Гаплогруппа G-M201 - Haplogroup G-M201 - Wikipedia

Эта статья о гаплогруппе Y-ДНК человека. Для гаплогруппы мтДНК человека см. Гаплогруппа G (мтДНК).
Гаплогруппа G
Гаплогруппа G (ADN-Y) .PNG
Возможное время происхожденияболее 48 500 лет до настоящего[1]
Возможное место происхожденияЗападная Азия[2]
ПредокГаплогруппа GHIJK
Потомкиначальный: G1, G2
Определение мутацийM201, PF2957, L116, L154, L204, L240, L269, L402, L520, L521, L522, L523, L605, L769, L770, L836, L837, M201, P257 / U6, Страница94 / U17, U2, U3, U7, U12, U20, U21, U23, U33

Гаплогруппа G (M201) человек Y-хромосома гаплогруппа. Это одна из двух ветвей родительской гаплогруппа GHIJK, другое существо HIJK.

На уровне национального населения G-M201 чаще всего встречается в Грузия; он обнаруживается на еще более высоких уровнях среди многих других региональных групп и меньшинств в Кавказ. G-M201 также широко распространен на низких частотах среди этнических групп Европа, Южная Азия, Центральная Азия, и Северная Африка.

Считается, что G-M201 возник в Западная Азия,[2] только один образец базальный G * или парагруппа G (xG1, G2) - то есть G * или иным образом недокументированный первичный субклад - известен: образец крови, взятый у человека, казненного на гильотина вовремя французская революция.[3] (См. "Историческое присутствие "раздел ниже для получения дополнительной информации.)

Наиболее часто встречающиеся субклады являются G1 * (M285) и многие субклады G2 (G-P287), особенно: G2a (P15), G2a1 (G-FGC7535, ранее G-L293), G2a2b2a (G-P303) ранее G2a3b1); G2a2b1 (G-M406) ранее G2a3a; G2a2b2a1 (G-L140) ранее G2a3b1a; G2a2b2a1a1b (G-L497) ранее G2a3b1a2; G2a2b2a1a1a1 (G-L13) ранее G2a3b1a1a; G2a2b2a1a1c1a (G-CTS5990 или G-Z1903) ранее G2a3b1a3; G2b (G-M3115) и; G2b1 (G-M377), ранее G2b.

Происхождение

Были предложены различные предполагаемые даты и места происхождения G-M201, большинство из которых Западная Азия[2]

В 2012 году в статье Siiri Rootsi et al. предположил, что: "По нашим оценкам, географическое происхождение гаплогруппы G вероятно находится где-то поблизости восточного Анатолия, Армения или западный Иран."[4]

Ранее Национальное географическое общество разместил свое происхождение на Ближнем Востоке 30 000 лет назад и предполагает, что люди, несущие гаплогруппу, принимали участие в распространении Неолит.[5]

Две научные статьи также предполагают происхождение с Ближнего Востока, но различаются по дате. Semino et al. (2000) предположили 17000 лет назад.[6] Cinnioglu et al. (2004) предположили, что мутация произошла всего 9 500 лет назад.[7]

Также упоминалось более восточное происхождение, которое, по мнению некоторых, происходит из области, близкой к предгорьям Гималаев.[8]

Структура

G * (M201)

  • G1 (M285, M342)
    • G1a (P20.1, P20.2, P20.3)
      • G1a1 (L201, L202, L203)
    • G1b (L830, L831, L832, L834, L835)
  • G2 (P287)
    • G2a (P15, U5, L31 / S149, L149)
      • G2a1 (L293^)
        • G2a1a (P16.1, P16.2)
          • G2a1a1 (P18.1, P18.2, P18.3)
      • G2a2 (L223^)
        • G2a2a (M286)
        • G2a2b (L91)
          • G2a2b1 (L166, L167)
      • G2a3 (L30 / S126, L32 / S148, L190 / M485)
        • G2a3a (M406)
          • G2a3a1 (L14 / Page57 / S130 / U16, L90 / S133)
          • G2a3a2 (L645)
        • G2a3b (L141.1)
          • G2a3b1 (P303 / S135)
            • G2a3b1a (L140)
              • G2a3b1a1 (U1)
                • G2a3b1a1a (L13 / S131 / U13, L78 / M527)
                  • G2a3b1a1a1 (L1263^)
                • G2a3b1a1b (L1266^)
                  • G2a3b1a1b1 (L1264^, L1265^, L1268^)
              • G2a3b1a2 (L497, L353.1^, L353.2^)
                • G2a3b1a2a (Z725^)
                  • G2a3b1a2a1 (L43 / S147)
                    • G2a3b1a2a1a (L42 / S146)
              • G2a3b1a3 (Z1903^)
                • G2a3b1a3a (Z724^)
                  • G2a3b1a3a1 (L640)
              • G2a3b1a4 (L660, L662)
            • G2a3b1b (L694)
          • G2a3b2 (L177.1, L177.2, L177.3)
    • G2b (M377, L72, L183)
      • G2b1 (M283)

(Субклады здесь соответствуют определениям SNP Y-ДНК, используемым ISOGG В 2012 году несколько категорий, обнаруженных только у одного человека в исследованиях, были удалены из дерева ISOGG, что вызвало некоторое переименование.)

Географическое распространение

Доисторическое присутствие

Древние G-M201 с секвенированием[самостоятельно опубликованный источник? ]Гаплогруппа G2a (G-P15) была обнаружена в человеческих останках эпохи неолита в Европе, датируемых между 5000 и 3000 годами до нашей эры. Эти европейцы эпохи неолита были потомками неолитических фермеров из Анатолии, одними из первых в мире, кто занимался сельским хозяйством. G-M201 также был обнаружен в неолитических анатолийских памятниках, таких как Бончуклу, датируемых 8300-7600 гг. До н.э., и Барчин, датируемыми 6419-6238 гг. До н.э.[9][10]

Более того, большинство мужских скелетов из Европейский неолит периода до сих пор дали Y-ДНК, принадлежащую этой гаплогруппе. Самые старые скелеты подтверждены древняя ДНК тестирование как носителей гаплогруппы G2a было обнаружено пятью в Пещера Авелланер место захоронения, рядом Les Planes d'Hostoles, в Каталония, Испания и были датированы радиоуглеродное датирование примерно до 5000 г. до н.э.[11]

