Гаплогруппа Q-L54 - Haplogroup Q-L54

Гаплогруппа Q-L54
Возможное место происхождения	Евразия
Предок	Q-L53
Потомки	Q-L330, Q-M3, Q-M971, Q-Z780, Q-L804
Определение мутаций	L54

Гаплогруппа Q-L54 является субкладом Y-ДНК гаплогруппа Q-L53. Q1a3a-L54 определяется наличием L54 Однонуклеотидный полиморфизм (SNP).

Распределение

Q-L54 имеет потомков в Западной и Центральной Европе, на севере и востоке Азии и в Америке. Он включает две основные доколумбовые отцовские линии в Северной и Южной Америке: Q-M3 и Q-M971. Парень Анзик-1, который жил 12 600 лет назад и был найден в штате Монтана, имеет Y-хромосому, которая относится к гаплогруппе Q-M971 (Q-L54 * (xM3)).^[1]^[2]^[3] Линии потомства Q-L54 также включают две евразийские отцовские линии, среднеазиатскую линию Q-L330 и скандинавскую линию Q-L804. ^[4] Q-L804 - скандинавский, а TMRCA - чуть более 3000 лет.^[5]Гаплогруппа Q ‐ L54 доминирует в двух северо-сибирских популяциях: Кеты и Селькупов, с частотами 97,7% и 66,7% соответственно.^[6]

Связанные SNP

Q-L54 в настоящее время определяется только SNP L54.

Подгруппы

Текущее состояние полигентного дерева для Q-L54 опубликовано pinotti et. все в статье Последовательности Y-хромосомы показывают кратковременный берингийский застой, быстрое расширение и раннюю популяционную структуру коренных американцев-основателей. Калиброванная филогения гаплогруппы Y Q-L54.^[7]

L54
- Q-L330
- Q-MPB001 (18,9 тыс. Лет назад)
  - Q-CTS1780
  - Q-M930
    - Q-L804
    - Q-M3 (15,0 тыс. Лет назад)
      - Q-Y4308
      - Q-M848 (14,9 тыс. Лет назад)

Версия полигентного дерева для гаплогруппы Q-L54 2013 года, сделанная Томасом Краном в Центре геномных исследований: Предлагаемое дерево.

L54
- M3, L341.2
  - M19
  - M194
  - M199, P106, P292
  - СТРАНИЦЫ104, СТРАНИЦЫ126
  - СТРАНИЦЫ131
  - L663
  - SA01
  - L766, L767
  - L883, L884, L885, L886, L887
  - L888, L889, L890, L891
- L804, L805
  - L807
- Z780
  - L191
  - L400, L401
- L456
- L568, L569, L570, L571
  - L567
  - L619.1
- L330, L334
  - L329, L332, L333

Смотрите также

Гаплогруппа ДНК Y-хромосомы человека

Y-ДНК Q-M242 Субклады

Основное дерево Y-ДНК

Филогенетическое древо человека Гаплогруппы ДНК Y-хромосомы ^{[χ 1]}^{[χ 2]}

"Y-хромосомный Адам "

