IMPDH2 - IMPDH2

IMPDH2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1B3O, 1NF7, 1НФБ
Идентификаторы
Псевдонимы	IMPDH2, IMPD2, IMPDH-II, IMP (инозин-5'-монофосфат) дегидрогеназа 2, инозинмонофосфатдегидрогеназа 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 146691 MGI: 109367 ГомолоГен: 48919 Генные карты: IMPDH2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 3 (человек)[1] Группа 3п21.31 Начните 49,024,325 бп[1] Конец 49,029,408 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 9 (мышь)[2] Группа 9 | 9 F2 Начните 108,560,286 бп[2] Конец 108,565,584 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • связывание ионов металлов • каталитическая активность • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК • оксидоредуктазная активность • связывание нуклеотидов • Активность IMP дегидрогеназы Сотовый компонент • цитоплазма • мембрана • пероксисомальная мембрана • внеклеточная экзосома • ядро клетки • внеклеточная область • цитозоль • просвет секреторной гранулы • Просвет гранул, богатых фиколином-1 Биологический процесс • клеточный ответ на интерлейкин-4 • процесс биосинтеза пуриновых нуклеотидов • развитие сетчатки глаза камерного типа • процесс биосинтеза пуринового рибонуклеозида монофосфата • разрастание лимфоцитов • GMP биосинтетический процесс • гомотетрамеризация белков • окислительно-восстановительный процесс • Биосинтетический процесс GTP • дегрануляция нейтрофилов • циркадный ритм Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	3615	23918
Ансамбль	ENSG00000178035	ENSMUSG00000062867
UniProt	P12268	P24547
RefSeq (мРНК)	NM_000884	NM_011830 NM_001378921
RefSeq (белок)	NP_000875	NP_035960 NP_001365850
Расположение (UCSC)	Chr 3: 49.02 - 49.03 Мб	Chr 9: 108,56 - 108,57 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Инозин-5'-монофосфатдегидрогеназа 2, также известен как IMP дегидрогеназа 2, является фермент что у людей кодируется IMPDH2 ген.^[5][6][7]

Функция

IMP дегидрогеназа 2 является ферментом, ограничивающим скорость в de novo гуанин нуклеотид биосинтез. Таким образом, он участвует в поддержании клеточных гуанин-дезокси- и рибонуклеотидных пулов, необходимых для синтеза ДНК и РНК. IMPDH2 катализирует НАД-зависимое окисление инозин-5'-монофосфат в ксантин-5'-монофосфат, который затем преобразуется в гуанозин-5'-монофосфат.^[5] IMPDH2 был идентифицирован как внутриклеточная мишень природного продукта санглиферина A.^[8]

Клиническое значение

Этот ген активируется в некоторых новообразованиях, что позволяет предположить, что он может играть роль в злокачественной трансформации.^[5]

Смотрите также

• IMP дегидрогеназа

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000178035 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000062867 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: IMP (инозинмонофосфат) дегидрогеназа 2».
6. Нацума И, Оно С, Кавасаки Х, Конно И, Вебер Дж, Сузуки К. (март 1990 г.). «Две различные кДНК для дегидрогеназы IMP человека». J. Biol. Chem. 265 (9): 5292–5. PMID  1969416.
7. Кост-Алимова М.В., Глесне Д.А., Хуберман Э., Зеленин А.В. (1998). «Отнесение1 инозин '-монофосфатдегидрогеназы типа 2 (IMPDH2) к полосе хромосомы 3p21.2 человека посредством гибридизации in situ». Cytogenet. Cell Genet. 82 (3–4): 145–6. Дои:10.1159/000015088. PMID  9858805. S2CID  46764436.
8. Пуа К.Х., Стайлз Д.Т., Сова М.Э., Вердин Г.Л. (10 января 2017 г.). «IMPDH2 является внутриклеточной мишенью комплекса циклофилина А и санглиферина А». Сотовый представитель. 18 (2): 432–442. Дои:10.1016 / j.celrep.2016.12.030. PMID  28076787.