Скелет, найденный на неолитическом кладбище, известном как Деренбург Мееренштиг II, в Саксония-Анхальт Германия, очевидно, принадлежал G2a3 (G-S126) или субкладу. В нем были найдены погребальные артефакты, принадлежащие Linearbandkeramische Kultur ("Линейная ленточная керамическая культура "; LBK). Этот скелет не мог быть датирован радиоуглеродным методом, но другие скелеты были датированы между 5100 и 6100 годами. Наиболее детально идентифицированная мутация SNP была S126 (L30), которая определяет G2a3.[12]

G2a был обнаружен также в 20 из 22 образцов древней Y-ДНК из Treilles, типовая стоянка поздненеолитической группы земледельцев на юге Франция, датируемые примерно 5000 лет назад.[13] Четвертый объект того же периода - Эцталь Итальянские Альпы где мумифицированные останки Эци-ледяной человек были обнаружены. Iceman принадлежит к гаплогруппе G2a2b [14] (ранее назывался G2a4).

Гаплогруппа G2a2b - сегодня редкая группа в Европе. Авторы испанского исследования указали, что мужчины Авельянера имели редкие значения маркеров при тестировании их короткий тандемный повтор (STR) маркеры.

Современное присутствие

Основная статья: Гаплогруппа G (Y-ДНК) по странам

В Россия, Украина и Средняя Азия, представители различных этнических меньшинств и / или жители определенных населенных пунктов обладают G-M201 на самом высоком уровне в мире - даже при том, что средний уровень на национальном уровне составляет около 1% или меньше. В Маджар и Аргын племена (или кланы) Казахстан были обнаружены самые высокие уровни G-M201 среди любой современной этнической группы. Среди маджаров, G1 было найдено на уровне 87%. Отдельное исследование аргынов показало, что 71% мужчин принадлежат к G1. В России Северный Кавказ в Кабардинский и осетинский популяции также отличаются высоким уровнем G-M201. Дигора, Северная Осетия имеет самую высокую известную концентрацию G в одном городе, так как 74% протестированных мужчин были G.[15] Гаплогруппа G встречается в небольших процентах на востоке, в северном Китае, тогда как G может достигать более значительных процентов в группах меньшинств, таких как уйгуры.

В Турция, Южный Кавказ и Иран, гаплогруппа G достигает наивысшего процента населения страны. Среди турецкий мужчины 11% населения составляют G.[7] В Иране гаплогруппа G достигает от 13 до 15% населения в различных частях страны. Хотя он встречается в процентах выше 10% среди Бахтиари, Талышский народ, Гилаки, Мазандарани и Иранские азербайджанцы, среди иранских Арабов и в некоторых крупных городах.[16] Среди выборок в базе данных YHRD из стран Южного Кавказа 29% выборок из Абазиния, 31% от Грузия, 2% от Азербайджан и 18% от Армения кажутся образцами G.

В Европа к западу от Черное море Гаплогруппа G встречается в среднем у 5% населения на большей части континента.[17] Концентрация G падает ниже этого среднего в Скандинавия, самый западный бывший Советский республики и Польша, а также в Исландия и Британские острова. В Европе есть кажущиеся очаги необычной концентрации. В Уэльс, здесь доминирует характерный тип G2a3b1 (DYS388 = 13 и DYS594 = 11), который увеличивает процент G населения выше, чем в Англии.

в Тироль (Тироль) западной Австрия процентное содержание G-M201 может достигать 40% и более; пожалуй, самый известный пример - древние останки так называемого «Ледяного человека», Эци. В северных и высокогорных районах о. Сардиния от западного Италия, G процентов достигает 11% населения в одном исследовании[18] и достигла 21% в г. Темпио в другом исследовании. На греческом острове Крит, примерно 7%[19] до 11%[20] мужчин принадлежат к гаплогруппе G. На северо-востоке Хорватия, в городе Осиек, G был обнаружен у 14% мужчин.[21] Город на берегу реки Драва, которая, в частности, начинается в регионе Тироль / Тироль в Альпах, еще одной области гаплогруппы G в Европе. Дальше на север было обнаружено, что 8% этнических венгров мужчин и 5,1% этнических чешских (чешских) мужчин принадлежат к гаплогруппе G.

В Южная Азия, некоторые этнические меньшинства обладают гаплогруппой G в концентрации примерно 18%[22] до 20%[23] из Калаш, примерно 16% Брахуи,[23] и примерно 11,5% отобранных Пуштун,[22] но только около 3% от общего Пакистанский численность населения.[22] Многие группы в Индия и Бангладеш не были хорошо изучены. Около 6% образцов из Шри-Ланка и Малайзия были зарегистрированы как гаплогруппа G, но не были обнаружены в других прибрежных землях Индийский океан или же Тихий океан в Азии.[24]

в Средний Восток, гаплогруппа G составляет около 3% населения практически во всех областях.[25][26] Среди Друзы в основном жители Израиль 10% оказались гаплогруппой G.[27]

Около 10% Еврейский мужчины гаплогруппы G.[нужна цитата ]

В Африка, гаплогруппа G редко встречается в К югу от Сахары или к югу от Африканский рог среди коренного населения. В Египет, исследования предоставили информацию, согласно которой процент G составляет от 2% до 9%.[28][29][30] 3% Северной Африки Берберы оказались гаплогруппой G.[31] 2% арабского Марокканцы и 8% берберских марокканцев также оказались G.[32]

в Америка, процент гаплогруппы G соответствует количеству эмигрировавших из стран Старого Света. Не встречается среди Коренные американцы за исключением смешанных браков с лицами, не являющимися коренными жителями. Он был найден у мексиканских метисов.

G1 (M285 или M342)

Основная статья: Гаплогруппа G1 (Y-ДНК)

Почти все люди гаплогруппы G1 имеют значение 12 при короткий тандемный повтор (STR) маркер DYS392, и все будут иметь M285 или M342 SNP мутация, которая характеризует эту группу. Это значение 12 необычно для других категорий G, кроме G1.

субклады G1a, G1a1, G1b существуют.

