Наутилия профундикола - Nautilia profundicola - Wikipedia

Наутилия профундикола
Научная классификация
Королевство:
Бактерии
Тип:
Протеобактерии
Учебный класс:
Эпсилонпротеобактерии
Заказ:
Nautiliales
Семья:
Nautiliaceae
Род:
Наутилия
Разновидность:
Н. profundicola
Биномиальное имя
Наутилия профундикола
Смит и другие, 2008

Наутилия профундикола это Грамотрицательный хемолитоавтотрофный эпсилонпротеобактерии найдено вокруг гидротермальные источники в глубоком океане.[1] Впервые он был обнаружен в 1999 г. Восточно-Тихоокеанский подъем на глубине 2500 метров (8200 футов) на поверхности многощетинковый червь Альвинелла Помпежана.[2] Наутилия профундикола симбиотически живет на спинных волосках А. Помпежана но они также могут образовывать биопленки и живут самостоятельно на стенках гидротермальных источников. Способность Н. profundicola выжить в анаэробный окружающая среда, богатая сера, ЧАС2 и CO2 переменной температуры делает его полезным для изучения организмом, поскольку предполагается, что эти условия преобладали примерно во времена зарождения самой ранней жизни на Земле.[1]

Морфология

Наутилия профундикола представляет собой подвижную палочковидную бактерию длиной около 0,4 мкм и шириной 0,3 мкм.[2] Как и большинство эпсилонпротеобактерий, он имеет незащищенный полярный жгутик.[3]

Физиология

Наутилия профундикола живет среди гидротермальных источников и может расти при температуре 30–55 ° C (86–131 ° F). Оно использует анаэробное дыхание и является хемолитоавтотрофом. Наутилия профундикола использует водород или форматировать как донор электронов и сера акцептор электронов для производства сероводород.[2] Наутилия профундикола содержит белок обратная гираза, который был найден среди термофильные бактерии, и это помогает ему пережить большие колебания температуры, связанные с окружающей средой.[1] Теоретически обратная гираза сохраняет стабильность генома и предотвращает повреждение от сильной жары.[4] Наряду с возможностью фиксировать углерод и серу, анализ генома Наутилия профундикола указывает на новый путь азотфиксация.[1]

Таксономия

Анализ Ген 16S рРНК Последовательность из Наутилия профундикола позволил поместить его в семью Nautiliaceae порядка Nautiliales в классе Эпсилонпротеобактерии. Анализ этого гена показал, что этот организм на 97,8% разделяет ДНК этого гена с родственной бактерией. Наутилия литотрофная. С помощью ДНК-ДНК гибридизация, общее ДНК-ДНК-родство двух организмов составило 34,6%, что, наряду с различиями в филогения, допустимый Наутилия профундикола быть классифицированным как отдельный вид.[2]

Геномная информация

Геном Наутилия профундикола состоит из одного круговая хромосома 1,7 миллиона пар оснований, который невелик по сравнению с другими свободноживущими эпсилонпротеобактериями.[1] Доказательств влияния горизонтальный перенос генов в геноме Наутилия профундикола и этот недостаток внешней ДНК теоретически является продуктом его собственных защитных механизмов или недостатком свободной ДНК в окружающей негостеприимной среде.[1]

Экологическая функция

Наутилия профундикола является членом группы Epsilonproteobacteria, которая доминирует в жерловой экосистеме и, вероятно, играет ключевую роль в круговороте углерода, азота и серы.[1] Наутилия профундикола было обнаружено, что они имеют симбиотические отношения с Альвинелла Помпежана, в котором червь выделяет съедобные слизь, возможно, в обмен на термостойкость бактерии ферменты. Это может объяснить, как Альвинелла Помпежана может выжить, если одна часть его тела находится в воде с температурой 80 ° C (176 ° F) в вентиляционном отверстии, а остальная часть тела - в воде с температурой 22 ° C (72 ° F) за пределами вентиляционного отверстия.[5]

Рекомендации

  1. ^ а б c d е ж грамм Барбара Дж. Кэмпбелл; Джули Л. Смит; Томас Э. Хэнсон; Мартин Г. Клотц; Лиза Ю. Штейн; Чарльз К. Ли; Дунъин Ву; Джеффри М. Робинсон; Хода М. Хоури; Джонатан А. Эйзен; С. Крейг Кэри (2009). "Адаптация к подводным гидротермальным условиям на примере генома Наутилия профундикола". PLoS Genetics. 5 (2): e1000362. Дои:10.1371 / journal.pgen.1000362. ЧВК  2628731. PMID  19197347.
  2. ^ а б c d Джули Л. Смит; Барбара Дж. Кэмпбелл; Томас Э. Хэнсон; Чуаньлунь Л. Чжан; С. Крейг Кэри (2008). "Наутилия профундикола sp. nov., термофильная, восстанавливающая серу эпсилонпротеобактерия из глубоководных гидротермальных источников ". Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 58 (7): 1598–1602. Дои:10.1099 / ijs.0.65435-0. PMID  18599701.
  3. ^ Джек Р. Холт (2009). «Введение в эпсилонпротеобактерии». Разнообразие жизни. Susquehanna University. Получено 8 января, 2012.
  4. ^ Анна Валенти; Джузеппе Перуджино; Такехико Нохми; Мосе Росси; Мария Чарамелла (2009). «Ингибирование транслезионной ДНК-полимеразы архейной обратной гиразой». Исследования нуклеиновых кислот. 37: 4287–4295. Дои:10.1093 / nar / gkp386. ЧВК  2715243. PMID  19443439.
  5. ^ «В глубоководных жерлах обитает самое горячее животное Земли». Университет Делавэра. 2001. Получено 8 января, 2012.

внешняя ссылка