Список сайтов разрезания рестрикционных ферментов: E – F - List of restriction enzyme cutting sites: E–F - Wikipedia

Легенда о азотистые основания
Код	Нуклеотид представлен
А	Аденин (А)
C	Цитозин (С)
грамм	Гуанин (ГРАММ)
Т	Тимин (Т)
N	A, C, G или T
M	А или С
р	A или G
W	А или Т
Y	C или T
S	C или G
K	G или T
ЧАС	A, C или T
B	C, G или T
V	A, C или G
D	A, G или T

Эта статья содержит список наиболее изученных рестрикционных ферментов, названия которых начинаются с букв от E до F. Он содержит около 110 ферментов.

Приведена следующая информация:

Фермент: Принятое название молекула, согласно международно принятой номенклатура^[1]^[2], и библиографические ссылки. (Дальнейшее чтение: см. Раздел "Номенклатура "в статье"Фермент рестрикции ".)
Код PDB: Код, используемый для определения структуры белка в PDB база данных белковых структур. Трехмерная атомная структура белка дает очень ценную информацию для понимания внутренних деталей механизма его действия.^[3]^[4].
Источник: Организм, который естественным образом производит фермент.
Последовательность распознавания: Последовательность ДНК, распознаваемая ферментом и с которой он специфически связывается.
Резать: Участок разреза и продукты ДНК разреза. В последовательность распознавания и место разрезания обычно совпадают, но иногда сайт разреза может находиться на расстоянии нескольких десятков нуклеотидов от сайта распознавания^[5]^[6].
Изошизомеры и неошизомеры: An изошизомер является фермент который распознает ту же последовательность, что и другой. А неошизомер представляет собой особый тип изошизомера, который распознает одну и ту же последовательность, но разрезает другим способом. Для каждого фермента указано не более 8-10 наиболее распространенных изошизомеров, но их может быть намного больше. Неошизомеры выделены жирным шрифтом зеленого цвета (например: BamHI). Когда "Нет на Дата", это означает, что на эту дату в базах данных не было зарегистрированных изошизомеров с четко определенным участком разрезания. Изошизомеры, указанные белым шрифтом и серым фоном, соответствуют ферментам, не указанным в текущих списках:

как в этом не перечисленном ферменте:

EcoR70I

Навигация по всему списку

Ферменты рестрикции

E

Фермент Код PDB Источник Последовательность распознавания Резать Изошизомеры

EacI

Eubacterium acidaminophilum

5 'GGATC
3 'CCTAG

5 '--- GGATCNNNN N --- 3 '
3 '--- CCTAGNNNNN --- 5'

AclWI, AlwI, BinI,

БпуФИ,

BspPI,

BstH9I,

Bst31TI, Bth617I, Ral8I

EaeI Enterobacter aerogenes 5 'YGGCCR
3 'RCCGGY 5 '--- Y GGCCR --- 3 '
3 '--- RCCGG Y --- 5 '

Eae46I Enterobacter aerogenes 46 5 'CCGCGG
3 'GGCGCC 5 '--- CCGC GG --- 3 '
3 '--- GG CGCC --- 5 '

EaeAI Enterobacter aerogenes 5 'CCCGGG
3 'GGGCCC 5 '--- С CCGGG --- 3 '
3 '--- GGGCC C --- 5 ' AhyI, Cfr9I, EclRI, PaeBI, PspAI, PspALI, XcyI, XmaI, XmaCI

EagI Enterobacter agglomerans 5 'CGGCCG
3 'GCCGGC 5 '--- С GGCCG --- 3 '
3 '--- GCCGG C --- 5 ' AaaI, BseX3I, BstZI, EclXI, Eco52I, SenPT16I, XmaIII

EagBI Enterobacter agglomerans CBNU45 5 'CGATCG
3 'GCTAGC 5 '--- CGAT CG --- 3 '
3 '--- GC TAGC --- 5 ' Afa16RI, Afa22MI, BspCI, ErhB9I, NblI, Psu161I, RshI, XorII

EagMI Enterobacter agglomerans M3 5 'GGWCC
3 'CCWGG 5 '--- G GWCC --- 3 '
3 '--- CCWG G --- 5 ' Bme18I, BsrAI, Csp68KI, Eco47I, FssI, HgiEI, Kzo49I, SmuEI

Eam1104I Enterobacter amnigenus RFL1104 5 'CTCTTC
3 'ГАГААГ 5 '--- CTCTTCN NNN --- 3 '
3 '--- GAGAAGNNNN --- 5'

