Дэвид Кленерман - David Klenerman


Дэвид Кленерман

РодившийсяСентябрь 1959 (61 год)[1]
НациональностьБританский
Альма-матерКембриджский университет (Магистр, доктор философии)
ИзвестенСеквенирование красителей Illumina
Сканирующая ионно-проводящая микроскопия
Микроскопия сверхвысокого разрешения
Солекса
Награды
Научная карьера
ПоляБиофизическая химия
УчрежденияКембриджский университет
Стэндфордский Университет
ТезисИнфракрасная хемилюминесценция на спектрометре SISAM  (1985)
ДокторантЯн Уильям Мюрисон Смит
Другие научные консультантыРичард Заре
Интернет сайтKlenermangroup.co.Великобритания

Сэр Дэвид Кленерман ФРС FMedSci[3][4] (1959 г.р.) - британец биофизик-химик и профессором биофизической химии Кафедра химии на Кембриджский университет[5] и Парень из Колледж Христа, Кембридж.[6] Он наиболее известен своим вкладом в области секвенирование следующего поколения ДНК (что впоследствии привело к Солекса, компания по высокоскоростному секвенированию ДНК, соучредителем которой он является),[1][7][8][9][10] на основе нанопипеток сканирующая микроскопия ионной проводимости,[11][12] и микроскопия сверхвысокого разрешения.[13]

Образование

Кленерман получил образование в Кембриджский университет где он был студентом Черчилль-колледж, Кембридж и получил его BA степень в 1982 г.[14] Он заработал кандидат наук получил степень по химии в 1986 г. в аспирантуре Черчилль-колледж, Кембридж и находился под наблюдением Ян Уильям Мюрисон Смит.[15][2][14]

Карьера и исследования

После получения докторской степени Кленерман отправился в Стэндфордский Университет как Стипендиат программы Фулбрайта работать над химией высоких обертонов, с Ричард Заре. После его постдокторское исследование в Стэнфорде он вернулся в Соединенное Королевство, чтобы работать в BP Исследования за семь лет. Затем, в 1994 году, он поступил в Кембриджский университет в качестве преподавателя кафедры химии и сотрудника колледжа Христа.[2][14][16]

Кленерман вместе с Шанкар Баласубраманян, изобрел метод следующего поколения Секвенирование ДНК который сегодня широко известен как секвенирование Solexa или Секвенирование красителей Illumina.[7][9] Метод основан на обнаружении флуорофор меченые нуклеотиды, когда они включаются в ДНК пряди.[17] Это секвенирование методом синтеза приобрело популярность,[18][19] и в настоящее время считается наиболее широко используемой платформой для замены обычных Секвенирование по Сэнгеру Несмотря на его сравнительно низкую способность к мультиплексированию образцов, он предлагает несколько ключевых преимуществ: он автоматизирован, быстр, высокоточен, позволяет секвенировать несколько нитей одновременно через массивное параллельное секвенирование, и экономически дешевле в случае секвенирования всего генома.[20][21][22]

Он также известен своими исследованиями на основе нанопипеток (вместо обычных микропипеток). сканирующая микроскопия ионной проводимости методы.[11][23] Его исследовательская группа преуспела в получении топографических изображений живых клеток с очень высоким разрешением, в скачкообразной визуализации, в точной доставке малых молекул в клетку и в изучении детального функционирования клеток в реальном времени.[12][24][25]

Совсем недавно его группа сосредоточилась на 3D. микроскопия сверхвысокого разрешения для разработки нового понимания неправильная упаковка белка и нейродегенеративные заболевания.[13]

Коммерческая деятельность

Кленерман и Шанкар Баласубраманян коммерциализировали свое изобретение по высокоскоростному секвенированию ДНК на основе флуоресценции одной молекулы и совместно основали Солекса в 1998 году. Позже, в 2007 году, эту компанию приобрела Иллюмина за 600 миллионов долларов.[7][26][27][28][29]

