smad4». EMBO отчеты. 3 (2): 171–6. Дои:10.1093 / embo-reports / kvf024. ЧВК  1083965. PMID  11818334.
• Gemmill RM, Bemis LT, Lee JP, Sozen MA, Baron A, Zeng C и др. (Май 2002 г.). «Ген наследственного рака почки TRC8 подавляет рост и функционирует с VHL общим путем». Онкоген. 21 (22): 3507–16. Дои:10.1038 / sj.onc.1205437. PMID  12032852.
• Кабальеро О.Л., Ресто В., Паттураджан М., Меерзаман Д., Гуо М.З., Энглс Дж. И др. (Май 2002 г.). «Взаимодействие и совместная локализация PGP9.5 с JAB1 и p27 (Kip1)». Онкоген. 21 (19): 3003–10. Дои:10.1038 / sj.onc.1205390. PMID  12082530.
• Чопра С., Фернандес Де Маттос С., Лам EW, Манн DJ (сентябрь 2002 г.). «Совместная активация Jab1 c-Jun отменяется серином 10-фосфорилированной формой p27Kip1». Журнал биологической химии. 277 (36): 32413–6. Дои:10.1074 / jbc.C200311200. PMID  12119282.