Eam1105I

Enterobacter amnigenus RFL1105

5 'GACN₅GTC
3 'CTGN₅CAG

5 '--- GACNNN NNGTC --- 3 '
3 '--- CTGNN NNNCAG --- 5 '

Ахди, АспЭИ,	BmeRI,	BspOVI,
DriI, EclHKI, NruGI

EarI Enterobacter aerogenes 5 'CTCTTC
3 'ГАГААГ 5 '--- CTCTTCN NNN --- 3 '
3 '--- GAGAAGNNNN --- 5'

EcaI Энтеробактерные клоаки 5 'GGTNACC
3 'CCANTGG 5 '--- G GTNACC --- 3 '
3 '--- CCANTG G --- 5 ' AcrII, Bse64I, BseT10I, BstEII, Eco91I, EcoO65I, EcoO128I

EciI кишечная палочка 5 'GGCGGA
3 'CCGCCT 5 '--- GGCGGAN₈NNN --- 3'
3 '--- CCGCCTN₈N NN --- 5 '

Eci125I кишечная палочка ВКМ-125 5 'GGTNACC
3 'CCANTGG 5 '--- G GTNACC --- 3 '
3 '--- CCANTG G --- 5 ' AcrII, AspAI, BseT10I, BstEII, Eco91I, EcoO65I, EcoO128I

EclI Энтеробактерные клоаки 5 'CAGCTG
3 'GTCGAC 5 '--- CAG CTG --- 3 '
3 '--- GTC GAC --- 5 '

Ecl136II Энтеробактерные клоаки RFL136 5 'GAGCTC
3 'CTCGAG 5 '--- GAG CTC --- 3 '
3 '--- CTC GAG --- 5 '

EclHKI

Энтеробактерные клоаки

5 'GACN₅GTC
3 'CTGN₅CAG

5 '--- GACNNN NNGTC --- 3 '
3 '--- CTGNN NNNCAG --- 5 '

Ахди, АспЭИ,	BmeRI,	BspOVI,
DriI, Eam1105I, NruGI

EclRI Энтеробактерные клоаки р 5 'CCCGGG
3 'GGGCCC 5 '--- С CCGGG --- 3 '
3 '--- GGGCC C --- 5 ' AhyI, Cfr9I, EaeAI, Pac25I, PspAI, PspALI, XcyI, XmaI, XmaCI

EclXI Энтеробактерные клоаки 590 5 'CGGCCG
3 'GCCGGC 5 '--- С GGCCG --- 3 '
3 '--- GCCGG C --- 5 ' AaaI, BseX3I, BstZI, EagI, Eco52I, SenPT16I, XmaIII

Ecl18kI 2FQZ Энтеробактерные клоаки 18к 5 'CCNGG
3 'GGNCC 5' --- CCNGG --- 3 '
3 '--- GGNCC --- 5'

Ecl37kI Энтеробактерные клоаки 37 тыс. 5 'CTGCAG
3 'GACGTC 5 '--- CTGCA G --- 3 '
3 '--- G ACGTC --- 5 ' AjoI, AliAJI, Ecl2zI, PaePI, Psp23I, PstI, Sag16I, SflI, YenI

Ecl2zI Энтеробактерные клоаки 2z 5 'CTGCAG
3 'GACGTC 5 '--- CTGCA G --- 3 '
3 '--- G ACGTC --- 5 ' AliAJI, Bsp63I, CfrA4I, PaePI, Pfl21I, PstI, SflI, Sst12I, YenI

Eco24I кишечная палочка RFL24 5 'GRGCYC
3 'CYCGRG 5 '--- GRGCY C --- 3 '
3 '--- С YCGRG --- 5 '

Eco31I кишечная палочка RFL31 5 'GGTCTC
3 'CCAGAG 5 '--- GGTCTCN NNNN --- 3 '
3 '--- CCAGAGNNNNN --- 5'

Eco32I кишечная палочка RFL32 5 'GATATC
3 'CTATAG 5 '--- GAT ATC --- 3 '
3 '--- CTA ТЕГ --- 5 '

Eco47I кишечная палочка RFL47 5 'GGWCC
3 'CCWGG 5 '--- G GWCC --- 3 '
3 '--- CCWG G --- 5 ' Bme18I, BsrAI, Csp68KI, ErpI, FssI, HgiEI, Kzo49I, SmuEI