Самая высокая зарегистрированная концентрация G1 и его субкладов в отдельной стране находится в Иран, со следующей по частоте концентрации в соседних странах на западе.

Есть отличительные Ашкенази Еврейский и Казахский субклады на основе комбинаций значений маркеров STR.

G2 (P287)

Мужчины, которые принадлежат к этой группе, но отрицательны для всех субкладов G2, представляют небольшое количество мужчин гаплогруппы G. P287 был идентифицирован на Университет Аризоны и получил широкую известность в конце 2007 года. Его идентификация повлекла за собой значительное переименование категорий G.

G2a (P15)

Мужчины гаплогруппы G, принадлежащие к этой группе, но отрицательные для всех субкладов G2a, не распространены в Европе, но могут представлять значительную группу в пока плохо протестированных районах к востоку от Турции. P15 был идентифицирован на Университет Аризоны и стал широко известен к 2002 году. Его хромосома была указана как 21653414. G2a был обнаружен в средневековых останках в высокостатусной гробнице VII века н.э. в Эргольдинге, Бавария, Германия, но субклады G2a не тестировались.[33]

Есть несколько SNP, которые пока имеют такое же покрытие, что и P15. Это - с соответствующими положениями Y-хромосомы - U5 (rs2178500), L149 (8486380) и L31 (также называемые S149) (rs35617575..12538148). Если какой-либо мужчина с мутацией P15 окажется отрицательным (наследственным) на какой-либо из них, или наоборот, это открытие станет основой новой категории G2a.

G2a1 (FGC7535)

Основная статья: Гаплогруппа G-FGC7535

Гаплогруппа G2a1 (также известная как G-FGC753 и ранее как G-L293) и ее субклады представляют большинство образцов гаплогруппы G в некоторых частях Кавказские горы площадь. В других местах они встречаются только в крошечных количествах. Пока все люди G2a1 имеют значение 10 при STR маркер DYS392. Люди G2a1a также обычно имеют более высокие значения для DYS385b, такие как 16, 17 или 18, чем у большинства людей G.

Северные осетины в районе Среднего Северного Кавказа Россия в подавляющем большинстве принадлежат субкладу G2a1 на основе имеющихся образцов. Южные Осетины и Сваны в целом к ​​югу от Северной Осетии проживает значительное количество лиц G2a1, но процентное соотношение населения еще не предоставлено.

Наличие мутации SNP P18 характеризует единственный субклад G2a1a, G2a1a. Надежность как P16, так и P18 в идентификации каждого в каждой из этих категорий была поставлена ​​под сомнение, и необходимо изучить отдельные компоненты SNP.

Ашкенази Еврейские мужчины G2a1a северо-восточного европейского происхождения образуют отдельный кластер, основанный на значениях маркеров STR. Мужчины с Кавказа и мужчины из Восточной Европы также образуют отличительные группы STR.

G2a2a (PF3147)

G-PF3147 (ранее G-L223 и G-PF3146) характеризуется наличием мутации L223. L223 обнаружен на Y-хромосоме в rs810801 и 6405148 с мутацией от C до G. L223 впервые был идентифицирован в образцах на 23andMe в 2009 году, но оказалось проблематичным как индивидуальное испытание, первые успешные результаты были сообщены на Семейное древо ДНК в конце 2011 года под присвоенным ему лейблом L223. Затем стало известно, что к L223 принадлежат три следующих субклада:

Субклад G2a2a (M286) крошечный. Были идентифицированы образцы, указывающие на британские острова, турецкое и ливанское происхождение. Британские образцы во многих случаях имеют противоречивые двойные значения для STR-маркера DYS19. M286 был впервые обнаружен в Стэндфордский Университет в положении 21151187 хромосомы и представляет собой мутацию от G до A.

G2a2b (G-L91) был идентифицирован в 2009 году. В его состав входят "Эци ", так называемый Ледяной человек, умерший не менее 5000 лет назад. BP в европейских Альпах. G2a2b, по-видимому, охватывает значительную часть мужчин, принадлежащих к G. L91 до сих пор встречается в отдельных частях Европы и Северной Африки, а также в других странах. Армения. В группу G2a2b включены некоторые мужчины с двойными значениями маркера STR DYS19, но есть также мужчины из группы G2a2 с этим результатом, которые не принадлежат к группе G2a2b. Ситуация с двойным значением 19 не наблюдается в субкладах G2a1 и G2a3. Мутация L91 обнаружена в 21327383 и rs35474563 на Y-хромосоме. Передний праймер GTATTGAACTTACAATTCACGTCCC, и обратное CTCTCCAAATCGGGTTTCCT. Мутация включает изменение с C на T.[нужна цитата ] L223 находится на Y-хромосоме по адресу rs13304806.

SNP L293, который характеризует субклад G2a2c, был идентифицирован в июне 2010 года в Family Tree DNA. Он включает небольшую группу латиноамериканских мужчин, у которых на данный момент коэффициент нечетности составляет 13,21 по маркеру YCA. Мутация обнаружена на Y-хромосоме по адресу 10595022 и представляет собой изменение с G на C.

G2a2b (L30, PF3267, S126, U8)

G-L30 (также G-PF3267, G-S126 или G-U8; G2a2b, ранее G2a3) Мужчины, которые принадлежат к этой группе, но отрицательны для всех ее субкладов, составляют сегодня небольшое число. Эта гаплогруппа была обнаружена в скелете эпохи неолита примерно 5000 г. до н.э. на кладбище Деренбург-Мееренштиг II, Германия, которое является частью Линейная гончарная культура, известный на немецком языке как Linearbandkeramik (LBK),[12] но не тестировался на субкладах G2a3.

G2a2b1 (M406)

Основная статья: Гаплогруппа G-M406

G-M406 * (G2a2b1 *; ранее G2a3a *) и его субклады чаще всего встречаются в индюк и прибрежные районы восточного Средиземноморья, где он может составлять до 5% всех марок и 50% образцов гаплогруппы G. G2a3a чаще встречается в Южной Европе, чем в Северной Европе. В Европе - кроме Италия - G2a3a составляет менее 20% выборок G. G2a3a до сих пор редко всплывал на поверхность в Северной Африке или Южной Азии, но составляет небольшой процент населения G в регионе Кавказских гор и в других регионах. Иран.

Относительно высокий процент людей G2a3a имеет значение 21 по STR-маркеру DYS390. Маркер DYS391 в основном имеет значение 10, но иногда и 11 у людей с G2a3a, а DYS392 почти всегда равно 11. Если образец соответствует критериям, указанным для этих трех маркеров, вероятно, это G2a3a.

У G2a3a есть два известных субклада. Оба относительно распространены среди людей G2a3a.

G2a2b2 (CTS2488)

G-CTS2488 или G2a2b2 (также известный как G-L141.1; ранее G-141 и G2a3b) был идентифицирован только в середине 2009 г. Семейное древо ДНК. Почти все мужчины L141 принадлежат к субкладам L141. Были идентифицированы образцы людей с Британскими островами, сицилийского и турецкого происхождения. Лица L141, которые пока не принадлежат ни к одному из субкладов L141, имеют значение 11 по STR-маркеру DYS490 - находка, редкая для других категорий G. Мутация L141 обнаружена на Y-хромосоме по адресу 2948607. Мутация L141 включает в себя вставку.[34]

G2a2b2a (G-P303)

Основная статья: Гаплогруппа G-P303

G-P303 *, также известный как G2a2b2a * (ранее G2a3b1 *), и его субклады теперь сосредоточены в южных Россия и Кавказ, а также, на более низких уровнях, в других частях Европы и Юго-Западная Азия, особенно регион, включающий Турцию, Иран и Ближний Восток, где мог возникнуть G2a2b2a. G2a2b2a также встречается в Индии.

Большинство членов G-P303 принадлежат к одному из его субкладов, а не к G-P303 *.

Самый большой субклад G-P303 *, основанный на доступных выборках, - это субклад, в котором почти все люди имеют значение 13 по STR-маркеру DYS388. SNP L497 охватывает этих мужчин, но большинство мужчин G-L497 принадлежат к его субкладу G-Z725, также известному как G-DYS388 = 13. Существуют дополнительные субклады DYS388 = 13 мужчин, для которых характерно наличие специфических SNP или необычных маркеров STR. Члены этой группы были найдены в Европа и Средний Восток.[4]

Следующий по величине субклад G-P303 характеризуется наличием мутации U1. Но высокий процент мужчин U1 принадлежит к двум его субкладам, G-L13 / S13 и Z1266 (G2a3b1a1b). Субклад G-L13 наиболее распространен в северной части центральной Европы, а G-Z1266 наиболее распространен в горах западного Кавказа.

Последний основной субклад характеризуется наличием SNP Z1903 и значением 9 на маркере DYS568. Большой процент мужчин G-Z1903 принадлежит к его субкладу, G-Z724. Субклад G-Z724 содержит еще один большой субклад, состоящий преимущественно из Евреи ашкенази.[нужна цитата ]

Наибольший процент лиц G-P303 в дискретной популяции, описанной до сих пор, находится на острове Ибица у восточного побережья Испании. Эта группа была связана с Криптоеврейский население, которое бежало на остров во время испанская инквизиция, значительная часть которых идентифицируется как G-Z725 (DYS388 = 13).[35]

G2a2b2b (PF3359)

G-PF3359 (или G2a2b2b; ранее G2a3b2) был известен до 2013 года как G-L177. SNP L177 (он же L1771.1 / L177_1, L1771.2 / L177_2, L177.3 / L177_3) был отозван в качестве идентификатора ISOGG в 2013 году, после того как было «признано ненадежным палиндромным snp».[2][36]

Древняя ДНК, идентифицированная как G-PF3359, была обнаружена на археологических раскопках в: Венгрии (субклад G-F872 *), датируемой 7500 годами до настоящего времени (BP); Венгрия (субклад G-F1193 *) 7 150 лет назад, и; Испания (G-PF3359 *) 4700 лет назад.[2]

Члены G-PF3359, вероятно, меньше по численности, чем мужчины, включенные в G-P303, но только небольшое количество тестов было проведено на предмет соответствующих мутаций. Пока что мужчины, положительно относящиеся к этому, имели ирландское, английское, голландское, ливанское и / или турецкое (армянская фамилия) происхождение. Вероятно, существует несколько субкладов G-PF3359, основанных на общих маркерах STR.

Количество значений маркеров STR, разделяющих мужчин в этой группе, предполагает, что G-PF3359 является относительно старой группой, несмотря на небольшое количество вовлеченных мужчин.[37] Связанные с этим мутации могут быть сложными и трудными для интерпретации.

G2b1 (M377)

Основная статья: Гаплогруппа G-M377 (Y-ДНК)

G-M377, теперь также известный как G2b1, ранее назывался G2b и G2c. Клода близкородственных Евреи ашкенази представляют практически все G2b человек, только с тремя другими гаплотипами G2b, о которых сообщалось до сих пор: один Турок из Карс на северо-востоке Турции около Армении, один Пуштун, и один Burusho в Пакистане.

Чрезвычайная редкость G-M377 в северном Пакистане может указывать на то, что G2b в этой области происходит за пределами региона и был доставлен туда в исторический период, возможно, с дальнего запада (Пакистан был частью обеих стран. Ахеменидов Персидская империя, завоеванный Александр Великий, а затем вошли в состав Греко-Бактрийское царство ). Эти два сообщенных пакистанских гаплотипа G-M377 весьма расходятся с еврейской ашкеназской кладой и, следовательно, вовсе не указывают на недавнее общее происхождение. Турецкий G-M377 несколько ближе, но не идентичен. Еще неизвестно, выявит ли тестирование гаплотипы G-M377 в других популяциях - это некоторый признак того, что G-M377 встречается на низких уровнях на Ближнем Востоке.

