FCN1 - FCN1

FCN1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2D39, 2JHH, 2JHI, 2JHK, 2JHL, 2JHM, 2WNP
Идентификаторы
Псевдонимы	FCN1, FCNM, фиколин 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 601252 MGI: 1341158 ГомолоГен: 1518 Генные карты: FCN1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 9 (человек)[1] Группа 9q34.3 Начните 134,903,232 бп[1] Конец 134,917,912 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 | 2 A3 Начните 28,076,378 бп[2] Конец 28,084,885 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание сиаловой кислоты • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание с рецептором, сопряженным с G-белком • связывание ионов металлов • связывание углеводов • GO: 0008329 активность рецептора распознавания образов • активность эндопептидазы серинового типа • связывание производных углеводов Сотовый компонент • внеклеточная область • клеточная мембрана • коллаген • внешний компонент внешней стороны плазматической мембраны • мембрана • просвет секреторной гранулы • Просвет гранул, богатых фиколином-1 • коллагенсодержащий внеклеточный матрикс Биологический процесс • активация комплемента, лектиновый путь • активация комплемента • Путь передачи сигналов рецептора, сопряженного с G-белком • распознавание апоптотической клетки • локализация белка на поверхности клетки • сигнальный путь рецептора распознавания образов клеточной поверхности • иммунная система • протеолиз • врожденная иммунная система • дегрануляция нейтрофилов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	2219	14134
Ансамбль	ENSG00000085265	ENSMUSG00000026835
UniProt	O00602	O70497
RefSeq (мРНК)	NM_002003	NM_010190
RefSeq (белок)	NP_001994	NP_034320
Расположение (UCSC)	Chr 9: 134,9 - 134,92 Мб	Chr 2: 28.08 - 28.08 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фиколин-1, а также обычно называемый М-фиколин, является белок что у людей кодируется FCN1 ген.^[5][6][7]

Белки семья фиколин состоять из лидера пептид, короткое N-концевой сегмент, за которым следует коллагеноподобный домен, а C-терминал фибриноген -подобный домен. Название фиколин произошло от двух последних доменов. Коллагеноподобный и фибриноген-подобный домены также обнаруживаются в других белках, таких как тенасцины, в то время как первый также содержится в белке комплемента C1q и Colleins, который включает в себя лектин, связывающий маннозу и белки сурфактанта легких. Фиколины выборочно распознают ацетилированные соединения. M-фиколин, кодируемый FCN1, преимущественно экспрессируется в лейкоциты периферической крови, и было постулировано, чтобы функционировать как белок плазмы с связывающий эластин Мероприятия. Несколько SNP были описаны в FCN1 ген с влиянием на концентрации в сыворотке М-фиколина и связывание лиганда способность. Уровни M-фиколина отражают активность заболевания и предсказывают ремиссию при раннем ревматоидном артрите.

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000085265 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026835 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Лу Дж., Тай П.Н., Кон О.Л., Рид КБ (март 1996 г.). «Фиколин человека: клонирование кДНК, демонстрация лейкоцитов периферической крови как основного сайта синтеза и отнесение гена к хромосоме 9». Biochem J. 313 (2): 473–8. Дои:10.1042 / bj3130473. ЧВК  1216931. PMID  8573080.
6. Эндо Й, Сато Й, Мацусита М, Фудзита Т (февраль 1997 г.). «Клонирование и характеристика гена лектина человека P35 и родственного ему гена». Геномика. 36 (3): 515–21. Дои:10.1006 / geno.1996.0497. PMID  8884275.
7. «Ген Энтреза: фиколин FCN1 (содержащий домен коллагена / фибриногена) 1».

дальнейшее чтение

• Лу Дж, Ле И (1999). «Фиколины и фибриноген-подобный домен». Иммунобиология. 199 (2): 190–9. Дои:10.1016 / s0171-2985 (98) 80026-0. PMID  9777405.
• Ichijo H, Hellman U, Wernstedt C и др. (1993). «Молекулярное клонирование и характеристика фиколина, мультимерного белка с фибриноген- и коллагеноподобными доменами». J. Biol. Chem. 268 (19): 14505–13. PMID  7686157.
• Мацусита М., Эндо Ю., Тайра С. и др. (1996). «Новый лектин сыворотки человека с коллаген- и фибриноген-подобными доменами, который функционирует как опсонин». J. Biol. Chem. 271 (5): 2448–54. Дои:10.1074 / jbc.271.5.2448. PMID  8576206.
• Харумия С., Такеда К., Сугиура Т. и др. (1997). «Характеристика фиколинов как новых связывающих эластин белков и молекулярное клонирование фиколина-1 человека». J. Biochem. 120 (4): 745–51. Дои:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a021474. PMID  8947836.
• Ле И, Тан С.М., Ли Ш.и др. (1997). «Очищающие и связывающие свойства человеческого фиколиноподобного белка». J. Immunol. Методы. 204 (1): 43–9. Дои:10.1016 / S0022-1759 (97) 00029-X. PMID  9202708.
• Matsushita M, Endo Y, Fujita T (2000). «Передний край: активирующий комплемент комплекс фиколина и маннозо-связывающей лектин-ассоциированной сериновой протеазы». J. Immunol. 164 (5): 2281–4. Дои:10.4049 / jimmunol.164.5.2281. PMID  10679061.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Цзэн Л., Дай Дж, Инь К. и др. (2003). «Идентификация нового человеческого ангиопоэтин-подобного гена, экспрессирующегося в основном в сердце». J. Hum. Genet. 48 (3): 159–62. Дои:10.1007 / с100380300025. PMID  12624729.
• Грегори Л.А., Тиленс Н.М., Мацусита М. и др. (2004). «Рентгеновская структура человеческого маннан-связывающего лектин-ассоциированного белка 19 (MAp19) и его сайт взаимодействия с маннан-связывающим лектином и L-фиколином». J. Biol. Chem. 279 (28): 29391–7. Дои:10.1074 / jbc.M402687200. PMID  15117939.
• Чжан З., Хензель В.Дж. (2005). «Прогнозирование сигнального пептида на основе анализа экспериментально подтвержденных сайтов расщепления». Белковая наука. 13 (10): 2819–24. Дои:10.1110 / пс. 04682504. ЧВК  2286551. PMID  15340161.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Frederiksen PD, Thiel S, Larsen CB, Jensenius JC (2006). «М-фиколин, молекула врожденной иммунной защиты, связывает ацетильные группы и активирует комплемент». Сканд. J. Immunol. 62 (5): 462–73. Дои:10.1111 / j.1365-3083.2005.01685.x. PMID  16305643. S2CID  35639359.
• Танио М., Кондо С., Сугио С., Коно Т. (2007). «Трехвалентная единица распознавания системы врожденного иммунитета: кристаллическая структура тримерного фибриноген-подобного домена M-фиколина человека». J. Biol. Chem. 282 (6): 3889–95. Дои:10.1074 / jbc.M608627200. PMID  17148457.

Ревматоидный артрит. 2013 декабрь; 65 (12): 3045-50. doi: 10.1002 / art.38179. Уровни М-фиколина отражают активность заболевания и предсказывают ремиссию при раннем ревматоидном артрите. Ammitzbøll CG1, Thiel S, Jensenius JC, Ellingsen T, Hørslev-Petersen K, Hetland ML, Junker P, Krogh NS, Østergaard М., Стенгаард-Педерсен К.