Галектин-8 - Galectin-8

LGALS8
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2YRO, 2YV8, 2YXS, 3AP4, 3AP5, 3AP6, 3AP7, 3AP9, 3APB, 3OJB, 3ВКЛ, 3ВКМ, 3ВКН, 3ВКО, 4БМБ, 4BME, 4FQZ, 4GXL, 4HAN
Идентификаторы
Псевдонимы	LGALS8, Gal-8, PCTA-1, PCTA1, Po66-CBP, галектин 8
Внешние идентификаторы	OMIM: 606099 MGI: 1928481 ГомолоГен: 31386 Генные карты: LGALS8
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q43 Начните 236,518,000 бп[1] Конец 236,552,981 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 13 (мышь)[2] Группа 13 A1 | 13 4,64 см Начните 12,439,415 бп[2] Конец 12,464,944 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание углеводов • связывание интегрина Сотовый компонент • внеклеточная экзосома • мембрана • внеклеточный • цитозоль • цитоплазматический пузырек • цитоплазма Биологический процесс • ксенофагия • аутофагия • клеточный ответ на вирус • миграция лимфатических эндотелиальных клеток Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	3964	56048
Ансамбль	ENSG00000116977	ENSMUSG00000057554
UniProt	O00214	Q9JL15
RefSeq (мРНК)	NM_006499 NM_201543 NM_201544 NM_201545	NM_001199043 NM_001291055 NM_001291057 NM_001291060 NM_018886
RefSeq (белок)	NP_006490 NP_963837 NP_963838 NP_963839	NP_001185972 NP_001277984 NP_001277986 NP_001277989 NP_061374
Расположение (UCSC)	Chr 1: 236,52 - 236,55 Мб	Chr 13: 12.44 - 12.46 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Галектин-8 это белок из галектин семья, которая у людей кодируется LGALS8 ген.^[5][6][7]

Функция

Этот ген кодирует члена семейства галектинов. Галектины являются животными, связывающими бета-галактозиды. лектины с консервативными доменами узнавания углеводов. Галектины участвуют во многих важных функциях, включая развитие, дифференцировку, клеточно-клеточную адгезия, ячейка-матрица взаимодействие, регулирование роста, апоптоз, и Сплайсинг РНК. Этот ген широко экспрессируется в опухолевых тканях и, по-видимому, участвует в интегрин -подобные клеточные взаимодействия. Были идентифицированы альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие разные изоформы.^[7]

Галектин-8, взаимодействует с mTOR система регулирования, состоящая из SLC38A9, Рагулятор, RagA B, RagCD.^[8] Галектин-8 контролирует mTOR вызывая его инактивацию и диссоциацию из поврежденных лизосом, тем самым трансформируя разрыв лизосомальной мембраны в mTOR.^[8] Физиологические последствия ингибирования mTOR после повреждения лизосомальной мембраны^[8] охватить аутофагия и метаболический переключение.

Роль в клеточной защите

Недавно было показано, что галектин-8 играет роль в клеточной защите как от бактериальной цитозольной инфекции, так и от вакуолярного повреждения.^[9] Многие внутриклеточные бактерии, такие как S. enterica серовар Typhimurium и S. flexneri предпочитают реплицироваться внутри и за пределами безопасности вакуолей, соответственно, однако эти вакуоли могут быть повреждены, подвергая бактерии цитоплазме клетки-хозяина. Было показано, что связывание галектина-8 с поврежденной вакуолью может привлекать аутофагия адаптеры, такие как NDP52 ведущий к формированию аутофагосома и последующее бактериальное уничтожение.^[9] Поскольку эксперименты с нокаутом галектина-8 приводят к более успешной цитозольной репликации за счет S. enterica serovar Typhimurium, считается, что галектин-8 действует как опасный рецептор для защиты от внутриклеточных патогенов.^[9][10]

