D-аланин — D-аланин-лигаза - D-alanine—D-alanine ligase
| D-аланин — D-аланин-лигаза | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Номер ЕС | 6.3.2.4 | ||||||||
| Количество CAS | 9023-63-6 | ||||||||
| Базы данных | |||||||||
| IntEnz | Просмотр IntEnz | ||||||||
| БРЕНДА | BRENDA запись | ||||||||
| ExPASy | Просмотр NiceZyme | ||||||||
| КЕГГ | Запись в KEGG | ||||||||
| MetaCyc | метаболический путь | ||||||||
| ПРИАМ | профиль | ||||||||
| PDB структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Генная онтология | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
| D-ala N-конец D-ala лигазы | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 комплекс y216f d-ala: d-ala лигазы с adp и фосфорилфосфинатом | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Dala_Dala_lig_N | ||||||||
| Pfam | PF01820 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR011127 | ||||||||
| SCOP2 | 2длин / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| |||||||||
| D-ala С-конец D-ala лигазы | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
комплекс y216f d-ala: d-ala лигазы с adp и фосфорилфосфинатом | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Дала_Дала_лиг_C | ||||||||
| Pfam | PF07478 | ||||||||
| Pfam клан | CL0179 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR011095 | ||||||||
| SCOP2 | 2длин / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| |||||||||
В энзимология, а D-аланин — D-аланин-лигаза (EC 6.3.2.4 ) является фермент который катализирует то химическая реакция
- АТФ + 2 D-аланин АДФ + фосфат + D-аланил-D-аланин
Таким образом, два субстраты этого фермента АТФ и D-аланин, а его 3 товары находятся ADP, фосфат, и D-аланил-D-аланин.
Этот фермент принадлежит к семейству лигазы особенно те, которые образуют связи углерод-азот в виде лигаз кислота-D-аминокислота (пептидные синтазы). В систематическое название этого класса ферментов D-аланин: D-аланин-лигаза (АДФ-образующая). Другие широко используемые имена включают аланин: аланинлигаза (АДФ-образующая), и аланилаланинсинтетаза. Этот фермент участвует в метаболизм d-аланина и биосинтез пептидогликана. Фосфинат и D-циклосерин известны подавлять этот фермент.
Считается, что N-концевой участок D-аланин-D-аланин-лигазы участвует в субстрат привязка, в то время как C-конец считается каталитический домен.[1]
Структурные исследования
На конец 2007 г. 8 структуры были решены для этого класса ферментов, с PDB коды доступа 1EHI, 1ИОВ, 1IOW, 2DLN, 2FB9, 2I80, 2I87, и 2I8C.
Рекомендации
- ^ Ропер Д.И., Хайтон Т., Вагин А., Додсон Г. (август 2000 г.). «Молекулярные основы устойчивости к ванкомицину у клинически значимых энтерококков: кристаллическая структура D-аланил-D-лактатлигазы (VanA)». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (16): 8921–5. Bibcode:2000PNAS ... 97.8921R. Дои:10.1073 / pnas.150116497. ЧВК 16797. PMID 10908650.
дальнейшее чтение
- Ито, Э; Стромингер JL (1962). «Ферментативный синтез пептида в бактериальных уридиновых нуклеотидах II. Ферментативный синтез и добавление D-аланил-D-аланина». J. Biol. Chem. 237: 2696–2703.
- ФК Нейгауз (1962). «Кинетические исследования D-Ala-D-Ala синтетазы». Кормили. Proc. 21: 229.
- ван Хейенорт Дж (2001). «Последние достижения в формировании мономерной единицы бактериального пептидогликана». Nat. Prod. Представитель. 18 (5): 503–19. Дои:10.1039 / a804532a. PMID 11699883.
| Этот EC 6.3 фермент -связанная статья является заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |