Гаплогруппа S1a (Y-ДНК) - Haplogroup S1a (Y-DNA) - Wikipedia

Гаплогруппа S1a
Возможное место происхождения	Приморская Юго-Восточная Азия или же Океания
Предок	S1 (S-B255)
Потомки	S-P405
Определение мутаций	Z41335, Z41336, Z41337, Z41338, Z41339, Z41340, Z41341

Гаплогруппа S1a человек Y-ДНК гаплогруппа, определяется SNP Z41335, Z41336, Z41337, Z41338, Z41339, Z41340 и Z41341.

S1a встречается в основном в Меланезия (особенно в Папуа - Новая Гвинея ), Микронезия, Приморская Юго-Восточная Азия и среди коренные австралийцы.^[1]

По состоянию на 2017 год он включает безымянный основной подклад, называемый ISOGG как «S1a ~» (P405),^[1] ^[2]^[3] (который ранее был известен как K2b1a). Символ «~» - это способ ISOGG указать, что может существовать непроверенный и пока что неназванный непосредственный предок.

Его вторичные субклады включают: S1a1 (Z42413), S1a2 ~ (P79, P307) и S1a3 (P315).

До 2016 г. S1a1b (M230, P202, P204) был известен как Гаплогруппа S * (а до этого как гаплогруппа K5). (В 2016 г. гаплогруппа S-B254 был "повышен" до уровня S * с предыдущей позиции S1.)

К «родственным» классам S1a относятся: S1b (B275, Z33756, Z33757, Z33758, Z33759), S1c (Z41926, Z41927, Z41928, Z41929, Z41930) и S1d (SK1806).

Филогения

Гаплогруппа S1 (B255) включает следующие подклады:
S1a Z41335

S1a1 Z42413
- S1a1a
  - S1a1a1 P60, P304, P308
  - S1a1a2
- S1a1b M230, P202, P204 - «понижены» с прежнего положения базального Гаплогруппа S * (и ранее известная как гаплогруппа K5)
  - S1a1b1 M254 (ранее известный как K2b1a4a)
    - S1a1b1a P57
    - S1a1b1b P61
    - S1a1b1c P83
    - S1a1b1d SK1891
S1a2 P79, P307
S1a3 P315
- S1a3a Z41763
- S1a3b ~ P401

S1b ~ B275, Z33756, Z33757, Z33758, Z33759

S1c ~ Z41926, Z41927, Z41928, Z41929, Z41930

S1d SK1806

(По данным 2017 г. ISOGG дерево и последующие опубликованные исследования.^[1])

Распределение

Базальный S1a *, по-видимому, чрезвычайно редок или вымер у ныне живущих самцов. Первичный субклад S-P405 * также относительно редок, но встречается на значительных уровнях среди различных Микронезийский население: 5,6%. Он также встречается среди мужчин на индонезийском острове Сумба в размере 0,2%.^[4]

Согласно ISOGG (2017), S1a1 (Z42413) был обнаружен среди Леббо народ Индонезии и S1a1a1 (P60) среди коренные австралийцы.^[1] В одном исследовании сообщается о обнаружении S-M230 (S1a1b) в 52% (16/31) выборке из Папуа - Новая Гвинея (PNG) Хайлендс; 21% (7/34) выборки из Молуккские острова (Малуку); 16% (5/31) выборки с побережья Папуа-Новой Гвинеи; 12,5% (2/16) выборки Толай из Новая Британия; 10% (3/31) образца из Нуса Тенгара, и; 2% (2/89) выборки из Западная Новая Гвинея низменности / побережье. Один субклад, гаплогруппа S1a1b1d1a (S-M226.1), был обнаружен на низких частотах в Адмиралтейские острова и вдоль побережья материковой части PNG. ^[5] ^[6]

Распределение других основных субкладов S1a согласно ISOGG,^[1] как следует:

S1a2 (P79) - Меланезия и Папуа-Новая Гвинея, включая острова Адмиралтейства;
S1a3 (P315) - коренные австралийцы и;
S1a3b (P401) - Вануату.

Сноски

^ ^а ^б ^c ^d ^е Международное общество генетической генеалогии (ISOGG; 2017), Дерево гаплогруппы Y-ДНК 2015 (24 марта 2017 г.).
^ http://www.phylotree.org/Y/tree/index.htm
^ Karafet TM, Mendez FL, Sudoyo H, Lansing JS, Hammer MF (июнь 2014 г.). «Улучшенное филогенетическое разрешение и быстрая диверсификация гаплогруппы Y-хромосомы K-M526 в Юго-Восточной Азии». Eur J Hum Genet. 23 (3): 369–373. Дои:10.1038 / ejhg.2014.106. ЧВК 4326703. PMID 24896152.
^ Karafet TM, Mendez FL, Sudoyo H, Lansing JS, Hammer MF (2013). «Таблица 1 (« Улучшенное филогенетическое разрешение и быстрая диверсификация гаплогруппы Y-хромосомы K-M526 в Юго-Восточной Азии »)». Европейский журнал генетики человека. 23 (3): 369–373. Дои:10.1038 / ejhg.2014.106. ЧВК 4326703. PMID 24896152.
^ Кайзер М., Чой Й., Ван Овен М., Мона С., Брауэр С., Трент Р. Дж., Суаркия Д., Шифенховел В., Стоункинг М. (2008). «Влияние австронезийской экспансии: данные по мтДНК и разнообразию Y-хромосомы на Адмиралтейских островах в Меланезии». Молекулярная биология и эволюция. 25 (7): 1362–74. Дои:10.1093 / molbev / msn078. PMID 18390477.
^ Кокс МП, Миразон Лар М. (2006). «Разнообразие Y-хромосомы обратно пропорционально языковой принадлежности в парных австронезийских и папуасоязычных сообществах Соломоновых островов». Американский журнал биологии человека. 18 (1): 35–50. Дои:10.1002 / ajhb.20459. PMID 16378340. S2CID 4824401.

Филогенетическое древо человека Гаплогруппы ДНК Y-хромосомы ^{[χ 1]}^{[χ 2]}

"Y-хромосомный Адам "

A0-T ^{[χ 3]}

A1 ^{[χ 4]}

F2

F3

GHIJK

я

J

LT ^{[χ 5]}

K2 ^{[χ 6]}

L

Т

K2a ^{[χ 7]}

K2b ^{[χ 8]}

K2c

K2d

K2e ^{[χ 9]}

K-M2313 ^{[χ 10]}

K2b1 ^{[χ 11]}

п ^{[χ 12]}

НЕТ

S ^{[χ 13]}

M ^{[χ 14]}

P1

P2

Сноски

^ Ван Овен М., Ван Гейстелен А., Кайзер М., Декорте Р., Larmuseau HD (2014). «Видеть лес за деревьями: минимальная эталонная филогения Y-хромосомы человека». Человеческая мутация. 35 (2): 187–91. Дои:10.1002 / humu.22468. PMID 24166809.
^ Международное общество генетической генеалогии (ISOGG; 2015), Дерево гаплогруппы Y-ДНК 2015. (Дата обращения: 1 февраля 2015 г.)
^ Гаплогруппа A0-T также известна как A-L1085 (а ранее как A0'1'2'3'4).
^ Гаплогруппа A1 также известна как A1'2'3'4.
^ Гаплогруппа LT (L298 / P326) также известна как гаплогруппа K1.
^ С 2002 по 2008 гг. Гаплогруппа T-M184 была известна как «Гаплогруппа К2». С тех пор это имя было изменено на K-M526, брат Haplogroup LT.
^ Гаплогруппа K2a (M2308) и ее первичный субклад K-M2313 были отделены от гаплогруппы NO (F549) в 2016 году (это последовало за публикацией: Позник Г.Д., Сюэ У., Мендес Ф.Л. и др. (2016). «Прерывистые всплески в демографии мужчин-мужчин, выведенные из 1244 всемирных последовательностей Y-хромосомы». Природа Генетика. 48 (6): 593–9. Дои:10,1038 / нг.3559. ЧВК 4884158. PMID 27111036. В прошлом другие гаплогруппы, включая NO (M214) и K2e, также были идентифицированы с именем «K2a».
^ Гаплогруппа K2b (M1221 / P331 / PF5911) также известна как MPS гаплогруппы.
^ Гаплогруппа K2e (K-M147) ранее была известна как «гаплогруппа X» и «K2a» (но является дочерней субкладой нынешней K2a).
^ K-M2313 *, у которого пока нет филогенетического названия, был зарегистрирован у двух живых людей, имеющих этнические связи с Индией и Юго-Восточной Азией. Кроме того, K-Y28299, который, по-видимому, является основной ветвью K-M2313, был обнаружен у трех живых людей из Индии. См .: Позник op. соч.; YFull YTree v5.08, 2017, «К-М2335», и; Филодерево, 2017, «Детали маркеров Y-SNP, включенных в минимальное дерево Y» (Дата доступа к этим страницам: 9 декабря 2017 г.)
^ Гаплогруппа K2b1 (P397 / P399) также известна как гаплогруппа MS, но имеет более широкую и сложную внутреннюю структуру.
^ Гаплогруппа P (P295) также известна как K2b2.
^ Гаплогруппа S с 2017 года также известна как K2b1a. (Ранее имя Гаплогруппа S было присвоено K2b1a4.)
^ Гаплогруппа M, по состоянию на 2017 год, также известна как K2b1b. (Ранее имя Гаплогруппа M было присвоено K2b1d.)

[isogg2017-1] а ^б ^c ^d ^е Международное общество генетической генеалогии (ISOGG; 2017), Дерево гаплогруппы Y-ДНК 2015 (24 марта 2017 г.).