Eco47III кишечная палочка RFL47 5 'AGCGCT
3 'TCGCGA 5 '--- AGC GCT --- 3 '
3 '--- TCG CGA --- 5 ' AfeI, AitI, Aor51H, FunI

Eco52I кишечная палочка RFL52 5 'CGGCCG
3 'GCCGGC 5 '--- С GGCCG --- 3 '
3 '--- GCCGG C --- 5 ' AaaI, BseX3I, BstZI, EagI, EclXI, SenPT16I, XmaIII

Eco56I кишечная палочка RFL56 5 'GCCGGC
3 'CGGCCG 5 '--- G CCGGC --- 3 '
3 '--- CGGCC G --- 5 '

Eco57I кишечная палочка RFL57 5 'CTGAAG
3 'GACTTC 5 '--- CTGAAGN₁₂NNNN --- 3'
3 '--- GACTTCN₁₂NN NN --- 5 ' AcuI, BspKT5I

Eco64I кишечная палочка RFL64 5 'GGYRCC
3 'CCRYGG 5 '--- G GYRCC --- 3 '
3 '--- CCRYG G --- 5 ' BanI, BbvBI, BspT107I, BshNI, HgiCI, HgiHI, MspB4I, PfaAI

Eco72I кишечная палочка RFL72 5 'CACGTG
3 'GTGCAC 5 '--- CAC ГТГ --- 3 '
3 '--- GTG CAC --- 5 ' AcvI, BcoAI, BbrPI, PmaCI, PmlI, PspCI

Eco78I кишечная палочка RFL78 5 'GGCGCC
3 'CCGCGG 5 '--- GGC GCC --- 3 '
3 '--- CCG CGG --- 5 '

Eco81I кишечная палочка RFL81 5 'CCTNAGG
3 'GGANTCC 5 '--- CC TNAGG --- 3 '
3 '--- ГГАНТ CC --- 5 ' AxyI, Bse21I, BspR7I, Bsu36I, Eco81I, MstII, OxaNI, SshAI

Eco88I кишечная палочка RFL88 5 'CYCGRG
3 'GRGCYC 5 '--- С YCGRG --- 3 '
3 '--- GRGCY C --- 5 ' AquI, BcoI, BsiHKCI, BstSI, Eco27kI, NspSAI, PlaAI, PunAI

Eco91I кишечная палочка RFL91 5 'GGTNACC
3 'CCANTGG 5 '--- G GTNACC --- 3 '
3 '--- CCANTG G --- 5 ' Bse64I, BstEII, BstPI, BstT9I, BstT10I, EcaI, Eci125I, NspSAII

Eco105I кишечная палочка RFL105 5 'ТАКГА
3 'ATGCAT 5 '--- TAC GTA --- 3 '
3 '--- ПТГ КОШКА --- 5 '

Eco130I кишечная палочка RFL130 5 'CCWWGG
3 'GGWWCC 5 '--- С CWWGG --- 3 '
3 '--- GGWWC C --- 5 '

Eco147I кишечная палочка RFL147 5 'AGGCCT
3 'TCCGGA 5 '--- AGG CCT --- 3 '
3 '--- TCC GGA --- 5 ' AatI, AspMI, GdiI, PceI, Pme55I, SarI, Sru30DI, SseBI, SteI, StuI

Eco255I

кишечная палочка RFL255

5 'АГТАКТ
3 'TCATGA

5 '--- AGT ACT --- 3 '
3 '--- TCA TGA --- 5 '

Acc113I, AssI,	BmcAI, Bpa34I,
DpaI, RflFII, ScaI, ZrmI

Eco1831I

кишечная палочка RFL1831

5 'CCSGG
3 'GGSCC

5' --- CCSGG --- 3 '
3 '--- GGSCC --- 5'

Ага, AseII, AsuC2I, BcnI,
БпуМИ,	CauII, ЭкоХИ, HgiS22I

EcoA4I кишечная палочка A4 5 'GGTCTC
3 'CCAGAG 5 '--- GGTCTCN NNNN --- 3 '
3 '--- CCAGAGNNNNN --- 5'

EcoHI кишечная палочка ЗДРАВСТВУЙ 5 'CCSGG
3 'GGSCC 5' --- CCSGG --- 3 '
3 '--- GGSCC --- 5' AsuC2I, BcnI, БпуМИ, CauII, ЭкоХИ, HgiS22I, Kpn49kII, NciI