Все протестированные на данный момент мужчины G-M377 также имеют редкое нулевое значение для DYS425 маркер, (отсутствующий аллель "Т" палиндромного гена DYS371 STR ), результат RecLOH событие, находка, еще не наблюдаемая среди большинства других гаплотипов G. Согласно одному исследованию, среди евреев в Израиле, прибывших из многих регионов мира, G-M377 составил 3,7%.[38]

Гаплогруппа G-M377 была обнаружена с частотой 60% среди пяти пуштунов в регионе Вардак в Афганистане. Вероятно, это связано с эффектом местного основателя.[39]

Определение SNP

В Международное общество генетической генеалогии (ISOGG) поддерживает самую последнюю согласованную версию категорий гаплогрупп.[40] Эти классификации основаны на общих мутациях SNP. Открытие новых SNP может привести к присвоению новых имен категориям гаплогрупп. До 2008 года, когда были внесены существенные изменения в категории, было всего несколько категорий G. Еще больше G SNP было идентифицировано с 2009 по 2012 год, что привело к большему количеству изменений. До 2008 г. о новых G SNP сообщалось из лабораторий Университет Аризоны (Обозначения P), Стэндфордский Университет (Обозначения M) или Университет Центральной Флориды (Обозначения U). Начиная с 2008 г., дополнительные G SNP были идентифицированы в Семейное древо ДНК (Обозначения L) и этноанцестрии (обозначения S). Эти последние лаборатории также использовали результаты необработанных данных, сообщенные людьми, протестированными примерно на 2000 SNP в 23andMe для предоставления новых тестов SNP с обозначением L или S. В 2009-10 гг. В рамках проекта Family Tree DNA Walk through the Y, секвенирующего определенные сегменты Y-хромосомы, был получен ряд новых G SNP с обозначением L. В 2012 году SNP с обозначением Z, впервые идентифицированные гражданскими исследователями из Проект 1000 геномов данные начали появляться.

Поскольку SNP обеспечивают наиболее надежный метод категоризации, каждый может представлять официальную категорию G. В категориях чередуются буквы и цифры. Но необычные значения или необычные комбинации значений, обнаруженные на короткий тандемный повтор маркеры (STR) также могут служить основой для дополнительной систематизации. Идентификация нового SNP может потребовать переименования одной или нескольких категорий.

Мутация SNP M201, характеризующая гаплогруппу G, была идентифицирована на Стэндфордский Университет и впервые было сообщено в 2001 году.[41] Технические характеристики M201 представлены как: refSNPid is rs2032636 ..... Расположение Y-хромосомы 13536923 .... прямой праймер tatgcatttgttgagtatatgtc..... обратный праймер gttctgaatgaaagttcaaacg..... мутация включает изменение с G на T.

Номер SNP были идентифицированы с таким же охватом населения, как и M201. Поскольку M201 был идентифицирован первым, это стандартный тест SNP, используемый при тестировании для людей G. Чтобы определить, представляет ли один из этих альтернативных SNP субклад M201, альтернативные SNP должны быть протестированы на людях G, которые отрицательны для известных субкладов G. В такой категории лишь небольшое количество людей, и только небольшое количество людей было протестировано на G-эквивалентные SNP, отличные от M201.

Следующие SNP пока идентифицированы как эквиваленты M201: L116, L154, L269, L294, L240, P257, L402, L520, L521, L522, L523, L605, Страница 94, U2, U3, U6, U7, U12, U17, U20, U21, U23 и U33. Впервые о P257 было сообщено в 2008 году.[42] L240 был идентифицирован в 2009 году.[43] "U" SNP были идентифицированы в 2006 году, но не опубликованы до 2009 года.[44]

Кроме того, существует несколько других SNP, которые, как считается, имеют такое же покрытие, как M201. Они находятся по адресу: rs9786910, rs9786537, rs2713254, rs35567891 и rs34621155 на Y-хромосоме. Ни одна лаборатория еще не присвоила им сокращенные названия.

Выдающиеся члены G-M201

Смотрите также: Список генетических результатов, полученных от исторических личностей

Человек, известный как "Эци "- чьи останки датируются 4 тысячелетие до н. Э., были обнаружены на современной границе между Австрией и Италией - входит в состав G-L91 (G2a2b).

Многие члены так называемой Буре родство, а клан -подобная группа, которая ведет свое происхождение от человека, родившегося в Швеции в конце 14 или начале 15 века, как сообщается, принадлежит G-Y12970 (также известному как G-Y12971 и G-Z30735), также известному как G2a2b2a1a1b1a1a2a1c2a ~ (согласно 2017 г. ISOGG дерево; ранее G2a3b1a2).[2]

король Ричард III Англии, кто был эксгумирован в 2012 г., был участником G2 (G-P287).[45]

Иосиф Сталин (урожденный Иосеб Бесарионис дзе Джугашвили), согласно генетическому тесту одного из его внуков (Александр Бурдонский), был членом гаплогруппы Y-ДНК G2a1a (FGC595 / Z6553).[2][46] Другие мужчины, предположительно являющиеся членами гаплогруппы G, включают: немецко-американский пионер и солдат. Филипп Хэмман, Политик США Линн Бэнкс, физик Джон Г. Крамер, Американские актеры Джеймс Францискус и Джейк Джилленхол, Американский бывший профессиональный баскетболист Ларри Берд, Американский бизнесмен Наджиб Халаби и американский юрист и администратор Ньютон Миноу.[47]