дальнейшее чтение

• Гарат А., Кауффиз С., Хамдан-Халил Р. и др. (2009). «Генетический полиморфизм IMPDH2: однонуклеотидный полиморфизм промотора разрушает элемент, чувствительный к циклическому аденозинмонофосфату». Биомаркеры Genet Test Mol. 13 (6): 841–7. Дои:10.1089 / gtmb.2009.0096. PMID  19810816.
• Ван Дж., Зееви А., Уэббер С. и др. (2007). «Новый вариант L263F инозин-5'-монофосфатдегидрогеназы 2 человека связан со сниженной ферментативной активностью». Pharmacogenet. Геномика. 17 (4): 283–90. Дои:10.1097 / FPC.0b013e328012b8cf. PMID  17496727. S2CID  21301713.
• Итак, HC, Fong PY, Chen RY и др. (2010). «Идентификация нейрогликана C и взаимодействующих партнеров в качестве генов потенциальной предрасположенности к шизофрении у населения Южного Китая». Am. J. Med. Genet. B Neuropsychiatr. Genet. 153B (1): 103–13. Дои:10.1002 / ajmg.b.30961. PMID  19367581. S2CID  20522961.
• Гриньо Дж., Ванрентергхем Й., Нашан Б. и др. (2008). «Ассоциация четырех полиморфизмов ДНК с острым отторжением после трансплантации почки». Транспл. Int. 21 (9): 879–91. Дои:10.1111 / j.1432-2277.2008.00679.x. PMID  18444945. S2CID  42432512.
• Ohmann EL, Burckart GJ, Brooks MM, et al. (2010). «Генетический полиморфизм влияет на побочные эффекты, связанные с микофенолятмофетилом, у педиатрических пациентов с трансплантацией сердца». Журнал трансплантации сердца и легких. 29 (5): 509–516. Дои:10.1016 / j.healun.2009.11.602. PMID  20061166.
• Sombogaard F, van Schaik RH, Mathot RA, et al. (2009). «Вариабельность активности IMPDH у пациентов с трансплантатом почки, получавших MMF, коррелирует с полиморфизмом 3757T> C IMPDH типа II». Pharmacogenet. Геномика. 19 (8): 626–34. Дои:10.1097 / FPC.0b013e32832f5f1b. PMID  19617864. S2CID  41882586.
• Фелленберг Дж., Бернд Л., Деллинг Дж. И др. (2007). «Прогностическое значение генов, регулируемых препаратами, при остеосаркоме высокой степени злокачественности». Мод. Патол. 20 (10): 1085–94. Дои:10.1038 / modpathol.3800937. PMID  17660802.
• Лим Дж., Хао Т., Шоу С. и др. (2006). «Сеть межбелкового взаимодействия для унаследованных атаксий человека и нарушений дегенерации клеток Пуркинье». Ячейка. 125 (4): 801–14. Дои:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID  16713569. S2CID  13709685.
• He Y, Mou Z, Li W и др. (2009). «Идентификация IMPDH2 как опухоль-ассоциированного антигена при колоректальном раке с использованием иммунопротеомического анализа». Int J Colorectal Dis. 24 (11): 1271–9. Дои:10.1007 / s00384-009-0759-2. PMID  19597826. S2CID  24143679.
• Peñuelas S, Noé V, Ciudad CJ (2005). «Модуляция IMPDH2, сурвивина, топоизомеразы I и виментина увеличивает чувствительность к метотрексату в клетках рака толстой кишки человека HT29». FEBS J. 272 (3): 696–710. Дои:10.1111 / j.1742-4658.2004.04504.x. PMID  15670151. S2CID  43226077.
• Винницкий В., Вейгель Г., Сандер-Плассманн Г. и др. (2010). «Однонуклеотидный полиморфизм инозин-5'-монофосфатдегидрогеназы 2 ослабляет действие микофеноловой кислоты». Фармакогеномика J. 10 (1): 70–6. Дои:10.1038 / tpj.2009.43. PMID  19770842.
• Патель К.Г., Ричман К., Янг Д. и др. (2007). «Влияние сахарного диабета на фармакокинетику микофенолата натрия и активность инозинмонофосфатдегидрогеназы у стабильных реципиентов трансплантата почки». Ther Drug Monit. 29 (6): 735–42. Дои:10.1097 / FTD.0b013e31815d8ace. ЧВК  4082794. PMID  18043470.
• Sanquer S, Maison P, Tomkiewicz C и др. (2008). «Экспрессия инозинмонофосфатдегидрогеназы типа I и типа II после лечения микофенолятмофетилом: двухлетнее наблюдение при трансплантации почки». Clin. Pharmacol. Ther. 83 (2): 328–35. Дои:10.1038 / sj.clpt.6100300. PMID  17713475. S2CID  44919245.
• Мохамед М.Ф., Фрай Р.Ф., Лангаи Т.Ю. (2008). «Частота межпопуляционных вариаций генетических полиморфизмов человеческой инозин-5'-монофосфатдегидрогеназы типа II (IMPDH2)». Genet. Тестовое задание. 12 (4): 513–6. Дои:10.1089 / gte.2008.0049. PMID  18976158.
• Mannava S, Grachtchouk V, Wheeler LJ и др. (2008). «Прямая роль метаболизма нуклеотидов в C-MYC-зависимой пролиферации клеток меланомы». Клеточный цикл. 7 (15): 2392–400. Дои:10.4161 / cc.6390. ЧВК  3744895. PMID  18677108.
• Чен Л., Петрелли Р., Олесяк М. и др. (2008). «Бис (сульфонамид) изостеры аналогов микофенольных адениндинуклеотидов: ингибирование инозинмонофосфатдегидрогеназы». Биоорг. Med. Chem. 16 (15): 7462–9. Дои:10.1016 / j.bmc.2008.06.003. PMID  18583139.
• Гуо Д., Хан Дж., Адам Б.Л. и др. (2005). «Протеомный анализ субстратов SUMO4 в клетках HEK293 в условиях стресса, вызванного голоданием сыворотки». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 337 (4): 1308–18. Дои:10.1016 / j.bbrc.2005.09.191. PMID  16236267.
• Кудо М., Сайто Ю., Сасаки Т. и др. (2009). «Генетические вариации генов HGPRT, ITPA, IMPDH1, IMPDH2 и GMPS у японцев». Drug Metab. Фармакокинет. 24 (6): 557–64. Дои:10.2133 / dmpk.24.557. PMID  20045992.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.