EcoHK31I кишечная палочка HK31 5 'YGGCCR
3 'RCCGGY 5 '--- Y GGCCR --- 3 '
3 '--- RCCGG Y --- 5 '

EcoICRI кишечная палочка 2bT 5 'GAGCTC
3 'CTCGAG 5 '--- GAG CTC --- 3 '
3 '--- CTC GAG --- 5 '

Eco75KI кишечная палочка БКМ 5 'GRGCYC
3 'CYCGRG 5 '--- GRGCY C --- 3 '
3 '--- С YCGRG --- 5 '

Eco57MI кишечная палочка RFL57M 5 'CTGRAG
3 'GACYTC 5 '--- CTGRAGN₁₂NNNN --- 3'
3 '--- GACYTCN₁₂NN NN --- 5 '

EcoNI кишечная палочка 5 'CCTN₅AGG
3 'ГГАН₅TCC 5 '--- CCTNN NNNAGG --- 3 '
3 '--- ГГАННН NNTCC --- 5 '

EcoO44I кишечная палочка O44 Hiromi 5 'GGTCTC
3 'CCAGAG 5 '--- GGTCTCN NNNN --- 3 '
3 '--- CCAGAGNNNNN --- 5'

EcoO65I кишечная палочка K11a 5 'GGTNACC
3 'CCANTGG 5 '--- G GTNACC --- 3 '
3 '--- CCANTG G --- 5 ' AcrII, Bse64I, BstEII, BstPI, BstT9I, EcaI, Eco91I, EcoO128I

EcoO109I 1WTD кишечная палочка H709c 5 'RGGNCCY
3 'YCCNGGR 5 '--- RG GNCCY --- 3 '
3 '--- YCCNG GR --- 5 '

EcoO128I кишечная палочка O128Ly3 5 'GGTNACC
3 'CCANTGG 5 '--- G GTNACC --- 3 '
3 '--- CCANTG G --- 5 ' AspAI, Bse64I, BstEII, BstT9I, EcaI, EcoO65I, NspSAII, PspEI

EcoP15I кишечная палочка P15 5 'CAGCAG
3 'GTCGTC 5 '--- CAGCAGN₂₅NN --- 3'
3 '--- GTCGTCN₂₅ NN --- 5 '

EcoR124II 2y3t, 2w74 Поиск кишечная палочка 5 '5'-GAAN₇RTCG-3 ' 5'

EcoRI 1QC9, Поиск конструкций EcoR1 кишечная палочка RY13 5 'GAATTC
3 'CTTAAG 5 '--- G AATTC --- 3 '
3 '--- CTTAA G --- 5 '

ЭкоРИИ 1NA6 кишечная палочка R245 5 'CCWGG
3 'GGWCC 5' --- CCWGG --- 3 '
3 '--- GGWCC --- 5' ApaORI, BseBI, BspNI, BstNI, BstOI, Bst2UI, MvaI, SspAI, Зани

EcoRV 1RVE Искать EcoRV кишечная палочка J62 pLG74 5 'GATATC
3 'CTATAG 5 '--- GAT ATC --- 3 '
3 '--- CTA ТЕГ --- 5 '

EcoT14I кишечная палочка TB14 5 'CCWWGG
3 'GGWWCC 5 '--- С CWWGG --- 3 '
3 '--- GGWWC C --- 5 '

EcoT22I кишечная палочка TB22 5 'ATGCAT
3 'ТАКГА 5 '--- ATGCA Т --- 3 '
3 '--- т ACGTA --- 5 ' BfrBI, Csp68KIII, Mph1103I, NsiI, PinBI, Ppu10I, SepI, SspD5II

EcoT38I кишечная палочка TH38 5 'GRGCYC
3 'CYCGRG 5 '--- GRGCY C --- 3 '
3 '--- С YCGRG --- 5 '

EcoVIII кишечная палочка E1585-68 5 'AAGCTT
3 'TTCGAA 5 '--- А AGCTT --- 3 '
3 '--- TTCGA А --- 5 '

Eco13kI кишечная палочка 13 тыс. 5 'CCNGG
3 'GGNCC 5' --- CCNGG --- 3 '
3 '--- GGNCC --- 5'

Eco21kI кишечная палочка 21k 5 'CCNGG
3 'GGNCC 5' --- CCNGG --- 3 '
3 '--- GGNCC --- 5'

Eco27kI кишечная палочка 27 5 'CYCGRG
3 'GRGCYC 5 '--- С YCGRG --- 3 '
3 '--- GRGCY C --- 5 ' Ama87I, AvaI, Bse15I, BsoBI, BstSI, NspIII, OfoI, PunAI

