Галектин-9 - Galectin-9

LGALS9
Доступные конструкции PDB Human UniProt search: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2EAK, 2EAL, 2ГГ1, 2ЖК, 2ЖЛ, 2ЖМ, 2ЖН, 3LSD, 3LSE, 3НВ1, 3NV2, 3NV3, 3NV4, 3WLU, 3WV6
Идентификаторы
Псевдонимы	LGALS9, HUAT, LGALS9A, галектин 9
Внешние идентификаторы	OMIM: 601879 ГомолоГен: 32078 Генные карты: LGALS9
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17q11.2 Начните 27,629,798 бп[1] Конец 27,649,560 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание галактозы • активность преобразователя сигнала • связывание ферментов • связывание дисахаридов • связывание углеводов Сотовый компонент • внутриклеточный • внеклеточная область • внеклеточная экзосома • цитоплазма • ядро клетки • внеклеточный • цитозоль Биологический процесс • отрицательная регуляция выработки гамма-интерферона • ответ на интерлейкин-1 • сигнальный путь толл-подобного рецептора 4 • материнский процесс, связанный с беременностью женщины • положительная регуляция активации Т-клеток посредством контакта рецептора Т-клеток с антигеном, связанным с молекулой MHC на антигенпрезентирующей клетке • иммунная система • положительное регулирование пролиферации CD4-положительных альфа-бета Т-клеток • Каскад ERK1 и ERK2 • женская беременность • положительное регулирование проникновения вируса в клетку-хозяин • положительная регуляция продукции хемотаксического белка-1 моноцитами • индукция толерантности к естественным клеткам-киллерам • отрицательное регулирование производства хемокинов • регуляция выработки интерлейкина-5 • сигнальный путь toll-подобного рецептора 2 • положительная регуляция активности эндопептидазы цистеинового типа, участвующей в апоптотическом сигнальном пути • отрицательная регуляция дегрануляции тучных клеток • отрицательная регуляция экспрессии генов • положительное регулирование выработки интерлейкина-4 • хемотаксис • отрицательная регуляция пролиферации активированных Т-клеток • регуляция выработки интерлейкина-4 • ответ на липополисахарид • положительная регуляция экспрессии генов • положительная регуляция активности фактора транскрипции NF-kappaB • положительная регуляция процесса апоптоза дендритных клеток • положительная регуляция каскада ERK1 и ERK2 • клеточный ответ на интерферон-гамма • положительная регуляция передачи сигналов I-kappaB киназы / NF-kappaB • каскад p38MAPK • отрицательная регуляция цитотоксичности, опосредованной естественными клетками-киллерами • положительное регулирование производства бета трансформирующего фактора роста • отрицательная регуляция пролиферации CD4-положительных, альфа-бета Т-клеток • положительная регуляция дифференцировки дендритных клеток • отрицательная регуляция выработки фактора некроза опухоли • положительное регулирование дифференцировки CD4-положительных, CD25-положительных, альфа-бета регуляторных Т-клеток, участвующих в иммунном ответе • воспалительная реакция • регулирование каскада p38MAPK • зрелая обычная дифференцировка дендритных клеток • положительная регуляция хемотаксиса дендритных клеток • позитивная регуляция автономной гибели активированных Т-клеток Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	3965	н / д
Ансамбль	ENSG00000168961	н / д
UniProt	O00182	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_002308 NM_009587 NM_001330163	н / д
RefSeq (белок)	NP_001317092 NP_002299 NP_033665	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 17: 27.63 - 27.65 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Галектин-9 был впервые выделен из эмбриональной почки мыши в 1997 году как белок бета-галактозид 36 кДа.^[3] Галектин-9 человека кодируется LGALS9 ген.^[4][5]

Функция

Белок имеет N- и C-концевые углеводсвязывающие домены, связанные пептидом связи. Для этого гена было обнаружено множество альтернативно сплайсированных вариантов транскриптов.^[5]

Галектин-9 - один из наиболее изученных лигандов для HAVCR2 (TIM-3) и экспрессируется на различных опухолевых клетках. Однако он также может взаимодействовать с другими белками (CLEC7A,^[6] CD137,^[7] CD40^[8]). Например, взаимодействие с CD40 на Т-клетках вызывает ингибирование их пролиферации и гибель клеток.