Аль Капоне был американским гангстером и бизнесменом, который, по словам Geni.com, был членом гаплогруппы Y-ДНК G-P303.[48]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ "G YTree".
  2. ^ а б c d е ж грамм ISOGG, 2017 г., Y-ДНК Гаплогруппа G и ее субклады - 2017 (17 мая 2017 г.).
  3. ^ Larmuseau MH, Delorme P, Germain P, Vanderheyden N, Gilissen A, Van Geystelen A, Cassiman JJ, Decorte R (2014). «Генетическая генеалогия выявляет истинную гаплогруппу Y Дома Бурбонов, что противоречит недавней идентификации предполагаемых останков двух французских королей». Eur J Hum Genet. 22 (5): 681–7. Дои:10.1038 / ejhg.2013.211. ЧВК  3992573. PMID  24105374.
  4. ^ а б Рутси, Сиири; Майрес, Натали М; Лин, Алиса А; Ярве, Мари; Кинг, Рой Дж; Кутуев, Ильдус; Кабрера, Висенте М; Хуснутдинова, Эльза К; Варенди, Кярт; Саакян, Оганес; Бехар, Дорон М; Хусаинова, Рита; Балановский, Олег; Балановская, Елена; Рудан, Павао; Епископосян, Левон; Бахманимехр, Ардешир; Фарджадян, Ширин; Кушняревич Алена; Эррера, Рене Дж; Гругни, Альт; Батталья, Винченца; Ники, Кармела; Кробу, Франческа; Карачанак, Сена; Кашани, Бахарак Хушиар; Хушманд, Масуд; Санати, Мохаммад Х; Тончева, Драга; Лиза, Антонелла; Семино, Орнелла; Кьярони, Жак; Кристофаро, Джули Ди; Виллемс, Ричард; Кивисилд, Тоомас; Андерхилл, Питер А (16 мая 2012 г.). «Выявление родословных Y-хромосом гаплогруппы G в популяциях Европы и Кавказа». Европейский журнал генетики человека. 20 (12): 1275–1282. Дои:10.1038 / ejhg.2012.86. ЧВК  3499744. PMID  22588667.
  5. ^ Атлас путешествия человека: гаплогруппа G (M201) В архиве 2011-02-05 в Wayback Machine
  6. ^ Семино О, Пассарино Дж., Офнер П.Дж., Лин А.А., Арбузова С., Бекман Л.Э., Де Бенедиктис Дж., Франкалаччи П., Коуватси А., Лимборска С., Марсикиае М., Мика А., Мика Б., Приморак Д., Сантачиара-Бенерецетти А. Sforza LL, Андерхилл, Пенсильвания (ноябрь 2000 г.). «Генетическое наследие палеолита Homo sapiens sapiens у современных европейцев: перспектива Y-хромосомы». Наука. 290 (5494): 1155–9. Bibcode:2000Sci ... 290.1155S. Дои:10.1126 / наука.290.5494.1155. PMID  11073453.
  7. ^ а б Cinnioğlu C, et al. (Январь 2004 г.). «Раскопки гаплотипов Y-хромосомы в Анатолии». Генетика человека. 114 (2): 127–48. Дои:10.1007 / s00439-003-1031-4. PMID  14586639. S2CID  10763736.
  8. ^ Махал, Дэвид Дж .; Мацукас, Янис Г. (23 января 2018 г.). «Географическое происхождение этнических групп на Индийском субконтиненте: изучение древних следов с помощью гаплогрупп Y-ДНК». Границы генетики. 9: 4. Дои:10.3389 / fgene.2018.00004. ЧВК  5787057. PMID  29410676.
  9. ^ Фельдман, Михал; Фернандес-Домингес, Ева; Рейнольдс, Люк; Бэрд, Дуглас; Пирсон, Джессика; Гершковиц, Израиль; Мэй, Хила; Горинг-Моррис, Найджел; Бенц, Марион; Грески, Юлия; Bianco, Raffaela A .; Fairbairn, Эндрю; Мустафаоглу, Гекхан; Stockhammer, Philipp W .; Пост, Козимо; Хаак, Вольфганг; Чон, Чунгвон; Краузе, Йоханнес (19 марта 2019 г.). «Геном человека позднего плейстоцена предполагает местное происхождение первых фермеров из центральной Анатолии». Nature Communications. 10 (1): 1218. Bibcode:2019НатКо..10.1218F. Дои:10.1038 / s41467-019-09209-7. PMID  30890703. S2CID  83464300.
  10. ^ Хофманова, Зузана; Крейцер, Сюзанна; Хелленталь, Гарретт; Продам, Кристиан; Дикманн, Йоан; Диес-дель-Молино, Дэвид; Дорп, Люси ван; Лопес, Сайоа; Кусатанас, Афанасий; Линк, Вивиан; Кирсанов, Карола; Кэссиди, Лара М .; Мартиниано, Руи; Штробель, Мелани; Шой, Амели; Коцакис, Костас; Холстед, Пол; Триантафиллу, Севи; Кипариси-Апостолика, Нина; Урем-Коцоу, Душанка-Кристина; Зиота, Кристина; Адактылу, Фотини; Гопалан, Шьямалика; Бобо, Дин М .; Винкельбах, Лаура; Блёхер, Йенс; Унтерлендер, Мартина; Леуэнбергер, Кристоф; Ilingirolu, iler; Хорейс, Барбара; Герритсен, Фокке; Шеннан, Стивен; Брэдли, Дэниел Дж .; Куррат, Матиас; Veeramah, Krishna R .; Вегманн, Даниэль; Thomas, Mark G .; Папагеоргопулу, Кристина; Бургер, Иоахим (25 ноября 2015 г.). «Ранние земледельцы со всей Европы - прямые потомки Эгейского неолита» (PDF). bioRxiv: 032763. Дои:10.1101/032763. S2CID  196682085.
  11. ^ Лакан, Мари; Кейзер, Кристина; Рико, Франсуа-Ксавье; Брукато, Николас; Таррус, Хосеп; Босх, Ангел; Guilaine, Жан; Крабези, Эрик; Лудес, Бертран (8 ноября 2011 г.). «Древняя ДНК предполагает ведущую роль человека в распространении неолита». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 108 (45): 18255–18259. Bibcode:2011PNAS..10818255L. Дои:10.1073 / pnas.1113061108. ЧВК  3215063. PMID  22042855.
  12. ^ а б Хаак В., Балановский О., Санчес Дж. Дж., Кошель С., Запорожченко В., Адлер С. Джей, Дер Саркисян К. С., Брандт Дж., Шварц К., Никлиш Н., Дрезели В., Фритч Б., Балановска Е., Виллемс Р., Меллер Н., Альт К. В., Купер А (2010). Пенни Д. (ред.). «Древняя ДНК европейских фермеров эпохи раннего неолита показывает их близость к Ближнему Востоку». PLOS Биология. 8 (11): e1000536. Дои:10.1371 / journal.pbio.1000536. ЧВК  2976717. PMID  21085689.