Eco29kI кишечная палочка 5 'CCGCGG
3 'GGCGCC 5 '--- CCGC GG --- 3 '
3 '--- GG CGCC --- 5 '

Eco53kI кишечная палочка 53 тыс. 5 'GAGCTC
3 'CTCGAG 5 '--- GAG CTC --- 3 '
3 '--- CTC GAG --- 5 '

Eco137kI кишечная палочка 137 тыс. 5 'CCNGG
3 'GGNCC 5' --- CCNGG --- 3 '
3 '--- GGNCC --- 5'

EgeI Enterobacter gergoviae NA 5 'GGCGCC
3 'CCGCGG 5 '--- GGC GCC --- 3 '
3 '--- CCG CGG --- 5 '

EheI Эрвиния гербикола 9/5 5 'GGCGCC
3 'CCGCGG 5 '--- GGC GCC --- 3 '
3 '--- CCG CGG --- 5 '

ErhI Эрвиния рапоничи B9 5 'CCWWGG
3 'GGWWCC 5 '--- С CWWGG --- 3 '
3 '--- GGWWC C --- 5 '

ErhB9I Эрвиния рапоничи B9 5 'CGATCG
3 'GCTAGC 5 '--- CGAT CG --- 3 '
3 '--- GC TAGC --- 5 ' Afa16RI, Afa22MI, EagBI, NblI, Ple19I, Psu161I, RshI, XorII

ErhB9II Эрвиния рапоничи B9 5 'CCWWGG
3 'GGWWCC 5 '--- С CWWGG --- 3 '
3 '--- GGWWC C --- 5 '

ErpI Эрвиния рапоничи 5 'GGWCC
3 'CCWGG 5 '--- G GWCC --- 3 '
3 '--- CCWG G --- 5 ' Bme18I, BthAI, Csp68KI, Eco47I, FssI, HgiEI, Kzo49I, SmuEI

EsaBC3I Экологический образец BC3 5 'TCGA
3 'AGCT 5 '--- TC GA --- 3 '
3 '--- AG CT --- 5 '

EsaBC4I Экологический образец BC4 5 'GGCC
3 'CCGG 5 '--- GG CC --- 3 '
3 '--- CC GG --- 5 '

EspI Эвкапсис sp. 5 'GCTNAGC
3 'CGANTCG 5 '--- GC TNAGC --- 3 '
3 '--- CGANT CG --- 5 '

Esp3I Эрвиния sp. RFL3 5 'CGTCTC
3 'GCAGAG 5 '--- CGTCTCN NNNN --- 3 '
3 '--- GCAGAGNNNNN --- 5'

Esp4I Эрвиния sp. RFL4 5 'CTTAAG
3 'GAATTC 5 '--- С TTAAG --- 3 '
3 '--- ГААТТ C --- 5 '

Esp1396I Энтеробактер sp. RFL1396 5 'CCAN₅TGG
3 'ГГТН₅АКК 5 '--- CCANNNN NTGG --- 3 '
3 '--- GGTN NNNNACC --- 5 ' AccB7I, AcpII, Asp10HII, BasI, PflBI, PflMI, Van91I

F

Фермент Код PDB Источник Последовательность распознавания Резать Изошизомеры

FalI Flavobacterium aquatile Ob10 5 'AAGN₅CTT
3 'TTCN₅GAA 5 '--- AAGN₅CTTN₇NNNNNN --- 3'
3 '--- TTCN₅ГААН₇N NNNNN --- 5 '

FalII Flavobacterium aquatile Ob10 5 футов CGCG
3 'GCGC 5 '--- CG CG --- 3 '
3 '--- GC GC --- 5 ' BepI, BspFNI, Bsp123I, BspFNI, BstUI, BtkI, FalII, SelI, Тай

FaqI Flavobacterium aquatile RFL1 5 'GGGAC
3 'CCCTG 5 '--- GGGACN₈NN NNNN --- 3 '
3 '--- CCCTGN₈NNNNNN --- 5'

Жирный Flavobacterium aquatile NL3 5 'CATG
3 'GTAC 5' --- CATG --- 3 '
3 '--- GTAC --- 5'

FauI Flavobacterium aquatile 5 'CCCGC
3 'GGGCG 5 '--- CCCGCNNNN NN --- 3 '
3 '--- GGGCGNNNNNN --- 5'