Галектин-9 также имеет важные цитоплазматические, внутриклеточные функции и контроль. AMPK^[9][10] в ответ на лизосомный повреждение, которое может произойти при воздействии эндогенных и экзогенных агентов, повреждающих мембраны, таких как кристаллический кремнезем, кристаллы холестерина, микробные токсины, протеопатический агрегаты, такие как тау-фибриллы и амилоиды и сигнальные пути, индуцирующие лизосомальную проницаемость, такие как инициированные ТРАССА.^[11] Легкое лизосомное повреждение, например, вызванное анти-сахарный диабет препарат, средство, медикамент метформин^[10] может способствовать терапевтическому действию метформин путем активации AMPK. Механизм того, как галектин-9 активирует AMPK, включает распознавание обнаженного просвета лизосомы. гликопротеины такие как ЛАМПА 1, ЛАМПА2, SCRAB2, TMEM192 и др., Отталкивание деубиквитинирующий фермент USP9X, вырос K63 убиквитинирование из ТАК1 (MAP3K7 ) киназа, которая, в свою очередь, фосфорилирует AMPK и активирует ее.^[10] Этот сигнальный каскад напрямую связывает внутриклеточную функцию галектина-9 с убикютин системы. Галектин-9 посредством регуляции AMPK, киназы, которая негативно регулирует mTOR, сотрудничает с Галектин-8 -основанные эффекты для инактивации mTOR ниже лизосомальных повреждающих агентов и состояний.^[9][10]

Клиническое значение

Экспрессия галектина-9 была обнаружена при различных гематологических злокачественных новообразованиях, таких как ХЛЛ,^[12] МДС,^[13] Ходжкинские и неходжкинские лимфомы,^[14] AML^[15] или солидные опухоли, такие как рак легких,^[16] рак молочной железы,^[17] и гепатоцеллюлярная карцинома.^[18]

Взаимодействие HAVCR2 / галектин-9 ослабляет экспансию Т-клеток, а эффекторы действуют в микроокружении опухоли и при хронических инфекциях.^[19][15] Более того, галектин-9 способствует онкогенезу за счет трансформации опухолевых клеток, регуляции клеточного цикла, ангиогенеза и клеточной адгезии.^[20] Корреляционные исследования, анализирующие экспрессию галектина-9 и злокачественные клинические признаки, показали противоречивые результаты. Это можно объяснить тем, что галектин-9 может способствовать ускользанию от опухоли иммунной системы, а также подавлять метастазирование, способствуя адгезии эндотелия.^[18] Поэтому многие факторы, такие как тип опухоли, стадия и участие различных галектинов, должны быть приняты во внимание при корреляции уровня экспрессии и злокачественности.