[2] ttp://www.phylotree.org/Y/tree/index.htm

[Karafet2014-3] Karafet TM, Mendez FL, Sudoyo H, Lansing JS, Hammer MF (июнь 2014 г.). «Улучшенное филогенетическое разрешение и быстрая диверсификация гаплогруппы Y-хромосомы K-M526 в Юго-Восточной Азии». Eur J Hum Genet. 23 (3): 369–373. Дои:10.1038 / ejhg.2014.106. ЧВК 4326703. PMID 24896152.

[Karafet-4] Karafet TM, Mendez FL, Sudoyo H, Lansing JS, Hammer MF (2013). «Таблица 1 (« Улучшенное филогенетическое разрешение и быстрая диверсификация гаплогруппы Y-хромосомы K-M526 в Юго-Восточной Азии »)». Европейский журнал генетики человека. 23 (3): 369–373. Дои:10.1038 / ejhg.2014.106. ЧВК 4326703. PMID 24896152.

[5] Кайзер М., Чой Й., Ван Овен М., Мона С., Брауэр С., Трент Р. Дж., Суаркия Д., Шифенховел В., Стоункинг М. (2008). «Влияние австронезийской экспансии: данные по мтДНК и разнообразию Y-хромосомы на Адмиралтейских островах в Меланезии». Молекулярная биология и эволюция. 25 (7): 1362–74. Дои:10.1093 / molbev / msn078. PMID 18390477.

[6] Кокс МП, Миразон Лар М. (2006). «Разнообразие Y-хромосомы обратно пропорционально языковой принадлежности в парных австронезийских и папуасоязычных сообществах Соломоновых островов». Американский журнал биологии человека. 18 (1): 35–50. Дои:10.1002 / ajhb.20459. PMID 16378340. S2CID 4824401.

[vanOven2014-7] Ван Овен М., Ван Гейстелен А., Кайзер М., Декорте Р., Larmuseau HD (2014). «Видеть лес за деревьями: минимальная эталонная филогения Y-хромосомы человека». Человеческая мутация. 35 (2): 187–91. Дои:10.1002 / humu.22468. PMID 24166809.

[ISOGG2015-8] Международное общество генетической генеалогии (ISOGG; 2015), Дерево гаплогруппы Y-ДНК 2015. (Дата обращения: 1 февраля 2015 г.)

[A0-T-9] Гаплогруппа A0-T также известна как A-L1085 (а ранее как A0'1'2'3'4).

[A1-10] Гаплогруппа A1 также известна как A1'2'3'4.

[LT-11] Гаплогруппа LT (L298 / P326) также известна как гаплогруппа K1.

[K2-12] С 2002 по 2008 гг. Гаплогруппа T-M184 была известна как «Гаплогруппа К2». С тех пор это имя было изменено на K-M526, брат Haplogroup LT.

[K2a-13] Гаплогруппа K2a (M2308) и ее первичный субклад K-M2313 были отделены от гаплогруппы NO (F549) в 2016 году (это последовало за публикацией: Позник Г.Д., Сюэ У., Мендес Ф.Л. и др. (2016). «Прерывистые всплески в демографии мужчин-мужчин, выведенные из 1244 всемирных последовательностей Y-хромосомы». Природа Генетика. 48 (6): 593–9. Дои:10,1038 / нг.3559. ЧВК 4884158. PMID 27111036. В прошлом другие гаплогруппы, включая NO (M214) и K2e, также были идентифицированы с именем «K2a».

[K2b-14] Гаплогруппа K2b (M1221 / P331 / PF5911) также известна как MPS гаплогруппы.

[K2e-15] Гаплогруппа K2e (K-M147) ранее была известна как «гаплогруппа X» и «K2a» (но является дочерней субкладой нынешней K2a).

[K-M2313-16] K-M2313 *, у которого пока нет филогенетического названия, был зарегистрирован у двух живых людей, имеющих этнические связи с Индией и Юго-Восточной Азией. Кроме того, K-Y28299, который, по-видимому, является основной ветвью K-M2313, был обнаружен у трех живых людей из Индии. См .: Позник op. соч.; YFull YTree v5.08, 2017, «К-М2335», и; Филодерево, 2017, «Детали маркеров Y-SNP, включенных в минимальное дерево Y» (Дата доступа к этим страницам: 9 декабря 2017 г.)

[K2b1-17] Гаплогруппа K2b1 (P397 / P399) также известна как гаплогруппа MS, но имеет более широкую и сложную внутреннюю структуру.

[P-18] Гаплогруппа P (P295) также известна как K2b2.

[S-19] Гаплогруппа S с 2017 года также известна как K2b1a. (Ранее имя Гаплогруппа S было присвоено K2b1a4.)

[M-20] Гаплогруппа M, по состоянию на 2017 год, также известна как K2b1b. (Ранее имя Гаплогруппа M было присвоено K2b1d.)

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[χ 1]

[χ 2]

[χ 3]

[χ 4]

[χ 5]

[χ 6]

[χ 7]

[χ 8]

[χ 9]

[χ 10]

[χ 11]

[χ 12]

[χ 13]

[χ 14]