FauBII Flavobacterium aureus B 5 футов CGCG
3 'GCGC 5 '--- CG CG --- 3 '
3 '--- GC GC --- 5 ' Bpu95I, BspFNI, Bsp123I, BspFNI, BstUI, BtkI, Csp68KVI, SelI, Тай

FauNDI Flavobacterium aquatile ND 5 'CATATG
3 'GTATAC 5 '--- CA ТАТГ --- 3 '
3 '--- GTAT AC --- 5 '

FbaI

Flavobacterium balustinum

5 'ТГАТКА
3 'ACTAGT

5 '--- т GATCA --- 3 '
3 '--- ACTAG Т --- 5 '

AbaI, BclI, BsiQI,
BspXII, BstT7I, Ksp22I,	ParI

FblI Flavobacterium balustinum 5 'GTMKAC
3 'CAKMTG 5 '--- GT MKAC --- 3 '
3 '--- CAKM ТГ --- 5 ' AccI, XmiI

FbrI Flavobacterium breve 5 'GCNGC
3 'CGNCG 5 '--- GC NGC --- 3 '
3 '--- CGN CG --- 5 '

FdiI Фремиелла диплосифон 5 'GGWCC
3 'CCWGG 5 '--- G GWCC --- 3 '
3 '--- CCWG G --- 5 ' Bme18I, BthAI, Csp68KI, ErpI, FssI, HgiEI, Kzo49I, SmuEI

FdiII Фремиелла диплосифон 5 'TGCGCA
3 'ACGCGT 5 '--- ТГК GCA --- 3 '
3 '--- АЧГ CGT --- 5 ' Acc16I, AosI, AviII, FspI, MstI, NsbI, PamI, Pun14627I

FgoI Fervidobacterium gondwanense AB39T 5 'CTAG
3 'GATC 5 '--- С ТЕГ --- 3 '
3 '--- GAT C --- 5 '

FmuI Flavobacterium multivorum 5 'GGNCC
3 'CCNGG 5 '--- GGNC C --- 3 '
3 '--- С CNGG --- 5 ' FmuIAvcI, BavAII, Bce22I, Bsu54I, NspIV, Pde12I, UnbI

FnuAI Fusobacterium nucleatum А 5 'GANTC
3 'CTNAG 5 '--- G ANTC --- 3 '
3 '--- CTNA G --- 5 '

FnuCI Fusobacterium nucleatum C 5 'GATC
3 'CTAG 5' --- GATC --- 3 '
3 '--- CTAG --- 5' Bme12I, Bsp67I, Bst19II, CcyI, FnuEI, MgoI, NphI, SauMI

FnuDI Fusobacterium nucleatum D 5 'GGCC
3 'CCGG 5 '--- GG CC --- 3 '
3 '--- CC GG --- 5 '

FnuDII Fusobacterium nucleatum D 5 футов CGCG
3 'GCGC 5 '--- CG CG --- 3 '
3 '--- GC GC --- 5 ' Bpu95I, Bsh1236I, Bsp50I, BstFNI, BstUI, Csp68KVI, FnuDII, ThaI

FnuDIII Fusobacterium nucleatum D 5 'GCGC
3 'CGCG 5 '--- GCG C --- 3 '
3 '--- С GCG --- 5 ' AspLEI, BspLAI, BstHHI, CfoI, HhaI, Hin6I, HinP1I, HspAI, Наука

ФнуЭИ Fusobacterium nucleatum E 5 'GATC
3 'CTAG 5' --- GATC --- 3 '
3 '--- CTAG --- 5' Bme12I, Bsp67I, Bst19II, CcyI, FnuCI, MgoI, NphI, Sau3AI

Fnu4HI Fusobacterium nucleatum 4H 5 'GCNGC
3 'CGNCG 5 '--- GC NGC --- 3 '
3 '--- CGN CG --- 5 '

FokI 2ФОК Flavobacterium okeanokoites 5 'ГГАТГ
3 'CCTAC 5 '--- ГГАТГН₈N NNNN --- 3 '
3 '--- CCTACN₈NNNNN --- 5'

Пт. Флавобактерии sp. O9 5 'GRGCYC
3 'CYCGRG 5 '--- GRGCY C --- 3 '
3 '--- С YCGRG --- 5 '

FseI Frankia sp. Eu11b 5 'GGCCGGCC
3 'CCGGCCGG 5 '--- GGCCGG CC --- 3 '
3 '--- CC GGCCGG --- 5 '

ФСИИ

Frankia sp.