Галектин-9, благодаря своему цитоплазматическому действию в контроле AMPK,^[9][10] может повлиять на различные состояния здоровья, на которые влияет AMPK, в том числе метаболизм, ожирение, сахарный диабет, рак, невосприимчивый ответные реакции и могут быть частью механизма действия широко прописываемого противодиабетного препарата метформин.^[10]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000168961 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. Вада Дж., Канвар Ю.С. (февраль 1997 г.). «Идентификация и характеристика галектина-9, нового связывающего бета-галактозид лектина млекопитающих». Журнал биологической химии. 272 (9): 6078–86. Дои:10.1074 / jbc.272.9.6078. PMID  9038233.
4. Türeci O, Schmitt H, Fadle N, Pfreundschuh M, Sahin U (март 1997 г.). «Молекулярное определение нового галектина человека, который является иммуногенным у пациентов с болезнью Ходжкина». Журнал биологической химии. 272 (10): 6416–22. Дои:10.1074 / jbc.272.10.6416. PMID  9045665.
5. «Ген Entrez: лектин LGALS9, галактозид-связывающий, растворимый, 9 (галектин 9)».
6. Дейли Д., Мани В.Р., Мохан Н., Аккад Н., Очи А., Хайндель Д.В. и др. (Май 2017). «Активация дектина 1 на макрофагах галектином 9 способствует карциноме поджелудочной железы и перитуморальной иммунной толерантности». Природа Медицина. 23 (5): 556–567. Дои:10,1038 / нм.4314. ЧВК  5419876. PMID  28394331.
7. Мадиредди С., Ын С.Ю., Ли С.В., Немчовичова И., Мехта А.К., Зайонц Д.М., Ниши Н., Ники Т., Хирасима М., Крофт М. (июнь 2014 г.). «Галектин-9 контролирует терапевтическую активность направленных на 4-1BB антител». Журнал экспериментальной медицины. 211 (7): 1433–48. Дои:10.1084 / jem.20132687. ЧВК  4076583. PMID  24958847.
8. Вайтайтис GM, Вагнер DH (2012). «Галектин-9 контролирует передачу сигналов CD40 через независимый от Tim-3 механизм и перенаправляет цитокиновый профиль патогенных Т-клеток в аутоиммунитет». PLOS ONE. 7 (6): e38708. Дои:10.1371 / journal.pone.0038708. ЧВК  3369903. PMID  22685601.
9. Jia J, Abudu YP, Claude-Taupin A, Gu Y, Kumar S, Choi SW и др. (Апрель 2018). «Галектины контролируют mTOR в ответ на повреждение эндомембраны». Молекулярная клетка. 70 (1): 120–135.e8. Дои:10.1016 / j.molcel.2018.03.009. ЧВК  5911935. PMID  29625033.
10. Джиа Дж, Бисса Б., Брехт Л., Аллерс Л., Чой С.В., Гу И и др. (Январь 2020 г.). «AMPK, регулятор метаболизма и аутофагии, активируется лизосомным повреждением через новую систему передачи сигнала убиквитина, направляемую галектином». Молекулярная клетка. 77 (5): 951–969.e9. Дои:10.1016 / j.molcel.2019.12.028. PMID  31995728.
11. Werneburg NW, Guicciardi ME, Bronk SF, Kaufmann SH, Gores GJ (сентябрь 2007 г.). «Лиганд, индуцирующий апоптоз, связанный с фактором некроза опухоли, активирует лизосомный путь апоптоза, который регулируется белками Bcl-2». Журнал биологической химии. 282 (39): 28960–70. Дои:10.1074 / jbc.M705671200. PMID  17686764.
