HIST3H2BB - HIST3H2BB

H2BU1
Идентификаторы
Псевдонимы	H2BU1, H2Bb, гистоновый кластер 3, H2bb, гистоновый кластер 3 H2B член семейства b, H2B.U гистон 1, HIST3H2BB
Внешние идентификаторы	OMIM: 615046 MGI: 1922442 ГомолоГен: 75941 Генные карты: H2BU1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q42.13 Начните 228,458,107 бп[1] Конец 228,460,470 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 | 11 B1.3 Начните 58,954,048 бп[2] Конец 58,954,512 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • активность гетеродимеризации белков • молекулярная функция Сотовый компонент • хромосома • нуклеосома • ядро клетки • нуклеоплазма • цитозоль Биологический процесс • сборка нуклеосом Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	128312	382522
Ансамбль	ENSG00000196890 ENSG00000285449	ENSMUSG00000080712
UniProt	Q8N257	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_175055	н / д
RefSeq (белок)	NP_778225	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 1: 228.46 - 228.46 Мб	Chr 11: 58.95 - 58.95 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Гистон H2B типа 3-B это белок что у людей кодируется HIST3H2BB ген.^[5][6]

Гистоны - это основные ядерные белки, отвечающие за нуклеосома структура хромосомного волокна в эукариоты. Нуклеосомы состоят примерно из 146 пар оснований (бп) из ДНК обернутый вокруг октамер гистонов состоит из пар каждого из четырех ядерных гистонов (H2A, H2B, H3, и H4 ). В хроматин волокно дополнительно уплотняется за счет взаимодействия линкерного гистона, H1, с ДНК между нуклеосомами, чтобы сформировать структуры хроматина более высокого порядка. Этот ген без интронов и кодирует член семейства гистонов H2B. Стенограммы от этого гена содержат палиндромный терминатор.^[6]

использованная литература

1. ENSG00000285449 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000196890, ENSG00000285449 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000080712 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Марзлуфф В.Ф., Гонджиди П., Вудс К.Р., Джин Дж., Мальтийский Л.Дж. (октябрь 2002 г.). «Репликационно-зависимые гены гистонов человека и мыши». Геномика. 80 (5): 487–98. Дои:10.1016 / S0888-7543 (02) 96850-3. PMID  12408966.
6. «Ген Entrez: HIST3H2BB гистоновый кластер 3, H2bb».

дальнейшее чтение

• Боровски П., Хейланд М., Оэльманн К. и др. (1996). «Неструктурный белок 3 вируса гепатита С ингибирует фосфорилирование, опосредованное цАМФ-зависимой протеинкиназой». Евро. J. Biochem. 237 (3): 611–8. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1996.0611p.x. PMID  8647104.
• Эль Харруби А., Пирас Г., Зенсен Р., Мартин М.А. (1998). «Активация транскрипции интегрированного промотора вируса иммунодефицита человека типа 1, ассоциированного с хроматином». Мол. Cell. Биол. 18 (5): 2535–44. Дои:10.1128 / mcb.18.5.2535. ЧВК  110633. PMID  9566873.
• Боровски П., Кюль Р., Лауфс Р. и др. (1999). «Идентификация и характеристика сайта связывания гистонов неструктурного белка 3 вируса гепатита С». J. Clin. Вирол. 13 (1–2): 61–9. Дои:10.1016 / S1386-6532 (99) 00007-4. PMID  10405893.
• Томсон С., Клейтон А.Л., Хаззалин К.А. и др. (1999). «Нуклеосомный ответ, связанный с индукцией немедленного раннего гена, опосредуется через каскады альтернативных MAP-киназ: MSK1 как потенциальная киназа гистона H3 / HMG-14». EMBO J. 18 (17): 4779–93. Дои:10.1093 / emboj / 18.17.4779. ЧВК  1171550. PMID  10469656.
• Дэн Л., де ла Фуэнте С., Фу П. и др. (2001). «Ацетилирование Tat ВИЧ-1 с помощью CBP / P300 увеличивает транскрипцию интегрированного генома ВИЧ-1 и усиливает связывание с коровыми гистонами». Вирусология. 277 (2): 278–95. Дои:10.1006 / viro.2000.0593. PMID  11080476.
• Дэн Л., Ван Д., де ла Фуэнте С. и др. (2001). «Повышение активности HAT p300 с помощью Tat ВИЧ-1 на ДНК хроматина». Вирусология. 289 (2): 312–26. Дои:10.1006 / viro.2001.1129. PMID  11689053.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Чунг В.Л., Аджиро К., Самедзима К. и др. (2003). «Апоптотическое фосфорилирование гистона H2B опосредуется стерильной двадцать киназой млекопитающих». Ячейка. 113 (4): 507–17. Дои:10.1016 / S0092-8674 (03) 00355-6. PMID  12757711.
• Коулман М.А., Миллер К.А., Бирнинк П.Т. и др. (2004). «Идентификация белковых взаимодействий, связанных с хроматином, с помощью белковых микрочипов». Протеомика. 3 (11): 2101–7. Дои:10.1002 / pmic.200300593. PMID  14595808.
• Lusic M, Marcello A, Cereseto A, Giacca M (2004). «Регулирование экспрессии гена ВИЧ-1 путем ацетилирования гистонов и набора факторов на промотор LTR». EMBO J. 22 (24): 6550–61. Дои:10.1093 / emboj / cdg631. ЧВК  291826. PMID  14657027.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Канно Т., Канно И., Сигель Р.М. и др. (2004). «Селективное распознавание ацетилированных гистонов белками бромодомена, визуализированных в живых клетках». Мол. Ячейка. 13 (1): 33–43. Дои:10.1016 / S1097-2765 (03) 00482-9. PMID  14731392.
• Чжан Ю., Гриффин К., Мондал Н., Парвин Дж. Д. (2004). «Фосфорилирование гистона H2A ингибирует транскрипцию на матрице хроматина». J. Biol. Chem. 279 (21): 21866–72. Дои:10.1074 / jbc.M400099200. PMID  15010469.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Golebiowski F, Kasprzak KS (2007). «Ингибирование ацетилирования ядер гистонов канцерогенным никелем (II)». Мол. Cell. Биохим. 279 (1–2): 133–9. Дои:10.1007 / s11010-005-8285-1. PMID  16283522.
• Zhu B, Zheng Y, Pham AD, et al. (2006). «Моноубиквитинирование гистона H2B человека: вовлеченные факторы и их роль в регуляции гена HOX». Мол. Ячейка. 20 (4): 601–11. Дои:10.1016 / j.molcel.2005.09.025. PMID  16307923.
• Bonenfant D, Coulot M, Towbin H и др. (2006). «Характеристика вариантов гистона H2A и H2B и их посттрансляционных модификаций с помощью масс-спектрометрии». Мол. Cell. Протеомика. 5 (3): 541–52. Дои:10.1074 / mcp.M500288-MCP200. PMID  16319397.
• Beck HC, Nielsen EC, Matthiesen R et al. (2006). «Количественный протеомный анализ посттрансляционных модификаций гистонов человека». Мол. Cell. Протеомика. 5 (7): 1314–25. Дои:10.1074 / mcp.M600007-MCP200. PMID  16627869.
• Грегори С.Г., Барлоу К.Ф., Маклей К.Э. и др. (2006). «Последовательность ДНК и биологическая аннотация хромосомы 1 человека». Природа. 441 (7091): 315–21. Дои:10.1038 / природа04727. PMID  16710414.