5 мин.
3 'YTTAAR

5 '--- R АЭТТИ --- 3 '
3 '--- YTTAA R --- 5 '

AcsI, ApoI,

CfaI,

XapI

FspI Fischerella sp. 5 'TGCGCA
3 'ACGCGT 5 '--- ТГК GCA --- 3 '
3 '--- АЧГ CGT --- 5 ' Acc16I, AosI, AviII, FdiII, MstI, NsbI, PamI, Pun14627I

FspII Fischerella sp. 5 'TTCGAA
3 'AAGCTT 5 '--- ТТ CGAA --- 3 '
3 '--- AAGC TT --- 5 ' Asp10HI, Bim19I, BsiCI, BstBI, Csp45I, LspI, PlaII, Ssp1I, SviI

Fsp1604I Флавобактерии sp. I 16-04 5 'CCWGG
3 'GGWCC 5 '--- CC WGG --- 3 '
3 '--- GGW CC --- 5 ' ApaORI, BseBI, BshGI, BstNI, BstOI, Bst2UI, BthEI, ЭкоРИИ, SleI

FspAI Flexibacter sp. ТВ-м21К 5 'RTGCGCAY
3 'YACGCGTR 5 '--- RTGC GCAY --- 3 '
3 '--- YACG CGTR --- 5 '

ФспБИ Флавобактерии sp. RFLI 5 'CTAG
3 'GATC 5 '--- С ТЕГ --- 3 '
3 '--- GAT C --- 5 '

Fsp4HI Флавобактерии sp. 4H 5 'GCNGC
3 'CGNCG 5 '--- GC NGC --- 3 '
3 '--- CGN CG --- 5 '

FspMSI Fischerella sp. 5 'GGWCC
3 'CCWGG 5 '--- G GWCC --- 3 '
3 '--- CCWG G --- 5 ' Bme18I, BthAI, DsaIV, ErpI, HgiBI, HgiEI, Kzo49I, SmuEI

ФССИ Fibrobacter succinogenes S85 5 'GGWCC
3 'CCWGG 5 '--- G GWCC --- 3 '
3 '--- CCWG G --- 5 ' Bme18I, BthAI, DsaIV, ErpI, FspMSI, HgiEI, Kzo49I, VpaK11AI

FunI Fischerella uniformis 5 'AGCGCT
3 'TCGCGA 5 '--- AGC GCT --- 3 '
3 '--- TCG CGA --- 5 ' AfeI, AitI, Aor51H, Eco47III

FunII Fischerella uniformis 5 'GAATTC
3 'CTTAAG 5 '--- G AATTC --- 3 '
3 '--- CTTAA G --- 5 '

Примечания

^ Смит Х.О., Натанс Д. (декабрь 1973 г.). «Письмо: Предлагаемая номенклатура для бактериальных систем модификации и рестрикции и их ферментов». J. Mol. Биол. 81 (3): 419–23. Дои:10.1016/0022-2836(73)90152-6. PMID 4588280.
^ Робертс Р.Дж., Белфорт М., Бестор Т., Бхагват А.С., Бикл Т.А., Битинаит Дж., Блюменталь Р.М., Дегтярев С.К., Драйден Д.Т., Дибвиг К., Фирман К., Громова Е.С., Гампорт Р.И., Халфорд С.Е., Хаттман С., Хейтман Дж., Хорнби Д.П. , Janulaitis A, Jeltsch A, Josephsen J, Kiss A, Klaenhammer TR, Kobayashi I, Kong H, Krüger DH, Lacks S, Marinus MG, Miyahara M, Morgan RD, Murray NE, Nagaraja V, Piekarowicz A, Pingoud A, Raleigh Э, Рао Д.Н., Райх Н., Репин В.Е., Селкер Э.У., Шоу П.С., Штейн Д.К., Стоддард Б.Л., Шибальский В., Траутнер Т.А., Ван Эттен Дж.Л., Витор Дж.М., Уилсон Г.Г., Сюй С.Ю. (апрель 2003 г.). «Номенклатура рестрикционных ферментов, ДНК-метилтрансфераз, самонаводящихся эндонуклеаз и их генов». Нуклеиновые кислоты Res. 31 (7): 1805–12. Дои:10.1093 / nar / gkg274. ЧВК 152790. PMID 12654995.
^ Джереми МБ, Джон LT, Люберт S (2002). «3. Структура и функции белка». Биохимия. Сан-Франциско: В. Х. Фриман. ISBN 0-7167-4684-0.
^ Анфинсен К. Б. (1973). «Принципы, регулирующие сворачивание белковых цепей». Наука. 181 (4096): 223–30. Дои:10.1126 / science.181.4096.223. PMID 4124164.
^ Кесслер C, Манта V (август 1990 г.). «Специфичность рестрикционных эндонуклеаз и модификации ДНК метилтрансфераз - обзор (издание 3)». Ген. 92 (1–2): 1–248. Дои:10.1016 / 0378-1119 (90) 90486-Б. PMID 2172084.
^ Pingoud A, Jeltsch A (сентябрь 2001 г.). «Структура и функция эндонуклеаз рестрикции II типа». Нуклеиновые кислоты Res. 29 (18): 3705–27. Дои:10.1093 / nar / 29.18.3705. ЧВК 55916. PMID 11557805.

