Кандидат в разделение SR1 и код грацилибактерий - Candidate division SR1 and gracilibacteria code - Wikipedia
В кандидат деления SR1 и код gracilibacteria (таблица перевода 25) используется в двух группах (пока) необработанных бактерии найдены в морской и пресной воде, а также в кишечнике и ротовой полости млекопитающих.[1] Отличие от стандартного и бактериального кода состоит в том, что UGA представляет собой дополнительный кодон глицина и не кодирует терминатор.[2]
Код
AA = FFLLSSSSYY ** CCGWLLLLPPPPHHQQRRRRIIIMTTTTNNKKSSRRVVVVVAAAADDEEGGGGНачинается = --- M ------------------------------- M ------------- --M ------------Base1 = TTTTTTTTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGGGGGGGGGGGGBase2 = TTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGBase3 = TCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAG
Базы: аденин (А), цитозин (С), гуанин (G) и тимин (T) или урацил (U).
Аминокислоты: Аланин (Ала, А), Аргинин (Arg, R), Аспарагин (Asn, N), Аспарагиновая кислота (Asp, D), Цистеин (Cys, C), Глютаминовая кислота (Клей), Глутамин (Gln, Q), Глицин (Gly, G), Гистидин (Его, H), Изолейцин (Иль, я), Лейцин (Leu, L), Лизин (Лис, К), Метионин (Met, M), Фенилаланин (Phe, F), Пролин (Pro, P), Серин (Сер, S), Треонин (Thr, T), Триптофан (Трп, Вт), Тирозин (Tyr, Y) и Валин (Вал, В).
Отличие от стандартного кода
| Кодон ДНК | Кодон РНК | Этот код (25) | Стандартный код (1) | |
|---|---|---|---|---|
| TGA | UGA | Гли (G) | СТОП = Тер (*) |
Кодоны инициации
- AUG, GUG, UUG
Систематический диапазон
Смотрите также
Рекомендации
Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.[3]
- ^ Дэвис, Джеймс П .; Юссеф, Ноха Х .; Эльшахед, Мостафа С. (июнь 2009 г.). «Оценка разнообразия, численности и экологического распределения членов подразделения-кандидата SR1 выявляет высокий уровень филогенетического разнообразия, но ограниченное морфотипическое разнообразие». Прикладная и экологическая микробиология. 75 (12): 4139–4148. Дои:10.1128 / AEM.00137-09. ISSN 1098-5336. ЧВК 2698373. PMID 19395567.
- ^ Дж. Х. Кэмпбелл; О'П. Донохью; А. Г. Кэмпбелл; П. Швентек; А. Щирба; Т. Войке; Д. Зёлль; М. Подар (2 апреля 2013 г.). «UGA является дополнительным кодоном глицина в некультивируемых бактериях SR1 из микробиоты человека». Proc Natl Acad Sci U S A. 110 (14): 5540–5. Дои:10.1073 / пнас.1303090110. ЧВК 3619370. PMID 23509275.
- ^ Эльзановский А, Остелл Дж, Лейпе Д., Сусов В. "Генетические коды". Браузер таксономии. Национальный центр биотехнологической информации (NCBI), Национальная медицинская библиотека США. Получено 19 марта 2016.