Инженерные анализы галектина 8

Галектин-8 также использовался для изучения эндосомных нарушений в развитии наноразмерных системы доставки лекарств. Многие системы доставки лекарств, несущие лекарства с большими молекулами, такие как антисмысловые олигонуклеотиды, миРНК, пептиды, и лечебные белки, разработаны так, чтобы быть чувствительными к pH и разрушать эндосомальную мембрану из-за более низкого pH, обнаруживаемого в эндосомах, которые постепенно подкисляются. Галектин-8 может быть помечен флуорофором для отслеживания этих поврежденных эндосомных мембран, особенно в сочетании с автоматической микроскопией.^[11]

Взаимодействия

Было показано, что галектин-8 взаимодействовать с участием CD49d,^[12] CD29^[12] и CD49c.^[12] Он также взаимодействует с компонентами mTORC1 сложный.^[8]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000116977 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000057554 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Хадари Ю. Р., Паз К., Декель Р., Местрович Т., Ачили Д., Зик И. (февраль 1995 г.). «Галектин-8. Новый крысиный лектин, родственный галектину-4». Журнал биологической химии. 270 (7): 3447–53. Дои:10.1074 / jbc.270.7.3447. PMID  7852431.
6. Су З.З., Лин Дж., Шен Р., Фишер П. Е., Гольдштейн Н. И., Фишер П. Б. (июль 1996 г.). «Маскирование поверхностных эпитопов и клонирование экспрессии идентифицируют ген опухолевого антигена карциномы предстательной железы человека PCTA-1, являющийся членом семейства генов галектина». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 93 (14): 7252–7. Bibcode:1996PNAS ... 93.7252S. Дои:10.1073 / пнас.93.14.7252. ЧВК  38969. PMID  8692978.
7. «Ген Entrez: лектин LGALS8, галактозид-связывающий, растворимый, 8 (галектин 8)».
8. Jia J, Abudu YP, Claude-Taupin A, Gu Y, Kumar S, Choi SW и др. (Апрель 2018). «Галектины контролируют mTOR в ответ на повреждение эндомембраны». Молекулярная клетка. 70 (1): 120–135.e8. Дои:10.1016 / j.molcel.2018.03.009. ЧВК  5911935. PMID  29625033.
9. Терстон Т.Л., Вандел депутат, фон Мюлинен Н., Фоглейн А., Рандоу Ф. (январь 2012 г.). «Галектин 8 нацелен на поврежденные везикулы для аутофагии, чтобы защитить клетки от бактериального вторжения». Природа. 482 (7385): 414–8. Bibcode:2012Натура 482..414Т. Дои:10.1038 / природа10744. ЧВК  3343631. PMID  22246324.
10. Хуанг Дж., Брумелл Дж. Х. (февраль 2012 г.). «Микробиология: прекрасный способ почувствовать опасность». Природа. 482 (7385): 316–7. Bibcode:2012Натура.482..316H. Дои:10.1038 / 482316a. PMID  22337047.
11. Килкрист К.В., Димоби С.К., Джексон М.А., Эванс BC, Верфель Т.А., Дайлинг Е.А. и др. (Февраль 2019). "Gal8 Визуализация разрушения эндосом предсказывает опосредованную носителем биодоступность внутриклеточной биодоступности". САУ Нано. 13 (2): 1136–1152. Дои:10.1021 / acsnano.8b05482. ЧВК  6995262. PMID  30629431.
12. Хадари Ю. Р., Арбель-Горен Р., Леви Ю., Амстердам А., Алон Р., Закут Р., Зик И. (июль 2000 г.). «Связывание галектина-8 с интегринами ингибирует клеточную адгезию и вызывает апоптоз». Журнал клеточной науки. 113 (Pt 13) (Pt 13): 2385–97. PMID  10852818.