В 2004 году Кленерман стал соучредителем другой дочерней компании, Ionscope, для поставки собранных сканирующие микроскопы ионной проводимости исследовательскому сообществу, которое ищет 3D-изображения живых клеток с высоким разрешением. В соответствии с Совет по исследованиям биотехнологии и биологических наук, по состоянию на февраль 2014 года Ionscope продала 35 устройств SICM по всему миру.[30]

Награды и почести

Основные награды и награды, полученные Кленерманом за свою исследовательскую работу:

Рекомендации

  1. ^ а б "Дэвид КЛЕНЕРМАН - личные встречи (бесплатная информация от Companies House)". beta.companieshouse.gov.uk.
  2. ^ а б c d «Победитель междисциплинарной премии 2007 г.». Королевское химическое общество. Получено 26 января 2016.
  3. ^ а б "Дэвид Кленерман: Королевское общество". Справочник стипендиатов. Королевское общество. Получено 26 января 2016.
  4. ^ а б «Сотрудник: Академия медицинских наук». Академия медицинских наук, Соединенное Королевство. Получено 26 января 2016.
  5. ^ "Профессор Давид Кленерман FMedSci FRS". Департамент химии Кембриджского университета. Кембриджский университет. Получено 26 января 2016.
  6. ^ «Профессор Дэвид Кленерман». Колледж Христа, Кембридж. Получено 26 января 2016.
  7. ^ а б c «История секвенирования Illumina». Иллюмина. Получено 26 января 2016.
  8. ^ Дэвис, Кевин (7 сентября 2010 г.). Геном за 1000 долларов. Свободная пресса. стр.102 –115. ISBN  978-1416569596. Получено 26 января 2016.
  9. ^ а б Бентли, ДР; Баласубраманян, S; Swerdlow, HP; и другие. (6 ноября 2008 г.). «Точное секвенирование всего генома человека с использованием химии обратимых терминаторов». Природа. 456 (7218): 53–59. Bibcode:2008Натура 456 ... 53Б. Дои:10.1038 / природа07517. ЧВК  2581791. PMID  18987734.
  10. ^ "История Солекса". Биотехнологический мир (Сентябрь – октябрь 2010 г.). 28 сентября 2010 г.. Получено 26 января 2016.
  11. ^ а б «Нанодудлинг демонстрирует силу пипеток». Новости BBC. 5 сентября 2006 г.. Получено 26 января 2016.
  12. ^ а б «Рисование с ДНК: нанопипетка позволяет подавать биомолекулы на поверхность под напряжением». Новости химии и машиностроения. 83 (44). Американское химическое общество. 31 октября 2005 г.. Получено 26 января 2016.
  13. ^ а б Ад, Стефан В .; Sahl, Steffen J .; Бейтс, Марк; Чжуан, Сяовэй; Хайнцманн, Райнер; Бут, Мартин Дж .; Беверсдорф, Йорг; Штенгель, Глеб; Гесс, Харальд; Тиннефельд, Филипп; Хонигманн, Альф; Якобс, Стефан; Теста, Илария; Cognet, Laurent; Лунис, Брахим; Эверс, Хельге; Дэвис, Саймон Дж .; Эггелинг, Кристиан; Кленерман, Дэвид; Виллиг, Катрин I .; Вичидомини, Джузеппе; Кастелло, Марко; Диаспро, Альберто; Кордес, Торбен; Штеффен Дж. Саль; Тиннефельд, Филипп; Кленерман, Дэвид; Катрин и Виллиг (14 октября 2015 г.). «Дорожная карта микроскопии сверхвысокого разрешения на 2015 год». Журнал физики D. 48 (44): 443001. arXiv:1711.04999. Bibcode:2015JPhD ... 48R3001H. Дои:10.1088/0022-3727/48/44/443001. S2CID  4804015.
  14. ^ а б c Анон (2017). «Кленерман, профессор Давид». Кто есть кто. ukwhoswho.com (онлайн Oxford University Press ред.). A&C Black, отпечаток Bloomsbury Publishing plc. Дои:10.1093 / ww / 9780199540884.013.266724. (подписка или Членство в публичной библиотеке Великобритании требуется) (требуется подписка)