[pmid4588280-1] Смит Х.О., Натанс Д. (декабрь 1973 г.). «Письмо: Предлагаемая номенклатура для бактериальных систем модификации и рестрикции и их ферментов». J. Mol. Биол. 81 (3): 419–23. Дои:10.1016/0022-2836(73)90152-6. PMID 4588280.

[pmid12654995-2] Робертс Р.Дж., Белфорт М., Бестор Т., Бхагват А.С., Бикл Т.А., Битинаит Дж., Блюменталь Р.М., Дегтярев С.К., Драйден Д.Т., Дибвиг К., Фирман К., Громова Е.С., Гампорт Р.И., Халфорд С.Е., Хаттман С., Хейтман Дж., Хорнби Д.П. , Janulaitis A, Jeltsch A, Josephsen J, Kiss A, Klaenhammer TR, Kobayashi I, Kong H, Krüger DH, Lacks S, Marinus MG, Miyahara M, Morgan RD, Murray NE, Nagaraja V, Piekarowicz A, Pingoud A, Raleigh Э, Рао Д.Н., Райх Н., Репин В.Е., Селкер Э.У., Шоу П.С., Штейн Д.К., Стоддард Б.Л., Шибальский В., Траутнер Т.А., Ван Эттен Дж.Л., Витор Дж.М., Уилсон Г.Г., Сюй С.Ю. (апрель 2003 г.). «Номенклатура рестрикционных ферментов, ДНК-метилтрансфераз, самонаводящихся эндонуклеаз и их генов». Нуклеиновые кислоты Res. 31 (7): 1805–12. Дои:10.1093 / nar / gkg274. ЧВК 152790. PMID 12654995.

[3] Джереми МБ, Джон LT, Люберт S (2002). «3. Структура и функции белка». Биохимия. Сан-Франциско: В. Х. Фриман. ISBN 0-7167-4684-0.

[4] Анфинсен К. Б. (1973). «Принципы, регулирующие сворачивание белковых цепей». Наука. 181 (4096): 223–30. Дои:10.1126 / science.181.4096.223. PMID 4124164.

[pmid2172084-5] Кесслер C, Манта V (август 1990 г.). «Специфичность рестрикционных эндонуклеаз и модификации ДНК метилтрансфераз - обзор (издание 3)». Ген. 92 (1–2): 1–248. Дои:10.1016 / 0378-1119 (90) 90486-Б. PMID 2172084.

[pmid11557805-6] Pingoud A, Jeltsch A (сентябрь 2001 г.). «Структура и функция эндонуклеаз рестрикции II типа». Нуклеиновые кислоты Res. 29 (18): 3705–27. Дои:10.1093 / nar / 29.18.3705. ЧВК 55916. PMID 11557805.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

Система модификации ограничений: рестрикционный фермент
Основная концепция	Изошизомер Неошизомер Изокаудомер
Последовательность распознавания 4bp	Taqя Sau3А АлуЯ* ХэIII * ДпнII NlaIII HpaII
Последовательность распознавания 5bp	ЭкоRII Фокя
Последовательность распознавания 6bp	Ааая BglII POVII * ЭкоRV * ЭкоRI БамЗДРАВСТВУЙ ЗадняяIII Xbaя Xhoя Мешокя Тихоокеанское стандартное времяя Ндея
Последовательность распознавания 8bp	Нетя
Списки	А Ba – Bc Bd – Bp Bsa – Bso Bsp – Bss Bst – Bv CD E-F G-K L-N ИЛИ ЖЕ S Т-Я
* означает, что расщепление производит тупые концы