A0-T ^{[χ 3]}

A1 ^{[χ 4]}

F2

F3

GHIJK

я

J

LT ^{[χ 5]}

K2 ^{[χ 6]}

L

Т

K2a ^{[χ 7]}

K2b ^{[χ 8]}

K2c

K2d

K2e ^{[χ 9]}

K-M2313 ^{[χ 10]}

K2b1 ^{[χ 11]}

п ^{[χ 12]}

Нет

S ^{[χ 13]}

M ^{[χ 14]}

P1

P2

Сноски

^ Ван Овен М., Ван Гейстелен А., Кайзер М., Декорте Р., Larmuseau HD (2014). «Видеть лес за деревьями: минимальная эталонная филогения Y-хромосомы человека». Человеческая мутация. 35 (2): 187–91. Дои:10.1002 / humu.22468. PMID 24166809.
^ Международное общество генетической генеалогии (ISOGG; 2015), Дерево гаплогруппы Y-ДНК 2015. (Дата обращения: 1 февраля 2015 г.)
^ Гаплогруппа A0-T также известна как A-L1085 (а ранее как A0'1'2'3'4).
^ Гаплогруппа A1 также известна как A1'2'3'4.
^ Гаплогруппа LT (L298 / P326) также известна как гаплогруппа K1.
^ С 2002 по 2008 гг. Гаплогруппа T-M184 была известна как «Гаплогруппа К2». С тех пор это имя было изменено на K-M526, брат Haplogroup LT.
^ Гаплогруппа K2a (M2308) и ее первичный субклад K-M2313 были отделены от гаплогруппы NO (F549) в 2016 году (это последовало за публикацией: Позник Г.Д., Сюэ У., Мендес Ф.Л. и др. (2016). «Прерывистые всплески в демографии мужчин-мужчин на основе 1244 всемирных последовательностей Y-хромосомы». Природа Генетика. 48 (6): 593–9. Дои:10,1038 / нг.3559. ЧВК 4884158. PMID 27111036. В прошлом другие гаплогруппы, включая NO (M214) и K2e, также были идентифицированы с именем «K2a».
^ Гаплогруппа K2b (M1221 / P331 / PF5911) также известна как MPS гаплогруппы.
^ Гаплогруппа K2e (K-M147) ранее была известна как «гаплогруппа X» и «K2a» (но является дочерней субкладой нынешней K2a).
^ K-M2313 *, у которого пока нет филогенетического названия, был зарегистрирован у двух живых людей, имеющих этнические связи с Индией и Юго-Восточной Азией. Кроме того, K-Y28299, который, по-видимому, является основной ветвью K-M2313, был обнаружен у трех живых людей из Индии. См .: Позник op. соч.; YFull YTree v5.08, 2017, «К-М2335», и; Филодерево, 2017, «Детали маркеров Y-SNP, включенных в минимальное дерево Y» (Дата доступа к этим страницам: 9 декабря 2017 г.)
^ Гаплогруппа K2b1 (P397 / P399) также известна как гаплогруппа MS, но имеет более широкую и сложную внутреннюю структуру.
^ Гаплогруппа P (P295) также известна как K2b2.
^ Гаплогруппа S с 2017 года также известна как K2b1a. (Ранее имя Гаплогруппа S было присвоено K2b1a4.)
^ Гаплогруппа M, по состоянию на 2017 год, также известна как K2b1b. (Ранее имя Гаплогруппа M было присвоено K2b1d.)

использованная литература

^ M. Rasmussen et al. Геном человека позднего плейстоцена из могильника Хлодвига в западной Монтане // Природа. 2014. Т. 506. С. 225–229.
^ Дженнифер А. Рафф и Дебора А. Болник. Палеогеномика: генетические корни первых американцев // Природа. 2014. Т. 506. С. 162–163.
^ Кивисилд, Тоомас (2017-03-04). «Изучение вариации Y-хромосомы человека с помощью древней ДНК». Генетика человека. Springer Nature. 136 (5): 529–546. Дои:10.1007 / s00439-017-1773-z. ISSN 0340-6717. ЧВК 5418327. PMID 28260210.
^ Кивисилд, Тоомас (2017-03-04). «Изучение вариации Y-хромосомы человека с помощью древней ДНК». Генетика человека. Springer Nature. 136 (5): 529–546. Дои:10.1007 / s00439-017-1773-z. ISSN 0340-6717. ЧВК 5418327. PMID 28260210.
^ https://yfull.com/tree/Q-L804/
^ Карафет, Татьяна М .; Осипова, Людмила П .; Савина, Ольга В .; Hallmark, Брайан; Хаммер, Майкл Ф. (2018). «Сибирское генетическое разнообразие свидетельствует о сложном происхождении самодоязычных популяций». Американский журнал биологии человека. Вайли. 30 (6): e23194. Дои:10.1002 / ajhb.23194. ISSN 1042-0533. PMID 30408262.
^ Пинотти, Томаз; Бергстрём, Андерс; Гепперт, Мария; Баун, Мэтт; Охаси, Доминик; Ши, Вентао; Lacerda, Daniela R .; Солли, Арне; Норстедт, Якоб; Рид, Кейт; Доутри, Ким; Гонсалес-Андраде, Фабрицио; Пас-и-Миньо, Сезар; Револло, Сусана; Куэльяр, Синтия; Jota, Marilza S .; Сантос, Хосе Э .; Аюб, Касим; Кивисилд, Тоомас; Sandoval, José R .; Фуджита, Рикардо; Сюэ, Яли; Роуэр, Лутц; Santos, Fabrício R .; Тайлер-Смит, Крис (2018). «Последовательности Y-хромосомы показывают кратковременный берингийский застой, быстрое расширение и раннюю популяционную структуру коренных американцев-основателей». Текущая биология. Elsevier BV. 29 (1): 149–157.e3. Дои:10.1016 / j.cub.2018.11.029. ISSN 0960-9822. PMID 30581024.

внешние ссылки

Проект Y-ДНК гаплогруппы Q

[vanOven2014-8] Ван Овен М., Ван Гейстелен А., Кайзер М., Декорте Р., Larmuseau HD (2014). «Видеть лес за деревьями: минимальная эталонная филогения Y-хромосомы человека». Человеческая мутация. 35 (2): 187–91. Дои:10.1002 / humu.22468. PMID 24166809.

[ISOGG2015-9] Международное общество генетической генеалогии (ISOGG; 2015), Дерево гаплогруппы Y-ДНК 2015. (Дата обращения: 1 февраля 2015 г.)

[A0-T-10] Гаплогруппа A0-T также известна как A-L1085 (а ранее как A0'1'2'3'4).

[A1-11] Гаплогруппа A1 также известна как A1'2'3'4.

[LT-12] Гаплогруппа LT (L298 / P326) также известна как гаплогруппа K1.

[K2-13] С 2002 по 2008 гг. Гаплогруппа T-M184 была известна как «Гаплогруппа К2». С тех пор это имя было изменено на K-M526, брат Haplogroup LT.