  15. ^ Кленерман, Дэвид (1985). Инфракрасная хемилюминесценция на спектрометре SISAM. lib.cam.ac.uk (Кандидатская диссертация). Кембриджский университет. OCLC  499899771. EThOS  uk.bl.ethos.355881.
  16. ^ «Давид Кленерман избран ФРС». Колледж Христа, Кембридж. Получено 27 января 2016.
  17. ^ Баласубраманян, Шанкар (4 мая 2011 г.). «Секвенирование нуклеиновых кислот: от химии к медицине». Химические коммуникации. 47 (26): 7281–7286. Дои:10.1039 / c1cc11078k. ЧВК  3428630. PMID  21544287.
  18. ^ Перепел, Майкл А. (25 ноября 2008 г.). «Усовершенствования системы секвенирования Illumina крупным центром генома». Методы природы. 5 (12): 1005–1010. Дои:10.1038 / nmeth.1270. ЧВК  2610436. PMID  19034268.
  19. ^ Кронн, Ричард (27 августа 2008 г.). «Мультиплексное секвенирование геномов хлоропластов растений с использованием технологии Solexa« секвенирование путем синтеза »». Исследования нуклеиновых кислот. 36 (19): e122. Дои:10.1093 / nar / gkn502. ЧВК  2577356. PMID  18753151. Получено 29 января 2016.
  20. ^ Мецкер, Майкл Л. (8 декабря 2009 г.). «Технологии секвенирования - новое поколение». Природа Обзоры Генетика. 11 (1): 31–46. CiteSeerX  10.1.1.719.3885. Дои:10.1038 / nrg2626. PMID  19997069. S2CID  205484500.
  21. ^ Петтерссон, Эрик; Лундеберг, Иоаким; Ахмадиан, Афшин (2009). «Поколения технологий секвенирования». Геномика. 93 (2): 105–111. Дои:10.1016 / j.ygeno.2008.10.003. PMID  18992322.
  22. ^ Перепел, Майкл А. (24 июля 2012 г.). «Рассказ о трех платформах секвенирования следующего поколения: сравнение секвенсоров Ion Torrent, Pacific Biosciences и Illumina MiSeq». BMC Genomics. 13 (341): 341. Дои:10.1186/1471-2164-13-341. ЧВК  3431227. PMID  22827831.
  23. ^ Шевчук, Андрей I (2011). «Реализация биологического и биомедицинского потенциала наноразмерной визуализации с помощью пипеточного зонда». Наномедицина. 6 (3): 565–575. Дои:10.2217 / нм.10.154. PMID  21542692.
  24. ^ Чен, Цзяо-Чен; Чжоу, Йи; Бейкер, Лейн А. (2012). «Сканирующая микроскопия ионной проводимости». Ежегодный обзор аналитической химии. 5 (207): 207–228. Bibcode:2012ARAC .... 5..207C. Дои:10.1146 / annurev-anchem-062011-143203. PMID  22524219.
  25. ^ Бергнер, Стефан; Вацяян, Прити; Матысик, Франк-Майкл (2 мая 2013 г.). «Последние достижения в сканирующей электрохимической микроскопии с высоким разрешением живых клеток - обзор». Analytica Chimica Acta. 775: 1–13. Дои:10.1016 / j.aca.2012.12.042. PMID  23601970.
  26. ^ «Сокращение бюджета Великобритании на науку было бы ложной экономией». Financial Times. Nikkei. 18 июня 2013 г.. Получено 27 января 2016.
  27. ^ "600 миллионов долларов для фирмы ДНК". Университетская. Получено 27 января 2016.
  28. ^ «Иллюмина покупает Solexa». Forbes. 13 ноября 2006 г.. Получено 27 января 2016.
  29. ^ «Illumina купит Solexa за 600 миллионов долларов на складе». Журнал "Уолл Стрит. 13 ноября 2006 г.. Получено 27 января 2016.
  30. ^ «Новая микроскопическая технология позволяет получать изображения живых клеток». BBSRC. Получено 30 января 2016.
  31. ^ «Лекционный тур Британского биофизического общества». Университетский колледж Дублина. Получено 27 января 2016.
  32. ^ Королевская медаль 2018
  33. ^ [1]