  13. ^ Мари Лакан, Кристин Кейзер, Франсуа-Ксавье Рико, Николя Брукато, Фрэнсис Дюрантон, Жан Гилен, Эрик Крубези и Бертран Лудес, Древняя ДНК показывает распространение мужчин по неолитическому средиземноморскому маршруту. Труды Национальной академии наук США, онлайн 31 мая 2011 г. перед печатью.
  14. ^ Интервью д-р Эдуард Эгартер-Вигл, Руководитель отдела консервации и помощник исследовательских проектов Археологического музея в Бозене. Из документального фильма: «Ötzi, ein Archäologiekrimi» [Отци, археологическое преступление] Кристины Спрахманн. Телетрансляция на 3sat 10 августа 2011 и br-alpha 13 сентября 2011
  15. ^ Насидзе, Иван; Саркисян, Тамара; Керимов, Азер; Стоункинг, Марк (14 декабря 2002 г.). «Проверка гипотез языковой замены на Кавказе: данные по Y-хромосоме». Генетика человека. 112 (3): 255–261. Дои:10.1007 / s00439-002-0874-4. PMID  12596050. S2CID  13232436.
  16. ^ Насидзе И. и др. (2008). «Тесная генетическая связь между семитоязычными и индоевропейско-говорящими группами в Иране». Анналы генетики человека. 72 (Pt 2): 241–52. Дои:10.1111 / j.1469-1809.2007.00413.x. PMID  18205892. S2CID  5873833.
  17. ^ «G-Z7941 - Проект гаплогруппы G». google.com.
  18. ^ Zei G, et al. (2003). «От фамилий к истории Y-хромосомы: население Сардинии как парадигма». Европейский журнал генетики человека. 11 (10): 802–07. Дои:10.1038 / sj.ejhg.5201040. PMID  14512971.
  19. ^ Мартинес Л. и др. (Апрель 2007 г.). «Палеолитическое наследие Y-гаплогруппы преобладает на Критском высокогорном плато». Европейский журнал генетики человека. 15 (4): 485–93. Дои:10.1038 / sj.ejhg.5201769. PMID  17264870.
  20. ^ King RJ и др. (Март 2008 г.). «Дифференциальные анатолийские влияния Y-хромосомы на греческий и критский неолит». Анналы генетики человека. 72 (Pt 2): 205–14. Дои:10.1111 / j.1469-1809.2007.00414.x. PMID  18269686. S2CID  22406638.
  21. ^ Батталья, Винченца; Форнарино, Симона; Аль-Захери, Надия; Оливьери, Анна; Пала, Мария; Майрес, Натали М; Кинг, Рой Дж; Рутси, Сиири; Марьянович, Дамир; Приморак, Драган; Хадзиселимович, Рифат; Видович, Стойко; Дробник, Катя; Дурмиши, Насер; Торрони, Антонио; Сантачиара-Бенеречетти, Сильвана; Андерхилл, Питер А; Семино, Орнелла (24 декабря 2008 г.). «Y-хромосомное свидетельство культурного распространения сельского хозяйства в Юго-Восточной Европе». Европейский журнал генетики человека. 17 (6): 820–830. Дои:10.1038 / ejhg.2008.249. ЧВК  2947100. PMID  19107149.
  22. ^ а б c Firasat S, Khaliq S, Mohyuddin A, Papaioannou M, Tyler-Smith C, Underhill PA, Ayub Q (2006). «Y-хромосомные доказательства ограниченного вклада Греции в патанское население Пакистана». Европейский журнал генетики человека. 15 (1): 121–26. Дои:10.1038 / sj.ejhg.5201726. ЧВК  2588664. PMID  17047675.
  23. ^ а б Sengupta S, et al. (Февраль 2006 г.). «Полярность и временность распределений Y-хромосомы высокого разрешения в Индии позволяют идентифицировать как местные, так и экзогенные экспансии и выявить незначительное генетическое влияние среднеазиатских скотоводов». Американский журнал генетики человека. 78 (2): 202–21. Дои:10.1086/499411. ЧВК  1380230. PMID  16400607.
  24. ^ Hammer MF и др. (2006). «Двойное происхождение японцев: общая основа для Y-хромосом охотников-собирателей и фермеров». Журнал генетики человека. 51 (1): 47–58. Дои:10.1007 / s10038-005-0322-0. PMID  16328082.
  25. ^ Однако в Ливане G составляет 6,5% населения, а в Иране - около 10%. Флорес С. и др. (2005). «Изоляты в коридоре миграций: анализ вариации Y-хромосомы в Иордании с высоким разрешением». Журнал генетики человека. 50 (9): 435–41. Дои:10.1007 / s10038-005-0274-4. PMID  16142507.
  26. ^ Cadenas AM и др. (2008). «Хромосомное разнообразие характеризует Оманский залив». Европейский журнал генетики человека. 16 (3): 374–86. Дои:10.1038 / sj.ejhg.5201934. PMID  17928816.
  27. ^ Шлуш Л.И. и др. (2008). Геммелл, штат Нью-Джерси (ред.). "Друзы: популяционный генетический рефугиум Ближнего Востока". PLOS ONE. 3 (5): e2105. Bibcode:2008PLoSO ... 3.2105S. Дои:10.1371 / journal.pone.0002105. ЧВК  2324201. PMID  18461126.
  28. ^ Элизабет Т Вуд, Дарин Стовер, Кристофер Эрет и другие., "Контрастные модели вариаций Y-хромосомы и мтДНК в Африке: свидетельства предвзятых по полу демографических процессов", Европейский журнал генетики человека (2005) 13, 867–876. (см. Приложение A: Частоты гаплотипов Y-хромосомы)
  29. ^ Луис Дж. Р. и др. (2004). «Левант против Африканского Рога: свидетельства двунаправленных коридоров миграции людей». Американский журнал генетики человека. 74 (3): 532–44. Дои:10.1086/382286. ЧВК  1182266. PMID  14973781.