12. Taghiloo S, Allahmoradi E, Ebadi R, Tehrani M, Hosseini-Khah Z, Janbabaei G, Shekarriz R., Asgarian-Omran H (август 2017 г.). «Повышение активности молекул галектина-9 и PD-L1 в иммунных контрольных точках у пациентов с хроническим лимфолейкозом». Азиатско-Тихоокеанский журнал профилактики рака. 18 (8): 2269–2274. Дои:10.22034 / APJCP.2017.18.8.2269. ЧВК  5697491. PMID  28843266.
13. Асаяма Т., Тамура Х., Ишибаши М., Курибаяси-Хамада Й, Онодера-Кондо А., Окуяма Н., Ямада А., Симидзу М., Мория К., Такахаши Х., Инокучи К. (октябрь 2017 г.). «Функциональная экспрессия Tim-3 на бластах и ​​клиническое влияние его лиганда галектина-9 на миелодиспластические синдромы». Oncotarget. 8 (51): 88904–88917. Дои:10.18632 / oncotarget.21492. ЧВК  5687656. PMID  29179486.
14. Макиси С., Окудаира Т., Исикава С., Савада С., Ватанабэ Т., Хирасима М., Сунакава Н., Мори Н. (август 2008 г.). «Модифицированная версия галектина-9 вызывает остановку клеточного цикла и апоптоз клеток лимфомы Беркитта и Ходжкина». Британский журнал гематологии. 142 (4): 583–94. Дои:10.1111 / j.1365-2141.2008.07229.x. PMID  18503581. S2CID  205264381.
15. Гонсалвеш Сильва I, Ясинская И.М., Сахневич С.С., Фидлер В., Веллброк Дж., Барделли М., Варани Л., Хуссейн Р., Силигарди Г., Чекконе Г., Бергер С.М., Ушкарев Ю.А., Гиббс Б.Ф., Фаслер-Кан Е., Сумбаев В.В. ). «Секреторный путь Tim-3-галектина-9 участвует в иммунном побеге клеток острого миелоидного лейкоза человека». EBioMedicine. 22: 44–57. Дои:10.1016 / j.ebiom.2017.07.018. ЧВК  5552242. PMID  28750861.
16. Гао Дж, Цю Х, Ли Х, Фань Х, Чжан Ф, Ур Т, Сон Y (февраль 2018). «Профили экспрессии и клиническое значение плазменного экзосомального Tim-3 и галектина-9 при немелкоклеточном раке легкого». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 498 (3): 409–415. Дои:10.1016 / j.bbrc.2018.02.114. PMID  29452091.
17. Ирие А., Ямаути А., Контани К., Кихара М., Лю Д., Сирато И., Секи М., Ниси Н., Накамура Т., Йокомисе Х., Хирасима М. (апрель 2005 г.). «Галектин-9 как прогностический фактор с антиметастатическим потенциалом при раке груди». Клинические исследования рака. 11 (8): 2962–8. Дои:10.1158 / 1078-0432.CCR-04-0861. PMID  15837748.
18. Чжан З.Й., Донг Дж.Х., Чен Ю.В., Ван XQ, Ли Ч., Ван Дж, Ван GQ, Ли Х.Л., Ван XD (2012). «Галектин-9 действует как прогностический фактор с антиметастатическим потенциалом при гепатоцеллюлярной карциноме». Азиатско-Тихоокеанский журнал профилактики рака. 13 (6): 2503–9. Дои:10.7314 / apjcp.2012.13.6.2503. PMID  22938412.
19. Сакуиси К., Апето Л., Салливан Дж. М., Блазар Б. Р., Кучро В. К., Андерсон А. С. (сентябрь 2010 г.). «Нацеливание на пути Tim-3 и PD-1 для обращения вспять истощения Т-клеток и восстановления противоопухолевого иммунитета» (PDF). Журнал экспериментальной медицины. 207 (10): 2187–94. Дои:10.1084 / jem.20100643. ЧВК  2947065. PMID  20819927.
20. Лю FT (Апрель 2005 г.). «Регуляторные роли галектинов в иммунном ответе». Международный архив аллергии и иммунологии. 136 (4): 385–400. Дои:10.1159/000084545. PMID  15775687. S2CID  6614531.

