LAPTM4B - LAPTM4B

LAPTM4B
Идентификаторы
Псевдонимы	LAPTM4B, LAPTM4beta, LC27, лизосомальный трансмембранный белок 4 бета
Внешние идентификаторы	OMIM: 613296 MGI: 1890494 ГомолоГен: 10182 Генные карты: LAPTM4B
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 8 (человек)[1] Группа 8q22.1 Начинать 97,775,057 бп[1] Конец 97,853,013 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 15 (мышь)[2] Группа 15 | 15 B3.1 Начинать 34,238,028 бп[2] Конец 34,284,302 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание киназы • связывание убиквитин-протеин-лигазы • связывание фосфатидилинозитола бисфосфата • керамидное связующее Сотовый компонент • эндомембранная система • неотъемлемый компонент мембраны • мембрана • ранняя эндосома • мультивезикулярное тело, внутренний пузырек • лизосома • лизосомальная мембрана • эндосома • клеточная мембрана • эндосомная мембрана • мембрана поздней эндосомы • мультивезикулярная мембрана тела • проекция клетки Биологический процесс • эндосомная организация • транспорт эндосом через мультивезикулярный путь сортировки тел • отрицательная регуляция катаболического процесса лизосомальных белков • отрицательное регулирование производства трансформирующего фактора роста бета1 • регуляция проницаемости лизосомальной мембраны • регуляция организации лизосом Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	55353	114128
Ансамбль	ENSG00000104341	ENSMUSG00000022257
UniProt	Q86VI4	Q91XQ6
RefSeq (мРНК)	NM_018407	NM_033521
RefSeq (белок)	NP_060877	NP_277056
Расположение (UCSC)	Chr 8: 97,78 - 97,85 Мб	Chr 15: 34,24 - 34,28 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Трансмембранный белок, связанный с лизосомами 4B это белок что у людей кодируется LAPTM4B ген.^[5]

Белок LAPTM4B содержит лизосома мотив локализации и локализуется на поздних эндосомы и лизосомы.

Клиническое значение

Повышенная экспрессия LAPTM4B была обнаружена при раке груди, печени, легких, яичников, матки и желудка. Повышенный уровень LAPTM4B способствует химиотерапия сопротивление в рак молочной железы. Было обнаружено, что сверхэкспрессия LAPTM4B вызывает антрациклины (доксорубицин, даунорубицин, и эпирубицин ) резистентность за счет удержания лекарственного средства в цитоплазме и уменьшения ядерной локализации лекарственного средства и вызванного лекарственным средством повреждения ДНК.^[6]

В 2011 году та же группа сообщила, что LAPTM4B также продвигает аутофагия, механизм выживания клеток, опосредованный лизосомами. LAPTM4B способствует аутофагии и делает опухолевые клетки устойчивыми к метаболическому и генотоксическому стрессу и приводит к более быстрому росту опухоли.^[7]

Основываясь на этих выводах, LAPTM4B можно использовать в качестве терапевтической мишени для предотвращения устойчивости к химиотерапии или маркера для выявления пациентов, которым антрациклины не принесут пользы.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000104341 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000022257 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: LAPTM4B лизосомно-связанный трансмембранный белок 4 бета».
6. Ли И, Цзоу Л., Ли Кью, Хайбе-Каинс Б., Тиан Р., Ли И, Десмед С., Сотириу С., Салласи З., Иглхарт Дж. Д., Ричардсон А. Л., Ван З. К. (февраль 2010 г.). «Амплификация LAPTM4B и YWHAZ способствует устойчивости к химиотерапии и рецидиву рака груди». Nat. Med. 16 (2): 214–8. Дои:10,1038 / нм.2090. ЧВК  2826790. PMID  20098429.
7. Ли И, Чжан Ц., Тиан Р., Ван Ц., Чжао Дж.Дж., Иглхарт Д.Д., Ван Ц.К., Ричардсон А.Л. (декабрь 2011 г.). «Лизосомный трансмембранный белок LAPTM4B способствует аутофагии и устойчивости к метаболическому стрессу в раковых клетках». Рак Res. 71 (24): 7481–9. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-11-0940. ЧВК  3261660. PMID  22037872.

дальнейшее чтение

• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Совместно с S, Rice T, Salinas C, Auld V (2003). «Fire exit - это потенциальный четырехкомпонентный трансмембранный белок, экспрессируемый в развивающейся глии Drosophila». Бытие. 35 (3): 143–52. Дои:10.1002 / ген.10177. PMID  12640618. S2CID  29252213.
• Shao GZ, Zhou RL, Zhang QY и др. (2003). «Молекулярное клонирование и характеристика LAPTM4B, нового гена, активируемого при гепатоцеллюлярной карциноме». Онкоген. 22 (32): 5060–9. Дои:10.1038 / sj.onc.1206832. PMID  12902989.
• Лю XR, Zhou RL, Zhang QY и др. (2004). «Структурный анализ и экспрессия нового тетрансмембранного белка, связанного с лизосомой трансмембранного белка 4 бета, связанного с гепатоцеллюлярной карциномой». Мир J. Гастроэнтерол. 10 (11): 1555–9. Дои:10.3748 / wjg.v10.i11.1555. ЧВК  4572753. PMID  15162524.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Каспер Г., Фогель А., Кламан И. и др. (2005). «Транскрипт человеческого LAPTM4b активируется в различных типах солидных опухолей и, по-видимому, играет двойную функциональную роль во время прогрессирования опухоли». Рак Lett. 224 (1): 93–103. Дои:10.1016 / j.canlet.2004.10.004. PMID  15911104.
• Оцуки Т., Ота Т., Нисикава Т. и др. (2007). «Сигнальная последовательность и ловушка ключевого слова in silico для отбора полноразмерных кДНК человека, кодирующих секрецию или мембранные белки из библиотек олигокапированных кДНК». ДНК Res. 12 (2): 117–26. Дои:10.1093 / dnares / 12.2.117. PMID  16303743.
• Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (Выпуск базы данных): D415–8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.
• Маэда К., Хорикоши Т., Накашима Э. и др. (2007). «MATN и LAPTM являются частями более крупных единиц транскрипции, произведенных межгенным сплайсингом: межгенный сплайсинг может быть обычным явлением». ДНК Res. 12 (5): 365–72. Дои:10.1093 / dnares / dsi017. PMID  16769693.
• Лю И, Чжан Цюй, Цянь Н., Чжоу Р.Л. (2007). «Связь между полиморфизмом гена LAPTM4B и предрасположенностью к раку желудка». Анна. Онкол. 18 (2): 311–6. Дои:10.1093 / annonc / mdl394. PMID  17074969.