  30. ^ Эль-Сибай М., Платт Д.Е., Хабер М., Сюэ И., Юханна С.К., Уэллс Р.С., Изаабель Х., Саньюра М.Ф., Харманани Х., Бонаб М.А., Бехбехани Дж., Хашва Ф., Тайлер-Смит С., Заллуа ПА (2009). "Географическая структура Y-хромосомного генетического ландшафта Леванта: контраст прибрежных и внутренних районов". Анналы генетики человека. 73 (Pt6): 561–81. Дои:10.1111 / j.1469-1809.2009.00538.x. ЧВК  3312577. PMID  19686289.
  31. ^ Алонсо С., Флорес С., Кабрера В., Алонсо А., Мартин П., Альбарран С., Изагирре Н., де ла Руа С., Гарсия О. (2005). «Место басков в пейзаже европейского разнообразия Y-хромосомы». Европейский журнал генетики человека. 13 (12): 1293–1302. Дои:10.1038 / sj.ejhg.5201482. PMID  16094307.
  32. ^ Cruciani F, et al. (2002). «Обратная миграция из Азии в Африку к югу от Сахары подтверждается анализом гаплотипов Y-хромосомы человека с высоким разрешением». Американский журнал генетики человека. 70 (5): 1197–1214. Дои:10.1086/340257. ЧВК  447595. PMID  11910562.
  33. ^ Ванек Д., Саскова Л., Кох Н. (2009). "Анализ родства и Y-хромосомы останков человека 7-го века: новая процедура извлечения ДНК и типирования древних материалов". Хорватский медицинский журнал. 50 (3): 286–95. Дои:10.3325 / cmj.2009.50.286. ЧВК  2702742. PMID  19480023.
  34. ^ ymap.ftdna.com[постоянная мертвая ссылка ]
  35. ^ Adams SM, Bosch E, Balaresque PL, Ballereau SJ, Lee AC, Arroyo E, López-Parra AM, Aler M, Grifo MS, Brion M, Carracedo A, Lavinha J, Martínez-Jarreta B, Quintana-Murci L, Picornell A , Рамон М., Скорецкий К., Бехар Д.М., Калафель Ф., Джоблинг М.А. (декабрь 2008 г.). «Генетическое наследие религиозного разнообразия и нетерпимости: отцовские линии христиан, евреев и мусульман на Пиренейском полуострове». Американский журнал генетики человека. 83 (6): 725–36. Дои:10.1016 / j.ajhg.2008.11.007. ЧВК  2668061. PMID  19061982.
  36. ^ L177, позже отвергнутый в пользу PF3359 и эквивалентных SNP, был впервые идентифицирован в Семейное древо ДНК в 2009 г. Компонент L177.1 обнаружен в позиции Y-хромосомы 23397163; L177.2 при 25030912; L177.3 на 25750264. См .: http://ytree.ftdna.com/index.php?name=Draft&parent=20173662 В архиве 2010-10-18 на Wayback Machine .
  37. ^ "..Рестры проектов - Проект Гаплогруппа G". google.com.[мертвая ссылка ][самостоятельно опубликованный источник? ]
  38. ^ Hammer MF и др. (2009). «Расширенные гаплотипы Y-хромосомы определяют множественные и уникальные линии еврейского священства». Генетика человека. 126 (5): 707–17. Дои:10.1007 / s00439-009-0727-5. ЧВК  2771134. PMID  19669163.
  39. ^ Habe, M; и другие. (28 марта 2012 г.). «Этнические группы Афганистана разделяют наследие Y-хромосомы, структурированное историческими событиями». PLOS ONE. 7 (3): e34288. Bibcode:2012PLoSO ... 734288H. Дои:10.1371 / journal.pone.0034288. ЧВК  3314501. PMID  22470552.
  40. ^ Авторское право 2015 ISOGG. «ISOGG 2015 Дерево гаплогруппы Y-ДНК». isogg.org.
  41. ^ Андерхилл П.А., Пассарино Г., Лин А.А., Шен П., Миразон Лар М., Фоли Р.А., Эфнер П.Дж., Кавалли-Сфорца Л.Л. (2001). «Филогеография бинарных гаплотипов Y-хромосомы и происхождение современных человеческих популяций». Анналы генетики человека. 65 (Pt1): 43–62. Дои:10.1046 / j.1469-1809.2001.6510043.x. PMID  11415522. S2CID  9441236.
  42. ^ Karafet TM, Mendez FL, Meilerman MB, Underhill PA, Zegura SL, Hammer MF (2008). «Новые бинарные полиморфизмы изменяют форму и увеличивают разрешение дерева гаплогруппы Y-хромосомы человека». Геномные исследования. 18 (5): 830–38. Дои:10.1101 / gr.7172008. ЧВК  2336805. PMID  18385274.
  43. ^ http://ymap.ftdna.com/cgi-bin/gbrowse_details/hs_chrY?name=L240;class=Sequence;ref=ChrY;start=3191153;end=3191153;feature_id=40369[постоянная мертвая ссылка ]
  44. ^ Sims LM, et al. (2009). Батцер М.А. (ред.). «Филогения гаплогруппы G с улучшенным разрешением в Y-хромосоме, выявленная набором недавно охарактеризованных SNP». PLOS ONE. 4 (6): 1–5. Bibcode:2009PLoSO ... 4.5792S. Дои:10.1371 / journal.pone.0005792. ЧВК  2686153. PMID  19495413.
  45. ^ King TE, Fortes GG, Balaresque P, Thomas MG, Balding D, Maisano Delser P, Neumann R, Parson W., Knapp M, Walsh S, Tonasso L, Holt J, Kayser M, Appleby J, Forster P, Ekserdjian D, Hofreiter М, Шюрер К. (2014). «Опознание останков короля Ричарда III». Nat. Сообщество. 5: 5631. Bibcode:2014 НатКо ... 5.56 31K. Дои:10.1038 / ncomms6631. ЧВК  4268703. PMID  25463651.
  46. ^ "Ежедневный зверь".
  47. ^ https://www.eupedia.com/europe/Haplogroup_G2a_Y-DNA.shtml[самостоятельно опубликованный источник? ]
  48. ^ https://www.geni.com/projects/G-P303-Y-DNA/9839[самостоятельно опубликованный источник? ]

внешняя ссылка

Филогенетическое древо человека Гаплогруппы ДНК Y-хромосомы [χ 1][χ 2]
"Y-хромосомный Адам "
A00A0-T  [χ 3]
A0A1  [χ 4]
A1aA1b
A1b1BT
BCT
DECF
DECF
F1 F2 F3 GHIJK
граммHIJK
IJKЧАС
IJK
я   J     LT  [χ 5]      K2 [χ 6]
L     Т    K2a  [χ 7]       K2b [χ 8]    K2c    K2dK2e  [χ 9]  
K-M2313 [χ 10]    K2b1 [χ 11]п  [χ 12]
НЕТ  S  [χ 13] M  [χ 14]   P1    P2
NОQр