дальнейшее чтение

• Бидон Н., Брихори Ф., Бурге П., Ле Пеннек Дж. П., Дазорд Л. (сентябрь 2001 г.). «Галектин-8: сложное подсемейство галектинов (Обзор)». Международный журнал молекулярной медицины. 8 (3): 245–50. Дои:10.3892 / ijmm.8.3.245. PMID  11494049.
• Данги А., Кэмби I, Поцелуй Р. (сентябрь 2002 г.). «Галектины и рак». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Общие предметы. 1572 (2–3): 285–93. Дои:10.1016 / S0304-4165 (02) 00315-X. PMID  12223276.
• Бидон-Вагнер Н, Ле Пеннек JP (2004). «Изоформы галектина-8 человека и рак». Журнал гликоконъюгатов. 19 (7–9): 557–63. Дои:10.1023 / B: GLYC.0000014086.38343.98. PMID  14758080.
• Бассен Р., Брихори Ф., Коулет-Моджандр С., Бидон Н., Делаваль П., Дезрю Б., Дазорд Л. (2000). «Экспрессия Po66-CBP, галектина типа 8, в различных здоровых, опухолевых и перитуморальных тканях». Противораковые исследования. 19 (6B): 5429–33. PMID  10697573.
• Хадари Ю. Р., Арбель-Горен Р., Леви Ю., Амстердам А., Алон Р., Закут Р., Зик И. (июль 2000 г.). «Связывание галектина-8 с интегринами ингибирует клеточную адгезию и вызывает апоптоз». Журнал клеточной науки. 113 (Pt 13) (13): 2385–97. PMID  10852818.
• Гопалкришнан Р.В., Робертс Т., Тули С., Канг Д., Кристиансен К.А., Фишер ПБ (сентябрь 2000 г.). «Молекулярная характеристика опухолевого антигена-1 карциномы простаты, PCTA-1, гена, родственного галектину-8 человека». Онкоген. 19 (38): 4405–16. Дои:10.1038 / sj.onc.1203767. PMID  10980616.
• Бидон Н., Брихори Ф., Ханаш С., Бурге П., Дазорд Л., Ле Пеннек Дж. П. (август 2001 г.). «Две матричные РНК и пять изоформ для Po66-CBP, гомолога галектина-8 в клеточной линии карциномы легкого человека». Ген. 274 (1–2): 253–62. Дои:10.1016 / S0378-1119 (01) 00598-4. PMID  11675018.
• Надь Н., Бронкарт Ю., Камби И., Лежандр Х., Лам Х., Кальтнер Х. и др. (Март 2002 г.). «Экспрессия галектина-8 снижается при раке по сравнению с нормальной и диспластической тканью толстой кишки человека и значительно действует на миграцию раковых клеток толстой кишки человека в качестве супрессора». Кишечник. 50 (3): 392–401. Дои:10.1136 / гут.50.3.392. ЧВК  1773143. PMID  11839721.
• Майер К., Рёш К., Херкоммер К., Бохум С., Кансель-Тассин Г., Кассено О. и др. (Сентябрь 2002 г.). «Подход с использованием гена-кандидата в области восприимчивости PCaP на 1q42.2-43 исключает вредные мутации гена PCTA-1, ответственные за наследственный рак простаты». Европейская урология. 42 (3): 301–7. Дои:10.1016 / S0302-2838 (02) 00280-4. PMID  12234517.
• Леви Ю., Ронен Д., Бершадский А.Д., Зик Ю. (апрель 2003 г.). «Устойчивая индукция ERK, протеинкиназы B и p70 S6 киназы регулирует распространение клеток и образование микрошипов F-актина при лигировании интегринов галектином-8, лектином млекопитающих». Журнал биологической химии. 278 (16): 14533–42. Дои:10.1074 / jbc.M207380200. PMID  12569102.
• Идео Х, Секо А, Исидзука И., Ямасита К. (октябрь 2003 г.). «N-концевой домен распознавания углеводов галектина-8 распознает специфические гликосфинголипиды с высоким сродством». Гликобиология. 13 (10): 713–23. Дои:10.1093 / glycob / cwg094. PMID  12851289.
• Ниши Н., Сёдзи Х., Секи М., Ито А., Миянака Х., Юубе К. и др. (Ноябрь 2003 г.). «Галектин-8 модулирует функцию нейтрофилов посредством взаимодействия с интегрином альфаМ». Гликобиология. 13 (11): 755–63. Дои:10.1093 / glycob / cwg102. PMID  12881409.