[K2a-14] Гаплогруппа K2a (M2308) и ее первичный субклад K-M2313 были отделены от гаплогруппы NO (F549) в 2016 году (это последовало за публикацией: Позник Г.Д., Сюэ У., Мендес Ф.Л. и др. (2016). «Прерывистые всплески в демографии мужчин-мужчин на основе 1244 всемирных последовательностей Y-хромосомы». Природа Генетика. 48 (6): 593–9. Дои:10,1038 / нг.3559. ЧВК 4884158. PMID 27111036. В прошлом другие гаплогруппы, включая NO (M214) и K2e, также были идентифицированы с именем «K2a».

[K2b-15] Гаплогруппа K2b (M1221 / P331 / PF5911) также известна как MPS гаплогруппы.

[K2e-16] Гаплогруппа K2e (K-M147) ранее была известна как «гаплогруппа X» и «K2a» (но является дочерней субкладой нынешней K2a).

[K-M2313-17] K-M2313 *, у которого пока нет филогенетического названия, был зарегистрирован у двух живых людей, имеющих этнические связи с Индией и Юго-Восточной Азией. Кроме того, K-Y28299, который, по-видимому, является основной ветвью K-M2313, был обнаружен у трех живых людей из Индии. См .: Позник op. соч.; YFull YTree v5.08, 2017, «К-М2335», и; Филодерево, 2017, «Детали маркеров Y-SNP, включенных в минимальное дерево Y» (Дата доступа к этим страницам: 9 декабря 2017 г.)

[K2b1-18] Гаплогруппа K2b1 (P397 / P399) также известна как гаплогруппа MS, но имеет более широкую и сложную внутреннюю структуру.

[P-19] Гаплогруппа P (P295) также известна как K2b2.

[S-20] Гаплогруппа S с 2017 года также известна как K2b1a. (Ранее имя Гаплогруппа S было присвоено K2b1a4.)

[M-21] Гаплогруппа M, по состоянию на 2017 год, также известна как K2b1b. (Ранее имя Гаплогруппа M было присвоено K2b1d.)

[1] M. Rasmussen et al. Геном человека позднего плейстоцена из могильника Хлодвига в западной Монтане // Природа. 2014. Т. 506. С. 225–229.

[2] Дженнифер А. Рафф и Дебора А. Болник. Палеогеномика: генетические корни первых американцев // Природа. 2014. Т. 506. С. 162–163.

[Kivisild_pp._529–546-3] Кивисилд, Тоомас (2017-03-04). «Изучение вариации Y-хромосомы человека с помощью древней ДНК». Генетика человека. Springer Nature. 136 (5): 529–546. Дои:10.1007 / s00439-017-1773-z. ISSN 0340-6717. ЧВК 5418327. PMID 28260210.

[Kivisild2017-4] Кивисилд, Тоомас (2017-03-04). «Изучение вариации Y-хромосомы человека с помощью древней ДНК». Генетика человека. Springer Nature. 136 (5): 529–546. Дои:10.1007 / s00439-017-1773-z. ISSN 0340-6717. ЧВК 5418327. PMID 28260210.

[5] ttps://yfull.com/tree/Q-L804/

[Karafet_Osipova_Savina_Hallmark_2018_p=e23194-6] Карафет, Татьяна М .; Осипова, Людмила П .; Савина, Ольга В .; Hallmark, Брайан; Хаммер, Майкл Ф. (2018). «Сибирское генетическое разнообразие свидетельствует о сложном происхождении самодоязычных популяций». Американский журнал биологии человека. Вайли. 30 (6): e23194. Дои:10.1002 / ajhb.23194. ISSN 1042-0533. PMID 30408262.

[Pinotti_Tyler-Smith_2018-7] Пинотти, Томаз; Бергстрём, Андерс; Гепперт, Мария; Баун, Мэтт; Охаси, Доминик; Ши, Вентао; Lacerda, Daniela R .; Солли, Арне; Норстедт, Якоб; Рид, Кейт; Доутри, Ким; Гонсалес-Андраде, Фабрицио; Пас-и-Миньо, Сезар; Револло, Сусана; Куэльяр, Синтия; Jota, Marilza S .; Сантос, Хосе Э .; Аюб, Касим; Кивисилд, Тоомас; Sandoval, José R .; Фуджита, Рикардо; Сюэ, Яли; Роуэр, Лутц; Santos, Fabrício R .; Тайлер-Смит, Крис (2018). «Последовательности Y-хромосомы показывают кратковременный берингийский застой, быстрое расширение и раннюю популяционную структуру коренных американцев-основателей». Текущая биология. Elsevier BV. 29 (1): 149–157.e3. Дои:10.1016 / j.cub.2018.11.029. ISSN 0960-9822. PMID 30581024.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[χ 1]

[χ 2]

[χ 3]

[χ 4]

[χ 5]

[χ 6]

[χ 7]

[χ 8]

[χ 9]

[χ 10]

[χ 11]

[χ 12]

[χ 13]

[χ 14]