дальнейшее чтение

• Хирасима М., Кашио Ю., Ниси Н., Ямаути А., Имаидзуми Т.А., Кагешита Т., Сайта Н., Накамура Т. (2004). «Галектин-9 в физиологических и патологических состояниях». Журнал гликоконъюгатов. 19 (7–9): 593–600. Дои:10.1023 / B: GLYC.0000014090.63206.2f. PMID  14758084. S2CID  11006101.
• Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Мацумото Р., Мацумото Х., Секи М., Хата М., Асано И., Канегасаки С., Стивенс Р. Л., Хирасима М. (июль 1998 г.). «Человеческий экалектин, вариант человеческого галектина-9, представляет собой новый хемоаттрактант эозинофилов, продуцируемый Т-лимфоцитами». Журнал биологической химии. 273 (27): 16976–84. Дои:10.1074 / jbc.273.27.16976. PMID  9642261.
• Мацумото Р., Хирасима М., Кита Х., Глейх Г.Дж. (февраль 2002 г.). «Биологическая активность экалектина: новый фактор, активирующий эозинофилы». Журнал иммунологии. 168 (4): 1961–7. Дои:10.4049 / jimmunol.168.4.1961. PMID  11823532.
• Кагешита Т., Кашио Ю., Ямаути А., Секи М., Абедин М.Дж., Ниси Н., Сёдзи Х., Накамура Т., Оно Т., Хирасима М. (июнь 2002 г.). «Возможная роль галектина-9 в агрегации клеток и апоптозе клеточных линий меланомы человека и его клиническое значение». Международный журнал рака. 99 (6): 809–16. Дои:10.1002 / ijc.10436. PMID  12115481. S2CID  205934076.
• Имаидзуми Т., Кумагаи М., Сасаки Н., Куротаки Х., Мори Ф., Секи М., Ниси Н., Фудзимото К., Танджи К., Шибата Т., Тамо В., Мацумия Т., Йошида Х., Цуй XF, Таканаши С., Ханада К., Окумура К. , Ягихаши С., Вакабаяси К., Накамура Т., Хирасима М., Сато К. (сентябрь 2002 г.). «Интерферон-гамма стимулирует экспрессию галектина-9 в культивируемых эндотелиальных клетках человека». Журнал биологии лейкоцитов. 72 (3): 486–91. PMID  12223516.
• Asakura H, Kashio Y, Nakamura K, Seki M, Dai S, Shirato Y, Abedin MJ, Yoshida N, Nishi N, Imaizumi T., Saita N, Toyama Y, Takashima H, Nakamura T., Ohkawa M, Hirashima M (ноябрь 2002 г. ). «Селективная адгезия эозинофилов к фибробластам через IFN-гамма-индуцированный галектин-9». Журнал иммунологии. 169 (10): 5912–8. Дои:10.4049 / jimmunol.169.10.5912. PMID  12421975.
• Кашио Ю., Накамура К., Абедин М.Дж., Секи М., Ниси Н., Йошида Н., Накамура Т., Хирасима М. (апрель 2003 г.). «Галектин-9 вызывает апоптоз через путь кальций-кальпаин-каспаза-1». Журнал иммунологии. 170 (7): 3631–6. Дои:10.4049 / jimmunol.170.7.3631. PMID  12646627.
• Абедин М.Дж., Кашио Ю., Секи М., Накамура К., Хирасима М. (май 2003 г.). «Возможные роли галектинов в дифференцировке миелоидов на три разные линии». Журнал биологии лейкоцитов. 73 (5): 650–6. Дои:10.1189 / jlb.0402163. PMID  12714580. S2CID  21337581.
• Мацуда А., Сузуки Ю., Хонда Дж., Мурамацу С., Мацузаки О, Нагано И., Дои Т., Шимотохно К., Харада Т., Нисида Е., Хаяси Х, Сугано С. (май 2003 г.). «Крупномасштабная идентификация и характеристика человеческих генов, активирующих сигнальные пути NF-kappaB и MAPK». Онкоген. 22 (21): 3307–18. Дои:10.1038 / sj.onc.1206406. PMID  12761501.
• Ирие А., Ямаути А., Контани К., Кихара М., Лю Д., Сирато И., Секи М., Ниси Н., Накамура Т., Йокомисе Х., Хирасима М. (апрель 2005 г.). «Галектин-9 как прогностический фактор с антиметастатическим потенциалом при раке груди». Клинические исследования рака. 11 (8): 2962–8. Дои:10.1158 / 1078-0432.CCR-04-0861. PMID  15837748.
• Касамацу А., Удзава К., Накашима Д., Коике Х., Шииба М., Букава Х., Ёкоэ Х., Танзава Х. (август 2005 г.). «Галектин-9 как регулятор клеточной адгезии в клеточных линиях плоскоклеточного рака полости рта человека». Международный журнал молекулярной медицины. 16 (2): 269–73. Дои:10.3892 / ijmm.16.2.269. PMID  16012760.
• Дай С.Ю., Накагава Р., Ито А., Мураками Х., Кашио Й., Абе Х., Като С., Контани К., Кихара М., Чжан С.Л., Хата Т, Накамура Т., Ямаути А., Хирасима М. (сентябрь 2005 г.). «Галектин-9 вызывает созревание дендритных клеток человека, происходящих из моноцитов». Журнал иммунологии. 175 (5): 2974–81. Дои:10.4049 / jimmunol.175.5.2974. PMID  16116184.
• Чжу С., Андерсон А.С., Шубарт А., Сюн Х., Имитола Дж., Хури С.Дж., Чжэн ХХ, Стром Т.Б., Кучру В.К. (декабрь 2005 г.). «Лиганд Tim-3 галектин-9 отрицательно регулирует иммунитет Т-хелперов 1 типа». Иммунология природы. 6 (12): 1245–52. Дои:10.1038 / ni1271. PMID  16286920. S2CID  24886582.
• ван де Вейер PS, Muehlfeit M, Klose C, Bonventre JV, Walz G, Kuehn EW (декабрь 2006 г.). «Высококонсервативный тирозин Tim-3 фосфорилируется при стимуляции его лигандом галектином-9». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 351 (2): 571–6. Дои:10.1016 / j.bbrc.2006.10.079. PMID  17069754.

внешние ссылки

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: O00182 (Галектин-9) на PDBe-KB.